Doublet Group distance statistics: 53092

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 1, 0, 2, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.005, 0.009, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.005 std_dev=0.003
N3	A	0, 0.006, 0.014, 0.021, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.014 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.004, 0.012, 0.021, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.003, 0.012, 0.022, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.002, 0.011, 0.021, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.011 std_dev=0.010
C2	A	0, -0.001, 0.009, 0.020, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.009 std_dev=0.011
C1'	A	0, -0.001, 0.010, 0.021, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.010 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.002, 0.014, 0.027, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.014 std_dev=0.012
N6	A	0, 0.008, 0.022, 0.035, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.022 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.003, 0.019, 0.035, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.019 std_dev=0.016
C8	A	0, 0.002, 0.021, 0.039, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.021 std_dev=0.018
O4'	A	0, 0.049, 0.107, 0.164, 0.171 max_d=0.171 avg_d=0.107 std_dev=0.058
C2'	A	0, 0.056, 0.118, 0.181, 0.190 max_d=0.190 avg_d=0.118 std_dev=0.063
OP1	B	0, 0.083, 0.215, 0.347, 0.426 max_d=0.426 avg_d=0.215 std_dev=0.132
O2'	A	0, 0.043, 0.198, 0.352, 0.514 max_d=0.514 avg_d=0.198 std_dev=0.154
C3'	A	0, 0.134, 0.298, 0.463, 0.486 max_d=0.486 avg_d=0.298 std_dev=0.164
C4'	A	0, 0.131, 0.344, 0.557, 0.582 max_d=0.582 avg_d=0.344 std_dev=0.213
O3'	A	0, 0.173, 0.395, 0.618, 0.695 max_d=0.695 avg_d=0.395 std_dev=0.223
P	B	0, 0.081, 0.326, 0.571, 0.792 max_d=0.792 avg_d=0.326 std_dev=0.245
N2	B	0, 0.202, 0.448, 0.695, 0.853 max_d=0.853 avg_d=0.448 std_dev=0.246
C2	B	0, 0.173, 0.437, 0.701, 0.832 max_d=0.832 avg_d=0.437 std_dev=0.264
N3	B	0, 0.141, 0.420, 0.699, 0.751 max_d=0.751 avg_d=0.420 std_dev=0.279
N1	B	0, 0.170, 0.459, 0.749, 0.923 max_d=0.923 avg_d=0.459 std_dev=0.290
C1'	B	0, 0.121, 0.412, 0.704, 0.711 max_d=0.711 avg_d=0.412 std_dev=0.291
C4	B	0, 0.128, 0.427, 0.727, 0.775 max_d=0.775 avg_d=0.427 std_dev=0.299
N9	B	0, 0.133, 0.437, 0.740, 0.755 max_d=0.755 avg_d=0.437 std_dev=0.304
C8	B	0, 0.174, 0.485, 0.796, 0.883 max_d=0.883 avg_d=0.485 std_dev=0.311
C5	B	0, 0.143, 0.456, 0.770, 0.860 max_d=0.860 avg_d=0.456 std_dev=0.314
C6	B	0, 0.158, 0.474, 0.791, 0.938 max_d=0.938 avg_d=0.474 std_dev=0.317
N7	B	0, 0.162, 0.490, 0.818, 0.927 max_d=0.927 avg_d=0.490 std_dev=0.328
O6	B	0, 0.173, 0.523, 0.873, 1.029 max_d=1.029 avg_d=0.523 std_dev=0.350
OP2	B	0, 0.182, 0.532, 0.882, 1.071 max_d=1.071 avg_d=0.532 std_dev=0.350
O4'	B	0, 0.137, 0.489, 0.840, 0.903 max_d=0.903 avg_d=0.489 std_dev=0.351
O5'	B	0, 0.090, 0.452, 0.814, 1.153 max_d=1.153 avg_d=0.452 std_dev=0.362
