Doublet Group distance statistics: 53099

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.002, 0.007, 0.011, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.002, 0.008, 0.013, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.002, 0.008, 0.013, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.011 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.003, 0.012, 0.020, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.012 std_dev=0.008
N7	A	0, 0.003, 0.013, 0.022, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.013 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.016 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.005, 0.017, 0.029, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.017 std_dev=0.012
N6	A	0, 0.006, 0.020, 0.035, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.020 std_dev=0.014
C8	A	0, 0.007, 0.025, 0.043, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.025 std_dev=0.018
N9	A	0, 0.007, 0.035, 0.062, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.035 std_dev=0.027
P	B	0, 0.094, 0.333, 0.571, 0.547 max_d=0.547 avg_d=0.333 std_dev=0.239
O5'	B	0, 0.040, 0.295, 0.550, 0.622 max_d=0.622 avg_d=0.295 std_dev=0.255
OP1	B	0, 0.120, 0.440, 0.761, 0.752 max_d=0.752 avg_d=0.440 std_dev=0.320
OP2	B	0, 0.151, 0.527, 0.903, 0.852 max_d=0.852 avg_d=0.527 std_dev=0.376
N7	B	0, 0.217, 0.742, 1.267, 1.126 max_d=1.126 avg_d=0.742 std_dev=0.525
C8	B	0, 0.221, 0.762, 1.303, 1.198 max_d=1.198 avg_d=0.762 std_dev=0.541
C5	B	0, 0.226, 0.782, 1.337, 1.238 max_d=1.238 avg_d=0.782 std_dev=0.555
O4'	B	0, 0.235, 0.808, 1.382, 1.272 max_d=1.272 avg_d=0.808 std_dev=0.574
N9	B	0, 0.238, 0.817, 1.395, 1.262 max_d=1.262 avg_d=0.817 std_dev=0.578
C4	B	0, 0.240, 0.820, 1.399, 1.253 max_d=1.253 avg_d=0.820 std_dev=0.580
C6	B	0, 0.220, 0.826, 1.432, 1.437 max_d=1.437 avg_d=0.826 std_dev=0.606
N3	B	0, 0.260, 0.894, 1.528, 1.401 max_d=1.401 avg_d=0.894 std_dev=0.634
O6	B	0, 0.203, 0.840, 1.478, 1.543 max_d=1.543 avg_d=0.840 std_dev=0.637
C1'	B	0, 0.263, 0.901, 1.539, 1.388 max_d=1.388 avg_d=0.901 std_dev=0.638
C2	B	0, 0.256, 0.923, 1.590, 1.555 max_d=1.555 avg_d=0.923 std_dev=0.667
O4'	A	0, 0.269, 0.940, 1.611, 1.521 max_d=1.521 avg_d=0.940 std_dev=0.671
N1	B	0, 0.230, 0.902, 1.573, 1.610 max_d=1.610 avg_d=0.902 std_dev=0.671
C2'	A	0, 0.290, 1.007, 1.725, 1.620 max_d=1.620 avg_d=1.007 std_dev=0.718
N2	B	0, 0.272, 0.994, 1.715, 1.691 max_d=1.691 avg_d=0.994 std_dev=0.721
C4'	B	0, 0.223, 0.974, 1.724, 1.826 max_d=1.826 avg_d=0.974 std_dev=0.750
C2'	B	0, 0.322, 1.105, 1.889, 1.725 max_d=1.725 avg_d=1.105 std_dev=0.784
O5'	A	0, 0.128, 0.953, 1.778, 2.012 max_d=2.012 avg_d=0.953 std_dev=0.825
C3'	B	0, 0.314, 1.151, 1.988, 1.967 max_d=1.967 avg_d=1.151 std_dev=0.837
O2'	B	0, 0.349, 1.201, 2.053, 1.881 max_d=1.881 avg_d=1.201 std_dev=0.852
OP1	A	0, 0.334, 1.266, 2.197, 2.214 max_d=2.214 avg_d=1.266 std_dev=0.931
C5'	B	0, 0.035, 1.005, 1.975, 2.316 max_d=2.316 avg_d=1.005 std_dev=0.970
