Doublet Group distance statistics: 53098

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.008, 0.014, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.008 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.011 std_dev=0.008
N7	A	0, 0.003, 0.015, 0.027, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.005, 0.018, 0.031, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.018 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.005, 0.018, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.006, 0.020, 0.034, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.020 std_dev=0.014
C8	A	0, 0.005, 0.020, 0.035, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.020 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.007, 0.023, 0.039, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.023 std_dev=0.016
N3	A	0, 0.008, 0.028, 0.047, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.028 std_dev=0.019
C1'	A	0, 0.009, 0.032, 0.054, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.032 std_dev=0.022
N6	A	0, 0.010, 0.036, 0.061, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.036 std_dev=0.025
OP1	B	0, 0.140, 0.542, 0.945, 0.961 max_d=0.961 avg_d=0.542 std_dev=0.402
P	B	0, 0.269, 0.959, 1.648, 1.593 max_d=1.593 avg_d=0.959 std_dev=0.689
OP2	B	0, 0.335, 1.172, 2.009, 1.899 max_d=1.899 avg_d=1.172 std_dev=0.837
C2'	A	0, 0.348, 1.189, 2.029, 1.807 max_d=1.807 avg_d=1.189 std_dev=0.841
O4'	A	0, 0.369, 1.262, 2.154, 1.928 max_d=1.928 avg_d=1.262 std_dev=0.893
O2'	A	0, 0.388, 1.330, 2.271, 2.053 max_d=2.053 avg_d=1.330 std_dev=0.941
C4'	A	0, 0.524, 1.792, 3.059, 2.728 max_d=2.728 avg_d=1.792 std_dev=1.267
C3'	A	0, 0.555, 1.894, 3.234, 2.870 max_d=2.870 avg_d=1.894 std_dev=1.340
O3'	A	0, 0.734, 2.508, 4.281, 3.776 max_d=3.776 avg_d=2.508 std_dev=1.773
O5'	A	0, 0.754, 2.575, 4.395, 3.892 max_d=3.892 avg_d=2.575 std_dev=1.821
O5'	B	0, 0.876, 3.001, 5.126, 4.642 max_d=4.642 avg_d=3.001 std_dev=2.125
P	A	0, 0.879, 3.009, 5.140, 4.649 max_d=4.649 avg_d=3.009 std_dev=2.131
C5'	A	0, 0.887, 3.030, 5.173, 4.615 max_d=4.615 avg_d=3.030 std_dev=2.143
OP1	A	0, 1.098, 3.751, 6.404, 5.675 max_d=5.675 avg_d=3.751 std_dev=2.653
OP2	A	0, 1.200, 4.110, 7.020, 6.344 max_d=6.344 avg_d=4.110 std_dev=2.910
C5'	B	0, 1.243, 4.252, 7.260, 6.514 max_d=6.514 avg_d=4.252 std_dev=3.009
N7	B	0, 1.518, 5.190, 8.862, 7.923 max_d=7.923 avg_d=5.190 std_dev=3.672
C8	B	0, 1.553, 5.310, 9.067, 8.119 max_d=8.119 avg_d=5.310 std_dev=3.757
C4'	B	0, 1.781, 6.086, 10.390, 9.253 max_d=9.253 avg_d=6.086 std_dev=4.304
O4'	B	0, 1.913, 6.539, 11.164, 9.974 max_d=9.974 avg_d=6.539 std_dev=4.625
C3'	B	0, 1.982, 6.768, 11.554, 10.216 max_d=10.216 avg_d=6.768 std_dev=4.786
C5	B	0, 2.033, 6.947, 11.861, 10.558 max_d=10.558 avg_d=6.947 std_dev=4.914
N9	B	0, 2.068, 7.067, 12.065, 10.757 max_d=10.757 avg_d=7.067 std_dev=4.999