C5'	B	0, 0.168, 0.546, 0.923, 1.011 max_d=1.011 avg_d=0.546 std_dev=0.378
C5'	A	0, 0.212, 0.601, 0.989, 0.999 max_d=0.999 avg_d=0.601 std_dev=0.389
C2'	B	0, 0.131, 0.550, 0.970, 1.235 max_d=1.235 avg_d=0.550 std_dev=0.420
O5'	A	0, 0.220, 0.649, 1.079, 1.052 max_d=1.052 avg_d=0.649 std_dev=0.430
C4'	B	0, 0.156, 0.624, 1.093, 1.102 max_d=1.102 avg_d=0.624 std_dev=0.468
O2'	B	0, 0.167, 0.681, 1.195, 1.531 max_d=1.531 avg_d=0.681 std_dev=0.514
C3'	B	0, 0.203, 0.841, 1.479, 1.531 max_d=1.531 avg_d=0.841 std_dev=0.638
P	A	0, 0.242, 0.918, 1.594, 1.679 max_d=1.679 avg_d=0.918 std_dev=0.676
OP2	A	0, 0.244, 1.104, 1.964, 2.138 max_d=2.138 avg_d=1.104 std_dev=0.860
OP1	A	0, 0.300, 1.323, 2.346, 2.423 max_d=2.423 avg_d=1.323 std_dev=1.023
O3'	B	0, 0.180, 1.203, 2.226, 2.335 max_d=2.335 avg_d=1.203 std_dev=1.023

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.10	0.09	0.21	0.12
C2	0.02	0.00	0.09	0.09	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.13	0.11	0.02	0.23	0.28	0.50	0.31
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.04	0.05	0.07	0.09	0.02	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.08	0.08	0.05
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.07	0.01	0.08	0.01	0.09	0.09	0.09	0.08	0.09	0.10	0.05	0.02	0.00	0.01	0.06	0.09	0.09	0.06
C4	0.01	0.00	0.04	0.07	0.00	0.03	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.06	0.01	0.23	0.27	0.47	0.31
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.06	0.00	0.06	0.09	0.04	0.03	0.08	0.09	0.04	0.05	0.02	0.00	0.01	0.10	0.03	0.01
C5	0.00	0.01	0.02	0.08	0.00	0.06	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.08	0.02	0.28	0.39	0.59	0.40
C5'	0.02	0.08	0.01	0.01	0.10	0.00	0.15	0.00	0.15	0.17	0.12	0.06	0.19	0.19	0.10	0.05	0.03	0.01	0.01	0.11	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.06	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.09	0.02	0.30	0.43	0.64	0.43
C8	0.02	0.00	0.05	0.09	0.00	0.09	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.10	0.04	0.27	0.34	0.50	0.36
N1	0.02	0.00	0.07	0.09	0.01	0.04	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.11	0.10	0.01	0.27	0.37	0.59	0.38
N3	0.02	0.00	0.09	0.08	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.12	0.10	0.02	0.20	0.22	0.43	0.26
N6	0.01	0.01	0.02	0.09	0.01	0.08	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.10	0.03	0.32	0.52	0.71	0.49
N7	0.01	0.01	0.03	0.10	0.01	0.09	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.11	0.04	0.31	0.45	0.63	0.44
N9	0.00	0.00	0.01	0.05	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.20	0.22	0.38	0.26
O2'	0.01	0.13	0.00	0.02	0.06	0.05	0.04	0.05	0.07	0.03	0.11	0.12	0.06	0.02	0.01	0.00	0.02	0.04	0.05	0.11	0.06	0.05
O3'	0.01	0.11	0.02	0.00	0.06	0.02	0.08	0.03	0.09	0.10	0.10	0.10	0.10	0.11	0.05	0.02	0.00	0.01	0.14	0.18	0.23	0.16
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.03	0.04	0.01	0.04	0.01	0.00	0.09	0.08	0.16	0.09
