Doublet Group distance statistics: 53087

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 5, 9, 2, 2, 2, 1, 1, 2, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.001, 0.005, 0.010, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.005 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.003, 0.007, 0.012, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.007 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.006, 0.012, 0.018, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.012 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.007, 0.014, 0.022, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.014 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.005, 0.012, 0.020, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.012 std_dev=0.008
N9	A	0, 0.006, 0.016, 0.025, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.016 std_dev=0.009
N6	A	0, 0.007, 0.022, 0.038, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.022 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.006, 0.024, 0.041, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.024 std_dev=0.018
C8	A	0, 0.008, 0.028, 0.049, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.028 std_dev=0.020
O4'	A	0, 0.008, 0.074, 0.140, 0.310 max_d=0.310 avg_d=0.074 std_dev=0.066
C2'	A	0, 0.026, 0.097, 0.168, 0.315 max_d=0.315 avg_d=0.097 std_dev=0.071
O2'	A	0, 0.050, 0.137, 0.225, 0.401 max_d=0.401 avg_d=0.137 std_dev=0.087
C4'	A	0, 0.028, 0.125, 0.222, 0.458 max_d=0.458 avg_d=0.125 std_dev=0.097
C3'	A	0, 0.045, 0.152, 0.260, 0.485 max_d=0.485 avg_d=0.152 std_dev=0.107
C5'	A	0, 0.038, 0.202, 0.365, 0.759 max_d=0.759 avg_d=0.202 std_dev=0.164
O3'	A	0, 0.069, 0.241, 0.412, 0.820 max_d=0.820 avg_d=0.241 std_dev=0.171
O4'	B	0, 0.069, 0.276, 0.483, 0.920 max_d=0.920 avg_d=0.276 std_dev=0.207
O5'	A	0, 0.040, 0.250, 0.460, 0.919 max_d=0.919 avg_d=0.250 std_dev=0.210
P	A	0, 0.098, 0.323, 0.548, 1.155 max_d=1.155 avg_d=0.323 std_dev=0.225
P	B	0, 0.093, 0.329, 0.565, 1.018 max_d=1.018 avg_d=0.329 std_dev=0.236
C4'	B	0, 0.080, 0.317, 0.555, 1.024 max_d=1.024 avg_d=0.317 std_dev=0.237
O5'	B	0, 0.052, 0.298, 0.544, 0.991 max_d=0.991 avg_d=0.298 std_dev=0.246
OP1	A	0, 0.117, 0.365, 0.613, 1.171 max_d=1.171 avg_d=0.365 std_dev=0.248
C5'	B	0, 0.053, 0.326, 0.600, 1.314 max_d=1.314 avg_d=0.326 std_dev=0.273
OP2	A	0, 0.133, 0.407, 0.680, 1.381 max_d=1.381 avg_d=0.407 std_dev=0.273
OP1	B	0, 0.106, 0.406, 0.706, 1.357 max_d=1.357 avg_d=0.406 std_dev=0.300
OP2	B	0, 0.127, 0.429, 0.731, 1.228 max_d=1.228 avg_d=0.429 std_dev=0.302
C1'	B	0, 0.044, 0.352, 0.661, 1.364 max_d=1.364 avg_d=0.352 std_dev=0.308
C4	B	0, 0.074, 0.399, 0.724, 1.339 max_d=1.339 avg_d=0.399 std_dev=0.325
C3'	B	0, 0.023, 0.414, 0.805, 1.764 max_d=1.764 avg_d=0.414 std_dev=0.391
C6	B	0, 0.035, 0.436, 0.837, 1.863 max_d=1.863 avg_d=0.436 std_dev=0.401
N9	B	0, -0.028, 0.383, 0.794, 1.973 max_d=1.973 avg_d=0.383 std_dev=0.411
