Doublet Group distance statistics: 53081

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 9, 12, 11, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.002, 0.007, 0.013, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.003, 0.011, 0.018, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.011 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.004, 0.011, 0.019, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.011 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.005, 0.013, 0.021, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.000, 0.010, 0.021, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.001, 0.013, 0.025, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.013 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.002, 0.015, 0.028, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.015 std_dev=0.013
N7	A	0, -0.001, 0.020, 0.041, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.020 std_dev=0.021
N6	A	0, 0.001, 0.023, 0.046, 0.128 max_d=0.128 avg_d=0.023 std_dev=0.022
C8	A	0, 0.000, 0.024, 0.049, 0.140 max_d=0.140 avg_d=0.024 std_dev=0.024
OP1	B	0, 0.140, 0.237, 0.333, 0.431 max_d=0.431 avg_d=0.237 std_dev=0.097
P	B	0, 0.110, 0.258, 0.406, 0.917 max_d=0.917 avg_d=0.258 std_dev=0.148
O5'	B	0, 0.103, 0.300, 0.498, 1.200 max_d=1.200 avg_d=0.300 std_dev=0.197
O3'	A	0, -0.091, 0.141, 0.374, 1.464 max_d=1.464 avg_d=0.141 std_dev=0.233
OP2	B	0, -0.005, 0.309, 0.624, 2.073 max_d=2.073 avg_d=0.309 std_dev=0.314
C3'	A	0, -0.180, 0.145, 0.469, 2.038 max_d=2.038 avg_d=0.145 std_dev=0.324
O4'	A	0, -0.267, 0.124, 0.514, 2.421 max_d=2.421 avg_d=0.124 std_dev=0.391
C2'	A	0, -0.270, 0.130, 0.531, 2.491 max_d=2.491 avg_d=0.130 std_dev=0.401
C4'	A	0, -0.286, 0.161, 0.608, 2.787 max_d=2.787 avg_d=0.161 std_dev=0.447
C5'	B	0, -0.176, 0.386, 0.948, 3.611 max_d=3.611 avg_d=0.386 std_dev=0.562
O3'	B	0, -0.174, 0.435, 1.043, 3.927 max_d=3.927 avg_d=0.435 std_dev=0.609
C3'	B	0, -0.212, 0.446, 1.104, 4.223 max_d=4.223 avg_d=0.446 std_dev=0.658
O2'	A	0, -0.483, 0.203, 0.890, 4.245 max_d=4.245 avg_d=0.203 std_dev=0.686
C4'	B	0, -0.265, 0.430, 1.125, 4.430 max_d=4.430 avg_d=0.430 std_dev=0.695
N2	B	0, -0.203, 0.576, 1.355, 4.967 max_d=4.967 avg_d=0.576 std_dev=0.779
O4'	B	0, -0.333, 0.492, 1.318, 5.237 max_d=5.237 avg_d=0.492 std_dev=0.826
C2	B	0, -0.250, 0.583, 1.416, 5.324 max_d=5.324 avg_d=0.583 std_dev=0.833
C2'	B	0, -0.324, 0.511, 1.347, 5.322 max_d=5.322 avg_d=0.511 std_dev=0.835
N3	B	0, -0.288, 0.549, 1.386, 5.349 max_d=5.349 avg_d=0.549 std_dev=0.837
C5'	A	0, -0.593, 0.297, 1.186, 5.542 max_d=5.542 avg_d=0.297 std_dev=0.890
O2'	B	0, -0.391, 0.547, 1.484, 5.950 max_d=5.950 avg_d=0.547 std_dev=0.937
C1'	B	0, -0.434, 0.541, 1.515, 6.168 max_d=6.168 avg_d=0.541 std_dev=0.974
N1	B	0, -0.351, 0.659, 1.669, 6.431 max_d=6.431 avg_d=0.659 std_dev=1.010
C4	B	0, -0.411, 0.603, 1.618, 6.457 max_d=6.457 avg_d=0.603 std_dev=1.015
