Doublet Group distance statistics: 53093

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.002, 0.010, 0.017, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.003, 0.012, 0.021, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.006, 0.016, 0.026, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.016 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.009, 0.020, 0.031, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.020 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.003, 0.020, 0.036, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.020 std_dev=0.017
N3	A	0, 0.004, 0.021, 0.038, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.021 std_dev=0.017
N6	A	0, 0.018, 0.038, 0.059, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.038 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.021, 0.042, 0.063, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.042 std_dev=0.021
C4	A	0, 0.006, 0.027, 0.049, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.027 std_dev=0.021
N9	A	0, 0.002, 0.027, 0.052, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.027 std_dev=0.025
C8	A	0, 0.019, 0.053, 0.087, 0.123 max_d=0.123 avg_d=0.053 std_dev=0.034
C2'	A	0, -0.030, 0.132, 0.294, 0.518 max_d=0.518 avg_d=0.132 std_dev=0.162
O2'	A	0, 0.022, 0.185, 0.348, 0.555 max_d=0.555 avg_d=0.185 std_dev=0.163
O4'	A	0, -0.035, 0.133, 0.300, 0.536 max_d=0.536 avg_d=0.133 std_dev=0.168
C4'	A	0, -0.024, 0.234, 0.491, 0.845 max_d=0.845 avg_d=0.234 std_dev=0.257
C3'	A	0, -0.027, 0.232, 0.490, 0.844 max_d=0.844 avg_d=0.232 std_dev=0.259
P	B	0, 0.312, 0.604, 0.895, 0.978 max_d=0.978 avg_d=0.604 std_dev=0.292
O3'	A	0, 0.012, 0.350, 0.687, 1.123 max_d=1.123 avg_d=0.350 std_dev=0.338
P	A	0, 0.089, 0.455, 0.822, 1.081 max_d=1.081 avg_d=0.455 std_dev=0.366
OP2	B	0, 0.372, 0.777, 1.181, 1.283 max_d=1.283 avg_d=0.777 std_dev=0.404
C5'	A	0, -0.071, 0.356, 0.783, 1.379 max_d=1.379 avg_d=0.356 std_dev=0.427
OP1	B	0, 0.288, 0.816, 1.343, 1.677 max_d=1.677 avg_d=0.816 std_dev=0.528
O5'	A	0, -0.151, 0.423, 0.998, 1.811 max_d=1.811 avg_d=0.423 std_dev=0.575
O5'	B	0, 0.183, 1.006, 1.829, 2.411 max_d=2.411 avg_d=1.006 std_dev=0.823
OP1	A	0, 0.014, 0.920, 1.826, 2.600 max_d=2.600 avg_d=0.920 std_dev=0.906
OP2	A	0, -0.247, 0.805, 1.856, 3.327 max_d=3.327 avg_d=0.805 std_dev=1.052
C5'	B	0, -0.155, 1.395, 2.944, 3.960 max_d=3.960 avg_d=1.395 std_dev=1.550
C4'	B	0, -0.429, 1.929, 4.287, 5.657 max_d=5.657 avg_d=1.929 std_dev=2.358
O4'	B	0, -0.358, 2.107, 4.572, 6.024 max_d=6.024 avg_d=2.107 std_dev=2.465
C8	B	0, -0.296, 2.197, 4.691, 6.164 max_d=6.164 avg_d=2.197 std_dev=2.494
N7	B	0, -0.298, 2.361, 5.019, 6.655 max_d=6.655 avg_d=2.361 std_dev=2.659
C3'	B	0, -0.774, 2.363, 5.499, 7.327 max_d=7.327 avg_d=2.363 std_dev=3.137
N9	B	0, -0.591, 2.644, 5.878, 7.852 max_d=7.852 avg_d=2.644 std_dev=3.235
C1'	B	0, -0.652, 2.649, 5.951, 7.941 max_d=7.941 avg_d=2.649 std_dev=3.302
