Doublet Group distance statistics: 53077

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 5, 12, 5, 3, 2, 0, 0, 4, 4, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.005, 0.009, 0.013, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.009 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.004, 0.008, 0.012, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.008 std_dev=0.004
C1'	A	0, 0.009, 0.015, 0.021, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.015 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.008, 0.015, 0.021, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.015 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.007, 0.014, 0.020, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.014 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.012 std_dev=0.007
N9	A	0, 0.008, 0.017, 0.025, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.017 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.006, 0.014, 0.023, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.014 std_dev=0.009
N6	A	0, 0.011, 0.024, 0.038, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.024 std_dev=0.013
N7	A	0, 0.010, 0.026, 0.041, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.026 std_dev=0.016
C8	A	0, 0.009, 0.027, 0.045, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.027 std_dev=0.018
O2'	A	0, 0.072, 0.179, 0.286, 0.436 max_d=0.436 avg_d=0.179 std_dev=0.107
C2'	A	0, 0.049, 0.160, 0.272, 0.419 max_d=0.419 avg_d=0.160 std_dev=0.112
O4'	A	0, 0.029, 0.149, 0.268, 0.416 max_d=0.416 avg_d=0.149 std_dev=0.119
C3'	A	0, 0.084, 0.261, 0.439, 0.665 max_d=0.665 avg_d=0.261 std_dev=0.177
C4'	A	0, 0.064, 0.246, 0.428, 0.652 max_d=0.652 avg_d=0.246 std_dev=0.182
P	B	0, 0.260, 0.475, 0.690, 1.086 max_d=1.086 avg_d=0.475 std_dev=0.215
OP2	B	0, 0.253, 0.499, 0.744, 1.050 max_d=1.050 avg_d=0.499 std_dev=0.246
O3'	A	0, 0.150, 0.409, 0.669, 0.990 max_d=0.990 avg_d=0.409 std_dev=0.259
O5'	B	0, 0.275, 0.550, 0.826, 1.152 max_d=1.152 avg_d=0.550 std_dev=0.276
C5'	A	0, 0.093, 0.398, 0.704, 1.074 max_d=1.074 avg_d=0.398 std_dev=0.306
OP1	B	0, 0.083, 0.611, 1.139, 1.783 max_d=1.783 avg_d=0.611 std_dev=0.528
C5'	B	0, 0.228, 0.796, 1.363, 1.809 max_d=1.809 avg_d=0.796 std_dev=0.568
C3'	B	0, 0.197, 0.776, 1.354, 1.875 max_d=1.875 avg_d=0.776 std_dev=0.578
C4'	B	0, 0.144, 0.917, 1.690, 2.416 max_d=2.416 avg_d=0.917 std_dev=0.773
O5'	A	0, -0.129, 0.695, 1.520, 2.302 max_d=2.302 avg_d=0.695 std_dev=0.824
O3'	B	0, 0.065, 1.088, 2.110, 3.083 max_d=3.083 avg_d=1.088 std_dev=1.022
O4'	B	0, 0.014, 1.079, 2.145, 3.228 max_d=3.228 avg_d=1.079 std_dev=1.066
P	A	0, -0.251, 1.009, 2.269, 3.458 max_d=3.458 avg_d=1.009 std_dev=1.260
OP1	A	0, -0.116, 1.152, 2.420, 3.663 max_d=3.663 avg_d=1.152 std_dev=1.268
C2'	B	0, -0.119, 1.173, 2.466, 3.766 max_d=3.766 avg_d=1.173 std_dev=1.292
C8	B	0, -0.150, 1.212, 2.573, 3.959 max_d=3.959 avg_d=1.212 std_dev=1.361
C1'	B	0, -0.140, 1.256, 2.652, 4.073 max_d=4.073 avg_d=1.256 std_dev=1.396