O3'	B	0, 0.375, 1.351, 2.327, 2.269 max_d=2.269 avg_d=1.351 std_dev=0.976
C3'	A	0, 0.403, 1.408, 2.412, 2.279 max_d=2.279 avg_d=1.408 std_dev=1.005
C4'	A	0, 0.412, 1.450, 2.487, 2.371 max_d=2.371 avg_d=1.450 std_dev=1.038
O2'	A	0, 0.467, 1.596, 2.724, 2.393 max_d=2.393 avg_d=1.596 std_dev=1.128
O3'	A	0, 0.531, 1.812, 3.093, 2.725 max_d=2.725 avg_d=1.812 std_dev=1.281
P	A	0, -0.044, 1.326, 2.696, 3.212 max_d=3.212 avg_d=1.326 std_dev=1.370
C5'	A	0, 0.564, 2.159, 3.754, 3.805 max_d=3.805 avg_d=2.159 std_dev=1.595
OP2	A	0, -0.084, 2.342, 4.767, 5.684 max_d=5.684 avg_d=2.342 std_dev=2.426

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.20	0.01	0.21	0.07	0.56	0.29
C2	0.01	0.00	0.20	0.15	0.01	0.14	0.00	0.21	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.15	0.24	0.22	0.19	0.05	0.56	0.35
C2'	0.00	0.20	0.00	0.01	0.10	0.03	0.04	0.17	0.09	0.13	0.15	0.20	0.06	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.43	0.40	0.54	0.31
C3'	0.02	0.15	0.01	0.00	0.16	0.00	0.22	0.01	0.22	0.22	0.19	0.12	0.25	0.24	0.16	0.01	0.00	0.02	0.26	0.29	0.26	0.18
C4	0.00	0.01	0.10	0.16	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.10	0.17	0.12	0.24	0.09	0.77	0.46
C4'	0.01	0.14	0.03	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.03	0.18	0.09	0.14	0.05	0.15	0.05	0.22	0.01	0.01	0.00	0.14	0.36	0.08
C5	0.00	0.00	0.04	0.22	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.20	0.16	0.05	0.29	0.17	1.04	0.62
C5'	0.07	0.21	0.17	0.01	0.07	0.01	0.07	0.00	0.04	0.26	0.14	0.20	0.07	0.21	0.10	0.16	0.13	0.02	0.01	0.30	0.39	0.00
C6	0.01	0.01	0.09	0.22	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.17	0.19	0.10	0.27	0.17	0.98	0.60
C8	0.01	0.00	0.13	0.22	0.01	0.18	0.00	0.26	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.32	0.14	0.12	0.40	0.21	1.27	0.73
N1	0.00	0.00	0.15	0.19	0.00	0.09	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.12	0.20	0.17	0.22	0.11	0.75	0.47
N3	0.01	0.00	0.20	0.12	0.00	0.14	0.00	0.20	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.16	0.24	0.22	0.19	0.04	0.52	0.31
N6	0.01	0.01	0.06	0.25	0.01	0.05	0.01	0.07	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.22	0.21	0.06	0.31	0.22	1.14	0.70
N7	0.01	0.00	0.08	0.24	0.01	0.15	0.00	0.21	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.32	0.17	0.07	0.38	0.24	1.34	0.77
N9	0.00	0.00	0.01	0.16	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.14	0.12	0.01	0.29	0.11	0.86	0.50
O2'	0.01	0.15	0.00	0.01	0.10	0.22	0.20	0.16	0.17	0.32	0.12	0.16	0.22	0.32	0.14	0.00	0.05	0.15	0.29	0.27	0.68	0.25
O3'	0.20	0.24	0.01	0.00	0.17	0.01	0.16	0.13	0.19	0.14	0.20	0.24	0.21	0.17	0.12	0.05	0.00	0.15	0.17	0.24	0.36	0.30
O4'	0.01	0.22	0.01	0.02	0.12	0.01	0.05	0.02	0.10	0.12	0.17	0.22	0.06	0.07	0.01	0.15	0.15	0.00	0.12	0.19	0.48	0.32