O5'	A	0, -0.659, 0.366, 1.391, 6.403 max_d=6.403 avg_d=0.366 std_dev=1.025
N9	B	0, -0.482, 0.604, 1.691, 6.890 max_d=6.890 avg_d=0.604 std_dev=1.087
C5	B	0, -0.566, 0.694, 1.955, 7.995 max_d=7.995 avg_d=0.694 std_dev=1.261
C6	B	0, -0.547, 0.727, 2.001, 8.080 max_d=8.080 avg_d=0.727 std_dev=1.274
C8	B	0, -0.678, 0.697, 2.072, 8.687 max_d=8.687 avg_d=0.697 std_dev=1.375
P	A	0, -0.948, 0.457, 1.862, 8.740 max_d=8.740 avg_d=0.457 std_dev=1.405
OP2	A	0, -0.970, 0.494, 1.957, 9.119 max_d=9.119 avg_d=0.494 std_dev=1.463
N7	B	0, -0.752, 0.757, 2.266, 9.534 max_d=9.534 avg_d=0.757 std_dev=1.509
O6	B	0, -0.710, 0.811, 2.332, 9.617 max_d=9.617 avg_d=0.811 std_dev=1.521
OP1	A	0, -1.027, 0.547, 2.121, 9.808 max_d=9.808 avg_d=0.547 std_dev=1.574

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.09	0.11	0.09	0.05
C2	0.02	0.00	0.24	0.19	0.00	0.11	0.01	0.26	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.20	0.05	0.05	0.10	0.22	0.19	0.10
C2'	0.00	0.24	0.00	0.00	0.13	0.00	0.07	0.03	0.12	0.10	0.19	0.23	0.10	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.07	0.07	0.03
C3'	0.00	0.19	0.00	0.00	0.09	0.00	0.05	0.01	0.09	0.07	0.15	0.18	0.07	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.12	0.18	0.07	0.09
C4	0.01	0.00	0.13	0.09	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.11	0.03	0.03	0.13	0.24	0.11	0.10
C4'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.05	0.00	0.03	0.00	0.05	0.04	0.08	0.10	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.09	0.03
C5	0.01	0.01	0.07	0.05	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.03	0.02	0.20	0.33	0.11	0.16
C5'	0.02	0.26	0.03	0.01	0.11	0.00	0.07	0.00	0.11	0.12	0.20	0.24	0.09	0.09	0.04	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01
C6	0.01	0.01	0.12	0.09	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.03	0.03	0.18	0.36	0.13	0.16
C8	0.01	0.01	0.10	0.07	0.00	0.04	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.04	0.02	0.25	0.30	0.13	0.19
N1	0.01	0.00	0.19	0.15	0.01	0.08	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.04	0.04	0.12	0.30	0.17	0.11
N3	0.02	0.00	0.23	0.18	0.00	0.10	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.18	0.05	0.05	0.08	0.17	0.16	0.08
N6	0.01	0.01	0.10	0.07	0.01	0.03	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.03	0.03	0.22	0.42	0.13	0.20
N7	0.01	0.01	0.05	0.04	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.03	0.01	0.26	0.36	0.13	0.21
N9	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.01	0.16	0.22	0.10	0.11
O2'	0.01	0.20	0.00	0.01	0.11	0.01	0.08	0.02	0.12	0.08	0.17	0.18	0.10	0.04	0.03	0.00	0.04	0.01	0.06	0.12	0.07	0.06
O3'	0.03	0.05	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.04	0.04	0.05	0.03	0.03	0.03	0.04	0.00	0.04	0.15	0.25	0.12	0.13
O4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.05	0.03	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.14	0.16	0.10	0.08