C2'	B	0, -0.016, 0.438, 0.891, 2.154 max_d=2.154 avg_d=0.438 std_dev=0.454
O3'	B	0, 0.014, 0.479, 0.944, 1.994 max_d=1.994 avg_d=0.479 std_dev=0.465
C5	B	0, -0.063, 0.446, 0.954, 2.454 max_d=2.454 avg_d=0.446 std_dev=0.508
O2'	B	0, -0.015, 0.504, 1.023, 2.426 max_d=2.426 avg_d=0.504 std_dev=0.519
N1	B	0, 0.016, 0.569, 1.121, 2.262 max_d=2.262 avg_d=0.569 std_dev=0.552
O6	B	0, -0.107, 0.541, 1.189, 3.110 max_d=3.110 avg_d=0.541 std_dev=0.648
N3	B	0, -0.120, 0.641, 1.402, 3.252 max_d=3.252 avg_d=0.641 std_dev=0.761
C2	B	0, -0.195, 0.734, 1.663, 3.981 max_d=3.981 avg_d=0.734 std_dev=0.929
C8	B	0, -0.454, 0.545, 1.545, 4.356 max_d=4.356 avg_d=0.545 std_dev=0.999
N7	B	0, -0.501, 0.596, 1.693, 4.786 max_d=4.786 avg_d=0.596 std_dev=1.097
N2	B	0, -0.530, 1.024, 2.578, 6.535 max_d=6.535 avg_d=1.024 std_dev=1.554

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.08	0.10	0.05
C2	0.02	0.00	0.06	0.07	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.10	0.02	0.07	0.08	0.12	0.06
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.03	0.05	0.05	0.04	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.08	0.08	0.04
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.06	0.05	0.07	0.06	0.07	0.05	0.03	0.01	0.01	0.01	0.06	0.08	0.05	0.04
C4	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01	0.08	0.08	0.12	0.06
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.04	0.03	0.03	0.04	0.04	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.09	0.05	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.06	0.01	0.09	0.09	0.12	0.08
C5'	0.02	0.04	0.01	0.02	0.04	0.00	0.05	0.00	0.05	0.06	0.04	0.03	0.06	0.07	0.04	0.03	0.02	0.01	0.01	0.09	0.04	0.02
C6	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.09	0.09	0.12	0.08
C8	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.11	0.09	0.13	0.07
N1	0.01	0.00	0.05	0.07	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.08	0.09	0.12	0.07
N3	0.02	0.00	0.05	0.06	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.08	0.02	0.07	0.08	0.11	0.06
N6	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.10	0.10	0.12	0.08
N7	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.06	0.01	0.11	0.10	0.13	0.08
N9	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.08	0.08	0.11	0.06
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.03	0.03	0.03	0.03	0.04	0.02	0.05	0.05	0.04	0.02	0.01	0.00	0.03	0.03	0.03	0.09	0.07	0.04
O3'	0.01	0.10	0.02	0.01	0.06	0.01	0.06	0.02	0.08	0.05	0.09	0.08	0.09	0.06	0.03	0.03	0.00	0.01	0.09	0.10	0.05	0.05
O4'	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.08	0.08	0.10	0.05
