Doublet Group distance statistics: 53068

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.002, 0.003, 0.003 max_d=0.003 avg_d=0.002 std_dev=0.002
C1'	A	0, 0.000, 0.004, 0.009, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.004 std_dev=0.004
C2	A	0, 0.000, 0.006, 0.013, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.000, 0.009, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.009
N7	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C8	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.013
N6	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.014
O2'	A	0, 0.000, 0.104, 0.209, 0.209 max_d=0.209 avg_d=0.104 std_dev=0.104
O4'	A	0, 0.000, 0.178, 0.355, 0.355 max_d=0.355 avg_d=0.178 std_dev=0.178
C2'	A	0, 0.000, 0.179, 0.359, 0.359 max_d=0.359 avg_d=0.179 std_dev=0.179
OP2	B	0, 0.000, 0.234, 0.469, 0.469 max_d=0.469 avg_d=0.234 std_dev=0.234
C3'	A	0, 0.000, 0.365, 0.729, 0.729 max_d=0.729 avg_d=0.365 std_dev=0.365
C4'	A	0, 0.000, 0.377, 0.753, 0.753 max_d=0.753 avg_d=0.377 std_dev=0.377
P	B	0, 0.000, 0.388, 0.776, 0.776 max_d=0.776 avg_d=0.388 std_dev=0.388
OP1	B	0, 0.000, 0.451, 0.902, 0.902 max_d=0.902 avg_d=0.451 std_dev=0.451
OP2	A	0, 0.000, 0.480, 0.959, 0.959 max_d=0.959 avg_d=0.480 std_dev=0.480
O3'	A	0, 0.000, 0.523, 1.047, 1.047 max_d=1.047 avg_d=0.523 std_dev=0.523
C5'	A	0, 0.000, 0.614, 1.229, 1.229 max_d=1.229 avg_d=0.614 std_dev=0.614
C5'	B	0, 0.000, 0.619, 1.238, 1.238 max_d=1.238 avg_d=0.619 std_dev=0.619
O5'	A	0, 0.000, 0.635, 1.270, 1.270 max_d=1.270 avg_d=0.635 std_dev=0.635
O5'	B	0, 0.000, 0.637, 1.274, 1.274 max_d=1.274 avg_d=0.637 std_dev=0.637
P	A	0, 0.000, 0.850, 1.701, 1.701 max_d=1.701 avg_d=0.850 std_dev=0.850
C4'	B	0, 0.000, 1.129, 2.258, 2.258 max_d=2.258 avg_d=1.129 std_dev=1.129
O4'	B	0, 0.000, 1.241, 2.483, 2.483 max_d=2.483 avg_d=1.241 std_dev=1.241
C6	B	0, 0.000, 1.468, 2.936, 2.936 max_d=2.936 avg_d=1.468 std_dev=1.468
O3'	B	0, 0.000, 1.535, 3.069, 3.069 max_d=3.069 avg_d=1.535 std_dev=1.535
C3'	B	0, 0.000, 1.604, 3.208, 3.208 max_d=3.208 avg_d=1.604 std_dev=1.604
C1'	B	0, 0.000, 1.666, 3.332, 3.332 max_d=3.332 avg_d=1.666 std_dev=1.666
C5	B	0, 0.000, 1.685, 3.371, 3.371 max_d=3.371 avg_d=1.685 std_dev=1.685
N1	B	0, 0.000, 1.686, 3.371, 3.371 max_d=3.371 avg_d=1.686 std_dev=1.686
C2'	B	0, 0.000, 1.689, 3.377, 3.377 max_d=3.377 avg_d=1.689 std_dev=1.689
O2'	B	0, 0.000, 2.072, 4.144, 4.144 max_d=4.144 avg_d=2.072 std_dev=2.072
C4	B	0, 0.000, 2.084, 4.169, 4.169 max_d=4.169 avg_d=2.084 std_dev=2.084
C2	B	0, 0.000, 2.099, 4.199, 4.199 max_d=4.199 avg_d=2.099 std_dev=2.099
OP1	A	0, 0.000, 2.134, 4.269, 4.269 max_d=4.269 avg_d=2.134 std_dev=2.134
N3	B	0, 0.000, 2.256, 4.512, 4.512 max_d=4.512 avg_d=2.256 std_dev=2.256
O2	B	0, 0.000, 2.354, 4.709, 4.709 max_d=4.709 avg_d=2.354 std_dev=2.354
N4	B	0, 0.000, 2.364, 4.728, 4.728 max_d=4.728 avg_d=2.364 std_dev=2.364

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.08	0.52	0.06	0.15
C2	0.00	0.00	0.10	0.15	0.01	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.18	0.03	0.25	1.03	0.06	0.36
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.07	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.09	0.10	0.07	0.02	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.22	0.06	0.03
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.12	0.01	0.13	0.02	0.15	0.07	0.15	0.12	0.15	0.11	0.08	0.02	0.00	0.01	0.04	0.05	0.07	0.06