N9	B	0, -0.149, 1.263, 2.676, 4.114 max_d=4.114 avg_d=1.263 std_dev=1.413
OP2	A	0, -0.314, 1.100, 2.515, 3.963 max_d=3.963 avg_d=1.100 std_dev=1.414
N7	B	0, -0.208, 1.327, 2.861, 4.395 max_d=4.395 avg_d=1.327 std_dev=1.535
C4	B	0, -0.205, 1.417, 3.039, 4.656 max_d=4.656 avg_d=1.417 std_dev=1.622
C5	B	0, -0.245, 1.446, 3.136, 4.811 max_d=4.811 avg_d=1.446 std_dev=1.690
N3	B	0, -0.240, 1.571, 3.382, 5.154 max_d=5.154 avg_d=1.571 std_dev=1.811
C6	B	0, -0.332, 1.636, 3.604, 5.517 max_d=5.517 avg_d=1.636 std_dev=1.968
C2	B	0, -0.317, 1.742, 3.801, 5.785 max_d=5.785 avg_d=1.742 std_dev=2.059
N1	B	0, -0.363, 1.764, 3.892, 5.939 max_d=5.939 avg_d=1.764 std_dev=2.127
O6	B	0, -0.399, 1.729, 3.857, 5.908 max_d=5.908 avg_d=1.729 std_dev=2.128
O2'	B	0, -0.461, 1.681, 3.823, 5.835 max_d=5.835 avg_d=1.681 std_dev=2.142
N2	B	0, -0.370, 1.948, 4.266, 6.465 max_d=6.465 avg_d=1.948 std_dev=2.318

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.35	0.59	0.05	0.34
C2	0.01	0.00	0.09	0.11	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.14	0.03	0.60	0.85	0.28	0.70
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.01	0.03	0.01	0.05	0.04	0.08	0.09	0.04	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.18	0.26	0.09	0.17
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.06	0.00	0.05	0.02	0.07	0.06	0.10	0.10	0.07	0.05	0.03	0.01	0.01	0.01	0.09	0.07	0.16	0.10
C4	0.01	0.00	0.05	0.06	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.08	0.02	0.62	0.86	0.26	0.70
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.06	0.03	0.03	0.04	0.05	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.17	0.15	0.03
C5	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.07	0.02	0.72	0.99	0.38	0.88
C5'	0.02	0.04	0.01	0.02	0.05	0.00	0.08	0.00	0.07	0.11	0.05	0.03	0.09	0.11	0.06	0.04	0.06	0.02	0.00	0.13	0.08	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.07	0.00	0.03	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.10	0.02	0.74	1.02	0.43	0.92
C8	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.06	0.02	0.70	0.97	0.31	0.82
N1	0.01	0.00	0.08	0.10	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.13	0.03	0.69	0.95	0.38	0.84
N3	0.01	0.00	0.09	0.10	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.07	0.12	0.03	0.54	0.77	0.20	0.60
N6	0.01	0.00	0.04	0.07	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.10	0.03	0.78	1.09	0.52	1.03
N7	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.02	0.76	1.06	0.43	0.96
N9	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.57	0.81	0.19	0.62
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.04	0.03	0.03	0.04	0.04	0.03	0.07	0.07	0.04	0.02	0.01	0.00	0.05	0.02	0.03	0.13	0.14	0.06
O3'	0.01	0.14	0.02	0.01	0.08	0.01	0.07	0.06	0.10	0.06	0.13	0.12	0.10	0.05	0.03	0.05	0.00	0.01	0.20	0.32	0.17	0.17
O4'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.31	0.60	0.15	0.26
