Doublet Group distance statistics: 53097

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.013, 0.024, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.007, 0.025, 0.044, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.025 std_dev=0.018
C5	A	0, 0.008, 0.029, 0.050, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.029 std_dev=0.021
C2	A	0, 0.010, 0.035, 0.061, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.035 std_dev=0.025
C4	A	0, 0.009, 0.035, 0.060, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.035 std_dev=0.025
N7	A	0, 0.013, 0.044, 0.075, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.044 std_dev=0.031
C8	A	0, 0.013, 0.044, 0.075, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.044 std_dev=0.031
C1'	A	0, 0.012, 0.044, 0.076, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.044 std_dev=0.032
N9	A	0, 0.014, 0.046, 0.079, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.046 std_dev=0.033
N3	A	0, 0.014, 0.049, 0.084, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.049 std_dev=0.035
N6	A	0, 0.009, 0.048, 0.087, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.048 std_dev=0.039
C2'	A	0, 0.037, 0.126, 0.215, 0.193 max_d=0.193 avg_d=0.126 std_dev=0.089
C4'	A	0, 0.029, 0.125, 0.220, 0.233 max_d=0.233 avg_d=0.125 std_dev=0.096
C3'	A	0, 0.042, 0.180, 0.318, 0.335 max_d=0.335 avg_d=0.180 std_dev=0.138
O4'	A	0, 0.002, 0.159, 0.316, 0.373 max_d=0.373 avg_d=0.159 std_dev=0.157
O2'	A	0, 0.065, 0.231, 0.397, 0.382 max_d=0.382 avg_d=0.231 std_dev=0.166
C3'	B	0, 0.089, 0.314, 0.539, 0.514 max_d=0.514 avg_d=0.314 std_dev=0.225
N2	B	0, 0.074, 0.308, 0.541, 0.567 max_d=0.567 avg_d=0.308 std_dev=0.234
C5'	A	0, 0.022, 0.261, 0.499, 0.576 max_d=0.576 avg_d=0.261 std_dev=0.238
C4'	B	0, 0.080, 0.324, 0.567, 0.588 max_d=0.588 avg_d=0.324 std_dev=0.244
C2	B	0, 0.030, 0.306, 0.581, 0.668 max_d=0.668 avg_d=0.306 std_dev=0.276
O4'	B	0, 0.070, 0.363, 0.655, 0.717 max_d=0.717 avg_d=0.363 std_dev=0.293
C5'	B	0, 0.025, 0.324, 0.624, 0.722 max_d=0.722 avg_d=0.324 std_dev=0.300
OP1	B	0, 0.100, 0.401, 0.702, 0.726 max_d=0.726 avg_d=0.401 std_dev=0.301
O3'	A	0, 0.073, 0.386, 0.700, 0.768 max_d=0.768 avg_d=0.386 std_dev=0.314
N1	B	0, 0.060, 0.383, 0.705, 0.789 max_d=0.789 avg_d=0.383 std_dev=0.322
P	B	0, 0.094, 0.424, 0.753, 0.804 max_d=0.804 avg_d=0.424 std_dev=0.330
O5'	B	0, 0.030, 0.377, 0.724, 0.838 max_d=0.838 avg_d=0.377 std_dev=0.347
N3	B	0, -0.060, 0.296, 0.651, 0.796 max_d=0.796 avg_d=0.296 std_dev=0.355
C6	B	0, 0.031, 0.408, 0.786, 0.911 max_d=0.911 avg_d=0.408 std_dev=0.378
C4	B	0, -0.053, 0.334, 0.722, 0.877 max_d=0.877 avg_d=0.334 std_dev=0.387
C5	B	0, -0.031, 0.368, 0.766, 0.922 max_d=0.922 avg_d=0.368 std_dev=0.398
OP1	A	0, -0.025, 0.385, 0.795, 0.953 max_d=0.953 avg_d=0.385 std_dev=0.410
OP2	A	0, -0.056, 0.378, 0.812, 0.986 max_d=0.986 avg_d=0.378 std_dev=0.434
N9	B	0, -0.020, 0.424, 0.869, 1.038 max_d=1.038 avg_d=0.424 std_dev=0.445
O6	B	0, 0.044, 0.503, 0.963, 1.111 max_d=1.111 avg_d=0.503 std_dev=0.460
