Doublet Group distance statistics: 53079

back

Distances from reference structure (by RMSD)

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	max_d=0.019 avg_d=0.008 std_dev=0.004
C2	A	max_d=0.038 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C1'	A	max_d=0.041 avg_d=0.015 std_dev=0.008
N3	A	max_d=0.038 avg_d=0.017 std_dev=0.008
N1	A	max_d=0.037 avg_d=0.015 std_dev=0.008
C5	A	max_d=0.039 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C4	A	max_d=0.049 avg_d=0.018 std_dev=0.009
N9	A	max_d=0.055 avg_d=0.021 std_dev=0.011
N6	A	max_d=0.074 avg_d=0.029 std_dev=0.016
N7	A	max_d=0.082 avg_d=0.031 std_dev=0.018
C8	A	max_d=0.100 avg_d=0.035 std_dev=0.021
C2'	A	max_d=0.301 avg_d=0.114 std_dev=0.067
O4'	A	max_d=0.315 avg_d=0.133 std_dev=0.073
C4'	A	max_d=0.401 avg_d=0.215 std_dev=0.083
C3'	A	max_d=0.413 avg_d=0.181 std_dev=0.087
C8	B	max_d=0.454 avg_d=0.282 std_dev=0.109
O2'	A	max_d=0.450 avg_d=0.181 std_dev=0.109
C5'	A	max_d=0.713 avg_d=0.337 std_dev=0.129
P	A	max_d=0.707 avg_d=0.415 std_dev=0.129
O5'	A	max_d=0.728 avg_d=0.373 std_dev=0.135
N7	B	max_d=0.609 avg_d=0.350 std_dev=0.146
OP2	B	max_d=0.754 avg_d=0.427 std_dev=0.151
O5'	B	max_d=0.740 avg_d=0.339 std_dev=0.152
OP1	A	max_d=0.755 avg_d=0.424 std_dev=0.152
O4'	B	max_d=0.663 avg_d=0.281 std_dev=0.154
N9	B	max_d=0.608 avg_d=0.301 std_dev=0.159
P	B	max_d=0.744 avg_d=0.381 std_dev=0.160
C1'	B	max_d=0.612 avg_d=0.316 std_dev=0.169
OP2	A	max_d=1.160 avg_d=0.497 std_dev=0.195
C5'	B	max_d=0.944 avg_d=0.403 std_dev=0.197
O3'	A	max_d=1.322 avg_d=0.232 std_dev=0.209
OP1	B	max_d=1.127 avg_d=0.425 std_dev=0.211
C4'	B	max_d=0.913 avg_d=0.386 std_dev=0.213
C5	B	max_d=0.861 avg_d=0.408 std_dev=0.222
C4	B	max_d=0.860 avg_d=0.371 std_dev=0.230
C2'	B	max_d=1.002 avg_d=0.442 std_dev=0.277
N3	B	max_d=1.076 avg_d=0.425 std_dev=0.305
C6	B	max_d=1.140 avg_d=0.521 std_dev=0.306
O2'	B	max_d=1.138 avg_d=0.522 std_dev=0.310
C3'	B	max_d=1.170 avg_d=0.475 std_dev=0.318
O6	B	max_d=1.258 avg_d=0.601 std_dev=0.330
C2	B	max_d=1.320 avg_d=0.512 std_dev=0.370
N1	B	max_d=1.357 avg_d=0.560 std_dev=0.373
O3'	B	max_d=1.478 avg_d=0.596 std_dev=0.411
N2	B	max_d=1.565 avg_d=0.584 std_dev=0.444

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.11	0.00	0.04	0.06	0.11	0.05
C2	0.02	0.00	0.05	0.05	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.10	0.18	0.04	0.07	0.11	0.20	0.09
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.03	0.04	0.04	0.04	0.04	0.04	0.02	0.00	0.04	0.01	0.06	0.12	0.07	0.11
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.06	0.03	0.05	0.03	0.05	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.10	0.06	0.09
C4	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.13	0.02	0.08	0.10	0.18	0.09
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.03	0.05	0.03	0.02	0.04	0.05	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.07	0.02
C5	0.00	0.00	0.03	0.02	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.10	0.02	0.10	0.13	0.21	0.12
C5'	0.02	0.06	0.04	0.01	0.06	0.00	0.09	0.00	0.09	0.08	0.08	0.05	0.10	0.10	0.05	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01
C6	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.12	0.03	0.10	0.14	0.23	0.13
C8	0.01	0.00	0.04	0.06	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.05	0.02	0.10	0.11	0.18	0.11
N1	0.01	0.00	0.04	0.03	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.09	0.16	0.04	0.09	0.13	0.22	0.12