O5'	0.35	0.60	0.18	0.09	0.62	0.01	0.72	0.00	0.74	0.70	0.69	0.54	0.78	0.76	0.57	0.03	0.20	0.31	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.59	0.85	0.26	0.07	0.86	0.17	0.99	0.13	1.02	0.97	0.95	0.77	1.09	1.06	0.81	0.13	0.32	0.60	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.05	0.28	0.09	0.16	0.26	0.15	0.38	0.08	0.43	0.31	0.38	0.20	0.52	0.43	0.19	0.14	0.17	0.15	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.34	0.70	0.17	0.10	0.70	0.03	0.88	0.01	0.92	0.82	0.84	0.60	1.03	0.96	0.62	0.06	0.17	0.26	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.76	0.46	0.25	0.59	0.36	0.73	0.43	0.90	0.45	0.89	0.78	0.60	0.66	0.40	0.41	0.68	0.22	0.23	1.03	0.28	0.14	0.22
C2	0.30	0.13	0.23	0.45	0.07	0.61	0.14	0.60	0.23	0.11	0.21	0.13	0.07	0.12	0.14	0.29	0.86	0.57	0.33	0.30	0.10	0.15	0.21
C2'	0.27	0.92	0.55	0.14	0.70	0.19	0.82	0.26	1.01	0.48	1.03	0.97	0.76	0.70	0.48	0.48	0.47	0.11	0.13	1.12	0.13	0.15	0.12
C3'	0.27	0.99	0.54	0.14	0.74	0.19	0.87	0.25	1.08	0.50	1.12	1.05	0.81	0.73	0.50	0.46	0.47	0.10	0.12	1.20	0.12	0.16	0.10
C4	0.15	0.35	0.27	0.38	0.24	0.54	0.37	0.56	0.50	0.16	0.47	0.35	0.23	0.33	0.09	0.20	0.83	0.46	0.29	0.61	0.16	0.14	0.22
C4'	0.30	1.02	0.55	0.18	0.78	0.26	0.94	0.34	1.16	0.58	1.17	1.06	0.82	0.83	0.54	0.52	0.59	0.12	0.18	1.31	0.25	0.14	0.18
C5	0.30	0.18	0.23	0.46	0.09	0.65	0.23	0.63	0.35	0.07	0.31	0.17	0.08	0.21	0.10	0.31	0.92	0.60	0.32	0.47	0.11	0.15	0.22
C5'	0.23	0.98	0.49	0.24	0.74	0.33	0.92	0.40	1.15	0.54	1.15	1.03	0.78	0.80	0.49	0.43	0.68	0.17	0.21	1.32	0.28	0.14	0.20
C6	0.46	0.09	0.28	0.52	0.14	0.74	0.08	0.68	0.15	0.17	0.11	0.11	0.17	0.09	0.26	0.49	0.98	0.73	0.34	0.26	0.10	0.16	0.20
C8	0.13	0.44	0.28	0.38	0.30	0.55	0.47	0.56	0.62	0.22	0.59	0.44	0.29	0.43	0.14	0.21	0.85	0.45	0.29	0.77	0.19	0.14	0.23
N1	0.48	0.13	0.29	0.53	0.18	0.73	0.10	0.68	0.10	0.22	0.09	0.14	0.20	0.11	0.29	0.50	0.96	0.73	0.35	0.17	0.13	0.15	0.20
N3	0.12	0.35	0.28	0.36	0.24	0.49	0.35	0.52	0.46	0.15	0.45	0.36	0.25	0.31	0.11	0.19	0.78	0.41	0.29	0.55	0.16	0.14	0.22
N6	0.60	0.22	0.37	0.58	0.27	0.82	0.13	0.72	0.09	0.26	0.11	0.26	0.32	0.12	0.38	0.67	1.04	0.84	0.35	0.15	0.13	0.16	0.19
N7	0.27	0.25	0.23	0.44	0.14	0.64	0.30	0.62	0.44	0.10	0.39	0.24	0.12	0.29	0.06	0.28	0.92	0.58	0.31	0.58	0.13	0.15	0.22
N9	0.06	0.53	0.33	0.33	0.38	0.48	0.53	0.51	0.68	0.28	0.66	0.53	0.38	0.48	0.21	0.24	0.78	0.37	0.27	0.81	0.22	0.14	0.23
O2'	0.44	1.11	0.67	0.09	0.88	0.11	0.99	0.19	1.18	0.63	1.22	1.17	0.94	0.85	0.65	0.68	0.38	0.17	0.12	1.29	0.18	0.15	0.12
O3'	0.37	1.15	0.60	0.09	0.85	0.10	0.95	0.16	1.18	0.53	1.26	1.24	0.95	0.76	0.58	0.54	0.35	0.13	0.10	1.30	0.10	0.15	0.09
O4'	0.20	0.83	0.48	0.27	0.65	0.38	0.82	0.46	1.01	0.51	0.99	0.85	0.66	0.75	0.45	0.45	0.74	0.21	0.25	1.16	0.35	0.13	0.26
O5'	0.49	1.10	0.79	0.17	0.88	0.11	0.99	0.08	1.17	0.69	1.20	1.15	0.94	0.88	0.68	0.71	0.26	0.22	0.18	1.28	0.26	0.33	0.20
OP1	0.66	1.20	1.03	0.43	1.03	0.28	1.15	0.26	1.31	0.89	1.32	1.23	1.05	1.07	0.86	0.96	0.11	0.36	0.43	1.43	0.54	0.60	0.44
OP2	0.25	0.95	0.47	0.24	0.70	0.25	0.82	0.31	1.04	0.47	1.08	1.02	0.77	0.69	0.47	0.40	0.69	0.13	0.18	1.16	0.23	0.14	0.18