C5	B	0, -0.619, 2.930, 6.479, 8.755 max_d=8.755 avg_d=2.930 std_dev=3.549
O3'	B	0, -0.997, 2.680, 6.358, 8.541 max_d=8.541 avg_d=2.680 std_dev=3.677
C2'	B	0, -0.904, 2.852, 6.607, 8.857 max_d=8.857 avg_d=2.852 std_dev=3.756
O6	B	0, -0.638, 3.268, 7.173, 9.772 max_d=9.772 avg_d=3.268 std_dev=3.905
C4	B	0, -0.796, 3.126, 7.048, 9.538 max_d=9.538 avg_d=3.126 std_dev=3.922
C6	B	0, -0.762, 3.340, 7.442, 10.153 max_d=10.153 avg_d=3.340 std_dev=4.102
O2'	B	0, -1.020, 3.207, 7.434, 9.975 max_d=9.975 avg_d=3.207 std_dev=4.227
N3	B	0, -1.080, 3.702, 8.484, 11.562 max_d=11.562 avg_d=3.702 std_dev=4.782
N1	B	0, -1.068, 3.910, 8.889, 12.212 max_d=12.212 avg_d=3.910 std_dev=4.979
C2	B	0, -1.206, 4.083, 9.372, 12.859 max_d=12.859 avg_d=4.083 std_dev=5.289
N2	B	0, -1.474, 4.693, 10.861, 14.956 max_d=14.956 avg_d=4.693 std_dev=6.168

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.30	0.34	0.16
C2	0.02	0.00	0.14	0.12	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.15	0.08	0.13	0.16	0.79	0.24
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.08	0.01	0.06	0.02	0.09	0.06	0.13	0.13	0.08	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.51	0.29	0.18
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.06	0.01	0.05	0.03	0.07	0.08	0.10	0.10	0.07	0.05	0.03	0.02	0.01	0.01	0.12	0.65	0.15	0.18
C4	0.01	0.01	0.08	0.06	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.07	0.05	0.12	0.17	0.74	0.24
C4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.05	0.06	0.03	0.02	0.06	0.07	0.03	0.05	0.03	0.00	0.03	0.40	0.09	0.07
C5	0.01	0.01	0.06	0.05	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.07	0.05	0.16	0.14	0.92	0.28
C5'	0.02	0.07	0.02	0.03	0.07	0.01	0.10	0.00	0.11	0.09	0.10	0.05	0.13	0.12	0.05	0.06	0.08	0.01	0.01	0.32	0.32	0.01
C6	0.01	0.01	0.09	0.07	0.01	0.05	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.10	0.07	0.18	0.16	0.99	0.30
C8	0.01	0.01	0.06	0.08	0.00	0.06	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.08	0.02	0.13	0.15	0.77	0.26
N1	0.01	0.00	0.13	0.10	0.01	0.03	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.14	0.09	0.16	0.15	0.92	0.28
N3	0.02	0.00	0.13	0.10	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.13	0.12	0.07	0.10	0.19	0.68	0.22
N6	0.01	0.01	0.08	0.07	0.01	0.06	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.10	0.07	0.20	0.19	1.09	0.32
N7	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.06	0.03	0.17	0.14	0.98	0.30
N9	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.09	0.21	0.61	0.21
O2'	0.01	0.15	0.01	0.02	0.07	0.05	0.06	0.06	0.09	0.04	0.13	0.13	0.08	0.02	0.01	0.00	0.03	0.05	0.07	0.50	0.15	0.14
O3'	0.02	0.15	0.02	0.01	0.07	0.03	0.07	0.08	0.10	0.08	0.14	0.12	0.10	0.06	0.02	0.03	0.00	0.02	0.19	0.79	0.19	0.20
O4'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.05	0.00	0.05	0.01	0.07	0.02	0.09	0.07	0.07	0.03	0.01	0.05	0.02	0.00	0.05	0.32	0.13	0.13
O5'	0.04	0.13	0.07	0.12	0.12	0.03	0.16	0.01	0.18	0.13	0.16	0.10	0.20	0.17	0.09	0.07	0.19	0.05	0.00	0.06	0.05	0.00