O5'	0.07	0.07	0.04	0.06	0.08	0.01	0.09	0.01	0.09	0.11	0.08	0.07	0.10	0.11	0.08	0.03	0.09	0.08	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.08	0.08	0.08	0.08	0.08	0.09	0.09	0.09	0.09	0.09	0.09	0.08	0.10	0.10	0.08	0.09	0.10	0.08	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.12	0.08	0.05	0.12	0.05	0.12	0.04	0.12	0.13	0.12	0.11	0.12	0.13	0.11	0.07	0.05	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.06	0.04	0.04	0.06	0.02	0.08	0.02	0.08	0.07	0.07	0.06	0.08	0.08	0.06	0.04	0.05	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.64	0.19	0.12	0.24	0.13	0.16	0.17	0.15	0.47	0.40	0.90	0.59	0.49	0.13	0.31	0.14	0.13	0.11	0.18	0.07	0.10	0.06
C2	0.13	0.67	0.14	0.12	0.19	0.12	0.19	0.24	0.10	0.63	0.39	0.99	0.62	0.61	0.17	0.27	0.12	0.13	0.14	0.20	0.13	0.11	0.11
C2'	0.18	0.53	0.20	0.12	0.23	0.13	0.14	0.17	0.15	0.37	0.35	0.71	0.51	0.37	0.12	0.29	0.14	0.12	0.11	0.14	0.09	0.09	0.06
C3'	0.19	0.40	0.22	0.14	0.23	0.14	0.15	0.18	0.18	0.19	0.30	0.50	0.38	0.20	0.14	0.32	0.17	0.12	0.11	0.15	0.10	0.09	0.06
C4	0.16	0.64	0.20	0.12	0.22	0.14	0.15	0.21	0.11	0.51	0.38	0.91	0.60	0.51	0.12	0.35	0.15	0.12	0.14	0.17	0.10	0.09	0.08
C4'	0.16	0.45	0.19	0.12	0.21	0.13	0.15	0.17	0.17	0.27	0.32	0.61	0.42	0.30	0.12	0.29	0.15	0.11	0.11	0.17	0.08	0.10	0.05
C5	0.17	0.59	0.23	0.14	0.21	0.14	0.13	0.22	0.12	0.45	0.37	0.85	0.56	0.45	0.11	0.39	0.18	0.12	0.15	0.15	0.12	0.10	0.10
C5'	0.18	0.38	0.23	0.14	0.20	0.15	0.15	0.17	0.17	0.20	0.28	0.50	0.36	0.22	0.13	0.34	0.18	0.12	0.11	0.17	0.08	0.10	0.06
C6	0.15	0.59	0.20	0.13	0.20	0.13	0.14	0.24	0.10	0.48	0.36	0.86	0.55	0.48	0.11	0.37	0.17	0.11	0.16	0.15	0.14	0.11	0.11
C8	0.22	0.57	0.27	0.17	0.25	0.16	0.14	0.20	0.16	0.36	0.38	0.80	0.54	0.38	0.13	0.43	0.21	0.14	0.15	0.16	0.10	0.10	0.08
N1	0.13	0.63	0.16	0.12	0.19	0.13	0.16	0.24	0.10	0.56	0.37	0.93	0.58	0.55	0.14	0.31	0.13	0.12	0.16	0.18	0.15	0.12	0.12
N3	0.14	0.68	0.15	0.11	0.21	0.12	0.18	0.21	0.10	0.62	0.40	1.00	0.64	0.61	0.15	0.28	0.12	0.12	0.13	0.19	0.10	0.09	0.08
N6	0.15	0.56	0.22	0.13	0.19	0.13	0.12	0.24	0.10	0.44	0.34	0.82	0.52	0.44	0.11	0.39	0.18	0.11	0.17	0.14	0.16	0.12	0.12
N7	0.20	0.56	0.27	0.16	0.23	0.16	0.13	0.22	0.14	0.37	0.36	0.79	0.53	0.38	0.12	0.44	0.22	0.13	0.16	0.14	0.12	0.10	0.09
N9	0.19	0.62	0.22	0.14	0.24	0.15	0.14	0.20	0.14	0.45	0.39	0.87	0.58	0.46	0.12	0.37	0.17	0.13	0.13	0.16	0.09	0.09	0.07
O2'	0.15	0.59	0.15	0.11	0.24	0.13	0.16	0.15	0.15	0.47	0.38	0.79	0.56	0.46	0.14	0.21	0.12	0.13	0.13	0.16	0.10	0.11	0.08
O3'	0.15	0.28	0.19	0.12	0.20	0.12	0.16	0.17	0.19	0.11	0.24	0.32	0.26	0.11	0.15	0.25	0.15	0.11	0.13	0.18	0.13	0.09	0.08
O4'	0.17	0.59	0.19	0.12	0.23	0.13	0.16	0.17	0.17	0.41	0.39	0.83	0.54	0.43	0.12	0.31	0.14	0.12	0.11	0.19	0.07	0.11	0.06
O5'	0.18	0.38	0.24	0.15	0.21	0.15	0.16	0.19	0.18	0.22	0.28	0.51	0.36	0.24	0.14	0.35	0.19	0.14	0.11	0.17	0.08	0.11	0.07
OP1	0.24	0.35	0.31	0.21	0.25	0.18	0.20	0.18	0.23	0.15	0.30	0.42	0.34	0.16	0.20	0.41	0.25	0.16	0.14	0.21	0.10	0.14	0.10
OP2	0.22	0.38	0.30	0.22	0.22	0.21	0.16	0.26	0.18	0.19	0.28	0.49	0.36	0.20	0.17	0.44	0.27	0.18	0.16	0.17	0.15	0.14	0.13
P	0.20	0.37	0.27	0.18	0.21	0.17	0.15	0.21	0.18	0.18	0.28	0.49	0.35	0.20	0.15	0.39	0.22	0.15	0.12	0.16	0.09	0.11	0.08