N3	0.02	0.00	0.04	0.05	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.18	0.04	0.07	0.09	0.17	0.08
N6	0.01	0.00	0.04	0.03	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.10	0.03	0.11	0.16	0.25	0.15
N7	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.05	0.02	0.11	0.15	0.21	0.14
N9	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.09	0.01	0.07	0.09	0.15	0.08
O2'	0.02	0.10	0.00	0.01	0.06	0.01	0.05	0.03	0.07	0.05	0.09	0.09	0.07	0.05	0.03	0.00	0.05	0.02	0.08	0.17	0.09	0.14
O3'	0.11	0.18	0.04	0.00	0.13	0.02	0.10	0.03	0.12	0.05	0.16	0.18	0.10	0.05	0.09	0.05	0.00	0.09	0.05	0.11	0.07	0.10
O4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.04	0.03	0.02	0.01	0.02	0.09	0.00	0.05	0.08	0.16	0.07
O5'	0.04	0.07	0.06	0.04	0.08	0.01	0.10	0.00	0.10	0.10	0.09	0.07	0.11	0.11	0.07	0.08	0.05	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.06	0.11	0.12	0.10	0.10	0.03	0.13	0.01	0.14	0.11	0.13	0.09	0.16	0.15	0.09	0.17	0.11	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.20	0.07	0.06	0.18	0.07	0.21	0.05	0.23	0.18	0.22	0.17	0.25	0.21	0.15	0.09	0.07	0.16	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.09	0.11	0.09	0.09	0.02	0.12	0.01	0.13	0.11	0.12	0.08	0.15	0.14	0.08	0.14	0.10	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.25	0.13	0.16	0.18	0.13	0.18	0.17	0.23	0.09	0.26	0.27	0.22	0.12	0.13	0.11	0.14	0.13	0.13	0.23	0.19	0.08	0.12
C2	0.12	0.12	0.12	0.10	0.11	0.10	0.12	0.08	0.13	0.12	0.12	0.12	0.11	0.13	0.11	0.16	0.12	0.10	0.07	0.14	0.10	0.08	0.07
C2'	0.11	0.27	0.13	0.17	0.19	0.13	0.19	0.17	0.24	0.09	0.28	0.28	0.23	0.11	0.12	0.10	0.16	0.12	0.12	0.25	0.17	0.09	0.10
C3'	0.11	0.28	0.14	0.17	0.18	0.13	0.18	0.16	0.25	0.09	0.29	0.30	0.23	0.11	0.12	0.10	0.16	0.12	0.12	0.27	0.17	0.10	0.11
C4	0.08	0.15	0.08	0.08	0.12	0.07	0.13	0.09	0.15	0.09	0.16	0.15	0.13	0.12	0.09	0.11	0.07	0.08	0.08	0.17	0.13	0.07	0.08
C4'	0.11	0.27	0.13	0.16	0.19	0.13	0.19	0.17	0.25	0.09	0.28	0.29	0.23	0.12	0.13	0.10	0.14	0.12	0.13	0.27	0.20	0.09	0.12
C5	0.07	0.11	0.08	0.07	0.09	0.08	0.12	0.08	0.14	0.09	0.13	0.11	0.09	0.13	0.07	0.14	0.10	0.07	0.07	0.16	0.11	0.08	0.08
C5'	0.12	0.27	0.13	0.17	0.20	0.14	0.21	0.18	0.27	0.11	0.29	0.29	0.23	0.15	0.14	0.09	0.14	0.13	0.14	0.29	0.21	0.09	0.14
C6	0.12	0.09	0.14	0.14	0.09	0.14	0.11	0.12	0.12	0.11	0.10	0.09	0.09	0.12	0.09	0.21	0.18	0.11	0.11	0.13	0.11	0.10	0.10
C8	0.08	0.20	0.08	0.10	0.16	0.08	0.19	0.11	0.22	0.10	0.22	0.20	0.17	0.16	0.11	0.10	0.07	0.09	0.09	0.25	0.14	0.07	0.08
N1	0.14	0.12	0.16	0.16	0.12	0.16	0.12	0.13	0.12	0.13	0.12	0.12	0.12	0.13	0.12	0.21	0.19	0.12	0.12	0.13	0.11	0.11	0.11
N3	0.10	0.14	0.10	0.10	0.12	0.09	0.13	0.10	0.14	0.11	0.14	0.15	0.13	0.12	0.10	0.12	0.10	0.10	0.09	0.15	0.13	0.07	0.08
N6	0.16	0.11	0.21	0.21	0.11	0.19	0.12	0.17	0.12	0.12	0.11	0.12	0.12	0.13	0.12	0.28	0.26	0.15	0.15	0.13	0.12	0.12	0.13
N7	0.07	0.14	0.08	0.08	0.12	0.08	0.15	0.09	0.18	0.09	0.17	0.14	0.12	0.15	0.08	0.14	0.09	0.08	0.08	0.21	0.12	0.08	0.08
N9	0.09	0.20	0.09	0.12	0.16	0.10	0.17	0.13	0.20	0.09	0.22	0.21	0.18	0.13	0.11	0.10	0.09	0.10	0.10	0.22	0.16	0.07	0.09
O2'	0.14	0.28	0.16	0.19	0.20	0.14	0.19	0.17	0.24	0.14	0.28	0.30	0.24	0.15	0.15	0.14	0.19	0.13	0.12	0.23	0.16	0.12	0.11
O3'	0.18	0.29	0.19	0.23	0.20	0.21	0.18	0.24	0.24	0.13	0.29	0.32	0.25	0.12	0.16	0.18	0.23	0.20	0.23	0.25	0.27	0.26	0.24
