Doublet Group distance statistics: 53088

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 2, 8, 5, 1, 1, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.006, 0.010, 0.013, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.010 std_dev=0.003
C6	A	0, 0.008, 0.012, 0.016, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.012 std_dev=0.004
C1'	A	0, 0.010, 0.014, 0.019, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.014 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.006, 0.012, 0.017, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.012 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.010, 0.017, 0.023, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.017 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.015, 0.026, 0.037, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.026 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.019, 0.031, 0.043, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.031 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.014, 0.027, 0.040, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.027 std_dev=0.013
N6	A	0, 0.043, 0.064, 0.085, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.064 std_dev=0.021
C8	A	0, 0.029, 0.057, 0.086, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.057 std_dev=0.029
N7	A	0, 0.035, 0.064, 0.093, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.064 std_dev=0.029
O2'	A	0, 0.076, 0.149, 0.223, 0.296 max_d=0.296 avg_d=0.149 std_dev=0.073
C2'	A	0, 0.055, 0.141, 0.226, 0.322 max_d=0.322 avg_d=0.141 std_dev=0.086
O4'	A	0, 0.044, 0.133, 0.221, 0.334 max_d=0.334 avg_d=0.133 std_dev=0.089
C4'	A	0, 0.079, 0.221, 0.363, 0.537 max_d=0.537 avg_d=0.221 std_dev=0.142
C3'	A	0, 0.092, 0.236, 0.380, 0.538 max_d=0.538 avg_d=0.236 std_dev=0.144
OP2	B	0, 0.281, 0.446, 0.612, 0.802 max_d=0.802 avg_d=0.446 std_dev=0.165
P	B	0, 0.208, 0.398, 0.588, 0.774 max_d=0.774 avg_d=0.398 std_dev=0.190
O3'	A	0, 0.126, 0.324, 0.522, 0.740 max_d=0.740 avg_d=0.324 std_dev=0.198
C5'	A	0, 0.112, 0.344, 0.576, 0.889 max_d=0.889 avg_d=0.344 std_dev=0.232
OP1	B	0, 0.141, 0.457, 0.774, 1.208 max_d=1.208 avg_d=0.457 std_dev=0.317
O5'	B	0, 0.191, 0.537, 0.883, 1.303 max_d=1.303 avg_d=0.537 std_dev=0.346
C5'	B	0, 0.047, 0.679, 1.312, 2.081 max_d=2.081 avg_d=0.679 std_dev=0.633
C3'	B	0, 0.134, 0.788, 1.441, 2.221 max_d=2.221 avg_d=0.788 std_dev=0.654
O5'	A	0, -0.072, 0.658, 1.389, 2.295 max_d=2.295 avg_d=0.658 std_dev=0.730
C4'	B	0, -0.014, 0.855, 1.724, 2.803 max_d=2.803 avg_d=0.855 std_dev=0.869
O3'	B	0, -0.074, 0.980, 2.034, 3.363 max_d=3.363 avg_d=0.980 std_dev=1.054
OP1	A	0, -0.217, 0.894, 2.005, 3.509 max_d=3.509 avg_d=0.894 std_dev=1.111
P	A	0, -0.232, 0.887, 2.006, 3.433 max_d=3.433 avg_d=0.887 std_dev=1.119
O4'	B	0, -0.125, 1.020, 2.164, 3.595 max_d=3.595 avg_d=1.020 std_dev=1.145
OP2	A	0, -0.323, 0.986, 2.296, 3.986 max_d=3.986 avg_d=0.986 std_dev=1.310
C2'	B	0, -0.180, 1.147, 2.474, 4.128 max_d=4.128 avg_d=1.147 std_dev=1.327