O5'	0.09	0.10	0.03	0.12	0.13	0.01	0.20	0.00	0.18	0.25	0.12	0.08	0.22	0.26	0.16	0.06	0.15	0.14	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.11	0.22	0.07	0.18	0.24	0.05	0.33	0.01	0.36	0.30	0.30	0.17	0.42	0.36	0.22	0.12	0.25	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.19	0.07	0.07	0.11	0.09	0.11	0.04	0.13	0.13	0.17	0.16	0.13	0.13	0.10	0.07	0.12	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.10	0.03	0.09	0.10	0.03	0.16	0.01	0.16	0.19	0.11	0.08	0.20	0.21	0.11	0.06	0.13	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.30	0.09	0.08	0.11	0.08	0.34	0.08	0.24	0.62	0.10	0.58	0.23	0.65	0.28	0.08	0.10	0.11	0.12	0.39	0.11	0.10	0.13
C2	0.16	0.53	0.16	0.16	0.23	0.17	0.09	0.18	0.18	0.22	0.39	0.73	0.47	0.21	0.08	0.14	0.17	0.18	0.06	0.11	0.12	0.15	0.16
C2'	0.20	0.64	0.26	0.28	0.22	0.26	0.06	0.26	0.10	0.33	0.42	0.94	0.56	0.37	0.07	0.27	0.33	0.23	0.25	0.11	0.30	0.42	0.27
C3'	0.07	0.44	0.10	0.12	0.05	0.11	0.24	0.11	0.14	0.54	0.22	0.74	0.36	0.58	0.18	0.11	0.18	0.08	0.13	0.30	0.23	0.33	0.18
C4	0.09	0.44	0.12	0.13	0.11	0.12	0.12	0.12	0.07	0.37	0.26	0.68	0.38	0.39	0.08	0.13	0.17	0.11	0.07	0.16	0.10	0.08	0.14
C4'	0.30	0.09	0.27	0.25	0.31	0.21	0.56	0.20	0.47	0.82	0.15	0.36	0.04	0.88	0.47	0.24	0.22	0.24	0.18	0.63	0.10	0.10	0.14
C5	0.20	0.49	0.22	0.22	0.19	0.23	0.08	0.21	0.10	0.25	0.31	0.71	0.45	0.28	0.08	0.24	0.26	0.21	0.06	0.12	0.11	0.09	0.14
C5'	0.22	0.11	0.23	0.22	0.26	0.13	0.51	0.12	0.44	0.72	0.15	0.35	0.07	0.80	0.39	0.19	0.22	0.14	0.11	0.60	0.19	0.14	0.08
C6	0.31	0.56	0.30	0.30	0.30	0.32	0.14	0.30	0.20	0.13	0.40	0.75	0.53	0.15	0.19	0.32	0.32	0.31	0.07	0.13	0.12	0.15	0.15
C8	0.10	0.39	0.14	0.14	0.07	0.14	0.19	0.12	0.13	0.42	0.19	0.65	0.35	0.47	0.11	0.18	0.21	0.11	0.08	0.27	0.10	0.08	0.13
N1	0.30	0.58	0.28	0.27	0.32	0.30	0.18	0.31	0.25	0.11	0.45	0.76	0.55	0.11	0.20	0.27	0.27	0.30	0.07	0.18	0.12	0.19	0.16
N3	0.07	0.45	0.08	0.10	0.11	0.09	0.10	0.09	0.07	0.37	0.29	0.68	0.38	0.37	0.09	0.08	0.12	0.09	0.08	0.12	0.11	0.10	0.14
N6	0.41	0.60	0.41	0.39	0.38	0.42	0.23	0.38	0.27	0.13	0.45	0.76	0.58	0.13	0.29	0.44	0.42	0.41	0.10	0.19	0.12	0.18	0.16
N7	0.19	0.45	0.22	0.22	0.16	0.23	0.11	0.20	0.08	0.30	0.26	0.69	0.42	0.34	0.07	0.26	0.28	0.20	0.07	0.17	0.10	0.07	0.14
N9	0.06	0.37	0.08	0.09	0.05	0.08	0.22	0.07	0.14	0.48	0.18	0.64	0.32	0.51	0.16	0.10	0.15	0.07	0.09	0.27	0.10	0.08	0.13
O2'	0.32	0.84	0.41	0.43	0.39	0.37	0.16	0.35	0.27	0.22	0.61	1.16	0.74	0.24	0.19	0.41	0.48	0.33	0.36	0.14	0.34	0.54	0.37
O3'	0.22	0.31	0.15	0.13	0.16	0.14	0.41	0.14	0.28	0.73	0.11	0.64	0.22	0.76	0.36	0.14	0.13	0.19	0.09	0.44	0.10	0.21	0.07
O4'	0.35	0.07	0.31	0.30	0.36	0.27	0.59	0.27	0.50	0.85	0.20	0.30	0.08	0.89	0.51	0.28	0.25	0.31	0.31	0.64	0.21	0.16	0.30
O5'	0.53	0.20	0.56	0.55	0.55	0.44	0.78	0.42	0.69	1.01	0.40	0.11	0.26	1.07	0.69	0.52	0.55	0.43	0.37	0.83	0.14	0.18	0.28
OP1	1.05	0.79	1.11	1.09	1.12	0.92	1.33	0.86	1.25	1.52	0.97	0.54	0.84	1.59	1.23	1.06	1.08	0.90	0.77	1.37	0.36	0.48	0.59
OP2	0.66	0.49	0.68	0.64	0.78	0.50	1.03	0.46	0.99	1.18	0.71	0.27	0.51	1.30	0.87	0.60	0.60	0.53	0.39	1.16	0.14	0.18	0.28