O6	B	0, 2.097, 7.159, 12.222, 10.802 max_d=10.802 avg_d=7.159 std_dev=5.063
O3'	B	0, 2.116, 7.224, 12.332, 10.864 max_d=10.864 avg_d=7.224 std_dev=5.108
C6	B	0, 2.270, 7.753, 13.236, 11.740 max_d=11.740 avg_d=7.753 std_dev=5.483
C1'	B	0, 2.272, 7.764, 13.255, 11.799 max_d=11.799 avg_d=7.764 std_dev=5.491
C4	B	0, 2.366, 8.083, 13.799, 12.278 max_d=12.278 avg_d=8.083 std_dev=5.717
C2'	B	0, 2.459, 8.397, 14.335, 12.684 max_d=12.684 avg_d=8.397 std_dev=5.938
N1	B	0, 2.798, 9.554, 16.311, 14.454 max_d=14.454 avg_d=9.554 std_dev=6.757
O2'	B	0, 2.837, 9.689, 16.541, 14.623 max_d=14.623 avg_d=9.689 std_dev=6.852
N3	B	0, 2.892, 9.877, 16.862, 14.972 max_d=14.972 avg_d=9.877 std_dev=6.985
C2	B	0, 3.079, 10.517, 17.955, 15.923 max_d=15.923 avg_d=10.517 std_dev=7.438
N2	B	0, 3.592, 12.269, 20.945, 18.556 max_d=18.556 avg_d=12.269 std_dev=8.676

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.15	0.33	0.26	0.07
C2	0.02	0.00	0.31	0.25	0.00	0.04	0.01	0.15	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.27	0.34	0.21	0.39	0.69	0.16	0.26
C2'	0.00	0.31	0.00	0.00	0.16	0.01	0.08	0.03	0.15	0.14	0.25	0.30	0.11	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.22	0.40	0.17	0.21
C3'	0.01	0.25	0.00	0.00	0.13	0.00	0.08	0.02	0.14	0.13	0.22	0.23	0.12	0.07	0.02	0.01	0.01	0.01	0.22	0.28	0.10	0.23
C4	0.01	0.00	0.16	0.13	0.00	0.02	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.12	0.16	0.11	0.34	0.65	0.24	0.22
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.05	0.03	0.04	0.02	0.05	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.04	0.14	0.02
C5	0.01	0.01	0.08	0.08	0.00	0.02	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.10	0.05	0.36	0.78	0.28	0.25
C5'	0.04	0.15	0.03	0.02	0.11	0.00	0.10	0.00	0.12	0.07	0.14	0.14	0.11	0.08	0.07	0.02	0.04	0.02	0.01	0.19	0.02	0.02
C6	0.01	0.01	0.15	0.14	0.00	0.02	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.12	0.18	0.09	0.40	0.82	0.24	0.27
C8	0.01	0.00	0.14	0.13	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.12	0.14	0.12	0.26	0.68	0.39	0.17
N1	0.02	0.00	0.25	0.22	0.00	0.03	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.21	0.29	0.16	0.41	0.77	0.19	0.28
N3	0.02	0.00	0.30	0.23	0.00	0.04	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.26	0.30	0.21	0.35	0.61	0.18	0.23
N6	0.01	0.01	0.11	0.12	0.00	0.02	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.15	0.06	0.39	0.87	0.26	0.28
N7	0.01	0.01	0.07	0.07	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.07	0.06	0.32	0.81	0.37	0.22
N9	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.27	0.56	0.30	0.16
O2'	0.01	0.27	0.00	0.01	0.12	0.03	0.05	0.02	0.12	0.12	0.21	0.26	0.08	0.07	0.01	0.00	0.02	0.03	0.11	0.27	0.18	0.13
O3'	0.01	0.34	0.01	0.01	0.16	0.02	0.10	0.04	0.18	0.14	0.29	0.30	0.15	0.07	0.02	0.02	0.00	0.01	0.15	0.16	0.05	0.22
O4'	0.00	0.21	0.00	0.01	0.11	0.00	0.05	0.02	0.09	0.12	0.16	0.21	0.06	0.06	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.06	0.28	0.10