OP1	0.30	0.16	0.51	0.65	0.17	0.40	0.14	0.32	0.16	0.15	0.15	0.19	0.19	0.14	0.21	0.50	0.79	0.32	0.06	0.00	0.01	0.01
OP2	0.34	0.79	0.29	0.15	0.74	0.09	0.92	0.32	0.99	0.77	0.92	0.68	1.09	0.98	0.61	0.15	0.19	0.13	0.05	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.24	0.18	0.18	0.24	0.07	0.28	0.01	0.30	0.26	0.28	0.22	0.32	0.30	0.21	0.14	0.20	0.13	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	1.91	2.25	1.97	1.30	1.85	1.23	1.55	0.37	1.63	1.22	1.98	2.53	2.24	1.17	1.67	2.55	1.25	1.54	0.68	1.44	0.63	0.19	0.16
C2	1.28	1.23	0.99	0.43	1.11	0.69	0.93	0.15	0.94	0.81	1.10	1.32	1.27	0.75	1.07	1.32	0.12	1.19	0.50	0.82	0.68	0.14	0.15
C2'	1.45	1.78	1.47	0.88	1.43	0.84	1.18	0.21	1.26	0.89	1.56	2.03	1.76	0.86	1.26	1.95	0.81	1.13	0.54	1.11	0.71	0.26	0.20
C3'	1.61	2.07	1.60	0.93	1.64	0.88	1.38	0.16	1.49	1.04	1.83	2.36	2.02	1.02	1.43	2.10	0.81	1.24	0.55	1.33	0.70	0.22	0.19
C4	1.79	1.94	1.60	0.85	1.66	0.99	1.39	0.16	1.44	1.14	1.71	2.13	1.96	1.08	1.54	2.13	0.55	1.51	0.55	1.27	0.68	0.16	0.16
C4'	2.06	2.61	2.15	1.43	2.10	1.28	1.78	0.41	1.91	1.37	2.32	2.97	2.55	1.35	1.85	2.73	1.39	1.61	0.71	1.71	0.59	0.19	0.15
C5	1.88	2.07	1.50	0.60	1.79	0.84	1.51	0.13	1.57	1.24	1.84	2.26	2.09	1.19	1.64	2.02	0.12	1.56	0.44	1.40	0.69	0.16	0.16
C5'	2.27	2.97	2.32	1.51	2.38	1.35	2.04	0.45	2.21	1.56	2.66	3.38	2.88	1.56	2.07	2.92	1.41	1.76	0.73	2.00	0.59	0.24	0.21
C6	1.67	1.75	1.08	0.19	1.56	0.56	1.34	0.28	1.37	1.13	1.57	1.86	1.78	1.09	1.47	1.48	0.47	1.44	0.31	1.23	0.67	0.18	0.15
C8	2.08	2.50	1.87	0.97	2.06	1.05	1.74	0.18	1.84	1.37	2.21	2.79	2.48	1.34	1.84	2.49	0.61	1.65	0.53	1.65	0.69	0.16	0.17
N1	1.33	1.28	0.79	0.07	1.18	0.45	1.01	0.35	1.02	0.90	1.15	1.35	1.32	0.84	1.15	1.09	0.50	1.25	0.32	0.91	0.66	0.17	0.14
N3	1.51	1.55	1.38	0.81	1.35	0.95	1.12	0.18	1.15	0.94	1.36	1.69	1.58	0.87	1.27	1.81	0.61	1.32	0.60	1.00	0.66	0.16	0.15
N6	1.61	1.80	0.81	0.21	1.61	0.32	1.41	0.42	1.45	1.18	1.65	1.91	1.82	1.16	1.49	1.15	0.99	1.34	0.19	1.32	0.64	0.22	0.15
N7	2.05	2.44	1.68	0.71	2.04	0.89	1.73	0.13	1.83	1.38	2.17	2.70	2.43	1.35	1.83	2.26	0.21	1.63	0.44	1.64	0.69	0.16	0.16
N9	1.95	2.24	1.85	1.08	1.87	1.12	1.57	0.24	1.65	1.25	1.98	2.49	2.24	1.20	1.69	2.44	0.85	1.58	0.60	1.46	0.67	0.17	0.16
O2'	1.35	1.66	1.48	1.01	1.32	0.88	1.07	0.27	1.15	0.80	1.45	1.91	1.64	0.76	1.16	1.93	1.07	1.04	0.56	1.00	0.66	0.30	0.18
O3'	1.40	1.86	1.42	0.81	1.45	0.74	1.22	0.16	1.33	0.89	1.65	2.15	1.80	0.88	1.25	1.86	0.72	1.06	0.52	1.18	0.69	0.25	0.21
O4'	2.26	2.75	2.38	1.64	2.25	1.49	1.90	0.56	2.02	1.49	2.43	3.09	2.71	1.46	2.01	3.00	1.62	1.80	0.79	1.80	0.57	0.23	0.22
O5'	2.29	3.02	2.24	1.36	2.43	1.27	2.11	0.40	2.28	1.62	2.72	3.42	2.93	1.64	2.12	2.82	1.13	1.78	0.71	2.08	0.60	0.31	0.26
OP1	2.19	2.92	1.99	1.02	2.28	1.07	1.92	0.16	2.08	1.44	2.57	3.37	2.82	1.42	1.98	2.63	0.70	1.70	0.50	1.85	0.66	0.09	0.04
OP2	2.88	3.81	2.69	1.75	3.13	1.72	2.83	0.90	3.05	2.28	3.52	4.25	3.65	2.34	2.77	3.23	1.38	2.34	1.21	2.87	0.54	0.87	0.81