C8	B	0, -0.250, 1.156, 2.561, 4.387 max_d=4.387 avg_d=1.156 std_dev=1.405
C1'	B	0, -0.245, 1.196, 2.637, 4.452 max_d=4.452 avg_d=1.196 std_dev=1.441
N9	B	0, -0.246, 1.219, 2.685, 4.536 max_d=4.536 avg_d=1.219 std_dev=1.466
N7	B	0, -0.310, 1.256, 2.821, 4.828 max_d=4.828 avg_d=1.256 std_dev=1.565
C4	B	0, -0.302, 1.369, 3.040, 5.127 max_d=5.127 avg_d=1.369 std_dev=1.671
C5	B	0, -0.343, 1.381, 3.105, 5.253 max_d=5.253 avg_d=1.381 std_dev=1.724
N3	B	0, -0.346, 1.514, 3.374, 5.715 max_d=5.715 avg_d=1.514 std_dev=1.860
C6	B	0, -0.439, 1.547, 3.532, 6.017 max_d=6.017 avg_d=1.547 std_dev=1.986
O2'	B	0, -0.559, 1.515, 3.590, 6.180 max_d=6.180 avg_d=1.515 std_dev=2.075
C2	B	0, -0.430, 1.666, 3.763, 6.405 max_d=6.405 avg_d=1.666 std_dev=2.096
O6	B	0, -0.505, 1.610, 3.725, 6.373 max_d=6.373 avg_d=1.610 std_dev=2.115
N1	B	0, -0.472, 1.679, 3.829, 6.536 max_d=6.536 avg_d=1.679 std_dev=2.151
N2	B	0, -0.500, 1.851, 4.201, 7.165 max_d=7.165 avg_d=1.851 std_dev=2.350

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.30	0.52	0.08	0.28
C2	0.01	0.00	0.06	0.08	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.09	0.03	0.53	0.79	0.21	0.62
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.05	0.06	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.16	0.23	0.05	0.14
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.07	0.05	0.08	0.07	0.07	0.05	0.03	0.01	0.01	0.01	0.09	0.08	0.13	0.10
C4	0.00	0.00	0.03	0.05	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.06	0.02	0.55	0.79	0.21	0.63
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.04	0.02	0.01	0.04	0.04	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.15	0.15	0.05
C5	0.01	0.00	0.02	0.05	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.07	0.02	0.66	0.92	0.36	0.81
C5'	0.02	0.04	0.01	0.02	0.05	0.00	0.06	0.00	0.06	0.07	0.05	0.03	0.08	0.08	0.05	0.03	0.05	0.02	0.01	0.13	0.07	0.01
C6	0.01	0.00	0.03	0.07	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.09	0.02	0.68	0.95	0.40	0.85
C8	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.06	0.02	0.66	0.89	0.31	0.76
N1	0.01	0.00	0.05	0.08	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.10	0.02	0.62	0.89	0.32	0.76
N3	0.01	0.00	0.06	0.07	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.07	0.03	0.47	0.72	0.14	0.52
N6	0.01	0.00	0.03	0.07	0.00	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.10	0.02	0.73	1.02	0.49	0.95
N7	0.01	0.00	0.02	0.05	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.07	0.02	0.72	0.99	0.43	0.90
N9	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.52	0.74	0.16	0.56
O2'	0.02	0.05	0.00	0.01	0.03	0.03	0.02	0.03	0.03	0.02	0.04	0.05	0.02	0.02	0.01	0.00	0.06	0.03	0.02	0.10	0.16	0.08
O3'	0.02	0.09	0.02	0.01	0.06	0.01	0.07	0.05	0.09	0.06	0.10	0.07	0.10	0.07	0.03	0.06	0.00	0.01	0.15	0.25	0.15	0.14
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.24	0.51	0.19	0.19