O5'	0.15	0.39	0.22	0.22	0.34	0.01	0.36	0.01	0.40	0.26	0.41	0.35	0.39	0.32	0.27	0.11	0.15	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.33	0.69	0.40	0.28	0.65	0.04	0.78	0.19	0.82	0.68	0.77	0.61	0.87	0.81	0.56	0.27	0.16	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.26	0.16	0.17	0.10	0.24	0.14	0.28	0.02	0.24	0.39	0.19	0.18	0.26	0.37	0.30	0.18	0.05	0.28	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.07	0.26	0.21	0.23	0.22	0.02	0.25	0.02	0.27	0.17	0.28	0.23	0.28	0.22	0.16	0.13	0.22	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.32	0.07	0.07	0.02	0.06	0.40	0.03	0.45	0.14	0.17	0.15	0.10	0.03	0.04	0.18	0.24	0.21	0.52	0.16	0.20	0.09	0.28	0.09
C2	0.84	0.65	0.82	0.75	0.66	0.91	0.55	0.83	0.50	0.60	0.56	0.68	0.71	0.50	0.71	0.95	0.74	0.88	0.50	0.42	0.12	0.11	0.16
C2'	0.20	0.65	0.50	0.61	0.51	0.12	0.59	0.06	0.71	0.38	0.73	0.67	0.53	0.52	0.37	0.31	0.82	0.04	0.37	0.78	0.38	0.79	0.40
C3'	0.32	0.89	0.60	0.69	0.72	0.18	0.85	0.10	1.01	0.58	1.01	0.92	0.74	0.77	0.54	0.36	0.85	0.07	0.47	1.11	0.42	0.96	0.51
C4	0.84	0.53	0.72	0.60	0.58	0.89	0.43	0.81	0.35	0.54	0.42	0.56	0.63	0.40	0.66	0.91	0.51	0.94	0.44	0.25	0.12	0.21	0.16
C4'	0.05	0.62	0.31	0.36	0.42	0.12	0.52	0.21	0.68	0.25	0.71	0.66	0.47	0.43	0.24	0.11	0.52	0.20	0.12	0.77	0.06	0.55	0.15
C5	1.25	0.95	1.18	1.01	0.94	1.28	0.74	1.09	0.66	0.81	0.78	1.02	1.05	0.65	1.01	1.44	0.97	1.30	0.64	0.51	0.16	0.18	0.22
C5'	0.11	0.53	0.11	0.17	0.34	0.30	0.49	0.36	0.67	0.19	0.68	0.56	0.35	0.41	0.14	0.15	0.27	0.35	0.04	0.80	0.05	0.56	0.11
C6	1.49	1.25	1.51	1.35	1.20	1.52	0.97	1.25	0.91	1.00	1.06	1.34	1.34	0.83	1.24	1.78	1.37	1.49	0.78	0.74	0.17	0.12	0.26
C8	1.01	0.63	0.84	0.67	0.67	1.03	0.49	0.91	0.38	0.61	0.47	0.68	0.75	0.44	0.77	1.11	0.55	1.12	0.48	0.24	0.13	0.26	0.18
N1	1.30	1.11	1.35	1.26	1.07	1.37	0.89	1.16	0.84	0.91	0.96	1.17	1.18	0.78	1.11	1.54	1.30	1.29	0.74	0.71	0.16	0.07	0.24
N3	0.58	0.34	0.48	0.40	0.39	0.65	0.30	0.63	0.24	0.40	0.27	0.35	0.41	0.30	0.46	0.61	0.31	0.68	0.32	0.17	0.09	0.19	0.11
N6	1.85	1.64	1.93	1.71	1.54	1.83	1.25	1.42	1.20	1.23	1.41	1.77	1.74	1.05	1.55	2.28	1.78	1.78	0.91	0.99	0.19	0.09	0.30
N7	1.31	0.99	1.21	1.01	0.98	1.31	0.75	1.10	0.65	0.83	0.79	1.07	1.10	0.65	1.05	1.52	0.95	1.38	0.64	0.48	0.16	0.21	0.23
N9	0.70	0.34	0.52	0.39	0.41	0.76	0.28	0.71	0.18	0.42	0.22	0.36	0.45	0.27	0.52	0.73	0.26	0.85	0.35	0.08	0.11	0.26	0.13
O2'	0.48	0.90	0.85	0.93	0.72	0.41	0.73	0.26	0.84	0.50	0.92	0.96	0.80	0.60	0.58	0.73	1.22	0.21	0.47	0.86	0.35	0.68	0.37
O3'	0.75	1.41	1.08	1.14	1.19	0.56	1.31	0.43	1.49	0.98	1.52	1.46	1.24	1.18	0.98	0.83	1.32	0.44	0.79	1.58	0.61	1.21	0.74
O4'	0.35	0.11	0.12	0.07	0.05	0.48	0.05	0.55	0.18	0.18	0.20	0.15	0.02	0.05	0.19	0.30	0.10	0.56	0.25	0.25	0.24	0.19	0.19
O5'	0.63	0.04	0.42	0.33	0.20	0.77	0.02	0.77	0.15	0.28	0.12	0.04	0.21	0.07	0.37	0.69	0.22	0.83	0.37	0.29	0.29	0.24	0.22
