Doublet Group distance statistics: 53104

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.000, 0.006, 0.011, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.000, 0.011, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.000, 0.012, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.000, 0.012, 0.024, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.012 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.000, 0.013, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.000, 0.019, 0.038, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.019 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.000, 0.027, 0.053, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.027 std_dev=0.027
N9	A	0, 0.000, 0.027, 0.054, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.027 std_dev=0.027
N6	A	0, 0.000, 0.030, 0.061, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.030 std_dev=0.030
C8	A	0, 0.000, 0.039, 0.077, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.039 std_dev=0.039
OP2	B	0, 0.000, 0.464, 0.929, 0.929 max_d=0.929 avg_d=0.464 std_dev=0.464
P	B	0, 0.000, 0.615, 1.230, 1.230 max_d=1.230 avg_d=0.615 std_dev=0.615
OP1	B	0, 0.000, 0.632, 1.264, 1.264 max_d=1.264 avg_d=0.632 std_dev=0.632
O4'	A	0, 0.000, 1.132, 2.263, 2.263 max_d=2.263 avg_d=1.132 std_dev=1.132
C4'	A	0, 0.000, 1.210, 2.420, 2.420 max_d=2.420 avg_d=1.210 std_dev=1.210
C2'	A	0, 0.000, 1.274, 2.548, 2.548 max_d=2.548 avg_d=1.274 std_dev=1.274
O5'	B	0, 0.000, 1.364, 2.729, 2.729 max_d=2.729 avg_d=1.364 std_dev=1.364
C3'	A	0, 0.000, 1.720, 3.440, 3.440 max_d=3.440 avg_d=1.720 std_dev=1.720
O2'	A	0, 0.000, 1.914, 3.828, 3.828 max_d=3.828 avg_d=1.914 std_dev=1.914
O3'	A	0, 0.000, 2.233, 4.466, 4.466 max_d=4.466 avg_d=2.233 std_dev=2.233
C5'	B	0, 0.000, 2.477, 4.953, 4.953 max_d=4.953 avg_d=2.477 std_dev=2.477
C5'	A	0, 0.000, 2.512, 5.024, 5.024 max_d=5.024 avg_d=2.512 std_dev=2.512
O4'	B	0, 0.000, 2.947, 5.894, 5.894 max_d=5.894 avg_d=2.947 std_dev=2.947
C4'	B	0, 0.000, 3.106, 6.212, 6.212 max_d=6.212 avg_d=3.106 std_dev=3.106
O5'	A	0, 0.000, 3.479, 6.957, 6.957 max_d=6.957 avg_d=3.479 std_dev=3.479
C1'	B	0, 0.000, 4.065, 8.131, 8.131 max_d=8.131 avg_d=4.065 std_dev=4.065
C3'	B	0, 0.000, 4.087, 8.174, 8.174 max_d=8.174 avg_d=4.087 std_dev=4.087
C8	B	0, 0.000, 4.310, 8.620, 8.620 max_d=8.620 avg_d=4.310 std_dev=4.310
N9	B	0, 0.000, 4.357, 8.714, 8.714 max_d=8.714 avg_d=4.357 std_dev=4.357
O3'	B	0, 0.000, 4.736, 9.472, 9.472 max_d=9.472 avg_d=4.736 std_dev=4.736
C2'	B	0, 0.000, 4.934, 9.868, 9.868 max_d=9.868 avg_d=4.934 std_dev=4.934
P	A	0, 0.000, 4.975, 9.950, 9.950 max_d=9.950 avg_d=4.975 std_dev=4.975
N7	B	0, 0.000, 5.096, 10.192, 10.192 max_d=10.192 avg_d=5.096 std_dev=5.096
C4	B	0, 0.000, 5.245, 10.491, 10.491 max_d=10.491 avg_d=5.245 std_dev=5.245
OP1	A	0, 0.000, 5.264, 10.527, 10.527 max_d=10.527 avg_d=5.264 std_dev=5.264
OP2	A	0, 0.000, 5.557, 11.114, 11.114 max_d=11.114 avg_d=5.557 std_dev=5.557
C5	B	0, 0.000, 5.605, 11.210, 11.210 max_d=11.210 avg_d=5.605 std_dev=5.605
O2'	B	0, 0.000, 5.927, 11.854, 11.854 max_d=11.854 avg_d=5.927 std_dev=5.927
N3	B	0, 0.000, 5.963, 11.925, 11.925 max_d=11.925 avg_d=5.963 std_dev=5.963
C6	B	0, 0.000, 6.683, 13.366, 13.366 max_d=13.366 avg_d=6.683 std_dev=6.683
C2	B	0, 0.000, 6.922, 13.845, 13.845 max_d=13.845 avg_d=6.922 std_dev=6.922
N1	B	0, 0.000, 7.218, 14.436, 14.436 max_d=14.436 avg_d=7.218 std_dev=7.218
O6	B	0, 0.000, 7.339, 14.677, 14.677 max_d=14.677 avg_d=7.339 std_dev=7.339
N2	B	0, 0.000, 7.875, 15.750, 15.750 max_d=15.750 avg_d=7.875 std_dev=7.875