C4	0.00	0.01	0.07	0.12	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.13	0.01	0.25	1.00	0.04	0.36
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.08	0.09	0.06	0.02	0.10	0.10	0.06	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.20	0.01
C5	0.00	0.00	0.06	0.13	0.00	0.08	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.15	0.01	0.31	1.20	0.10	0.45
C5'	0.02	0.10	0.01	0.02	0.12	0.01	0.17	0.00	0.18	0.19	0.14	0.07	0.20	0.21	0.12	0.05	0.06	0.01	0.01	0.20	0.35	0.03
C6	0.01	0.01	0.08	0.15	0.01	0.08	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.18	0.01	0.33	1.26	0.12	0.48
C8	0.00	0.01	0.01	0.07	0.00	0.09	0.01	0.19	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.02	0.30	1.08	0.06	0.42
N1	0.00	0.00	0.09	0.15	0.01	0.06	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.19	0.03	0.29	1.17	0.10	0.43
N3	0.00	0.00	0.10	0.12	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.14	0.03	0.21	0.91	0.03	0.31
N6	0.01	0.01	0.07	0.15	0.01	0.10	0.01	0.20	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.19	0.00	0.36	1.36	0.16	0.53
N7	0.01	0.00	0.02	0.11	0.01	0.10	0.00	0.21	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.12	0.01	0.35	1.28	0.12	0.49
N9	0.00	0.01	0.03	0.08	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.01	0.22	0.87	0.01	0.31
O2'	0.00	0.05	0.00	0.02	0.03	0.04	0.02	0.05	0.04	0.01	0.04	0.04	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.09	0.03	0.02
O3'	0.01	0.18	0.01	0.00	0.13	0.02	0.15	0.06	0.18	0.07	0.19	0.14	0.19	0.12	0.08	0.01	0.00	0.01	0.11	0.38	0.09	0.17
O4'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.39	0.18	0.10
O5'	0.08	0.25	0.01	0.04	0.25	0.01	0.31	0.01	0.33	0.30	0.29	0.21	0.36	0.35	0.22	0.03	0.11	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.52	1.03	0.22	0.05	1.00	0.01	1.20	0.20	1.26	1.08	1.17	0.91	1.36	1.28	0.87	0.09	0.38	0.39	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.06	0.06	0.06	0.07	0.04	0.20	0.10	0.35	0.12	0.06	0.10	0.03	0.16	0.12	0.01	0.03	0.09	0.18	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.36	0.03	0.06	0.36	0.01	0.45	0.03	0.48	0.42	0.43	0.31	0.53	0.49	0.31	0.02	0.17	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.35	0.31	0.09	0.05	0.36	0.07	0.43	0.05	0.44	0.36	0.30	0.34	0.26	0.40	0.04	0.30	0.12	0.24	0.05	0.08
C2	0.20	0.14	0.48	0.43	0.06	0.32	0.15	0.28	0.08	0.09	0.07	0.11	0.24	0.23	0.28	0.13	0.14	0.11	0.11	0.09
C2'	0.47	0.30	0.29	0.24	0.28	0.23	0.39	0.10	0.46	0.40	0.24	0.22	0.27	0.65	0.19	0.41	0.24	0.39	0.05	0.20
C3'	0.58	0.36	0.43	0.32	0.28	0.31	0.38	0.16	0.49	0.47	0.27	0.19	0.36	0.84	0.27	0.49	0.26	0.41	0.04	0.20
C4	0.00	0.01	0.25	0.27	0.16	0.20	0.25	0.22	0.22	0.07	0.05	0.19	0.09	0.06	0.22	0.02	0.04	0.16	0.09	0.02
C4'	0.58	0.47	0.36	0.26	0.39	0.25	0.45	0.06	0.52	0.52	0.41	0.32	0.48	0.74	0.21	0.48	0.18	0.28	0.08	0.09
C5	0.11	0.10	0.35	0.41	0.09	0.31	0.20	0.28	0.15	0.03	0.04	0.13	0.21	0.02	0.35	0.09	0.10	0.11	0.09	0.06
C5'	0.58	0.46	0.38	0.26	0.37	0.25	0.43	0.08	0.50	0.50	0.38	0.29	0.47	0.79	0.21	0.47	0.19	0.30	0.07	0.10
C6	0.26	0.21	0.50	0.55	0.02	0.42	0.12	0.33	0.05	0.14	0.13	0.07	0.34	0.20	0.46	0.20	0.17	0.05	0.10	0.10
C8	0.10	0.06	0.13	0.23	0.20	0.17	0.29	0.20	0.27	0.14	0.09	0.21	0.02	0.23	0.23	0.07	0.02	0.16	0.09	0.01
N1	0.31	0.24	0.57	0.58	0.01	0.43	0.09	0.34	0.01	0.18	0.15	0.06	0.36	0.32	0.44	0.23	0.20	0.03	0.11	0.12
N3	0.02	0.01	0.29	0.25	0.16	0.17	0.25	0.19	0.21	0.06	0.06	0.19	0.08	0.02	0.15	0.03	0.03	0.18	0.09	0.01