P	0.76	0.53	0.80	0.77	0.85	0.62	1.09	0.58	1.02	1.27	0.74	0.29	0.57	1.36	0.95	0.74	0.75	0.62	0.51	1.18	0.19	0.27	0.38

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.11	0.01	0.06	0.15	0.09
C2	0.02	0.00	0.04	0.14	0.00	0.18	0.01	0.27	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.11	0.18	0.58	0.01	0.58	0.71	0.68
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.04	0.03	0.04	0.05	0.04	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.05	0.05	0.04	0.16	0.07
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.06	0.19	0.08	0.21	0.14	0.17	0.08	0.01	0.01	0.01	0.04	0.09	0.05	0.17	0.07
C4	0.01	0.00	0.03	0.04	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.05	0.09	0.29	0.01	0.22	0.34	0.30
C4'	0.01	0.18	0.01	0.00	0.05	0.00	0.03	0.00	0.04	0.18	0.12	0.25	0.18	0.14	0.05	0.04	0.01	0.00	0.01	0.03	0.08	0.09	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.10	0.04	0.18	0.01	0.12	0.22	0.18
C5'	0.02	0.27	0.02	0.01	0.06	0.00	0.09	0.00	0.05	0.32	0.16	0.40	0.25	0.27	0.10	0.04	0.02	0.01	0.00	0.08	0.07	0.11	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.04	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.09	0.08	0.29	0.01	0.25	0.35	0.32
C8	0.01	0.01	0.03	0.19	0.00	0.18	0.00	0.32	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.17	0.11	0.13	0.01	0.28	0.14	0.19
N1	0.01	0.00	0.04	0.08	0.01	0.12	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.07	0.14	0.47	0.00	0.47	0.58	0.55
N2	0.02	0.00	0.05	0.21	0.01	0.25	0.01	0.40	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.18	0.22	0.72	0.01	0.78	0.92	0.88
N3	0.02	0.00	0.04	0.14	0.00	0.18	0.01	0.25	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.11	0.18	0.52	0.01	0.48	0.61	0.58
N7	0.00	0.01	0.04	0.17	0.00	0.14	0.00	0.27	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.17	0.06	0.08	0.02	0.20	0.09	0.12
N9	0.00	0.01	0.02	0.08	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.07	0.01	0.10	0.01	0.07	0.14	0.08
O2'	0.02	0.11	0.00	0.01	0.04	0.04	0.04	0.04	0.04	0.10	0.07	0.15	0.10	0.09	0.04	0.00	0.03	0.05	0.05	0.05	0.11	0.10	0.06
O3'	0.01	0.11	0.01	0.01	0.05	0.01	0.10	0.02	0.09	0.17	0.07	0.18	0.11	0.17	0.07	0.03	0.00	0.01	0.14	0.12	0.11	0.14	0.10
O4'	0.00	0.18	0.01	0.01	0.09	0.00	0.04	0.01	0.08	0.11	0.14	0.22	0.18	0.06	0.01	0.05	0.01	0.00	0.14	0.07	0.07	0.14	0.10
O5'	0.11	0.58	0.05	0.04	0.29	0.01	0.18	0.00	0.29	0.13	0.47	0.72	0.52	0.08	0.10	0.05	0.14	0.14	0.00	0.23	0.02	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.12	0.07	0.23	0.00	0.20	0.29	0.25
OP1	0.06	0.58	0.04	0.05	0.22	0.08	0.12	0.07	0.25	0.28	0.47	0.78	0.48	0.20	0.07	0.11	0.11	0.07	0.02	0.20	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.71	0.16	0.17	0.34	0.09	0.22	0.11	0.35	0.14	0.58	0.92	0.61	0.09	0.14	0.10	0.14	0.14	0.01	0.29	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.68	0.07	0.07	0.30	0.02	0.18	0.01	0.32	0.19	0.55	0.88	0.58	0.12	0.08	0.06	0.10	0.10	0.00	0.25	0.01	0.01	0.00