P	2.30	3.11	2.14	1.21	2.46	1.19	2.14	0.37	2.33	1.63	2.79	3.54	2.98	1.65	2.13	2.72	0.91	1.79	0.67	2.13	0.61	0.33	0.28

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.20	0.02	0.33	0.08	0.25
C2	0.03	0.00	0.09	0.14	0.00	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.17	0.03	0.34	0.01	0.31	0.12	0.30
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.06	0.03	0.08	0.09	0.08	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.17	0.06	0.26	0.17	0.18
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.11	0.00	0.11	0.02	0.13	0.08	0.14	0.14	0.12	0.10	0.07	0.01	0.01	0.01	0.19	0.13	0.22	0.27	0.13
C4	0.02	0.00	0.05	0.11	0.00	0.06	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.11	0.02	0.37	0.01	0.32	0.11	0.30
C4'	0.00	0.07	0.01	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.08	0.08	0.08	0.07	0.06	0.08	0.05	0.02	0.03	0.00	0.01	0.09	0.24	0.27	0.09
C5	0.02	0.01	0.05	0.11	0.00	0.08	0.00	0.16	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.13	0.02	0.45	0.01	0.32	0.16	0.33
C5'	0.03	0.13	0.01	0.02	0.13	0.00	0.16	0.00	0.17	0.15	0.16	0.11	0.11	0.18	0.11	0.03	0.04	0.02	0.01	0.19	0.23	0.40	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.13	0.01	0.08	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.16	0.03	0.45	0.00	0.32	0.18	0.33
C8	0.01	0.01	0.03	0.08	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.09	0.03	0.46	0.01	0.33	0.13	0.33
N1	0.03	0.00	0.08	0.14	0.01	0.08	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.18	0.03	0.40	0.01	0.31	0.16	0.31
N2	0.03	0.00	0.09	0.14	0.01	0.07	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.10	0.18	0.03	0.30	0.01	0.31	0.12	0.28
N3	0.02	0.00	0.08	0.12	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.13	0.02	0.30	0.01	0.31	0.10	0.28
N7	0.02	0.01	0.04	0.10	0.01	0.08	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.11	0.03	0.49	0.01	0.32	0.18	0.34
N9	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01	0.35	0.01	0.33	0.09	0.30
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.05	0.02	0.05	0.03	0.07	0.03	0.09	0.10	0.08	0.04	0.03	0.00	0.04	0.02	0.02	0.07	0.23	0.19	0.13
O3'	0.02	0.17	0.02	0.01	0.11	0.03	0.13	0.04	0.16	0.09	0.18	0.18	0.13	0.11	0.06	0.04	0.00	0.02	0.10	0.17	0.11	0.35	0.06
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.14	0.03	0.34	0.11	0.23
O5'	0.20	0.34	0.17	0.19	0.37	0.01	0.45	0.01	0.45	0.46	0.40	0.30	0.30	0.49	0.35	0.02	0.10	0.14	0.00	0.49	0.01	0.01	0.01
O6	0.02	0.01	0.06	0.13	0.01	0.09	0.01	0.19	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.17	0.03	0.49	0.00	0.32	0.21	0.34
OP1	0.33	0.31	0.26	0.22	0.32	0.24	0.32	0.23	0.32	0.33	0.31	0.31	0.31	0.32	0.33	0.23	0.11	0.34	0.01	0.32	0.00	0.01	0.00
OP2	0.08	0.12	0.17	0.27	0.11	0.27	0.16	0.40	0.18	0.13	0.16	0.12	0.10	0.18	0.09	0.19	0.35	0.11	0.01	0.21	0.01	0.00	0.01
P	0.25	0.30	0.18	0.13	0.30	0.09	0.33	0.02	0.33	0.33	0.31	0.28	0.28	0.34	0.30	0.13	0.06	0.23	0.01	0.34	0.00	0.01	0.00