N6	0.34	0.30	0.58	0.65	0.04	0.49	0.07	0.36	0.01	0.22	0.21	0.03	0.44	0.28	0.57	0.28	0.21	0.01	0.10	0.12
N7	0.04	0.05	0.26	0.36	0.12	0.28	0.23	0.25	0.19	0.03	0.00	0.15	0.16	0.10	0.34	0.04	0.07	0.12	0.09	0.04
N9	0.15	0.12	0.10	0.15	0.24	0.10	0.32	0.16	0.31	0.19	0.15	0.25	0.05	0.24	0.14	0.13	0.02	0.19	0.08	0.01
O2'	0.61	0.45	0.40	0.38	0.36	0.35	0.44	0.16	0.54	0.53	0.36	0.27	0.44	0.71	0.31	0.54	0.28	0.36	0.02	0.19
O3'	0.75	0.44	0.65	0.52	0.25	0.48	0.37	0.28	0.53	0.56	0.28	0.11	0.48	1.10	0.44	0.62	0.34	0.48	0.09	0.26
O4'	0.46	0.44	0.18	0.12	0.46	0.12	0.51	0.03	0.52	0.47	0.44	0.44	0.42	0.51	0.08	0.38	0.13	0.21	0.09	0.06
O5'	0.50	0.33	0.34	0.22	0.30	0.22	0.41	0.12	0.48	0.43	0.27	0.24	0.31	0.76	0.17	0.41	0.24	0.43	0.06	0.21
OP1	0.63	0.35	0.52	0.50	0.38	0.50	0.59	0.51	0.67	0.54	0.28	0.30	0.26	0.91	0.46	0.59	0.67	1.06	0.61	0.77
OP2	0.33	0.30	0.12	0.08	0.40	0.07	0.47	0.15	0.45	0.35	0.32	0.41	0.23	0.53	0.19	0.21	0.07	0.17	0.03	0.05
P	0.49	0.32	0.32	0.21	0.32	0.22	0.44	0.14	0.50	0.42	0.27	0.27	0.27	0.75	0.16	0.40	0.29	0.50	0.14	0.28

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.07	0.02	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.28	0.00	0.13	0.21	0.16	0.15
C2	0.02	0.00	0.14	0.15	0.00	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.19	0.09	0.01	0.04	0.04	0.03
C2'	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.20	0.17	0.00	0.09	0.01	0.26	0.00	0.03	0.02	0.42	0.58	0.49	0.50
C3'	0.02	0.15	0.01	0.00	0.26	0.00	0.27	0.03	0.23	0.16	0.21	0.28	0.09	0.00	0.01	0.00	0.10	0.32	0.02	0.17
C4	0.01	0.00	0.01	0.26	0.00	0.10	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.32	0.02	0.00	0.16	0.14	0.20	0.22
C4'	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.00	0.17	0.01	0.18	0.06	0.02	0.11	0.08	0.22	0.02	0.00	0.03	0.08	0.01	0.06
C5	0.02	0.01	0.13	0.27	0.00	0.17	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.45	0.10	0.08	0.22	0.19	0.21	0.26
C5'	0.07	0.06	0.20	0.03	0.05	0.01	0.14	0.00	0.14	0.00	0.03	0.07	0.13	0.02	0.13	0.01	0.01	0.09	0.01	0.02
C6	0.02	0.01	0.17	0.23	0.00	0.18	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.42	0.05	0.12	0.16	0.09	0.09	0.16
N1	0.00	0.01	0.00	0.16	0.01	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.17	0.12	0.00	0.02	0.05	0.00	0.02
N3	0.01	0.00	0.09	0.21	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.16	0.10	0.07	0.07	0.05	0.13	0.12
N4	0.00	0.01	0.01	0.28	0.01	0.11	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.34	0.06	0.00	0.19	0.21	0.27	0.28
O2	0.05	0.00	0.26	0.09	0.00	0.08	0.01	0.13	0.02	0.02	0.00	0.00	0.00	0.19	0.30	0.15	0.05	0.11	0.00	0.03
O2'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.32	0.22	0.45	0.02	0.42	0.17	0.16	0.34	0.19	0.00	0.01	0.15	0.34	0.55	0.59	0.49
O3'	0.28	0.19	0.03	0.01	0.02	0.02	0.10	0.13	0.05	0.12	0.10	0.06	0.30	0.01	0.00	0.19	0.06	0.03	0.23	0.07
O4'	0.00	0.09	0.02	0.00	0.00	0.00	0.08	0.01	0.12	0.00	0.07	0.00	0.15	0.15	0.19	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01
O5'	0.13	0.01	0.42	0.10	0.16	0.03	0.22	0.01	0.16	0.02	0.07	0.19	0.05	0.34	0.06	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01
OP1	0.21	0.04	0.58	0.32	0.14	0.08	0.19	0.09	0.09	0.05	0.05	0.21	0.11	0.55	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01
OP2	0.16	0.04	0.49	0.02	0.20	0.01	0.21	0.01	0.09	0.00	0.13	0.27	0.00	0.59	0.23	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.15	0.03	0.50	0.17	0.22	0.06	0.26	0.02	0.16	0.02	0.12	0.28	0.03	0.49	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00