O5'	0.10	0.23	0.04	0.06	0.23	0.01	0.28	0.01	0.30	0.27	0.27	0.20	0.32	0.31	0.20	0.05	0.14	0.09	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.09	0.28	0.08	0.09	0.27	0.10	0.39	0.11	0.43	0.34	0.37	0.22	0.52	0.45	0.22	0.11	0.18	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.21	0.50	0.08	0.09	0.47	0.03	0.59	0.02	0.64	0.50	0.59	0.43	0.71	0.63	0.38	0.06	0.23	0.16	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.31	0.05	0.06	0.31	0.01	0.40	0.01	0.43	0.36	0.38	0.26	0.49	0.44	0.26	0.05	0.16	0.09	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.18	0.18	0.31	0.21	0.40	0.24	0.41	0.23	0.25	0.21	0.15	0.18	0.25	0.22	0.25	0.69	0.30	0.19	0.24	0.08	0.39	0.16
C2	0.18	0.18	0.20	0.11	0.10	0.16	0.08	0.24	0.08	0.22	0.18	0.24	0.11	0.18	0.18	0.17	0.22	0.18	0.14	0.08	0.08	0.34	0.10
C2'	0.13	0.14	0.14	0.32	0.14	0.39	0.16	0.39	0.16	0.17	0.16	0.16	0.13	0.17	0.15	0.28	0.68	0.24	0.16	0.17	0.16	0.32	0.13
C3'	0.15	0.19	0.16	0.34	0.18	0.40	0.18	0.39	0.19	0.18	0.20	0.21	0.18	0.19	0.17	0.28	0.72	0.26	0.16	0.20	0.20	0.33	0.15
C4	0.18	0.11	0.19	0.15	0.17	0.27	0.20	0.33	0.16	0.25	0.12	0.17	0.10	0.25	0.21	0.21	0.42	0.21	0.14	0.17	0.08	0.35	0.12
C4'	0.24	0.30	0.22	0.40	0.29	0.45	0.29	0.42	0.30	0.28	0.30	0.30	0.29	0.29	0.28	0.29	0.83	0.35	0.21	0.30	0.11	0.37	0.15
C5	0.20	0.16	0.20	0.12	0.20	0.21	0.24	0.28	0.21	0.28	0.18	0.20	0.14	0.29	0.23	0.22	0.30	0.18	0.13	0.23	0.09	0.28	0.09
C5'	0.25	0.31	0.23	0.39	0.29	0.44	0.28	0.41	0.29	0.28	0.30	0.32	0.29	0.28	0.28	0.30	0.84	0.35	0.18	0.29	0.14	0.37	0.14
C6	0.22	0.20	0.20	0.15	0.20	0.14	0.23	0.20	0.21	0.29	0.23	0.25	0.17	0.29	0.24	0.22	0.16	0.18	0.16	0.21	0.10	0.22	0.08
C8	0.19	0.15	0.19	0.17	0.21	0.30	0.26	0.36	0.27	0.27	0.21	0.13	0.15	0.30	0.23	0.24	0.49	0.23	0.13	0.30	0.08	0.33	0.12
N1	0.22	0.22	0.20	0.17	0.17	0.12	0.17	0.17	0.17	0.26	0.24	0.26	0.16	0.23	0.22	0.21	0.12	0.19	0.17	0.15	0.09	0.24	0.08
N3	0.17	0.11	0.20	0.16	0.13	0.27	0.14	0.33	0.08	0.22	0.10	0.19	0.06	0.20	0.19	0.17	0.40	0.21	0.15	0.09	0.07	0.39	0.15
N6	0.24	0.23	0.21	0.22	0.23	0.11	0.27	0.15	0.27	0.32	0.27	0.27	0.20	0.33	0.27	0.24	0.12	0.19	0.20	0.30	0.11	0.14	0.11
N7	0.20	0.16	0.20	0.12	0.22	0.24	0.27	0.30	0.27	0.29	0.21	0.17	0.15	0.31	0.24	0.24	0.36	0.20	0.12	0.31	0.09	0.28	0.09
N9	0.18	0.13	0.18	0.22	0.20	0.33	0.23	0.38	0.22	0.25	0.18	0.12	0.14	0.26	0.22	0.23	0.54	0.25	0.16	0.24	0.08	0.37	0.14
O2'	0.17	0.17	0.16	0.38	0.18	0.41	0.19	0.37	0.18	0.20	0.18	0.18	0.17	0.20	0.19	0.36	0.76	0.27	0.15	0.19	0.19	0.28	0.08
O3'	0.14	0.20	0.15	0.37	0.17	0.40	0.17	0.38	0.18	0.16	0.20	0.23	0.18	0.16	0.16	0.33	0.74	0.24	0.17	0.19	0.25	0.30	0.15
O4'	0.23	0.28	0.21	0.35	0.29	0.42	0.31	0.43	0.32	0.30	0.31	0.25	0.26	0.32	0.28	0.27	0.77	0.34	0.22	0.33	0.07	0.42	0.18
O5'	0.15	0.17	0.14	0.24	0.17	0.33	0.19	0.36	0.20	0.19	0.19	0.18	0.16	0.20	0.17	0.30	0.64	0.22	0.13	0.23	0.28	0.34	0.21
OP1	0.21	0.22	0.19	0.29	0.20	0.36	0.19	0.34	0.19	0.20	0.18	0.27	0.23	0.20	0.21	0.32	0.74	0.26	0.10	0.21	0.34	0.34	0.23
OP2	0.27	0.25	0.28	0.30	0.29	0.37	0.35	0.45	0.38	0.34	0.33	0.20	0.23	0.38	0.29	0.37	0.50	0.28	0.36	0.43	0.51	0.60	0.49
P	0.12	0.10	0.12	0.22	0.12	0.33	0.15	0.38	0.16	0.16	0.13	0.12	0.09	0.18	0.13	0.27	0.63	0.22	0.19	0.20	0.34	0.43	0.29