N7	B	0, -0.056, 0.405, 0.866, 1.050 max_d=1.050 avg_d=0.405 std_dev=0.461
C8	B	0, -0.040, 0.428, 0.895, 1.078 max_d=1.078 avg_d=0.428 std_dev=0.467
P	A	0, -0.082, 0.391, 0.865, 1.058 max_d=1.058 avg_d=0.391 std_dev=0.474
O3'	B	0, 0.113, 0.620, 1.126, 1.241 max_d=1.241 avg_d=0.620 std_dev=0.506
C1'	B	0, 0.007, 0.526, 1.046, 1.234 max_d=1.234 avg_d=0.526 std_dev=0.520
OP2	B	0, 0.159, 0.737, 1.314, 1.411 max_d=1.411 avg_d=0.737 std_dev=0.578
O5'	A	0, -0.120, 0.536, 1.191, 1.458 max_d=1.458 avg_d=0.536 std_dev=0.655
C2'	B	0, -0.089, 0.791, 1.672, 2.020 max_d=2.020 avg_d=0.791 std_dev=0.881
O2'	B	0, -0.312, 1.396, 3.104, 3.801 max_d=3.801 avg_d=1.396 std_dev=1.708

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.08	0.02	0.02	0.02	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.15	0.00	0.10	0.04	0.09	0.05
C2	0.03	0.00	0.04	0.05	0.01	0.03	0.01	0.10	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.22	0.09	0.07	0.09	0.17	0.07
C2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.16	0.02	0.04	0.03	0.04	0.04	0.04	0.01	0.01	0.03	0.01	0.19	0.05	0.09	0.06
C3'	0.02	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.05	0.04	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01	0.20	0.07	0.02	0.11
C4	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.04	0.19	0.05	0.04	0.06	0.14	0.02
C4'	0.01	0.03	0.03	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.13	0.01
C5	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.17	0.02	0.07	0.04	0.11	0.01
C5'	0.08	0.10	0.16	0.02	0.12	0.01	0.14	0.00	0.14	0.15	0.12	0.10	0.16	0.15	0.13	0.14	0.05	0.01	0.01	0.04	0.20	0.01
C6	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.20	0.04	0.04	0.07	0.13	0.03
C8	0.02	0.00	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.00	0.10	0.11	0.06	0.19	0.02	0.06	0.08
N1	0.02	0.00	0.03	0.03	0.00	0.03	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.21	0.07	0.05	0.08	0.16	0.06
N3	0.04	0.01	0.04	0.05	0.00	0.03	0.01	0.10	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.10	0.22	0.09	0.05	0.08	0.17	0.06
N6	0.03	0.01	0.04	0.04	0.02	0.04	0.02	0.16	0.00	0.04	0.00	0.02	0.00	0.04	0.03	0.07	0.20	0.04	0.05	0.07	0.13	0.04
N7	0.01	0.01	0.04	0.03	0.01	0.01	0.00	0.15	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.09	0.13	0.04	0.15	0.01	0.06	0.06
N9	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.13	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.15	0.01	0.10	0.04	0.11	0.02
O2'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.04	0.01	0.05	0.14	0.05	0.10	0.07	0.10	0.07	0.09	0.03	0.00	0.03	0.01	0.19	0.05	0.12	0.06
O3'	0.15	0.22	0.03	0.01	0.19	0.01	0.17	0.05	0.20	0.11	0.21	0.22	0.20	0.13	0.15	0.03	0.00	0.14	0.10	0.10	0.05	0.08
O4'	0.00	0.09	0.01	0.01	0.05	0.00	0.02	0.01	0.04	0.06	0.07	0.09	0.04	0.04	0.01	0.01	0.14	0.00	0.06	0.04	0.05	0.06
O5'	0.10	0.07	0.19	0.20	0.04	0.01	0.07	0.01	0.04	0.19	0.05	0.05	0.05	0.15	0.10	0.19	0.10	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01