OP1	1.17	0.51	0.98	0.84	0.64	1.30	0.38	1.21	0.19	0.65	0.27	0.54	0.71	0.38	0.83	1.36	0.77	1.35	0.71	0.09	0.51	0.10	0.45
OP2	0.39	0.17	0.28	0.15	0.08	0.52	0.33	0.42	0.50	0.11	0.40	0.12	0.01	0.35	0.07	0.64	0.15	0.53	0.07	0.69	0.23	0.82	0.33
P	0.74	0.15	0.56	0.43	0.27	0.86	0.05	0.79	0.14	0.29	0.08	0.18	0.33	0.05	0.43	0.90	0.37	0.91	0.34	0.32	0.18	0.39	0.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.02	0.04	0.04	0.05
C2	0.03	0.00	0.03	0.03	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.06	0.01	0.05	0.09	0.09
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.03	0.04	0.02	0.04	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.04	0.03	0.03	0.02
C3'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.05	0.07	0.04	0.05	0.02	0.07	0.03	0.00	0.00	0.00	0.02	0.06	0.05	0.02	0.01
C4	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.07	0.10	0.09
C4'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.02	0.01	0.01
C5	0.01	0.00	0.03	0.04	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.05	0.00	0.08	0.01	0.11	0.13	0.12
C5'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.05	0.05	0.04	0.03	0.03	0.05	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01	0.01
C6	0.02	0.01	0.03	0.05	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.08	0.00	0.11	0.14	0.12
C8	0.01	0.02	0.04	0.07	0.01	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.09	0.03	0.10	0.02	0.13	0.14	0.13
N1	0.03	0.00	0.03	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.02	0.07	0.00	0.08	0.11	0.11
N2	0.04	0.01	0.04	0.05	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.06	0.04	0.05	0.01	0.04	0.07	0.08
N3	0.03	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.05	0.01	0.05	0.07	0.08
N7	0.00	0.01	0.04	0.07	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.09	0.02	0.10	0.02	0.14	0.16	0.14
N9	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.00	0.07	0.01	0.08	0.09	0.09
O2'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.03	0.03	0.03	0.01	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.03	0.02	0.00
O3'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.05	0.09	0.03	0.06	0.02	0.09	0.04	0.00	0.00	0.01	0.03	0.08	0.08	0.02	0.04
O4'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.02	0.04	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.02	0.04
O5'	0.04	0.06	0.02	0.02	0.07	0.00	0.08	0.01	0.08	0.10	0.07	0.05	0.05	0.10	0.07	0.01	0.03	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.04	0.06	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.08	0.00	0.09	0.00	0.13	0.16	0.14
OP1	0.04	0.05	0.03	0.05	0.07	0.02	0.11	0.02	0.11	0.13	0.08	0.04	0.05	0.14	0.08	0.03	0.08	0.04	0.01	0.13	0.00	0.00	0.01
OP2	0.04	0.09	0.03	0.02	0.10	0.01	0.13	0.01	0.14	0.14	0.11	0.07	0.07	0.16	0.09	0.02	0.02	0.02	0.01	0.16	0.00	0.00	0.00
P	0.05	0.09	0.02	0.01	0.09	0.01	0.12	0.01	0.12	0.13	0.11	0.08	0.08	0.14	0.09	0.00	0.04	0.04	0.00	0.14	0.01	0.00	0.00