O5'	0.21	0.19	0.43	0.26	0.24	0.00	0.29	0.01	0.27	0.40	0.22	0.19	0.31	0.38	0.29	0.29	0.17	0.12	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.07	0.05	0.40	0.29	0.09	0.14	0.17	0.30	0.17	0.21	0.11	0.04	0.22	0.24	0.11	0.27	0.24	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.56	0.56	0.54	0.26	0.77	0.36	1.04	0.39	0.98	1.27	0.75	0.52	1.14	1.34	0.86	0.68	0.36	0.48	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.29	0.35	0.31	0.18	0.46	0.08	0.62	0.00	0.60	0.73	0.47	0.31	0.70	0.77	0.50	0.25	0.30	0.32	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.69	0.63	0.77	0.90	0.67	0.86	0.65	0.98	0.58	0.67	0.58	0.61	0.66	0.67	0.68	0.72	0.94	0.71	0.03	0.52	0.14	0.15	0.10
C2	0.16	0.09	0.20	0.33	0.06	0.42	0.12	0.58	0.14	0.12	0.08	0.12	0.11	0.22	0.04	0.22	0.37	0.30	0.13	0.20	0.12	0.10	0.11
C2'	0.91	0.83	1.02	1.17	0.89	1.10	0.89	1.24	0.82	0.91	0.79	0.79	0.87	0.93	0.90	0.96	1.23	0.90	0.34	0.76	0.22	0.20	0.23
C3'	0.97	0.99	1.11	1.27	0.99	1.15	1.01	1.28	1.00	0.97	0.98	0.96	0.99	1.02	0.97	1.05	1.35	0.93	0.31	1.00	0.08	0.01	0.12
C4	0.47	0.38	0.49	0.61	0.39	0.65	0.30	0.79	0.23	0.33	0.28	0.38	0.42	0.24	0.42	0.47	0.63	0.56	0.09	0.15	0.12	0.13	0.10
C4'	0.66	0.85	0.79	0.92	0.77	0.81	0.81	0.93	0.88	0.68	0.89	0.86	0.80	0.76	0.70	0.72	0.99	0.64	0.07	0.95	0.32	0.33	0.25
C5	0.38	0.32	0.36	0.46	0.31	0.53	0.18	0.65	0.14	0.16	0.21	0.34	0.37	0.08	0.31	0.35	0.46	0.48	0.15	0.14	0.10	0.13	0.10
C5'	0.72	1.09	0.85	0.96	0.92	0.81	0.99	0.90	1.14	0.75	1.17	1.12	0.98	0.88	0.79	0.77	1.02	0.65	0.10	1.26	0.41	0.40	0.32
C6	0.13	0.11	0.11	0.22	0.10	0.32	0.22	0.46	0.24	0.20	0.15	0.14	0.12	0.32	0.07	0.12	0.22	0.28	0.20	0.31	0.08	0.11	0.10
C8	0.61	0.65	0.62	0.71	0.64	0.71	0.61	0.82	0.57	0.53	0.60	0.64	0.67	0.52	0.61	0.58	0.71	0.64	0.09	0.46	0.11	0.14	0.10
N1	0.03	0.10	0.04	0.14	0.16	0.26	0.29	0.41	0.28	0.34	0.19	0.08	0.08	0.41	0.16	0.06	0.17	0.17	0.20	0.33	0.09	0.10	0.11
N3	0.38	0.26	0.42	0.56	0.26	0.62	0.16	0.78	0.13	0.20	0.17	0.28	0.30	0.11	0.29	0.42	0.60	0.49	0.07	0.11	0.14	0.12	0.11
N6	0.10	0.18	0.13	0.09	0.26	0.15	0.39	0.29	0.38	0.36	0.28	0.13	0.16	0.46	0.24	0.09	0.10	0.13	0.26	0.42	0.08	0.13	0.12
N7	0.49	0.52	0.46	0.54	0.49	0.58	0.38	0.69	0.34	0.32	0.42	0.53	0.55	0.25	0.45	0.43	0.53	0.54	0.14	0.20	0.09	0.14	0.10
N9	0.60	0.56	0.64	0.75	0.58	0.75	0.55	0.88	0.47	0.54	0.49	0.54	0.59	0.53	0.59	0.60	0.77	0.65	0.06	0.38	0.13	0.14	0.10
O2'	1.10	1.00	1.23	1.31	1.07	1.21	1.05	1.27	0.95	1.08	0.93	0.97	1.06	1.09	1.09	1.19	1.37	1.05	0.25	0.84	0.14	0.12	0.16
O3'	1.08	0.99	1.26	1.43	1.03	1.31	1.01	1.43	0.95	1.06	0.95	0.97	1.02	1.05	1.06	1.21	1.54	1.07	0.40	0.91	0.27	0.34	0.31
O4'	0.54	0.65	0.64	0.77	0.60	0.71	0.62	0.83	0.66	0.54	0.66	0.65	0.61	0.59	0.56	0.58	0.82	0.57	0.19	0.69	0.39	0.38	0.33
O5'	1.00	1.31	1.12	1.20	1.17	1.07	1.23	1.13	1.35	1.01	1.37	1.33	1.22	1.12	1.06	1.04	1.25	0.95	0.20	1.43	0.27	0.26	0.23
OP1	0.82	1.15	0.92	1.03	0.98	0.92	1.01	1.03	1.15	0.82	1.21	1.19	1.04	0.91	0.87	0.83	1.09	0.78	0.05	1.22	0.11	0.12	0.06
OP2	1.78	2.57	1.91	1.88	2.16	1.66	2.20	1.63	2.51	1.70	2.67	2.68	2.34	1.88	1.87	1.84	1.92	1.57	0.65	2.62	0.31	0.29	0.41