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.08	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.02	0.28	0.00	0.12	0.01	0.06	0.38	0.17
C2	0.03	0.00	0.08	0.06	0.00	0.18	0.01	0.26	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.42	0.18	0.23	0.02	0.21	0.50	0.26
C2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.02	0.02	0.05	0.23	0.03	0.13	0.04	0.11	0.08	0.11	0.04	0.00	0.02	0.01	0.42	0.05	0.43	0.62	0.48
C3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.11	0.01	0.19	0.02	0.17	0.31	0.10	0.09	0.06	0.29	0.16	0.01	0.00	0.02	0.07	0.21	0.03	0.08	0.06
C4	0.02	0.00	0.02	0.11	0.00	0.10	0.01	0.21	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.24	0.11	0.20	0.01	0.16	0.48	0.22
C4'	0.00	0.18	0.02	0.01	0.10	0.00	0.10	0.01	0.11	0.14	0.14	0.21	0.17	0.13	0.06	0.25	0.01	0.00	0.01	0.11	0.15	0.07	0.02
C5	0.02	0.01	0.05	0.19	0.01	0.10	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.24	0.13	0.07	0.25	0.01	0.22	0.50	0.25
C5'	0.08	0.26	0.23	0.02	0.21	0.01	0.21	0.00	0.23	0.14	0.25	0.28	0.24	0.18	0.12	0.06	0.19	0.02	0.00	0.23	0.19	0.04	0.01
C6	0.01	0.02	0.03	0.17	0.00	0.11	0.01	0.23	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.21	0.17	0.10	0.28	0.00	0.26	0.51	0.29
C8	0.02	0.01	0.13	0.31	0.00	0.14	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.38	0.17	0.06	0.17	0.01	0.17	0.45	0.18
N1	0.02	0.01	0.04	0.10	0.01	0.14	0.01	0.25	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.13	0.30	0.14	0.27	0.01	0.25	0.51	0.29
N2	0.03	0.00	0.11	0.09	0.00	0.21	0.01	0.28	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.23	0.53	0.21	0.23	0.03	0.21	0.50	0.26
N3	0.03	0.01	0.08	0.06	0.01	0.17	0.02	0.24	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.14	0.43	0.19	0.20	0.01	0.15	0.47	0.23
N7	0.02	0.01	0.11	0.29	0.01	0.13	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.38	0.16	0.04	0.24	0.01	0.23	0.48	0.23
N9	0.01	0.01	0.04	0.16	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.18	0.13	0.01	0.14	0.00	0.10	0.43	0.16
O2'	0.02	0.14	0.00	0.01	0.12	0.25	0.24	0.06	0.21	0.38	0.13	0.23	0.14	0.38	0.18	0.00	0.05	0.21	0.37	0.27	0.39	0.76	0.48
O3'	0.28	0.42	0.02	0.00	0.24	0.01	0.13	0.19	0.17	0.17	0.30	0.53	0.43	0.16	0.13	0.05	0.00	0.24	0.20	0.12	0.30	0.28	0.23
O4'	0.00	0.18	0.01	0.02	0.11	0.00	0.07	0.02	0.10	0.06	0.14	0.21	0.19	0.04	0.01	0.21	0.24	0.00	0.08	0.08	0.21	0.18	0.08
O5'	0.12	0.23	0.42	0.07	0.20	0.01	0.25	0.00	0.28	0.17	0.27	0.23	0.20	0.24	0.14	0.37	0.20	0.08	0.00	0.30	0.02	0.01	0.00
O6	0.01	0.02	0.05	0.21	0.01	0.11	0.01	0.23	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.27	0.12	0.08	0.30	0.00	0.30	0.52	0.32
OP1	0.06	0.21	0.43	0.03	0.16	0.15	0.22	0.19	0.26	0.17	0.25	0.21	0.15	0.23	0.10	0.39	0.30	0.21	0.02	0.30	0.00	0.00	0.00
OP2	0.38	0.50	0.62	0.08	0.48	0.07	0.50	0.04	0.51	0.45	0.51	0.50	0.47	0.48	0.43	0.76	0.28	0.18	0.01	0.52	0.00	0.00	0.00
P	0.17	0.26	0.48	0.06	0.22	0.02	0.25	0.01	0.29	0.18	0.29	0.26	0.23	0.23	0.16	0.48	0.23	0.08	0.00	0.32	0.00	0.00	0.00