OP1	0.04	0.09	0.05	0.07	0.06	0.05	0.04	0.04	0.07	0.02	0.08	0.08	0.07	0.01	0.04	0.05	0.10	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.09	0.17	0.09	0.02	0.14	0.13	0.11	0.20	0.13	0.06	0.16	0.17	0.13	0.06	0.11	0.12	0.05	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.07	0.06	0.11	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.08	0.06	0.06	0.04	0.06	0.02	0.06	0.08	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.10	0.51	0.19	0.10	0.20	0.05	0.28	0.07	0.06	0.07	0.12	0.14	0.03	0.14	0.42	0.18	0.07	0.29	0.09	0.04	0.07	0.04
C2	0.25	0.07	0.13	0.14	0.17	0.20	0.19	0.32	0.16	0.25	0.11	0.02	0.10	0.23	0.21	0.57	0.34	0.08	0.16	0.17	0.13	0.10	0.07
C2'	0.20	0.08	0.57	0.10	0.10	0.09	0.02	0.14	0.04	0.08	0.02	0.10	0.13	0.01	0.16	0.64	0.06	0.04	0.23	0.09	0.07	0.10	0.07
C3'	0.24	0.10	0.66	0.17	0.12	0.13	0.02	0.17	0.04	0.10	0.03	0.12	0.15	0.01	0.18	0.73	0.04	0.05	0.30	0.10	0.04	0.17	0.12
C4	0.08	0.06	0.23	0.18	0.03	0.26	0.08	0.36	0.10	0.09	0.08	0.09	0.06	0.11	0.04	0.09	0.35	0.15	0.24	0.12	0.11	0.07	0.04
C4'	0.18	0.12	0.57	0.15	0.13	0.13	0.08	0.17	0.08	0.11	0.09	0.13	0.15	0.06	0.17	0.56	0.05	0.05	0.24	0.08	0.06	0.05	0.04
C5	0.09	0.08	0.17	0.19	0.02	0.29	0.06	0.36	0.10	0.06	0.09	0.09	0.06	0.07	0.05	0.12	0.46	0.23	0.24	0.12	0.12	0.10	0.06
C5'	0.33	0.30	0.71	0.23	0.32	0.20	0.30	0.22	0.27	0.33	0.28	0.29	0.32	0.30	0.35	0.75	0.12	0.13	0.25	0.24	0.05	0.06	0.05
C6	0.14	0.06	0.10	0.18	0.10	0.28	0.12	0.36	0.11	0.13	0.09	0.05	0.05	0.13	0.12	0.39	0.50	0.22	0.21	0.12	0.12	0.12	0.07
C8	0.20	0.14	0.41	0.19	0.17	0.27	0.12	0.33	0.11	0.15	0.12	0.14	0.18	0.10	0.21	0.36	0.37	0.21	0.27	0.10	0.09	0.08	0.03
N1	0.25	0.09	0.19	0.15	0.18	0.23	0.19	0.32	0.16	0.23	0.11	0.03	0.13	0.21	0.21	0.63	0.44	0.13	0.16	0.15	0.12	0.12	0.08
N3	0.14	0.04	0.12	0.16	0.10	0.21	0.14	0.34	0.13	0.19	0.08	0.06	0.02	0.19	0.12	0.28	0.27	0.09	0.20	0.15	0.12	0.07	0.06
N6	0.13	0.06	0.13	0.18	0.08	0.29	0.08	0.35	0.07	0.10	0.07	0.06	0.06	0.09	0.10	0.43	0.56	0.25	0.21	0.07	0.12	0.13	0.07
N7	0.16	0.13	0.28	0.19	0.13	0.29	0.09	0.35	0.11	0.10	0.12	0.13	0.15	0.06	0.15	0.18	0.46	0.25	0.26	0.11	0.11	0.10	0.05
N9	0.14	0.10	0.40	0.18	0.10	0.24	0.06	0.32	0.09	0.04	0.09	0.12	0.13	0.04	0.12	0.27	0.29	0.14	0.26	0.10	0.09	0.05	0.01
O2'	0.22	0.15	0.60	0.04	0.15	0.03	0.08	0.07	0.05	0.12	0.10	0.17	0.18	0.05	0.19	0.73	0.02	0.09	0.14	0.06	0.17	0.10	0.14
O3'	0.30	0.20	0.71	0.25	0.18	0.20	0.06	0.22	0.02	0.10	0.10	0.25	0.25	0.03	0.22	0.74	0.04	0.08	0.40	0.07	0.21	0.29	0.25
O4'	0.17	0.09	0.52	0.21	0.09	0.22	0.06	0.32	0.09	0.06	0.08	0.11	0.13	0.03	0.14	0.43	0.18	0.09	0.33	0.12	0.03	0.09	0.08
O5'	0.09	0.10	0.38	0.06	0.08	0.10	0.17	0.19	0.23	0.11	0.18	0.08	0.05	0.18	0.07	0.40	0.09	0.12	0.26	0.30	0.05	0.08	0.06
OP1	0.22	0.11	0.59	0.13	0.15	0.16	0.11	0.21	0.08	0.18	0.09	0.11	0.15	0.13	0.21	0.70	0.08	0.09	0.28	0.07	0.04	0.06	0.04
OP2	0.27	0.17	0.58	0.21	0.22	0.28	0.18	0.35	0.14	0.25	0.15	0.16	0.21	0.20	0.27	0.65	0.25	0.19	0.38	0.12	0.08	0.14	0.13
P	0.15	0.06	0.49	0.10	0.08	0.15	0.04	0.22	0.07	0.10	0.08	0.06	0.09	0.04	0.14	0.54	0.09	0.08	0.26	0.11	0.04	0.04	0.03