P	0.50	1.08	0.81	0.20	0.87	0.13	0.97	0.10	1.14	0.68	1.18	1.14	0.93	0.85	0.68	0.73	0.25	0.24	0.21	1.23	0.29	0.33	0.22

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.00	0.02	0.32	0.01	0.23	0.01	0.20	0.43	0.30
C2	0.03	0.00	0.45	0.32	0.01	0.09	0.00	0.20	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.27	0.09	0.29	0.20	0.01	0.24	0.45	0.38
C2'	0.00	0.45	0.00	0.00	0.24	0.01	0.13	0.23	0.21	0.19	0.35	0.54	0.43	0.09	0.03	0.00	0.01	0.01	0.53	0.16	0.46	0.68	0.55
C3'	0.01	0.32	0.00	0.00	0.32	0.01	0.40	0.02	0.43	0.32	0.39	0.29	0.27	0.40	0.25	0.02	0.01	0.02	0.14	0.46	0.17	0.11	0.07
C4	0.01	0.01	0.24	0.32	0.00	0.02	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.05	0.16	0.17	0.01	0.21	0.43	0.33
C4'	0.00	0.09	0.01	0.01	0.02	0.00	0.10	0.00	0.07	0.22	0.04	0.15	0.10	0.21	0.08	0.31	0.04	0.00	0.01	0.11	0.08	0.17	0.04
C5	0.01	0.00	0.13	0.40	0.00	0.10	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.25	0.13	0.06	0.14	0.01	0.15	0.37	0.25
C5'	0.10	0.20	0.23	0.02	0.11	0.00	0.05	0.00	0.07	0.14	0.14	0.25	0.21	0.14	0.05	0.08	0.20	0.02	0.01	0.06	0.09	0.14	0.01
C6	0.01	0.00	0.21	0.43	0.01	0.07	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.19	0.15	0.12	0.14	0.01	0.16	0.35	0.27
C8	0.01	0.01	0.19	0.32	0.00	0.22	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.50	0.14	0.18	0.14	0.01	0.12	0.36	0.18
N1	0.02	0.00	0.35	0.39	0.01	0.04	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.07	0.22	0.16	0.01	0.20	0.40	0.33
N2	0.04	0.00	0.54	0.29	0.01	0.15	0.01	0.25	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.45	0.15	0.35	0.22	0.01	0.26	0.47	0.42
N3	0.03	0.00	0.43	0.27	0.00	0.10	0.00	0.21	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.29	0.15	0.30	0.22	0.01	0.25	0.47	0.39
N7	0.01	0.01	0.09	0.40	0.00	0.21	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.48	0.21	0.10	0.16	0.02	0.11	0.30	0.16
N9	0.00	0.01	0.03	0.25	0.00	0.08	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.21	0.05	0.01	0.16	0.01	0.18	0.43	0.29
O2'	0.02	0.27	0.00	0.02	0.05	0.31	0.25	0.08	0.19	0.50	0.08	0.45	0.29	0.48	0.21	0.00	0.03	0.20	0.37	0.28	0.31	0.74	0.44
O3'	0.32	0.09	0.01	0.01	0.05	0.04	0.13	0.20	0.15	0.14	0.07	0.15	0.15	0.21	0.05	0.03	0.00	0.24	0.25	0.22	0.55	0.27	0.32
O4'	0.01	0.29	0.01	0.02	0.16	0.00	0.06	0.02	0.12	0.18	0.22	0.35	0.30	0.10	0.01	0.20	0.24	0.00	0.06	0.08	0.07	0.27	0.15
O5'	0.23	0.20	0.53	0.14	0.17	0.01	0.14	0.01	0.14	0.14	0.16	0.22	0.22	0.16	0.16	0.37	0.25	0.06	0.00	0.15	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.16	0.46	0.01	0.11	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.28	0.22	0.08	0.15	0.00	0.13	0.29	0.22
OP1	0.20	0.24	0.46	0.17	0.21	0.08	0.15	0.09	0.16	0.12	0.20	0.26	0.25	0.11	0.18	0.31	0.55	0.07	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01
OP2	0.43	0.45	0.68	0.11	0.43	0.17	0.37	0.14	0.35	0.36	0.40	0.47	0.47	0.30	0.43	0.74	0.27	0.27	0.01	0.29	0.01	0.00	0.01
P	0.30	0.38	0.55	0.07	0.33	0.04	0.25	0.01	0.27	0.18	0.33	0.42	0.39	0.16	0.29	0.44	0.32	0.15	0.00	0.22	0.01	0.01	0.00