P	1.27	1.75	1.36	1.41	1.50	1.28	1.53	1.32	1.72	1.22	1.81	1.81	1.61	1.34	1.33	1.30	1.44	1.17	0.33	1.79	0.10	0.08	0.18

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.33	0.02	0.36	0.13	0.26
C2	0.02	0.00	0.18	0.15	0.00	0.05	0.01	0.11	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.24	0.22	0.03	0.49	0.02	0.38	0.28	0.34
C2'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.08	0.00	0.03	0.02	0.07	0.10	0.15	0.22	0.18	0.05	0.01	0.00	0.02	0.01	0.18	0.04	0.28	0.03	0.14
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.05	0.19	0.10	0.20	0.14	0.15	0.06	0.00	0.00	0.01	0.14	0.07	0.29	0.10	0.10
C4	0.00	0.00	0.08	0.05	0.00	0.04	0.00	0.15	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.06	0.03	0.52	0.01	0.45	0.32	0.40
C4'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.07	0.16	0.04	0.08	0.05	0.14	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.11	0.25	0.20	0.05
C5	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.09	0.00	0.23	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.05	0.03	0.61	0.01	0.52	0.43	0.49
C5'	0.05	0.11	0.02	0.00	0.15	0.01	0.23	0.00	0.22	0.28	0.16	0.09	0.09	0.30	0.16	0.01	0.04	0.01	0.00	0.27	0.40	0.33	0.02
C6	0.00	0.02	0.07	0.05	0.00	0.07	0.00	0.22	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.11	0.05	0.04	0.62	0.01	0.51	0.44	0.49
C8	0.02	0.01	0.10	0.19	0.01	0.16	0.01	0.28	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.20	0.01	0.64	0.02	0.60	0.45	0.56
N1	0.02	0.00	0.15	0.10	0.02	0.04	0.01	0.16	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.20	0.15	0.02	0.57	0.01	0.46	0.38	0.43
N2	0.01	0.00	0.22	0.20	0.01	0.08	0.01	0.09	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.29	0.29	0.03	0.44	0.02	0.32	0.23	0.29
N3	0.01	0.00	0.18	0.14	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.22	0.20	0.03	0.45	0.02	0.37	0.24	0.31
N7	0.01	0.01	0.05	0.15	0.00	0.14	0.00	0.30	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.16	0.02	0.67	0.02	0.61	0.51	0.58
N9	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.06	0.01	0.52	0.02	0.48	0.31	0.42
O2'	0.01	0.24	0.00	0.00	0.11	0.00	0.07	0.01	0.11	0.07	0.20	0.29	0.22	0.03	0.02	0.00	0.03	0.05	0.07	0.09	0.16	0.13	0.10
O3'	0.02	0.22	0.02	0.00	0.06	0.01	0.05	0.04	0.05	0.20	0.15	0.29	0.20	0.16	0.06	0.03	0.00	0.02	0.10	0.05	0.16	0.24	0.07
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.28	0.05	0.36	0.03	0.21
O5'	0.33	0.49	0.18	0.14	0.52	0.01	0.61	0.00	0.62	0.64	0.57	0.44	0.45	0.67	0.52	0.07	0.10	0.28	0.00	0.64	0.01	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.04	0.07	0.01	0.11	0.01	0.27	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.09	0.05	0.05	0.64	0.00	0.53	0.48	0.51
OP1	0.36	0.38	0.28	0.29	0.45	0.25	0.52	0.40	0.51	0.60	0.46	0.32	0.37	0.61	0.48	0.16	0.16	0.36	0.01	0.53	0.00	0.02	0.02
OP2	0.13	0.28	0.03	0.10	0.32	0.20	0.43	0.33	0.44	0.45	0.38	0.23	0.24	0.51	0.31	0.13	0.24	0.03	0.02	0.48	0.02	0.00	0.01
P	0.26	0.34	0.14	0.10	0.40	0.05	0.49	0.02	0.49	0.56	0.43	0.29	0.31	0.58	0.42	0.10	0.07	0.21	0.01	0.51	0.02	0.01	0.00