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.05	0.10	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.11	0.02	0.13	0.08	0.08
C2	0.07	0.00	0.29	0.10	0.01	0.29	0.01	0.52	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.43	0.13	0.35	0.50	0.01	0.61	0.82	0.69
C2'	0.00	0.29	0.00	0.00	0.14	0.01	0.06	0.01	0.11	0.15	0.22	0.37	0.29	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01	0.14	0.06	0.19	0.14	0.14
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.07	0.01	0.07	0.01	0.08	0.11	0.09	0.11	0.10	0.11	0.05	0.01	0.01	0.02	0.18	0.08	0.24	0.14	0.17
C4	0.03	0.01	0.14	0.07	0.00	0.12	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.08	0.18	0.13	0.01	0.11	0.16	0.11
C4'	0.01	0.29	0.01	0.01	0.12	0.00	0.04	0.00	0.08	0.25	0.19	0.37	0.29	0.20	0.05	0.04	0.02	0.00	0.01	0.05	0.09	0.12	0.02
C5	0.01	0.01	0.06	0.07	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.09	0.05	0.33	0.02	0.31	0.31	0.32
C5'	0.02	0.52	0.01	0.01	0.16	0.00	0.10	0.00	0.11	0.48	0.33	0.71	0.49	0.41	0.11	0.05	0.05	0.01	0.01	0.10	0.09	0.18	0.02
C6	0.02	0.01	0.11	0.08	0.01	0.08	0.01	0.11	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.13	0.11	0.12	0.20	0.01	0.17	0.17	0.16
C8	0.03	0.01	0.15	0.11	0.01	0.25	0.02	0.48	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.22	0.07	0.24	0.79	0.06	0.77	0.81	0.83
N1	0.05	0.00	0.22	0.09	0.01	0.19	0.01	0.33	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.31	0.13	0.25	0.23	0.01	0.31	0.44	0.34
N2	0.10	0.00	0.37	0.11	0.01	0.37	0.01	0.71	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.56	0.15	0.42	0.78	0.02	0.97	1.26	1.08
N3	0.07	0.01	0.29	0.10	0.00	0.29	0.00	0.49	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.41	0.11	0.37	0.49	0.01	0.55	0.73	0.63
N7	0.01	0.01	0.09	0.11	0.01	0.20	0.01	0.41	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.16	0.09	0.16	0.75	0.06	0.76	0.85	0.83
N9	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.02	0.30	0.03	0.28	0.23	0.27
O2'	0.01	0.43	0.00	0.01	0.18	0.04	0.06	0.05	0.13	0.22	0.31	0.56	0.41	0.16	0.02	0.00	0.03	0.03	0.03	0.08	0.10	0.10	0.04
O3'	0.01	0.13	0.01	0.01	0.08	0.02	0.09	0.05	0.11	0.07	0.13	0.15	0.11	0.09	0.05	0.03	0.00	0.01	0.12	0.11	0.23	0.15	0.16
O4'	0.00	0.35	0.01	0.02	0.18	0.00	0.05	0.01	0.12	0.24	0.25	0.42	0.37	0.16	0.02	0.03	0.01	0.00	0.05	0.08	0.06	0.17	0.06
O5'	0.11	0.50	0.14	0.18	0.13	0.01	0.33	0.01	0.20	0.79	0.23	0.78	0.49	0.75	0.30	0.03	0.12	0.05	0.00	0.34	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.06	0.08	0.01	0.05	0.02	0.10	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.06	0.03	0.08	0.11	0.08	0.34	0.00	0.33	0.37	0.35
OP1	0.13	0.61	0.19	0.24	0.11	0.09	0.31	0.09	0.17	0.77	0.31	0.97	0.55	0.76	0.28	0.10	0.23	0.06	0.01	0.33	0.00	0.01	0.00
OP2	0.08	0.82	0.14	0.14	0.16	0.12	0.31	0.18	0.17	0.81	0.44	1.26	0.73	0.85	0.23	0.10	0.15	0.17	0.01	0.37	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.69	0.14	0.17	0.11	0.02	0.32	0.02	0.16	0.83	0.34	1.08	0.63	0.83	0.27	0.04	0.16	0.06	0.00	0.35	0.00	0.00	0.00