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.00	0.03	0.03	0.02	0.02	0.05	0.02	0.00	0.05	0.10	0.06	0.00	0.00	0.04	0.35	0.00	0.04	0.02	0.25	0.10	0.10
C2	0.07	0.00	0.15	0.11	0.03	0.21	0.02	0.25	0.02	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.17	0.60	0.26	0.18	0.03	0.09	0.19	0.07
C2'	0.00	0.15	0.00	0.01	0.06	0.02	0.02	0.18	0.05	0.14	0.11	0.18	0.14	0.09	0.02	0.00	0.06	0.02	0.23	0.03	0.12	0.25	0.13
C3'	0.03	0.11	0.01	0.00	0.06	0.00	0.14	0.02	0.12	0.24	0.07	0.20	0.11	0.23	0.11	0.02	0.02	0.04	0.18	0.16	0.16	0.38	0.23
C4	0.03	0.03	0.06	0.06	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.01	0.03	0.05	0.01	0.01	0.01	0.09	0.38	0.12	0.09	0.00	0.18	0.09	0.05
C4'	0.02	0.21	0.02	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.03	0.17	0.14	0.30	0.20	0.13	0.04	0.31	0.03	0.01	0.01	0.00	0.07	0.12	0.04
C5	0.02	0.02	0.02	0.14	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.26	0.25	0.03	0.05	0.01	0.22	0.04	0.11
C5'	0.05	0.25	0.18	0.02	0.12	0.00	0.05	0.00	0.09	0.11	0.18	0.33	0.23	0.08	0.04	0.11	0.18	0.03	0.00	0.06	0.09	0.04	0.02
C6	0.02	0.02	0.05	0.12	0.00	0.03	0.01	0.09	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.21	0.31	0.08	0.08	0.00	0.18	0.05	0.08
C8	0.00	0.04	0.14	0.24	0.01	0.17	0.01	0.11	0.02	0.00	0.03	0.05	0.03	0.00	0.01	0.46	0.04	0.16	0.04	0.02	0.30	0.06	0.18
N1	0.05	0.01	0.11	0.07	0.03	0.14	0.02	0.18	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.03	0.04	0.10	0.48	0.19	0.14	0.03	0.12	0.13	0.02
N2	0.10	0.01	0.18	0.20	0.05	0.30	0.02	0.33	0.02	0.05	0.02	0.00	0.04	0.03	0.07	0.29	0.74	0.34	0.25	0.04	0.11	0.27	0.15
N3	0.06	0.01	0.14	0.11	0.01	0.20	0.01	0.23	0.03	0.03	0.00	0.04	0.00	0.01	0.03	0.19	0.59	0.26	0.17	0.03	0.11	0.18	0.06
N7	0.00	0.02	0.09	0.23	0.01	0.13	0.01	0.08	0.02	0.00	0.03	0.03	0.01	0.00	0.00	0.45	0.07	0.10	0.04	0.03	0.28	0.06	0.17
N9	0.00	0.05	0.02	0.11	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.07	0.03	0.00	0.00	0.19	0.23	0.01	0.04	0.01	0.23	0.07	0.10
O2'	0.04	0.17	0.00	0.02	0.09	0.31	0.26	0.11	0.21	0.46	0.10	0.29	0.19	0.45	0.19	0.00	0.04	0.17	0.13	0.29	0.63	0.22	0.33
O3'	0.35	0.60	0.06	0.02	0.38	0.03	0.25	0.18	0.31	0.04	0.48	0.74	0.59	0.07	0.23	0.04	0.00	0.21	0.19	0.24	0.13	0.14	0.04
O4'	0.00	0.26	0.02	0.04	0.12	0.01	0.03	0.03	0.08	0.16	0.19	0.34	0.26	0.10	0.01	0.17	0.21	0.00	0.06	0.04	0.20	0.08	0.15
O5'	0.04	0.18	0.23	0.18	0.09	0.01	0.05	0.00	0.08	0.04	0.14	0.25	0.17	0.04	0.04	0.13	0.19	0.06	0.00	0.06	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.03	0.03	0.16	0.00	0.00	0.01	0.06	0.00	0.02	0.03	0.04	0.03	0.03	0.01	0.29	0.24	0.04	0.06	0.00	0.20	0.03	0.11
OP1	0.25	0.09	0.12	0.16	0.18	0.07	0.22	0.09	0.18	0.30	0.12	0.11	0.11	0.28	0.23	0.63	0.13	0.20	0.02	0.20	0.00	0.02	0.01
OP2	0.10	0.19	0.25	0.38	0.09	0.12	0.04	0.04	0.05	0.06	0.13	0.27	0.18	0.06	0.07	0.22	0.14	0.08	0.02	0.03	0.02	0.00	0.02
P	0.10	0.07	0.13	0.23	0.05	0.04	0.11	0.02	0.08	0.18	0.02	0.15	0.06	0.17	0.10	0.33	0.04	0.15	0.01	0.11	0.01	0.02	0.00