O5'	0.30	0.53	0.16	0.09	0.55	0.01	0.66	0.01	0.68	0.66	0.62	0.47	0.73	0.72	0.52	0.02	0.15	0.24	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.52	0.79	0.23	0.08	0.79	0.15	0.92	0.13	0.95	0.89	0.89	0.72	1.02	0.99	0.74	0.10	0.25	0.51	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.08	0.21	0.05	0.13	0.21	0.15	0.36	0.07	0.40	0.31	0.32	0.14	0.49	0.43	0.16	0.16	0.15	0.19	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.28	0.62	0.14	0.10	0.63	0.05	0.81	0.01	0.85	0.76	0.76	0.52	0.95	0.90	0.56	0.08	0.14	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.73	0.45	0.17	0.59	0.26	0.71	0.33	0.85	0.47	0.84	0.74	0.60	0.65	0.43	0.38	0.56	0.13	0.15	0.96	0.18	0.13	0.15
C2	0.27	0.13	0.08	0.39	0.11	0.54	0.14	0.54	0.19	0.13	0.17	0.12	0.11	0.13	0.15	0.21	0.78	0.49	0.29	0.24	0.11	0.10	0.21
C2'	0.31	0.86	0.51	0.08	0.68	0.13	0.78	0.19	0.93	0.49	0.95	0.90	0.73	0.67	0.49	0.44	0.39	0.10	0.08	1.02	0.11	0.14	0.08
C3'	0.30	0.91	0.50	0.09	0.70	0.14	0.81	0.19	0.98	0.49	1.01	0.96	0.75	0.69	0.49	0.41	0.40	0.10	0.08	1.09	0.11	0.14	0.07
C4	0.14	0.32	0.17	0.33	0.24	0.46	0.34	0.48	0.44	0.17	0.42	0.32	0.23	0.31	0.13	0.08	0.74	0.38	0.24	0.53	0.13	0.10	0.18
C4'	0.33	0.95	0.53	0.12	0.75	0.18	0.89	0.26	1.07	0.58	1.08	0.98	0.79	0.79	0.55	0.48	0.49	0.10	0.11	1.20	0.17	0.14	0.11
C5	0.29	0.16	0.08	0.42	0.11	0.59	0.20	0.57	0.29	0.11	0.26	0.15	0.10	0.19	0.13	0.26	0.85	0.54	0.29	0.39	0.12	0.10	0.20
C5'	0.27	0.91	0.46	0.18	0.71	0.26	0.86	0.33	1.06	0.54	1.06	0.94	0.74	0.77	0.50	0.39	0.57	0.12	0.15	1.20	0.19	0.13	0.14
C6	0.46	0.15	0.19	0.51	0.19	0.70	0.13	0.64	0.13	0.21	0.12	0.16	0.21	0.13	0.28	0.47	0.93	0.68	0.34	0.20	0.12	0.10	0.22
C8	0.13	0.40	0.19	0.33	0.29	0.48	0.43	0.49	0.56	0.22	0.53	0.40	0.28	0.40	0.16	0.09	0.76	0.38	0.24	0.68	0.15	0.10	0.18
N1	0.46	0.18	0.19	0.50	0.23	0.69	0.16	0.64	0.13	0.25	0.13	0.19	0.24	0.17	0.31	0.46	0.91	0.68	0.35	0.15	0.13	0.11	0.23
N3	0.11	0.33	0.22	0.29	0.25	0.41	0.33	0.44	0.41	0.18	0.40	0.33	0.25	0.29	0.15	0.10	0.68	0.32	0.23	0.48	0.13	0.10	0.18
N6	0.61	0.29	0.33	0.58	0.33	0.80	0.22	0.70	0.16	0.32	0.19	0.32	0.37	0.20	0.42	0.67	1.01	0.81	0.38	0.14	0.13	0.11	0.23
N7	0.27	0.22	0.09	0.42	0.14	0.58	0.26	0.57	0.38	0.11	0.34	0.21	0.13	0.25	0.11	0.23	0.85	0.52	0.28	0.49	0.13	0.10	0.20
N9	0.10	0.49	0.28	0.27	0.38	0.40	0.50	0.43	0.63	0.29	0.61	0.50	0.38	0.46	0.24	0.15	0.68	0.28	0.21	0.73	0.16	0.11	0.17
O2'	0.46	1.05	0.65	0.07	0.85	0.07	0.94	0.12	1.10	0.63	1.14	1.09	0.91	0.82	0.65	0.64	0.30	0.20	0.07	1.19	0.12	0.14	0.07
O3'	0.36	1.03	0.54	0.06	0.78	0.07	0.86	0.11	1.06	0.51	1.12	1.10	0.86	0.70	0.55	0.48	0.29	0.15	0.07	1.15	0.12	0.12	0.07
O4'	0.27	0.81	0.47	0.19	0.66	0.28	0.80	0.36	0.96	0.54	0.94	0.82	0.66	0.74	0.48	0.42	0.60	0.13	0.16	1.09	0.24	0.14	0.17
O5'	0.49	1.01	0.73	0.19	0.84	0.14	0.93	0.10	1.08	0.67	1.10	1.05	0.88	0.83	0.66	0.65	0.20	0.25	0.22	1.17	0.31	0.34	0.23
OP1	0.66	1.12	0.97	0.43	0.98	0.31	1.09	0.28	1.22	0.87	1.22	1.15	1.00	1.02	0.83	0.89	0.09	0.38	0.45	1.32	0.58	0.59	0.46
OP2	0.27	0.86	0.42	0.20	0.65	0.22	0.76	0.26	0.94	0.46	0.97	0.91	0.70	0.64	0.45	0.34	0.61	0.13	0.15	1.05	0.19	0.08	0.14
P	0.50	0.99	0.74	0.20	0.82	0.16	0.90	0.13	1.04	0.66	1.07	1.04	0.87	0.80	0.66	0.66	0.20	0.26	0.23	1.12	0.33	0.33	0.24