O4'	0.11	0.25	0.12	0.15	0.18	0.13	0.18	0.18	0.23	0.08	0.26	0.27	0.22	0.12	0.12	0.10	0.13	0.13	0.15	0.25	0.23	0.09	0.14
O5'	0.13	0.28	0.14	0.17	0.21	0.14	0.23	0.17	0.29	0.13	0.31	0.29	0.24	0.18	0.15	0.10	0.14	0.14	0.14	0.33	0.20	0.09	0.13
OP1	0.14	0.29	0.15	0.17	0.24	0.14	0.27	0.17	0.32	0.17	0.32	0.30	0.25	0.23	0.18	0.11	0.14	0.15	0.14	0.35	0.18	0.09	0.13
OP2	0.16	0.28	0.16	0.18	0.23	0.17	0.25	0.20	0.31	0.18	0.31	0.29	0.25	0.22	0.19	0.14	0.16	0.18	0.18	0.34	0.23	0.18	0.18
P	0.13	0.29	0.14	0.17	0.23	0.13	0.25	0.17	0.31	0.15	0.32	0.30	0.25	0.20	0.17	0.10	0.14	0.14	0.13	0.34	0.19	0.09	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.03	0.01	0.05	0.06	0.03
C2	0.02	0.00	0.06	0.12	0.00	0.09	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.15	0.05	0.09	0.01	0.15	0.10	0.10
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.06	0.07	0.06	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.06	0.05	0.02
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.07	0.00	0.07	0.01	0.09	0.02	0.11	0.13	0.10	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.08	0.04	0.02
C4	0.01	0.00	0.04	0.07	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.07	0.03	0.05	0.01	0.10	0.07	0.06
C4'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.05	0.00	0.04	0.00	0.05	0.02	0.07	0.11	0.08	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.01	0.05	0.05	0.04	0.01
C5	0.01	0.00	0.04	0.07	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.07	0.02	0.05	0.01	0.10	0.08	0.06
C5'	0.01	0.11	0.01	0.01	0.06	0.00	0.06	0.00	0.08	0.04	0.10	0.13	0.09	0.05	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.08	0.06	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.09	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.10	0.03	0.06	0.00	0.12	0.10	0.08
C8	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.04	0.01	0.07	0.07	0.05
N1	0.02	0.00	0.06	0.11	0.01	0.07	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.13	0.04	0.08	0.01	0.14	0.11	0.09
N2	0.02	0.01	0.07	0.13	0.01	0.11	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.18	0.06	0.11	0.01	0.17	0.12	0.13
N3	0.02	0.00	0.06	0.10	0.00	0.08	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.12	0.05	0.08	0.01	0.12	0.09	0.08
N7	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.03	0.01	0.04	0.01	0.08	0.08	0.05
N9	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.07	0.06	0.04
O2'	0.02	0.07	0.00	0.01	0.03	0.04	0.03	0.04	0.05	0.03	0.06	0.09	0.06	0.03	0.02	0.00	0.03	0.03	0.06	0.05	0.07	0.10	0.06
O3'	0.02	0.15	0.01	0.00	0.07	0.02	0.07	0.03	0.10	0.01	0.13	0.18	0.12	0.03	0.02	0.03	0.00	0.02	0.04	0.10	0.09	0.08	0.05
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.06	0.05	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.03	0.05	0.05	0.03
O5'	0.03	0.09	0.02	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.06	0.04	0.08	0.11	0.08	0.04	0.03	0.06	0.04	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.10	0.03	0.06	0.00	0.12	0.11	0.08
OP1	0.05	0.15	0.06	0.08	0.10	0.05	0.10	0.06	0.12	0.07	0.14	0.17	0.12	0.08	0.07	0.07	0.09	0.05	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01
OP2	0.06	0.10	0.05	0.04	0.07	0.04	0.08	0.02	0.10	0.07	0.11	0.12	0.09	0.08	0.06	0.10	0.08	0.05	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01
P	0.03	0.10	0.02	0.02	0.06	0.01	0.06	0.01	0.08	0.05	0.09	0.13	0.08	0.05	0.04	0.06	0.05	0.03	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00