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01	0.27	0.01	0.18	0.01	0.16	0.40	0.27
C2	0.02	0.00	0.38	0.28	0.00	0.06	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.20	0.08	0.24	0.11	0.01	0.19	0.41	0.32
C2'	0.00	0.38	0.00	0.00	0.21	0.01	0.10	0.18	0.18	0.17	0.30	0.46	0.37	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01	0.41	0.13	0.33	0.61	0.46
C3'	0.01	0.28	0.00	0.00	0.28	0.00	0.35	0.01	0.37	0.28	0.34	0.26	0.23	0.35	0.22	0.02	0.01	0.02	0.03	0.40	0.14	0.04	0.04
C4	0.01	0.00	0.21	0.28	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.03	0.13	0.09	0.01	0.17	0.40	0.28
C4'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.02	0.00	0.10	0.00	0.07	0.20	0.01	0.11	0.08	0.19	0.08	0.27	0.02	0.00	0.01	0.11	0.08	0.07	0.02
C5	0.00	0.00	0.10	0.35	0.00	0.10	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.22	0.12	0.04	0.08	0.01	0.14	0.34	0.22
C5'	0.07	0.14	0.18	0.01	0.07	0.00	0.05	0.00	0.05	0.14	0.08	0.19	0.16	0.14	0.03	0.09	0.18	0.01	0.00	0.07	0.07	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.18	0.37	0.00	0.07	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.17	0.13	0.09	0.09	0.00	0.14	0.32	0.22
C8	0.01	0.01	0.17	0.28	0.00	0.20	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.41	0.14	0.16	0.11	0.01	0.12	0.33	0.16
N1	0.01	0.00	0.30	0.34	0.01	0.01	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.06	0.17	0.07	0.01	0.16	0.36	0.28
N2	0.03	0.00	0.46	0.26	0.01	0.11	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.36	0.14	0.28	0.14	0.01	0.20	0.42	0.35
N3	0.02	0.00	0.37	0.23	0.00	0.08	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.23	0.13	0.24	0.14	0.01	0.20	0.43	0.34
N7	0.00	0.00	0.08	0.35	0.00	0.19	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.41	0.19	0.09	0.15	0.01	0.12	0.29	0.15
N9	0.00	0.01	0.02	0.22	0.00	0.08	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.17	0.04	0.00	0.09	0.01	0.15	0.39	0.25
O2'	0.01	0.20	0.00	0.02	0.05	0.27	0.22	0.09	0.17	0.41	0.05	0.36	0.23	0.41	0.17	0.00	0.02	0.18	0.29	0.25	0.19	0.64	0.35
O3'	0.27	0.08	0.01	0.01	0.03	0.02	0.12	0.18	0.13	0.14	0.06	0.14	0.13	0.19	0.04	0.02	0.00	0.20	0.21	0.19	0.54	0.23	0.30
O4'	0.01	0.24	0.01	0.02	0.13	0.00	0.04	0.01	0.09	0.16	0.17	0.28	0.24	0.09	0.00	0.18	0.20	0.00	0.04	0.06	0.03	0.20	0.12
O5'	0.18	0.11	0.41	0.03	0.09	0.01	0.08	0.00	0.09	0.11	0.07	0.14	0.14	0.15	0.09	0.29	0.21	0.04	0.00	0.12	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.13	0.40	0.01	0.11	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.25	0.19	0.06	0.12	0.00	0.14	0.28	0.19
OP1	0.16	0.19	0.33	0.14	0.17	0.08	0.14	0.07	0.14	0.12	0.16	0.20	0.20	0.12	0.15	0.19	0.54	0.03	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00
OP2	0.40	0.41	0.61	0.04	0.40	0.07	0.34	0.02	0.32	0.33	0.36	0.42	0.43	0.29	0.39	0.64	0.23	0.20	0.02	0.28	0.01	0.00	0.00
P	0.27	0.32	0.46	0.04	0.28	0.02	0.22	0.01	0.22	0.16	0.28	0.35	0.34	0.15	0.25	0.35	0.30	0.12	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00