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.18	0.01	0.14	0.01	0.28	0.17
C2	0.00	0.00	0.12	0.04	0.00	0.28	0.00	0.45	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.21	0.14	0.42	0.43	0.98	0.09	0.50
C2'	0.00	0.12	0.00	0.01	0.09	0.02	0.07	0.01	0.09	0.00	0.11	0.12	0.08	0.03	0.04	0.00	0.05	0.00	0.03	0.00	0.03	0.04
C3'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.16	0.00	0.29	0.02	0.27	0.36	0.16	0.00	0.33	0.39	0.21	0.01	0.00	0.01	0.02	0.16	0.11	0.03
C4	0.00	0.00	0.09	0.16	0.00	0.07	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.21	0.15	0.19	0.67	0.21
C4'	0.03	0.28	0.02	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.01	0.33	0.15	0.30	0.09	0.28	0.09	0.19	0.01	0.00	0.01	0.09	0.17	0.01
C5	0.00	0.00	0.07	0.29	0.00	0.09	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	0.14	0.06	0.56	0.25	1.29	0.71
C5'	0.02	0.45	0.01	0.02	0.04	0.01	0.23	0.00	0.09	0.66	0.21	0.46	0.25	0.61	0.22	0.16	0.09	0.03	0.00	0.13	0.30	0.00
C6	0.00	0.01	0.09	0.27	0.00	0.01	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.10	0.19	0.16	0.37	0.01	1.17	0.50
C8	0.01	0.00	0.00	0.36	0.00	0.33	0.00	0.66	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.38	0.03	0.26	1.11	0.91	1.67	1.30
N1	0.00	0.00	0.11	0.16	0.00	0.15	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.19	0.31	0.07	0.58	0.60	0.06
N3	0.01	0.00	0.12	0.00	0.00	0.30	0.00	0.46	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.23	0.07	0.42	0.44	0.88	0.00	0.48
N6	0.01	0.01	0.08	0.33	0.00	0.09	0.00	0.25	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.19	0.22	0.09	0.61	0.29	1.57	0.82
N7	0.01	0.00	0.03	0.39	0.00	0.28	0.00	0.61	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.36	0.11	0.16	1.08	0.89	1.89	1.34
N9	0.00	0.01	0.04	0.21	0.00	0.09	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.15	0.01	0.01	0.48	0.24	0.87	0.56
O2'	0.00	0.21	0.00	0.01	0.01	0.19	0.17	0.16	0.10	0.38	0.06	0.23	0.19	0.36	0.15	0.00	0.12	0.15	0.04	0.14	0.01	0.03
O3'	0.18	0.14	0.05	0.00	0.08	0.01	0.14	0.09	0.19	0.03	0.19	0.07	0.22	0.11	0.01	0.12	0.00	0.07	0.06	0.42	0.18	0.05
O4'	0.01	0.42	0.00	0.01	0.21	0.00	0.06	0.03	0.16	0.26	0.31	0.42	0.09	0.16	0.01	0.15	0.07	0.00	0.11	0.05	0.16	0.14
O5'	0.14	0.43	0.03	0.02	0.15	0.01	0.56	0.00	0.37	1.11	0.07	0.44	0.61	1.08	0.48	0.04	0.06	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.01	0.98	0.00	0.16	0.19	0.09	0.25	0.13	0.01	0.91	0.58	0.88	0.29	0.89	0.24	0.14	0.42	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.28	0.09	0.03	0.11	0.67	0.17	1.29	0.30	1.17	1.67	0.60	0.00	1.57	1.89	0.87	0.01	0.18	0.16	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.17	0.50	0.04	0.03	0.21	0.01	0.71	0.00	0.50	1.30	0.06	0.48	0.82	1.34	0.56	0.03	0.05	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	1.31	2.28	1.16	0.68	2.18	0.50	2.64	0.19	2.88	2.16	2.66	2.14	2.01	2.66	1.87	1.01	0.57	0.91	0.05	3.15	0.32	0.32	0.14
C2	1.60	2.60	1.57	1.10	2.22	1.05	2.09	0.80	2.26	1.46	2.52	2.70	2.46	1.63	1.81	1.41	0.88	1.32	0.41	2.11	0.33	0.30	0.01
C2'	1.20	2.06	0.99	0.47	2.07	0.24	2.59	0.15	2.77	2.25	2.47	1.87	1.81	2.76	1.82	0.86	0.38	0.74	0.25	3.06	0.65	0.65	0.46
C3'	1.33	2.02	1.05	0.58	2.08	0.41	2.58	0.01	2.73	2.36	2.43	1.82	1.81	2.79	1.91	0.89	0.49	0.94	0.01	3.03	0.29	0.38	0.17
C4	1.65	2.95	1.57	1.02	2.59	0.87	2.81	0.58	3.11	2.06	3.15	2.93	2.65	2.47	2.12	1.43	0.81	1.25	0.29	3.14	0.31	0.29	0.03
C4'	1.45	2.12	1.22	0.84	2.16	0.71	2.61	0.40	2.78	2.37	2.50	1.93	1.91	2.77	1.98	0.99	0.74	1.15	0.45	3.06	0.27	0.19	0.35
C5	1.83	3.53	1.81	1.19	2.90	1.01	3.07	0.75	3.54	2.09	3.74	3.62	3.11	2.54	2.28	1.69	0.92	1.37	0.40	3.56	0.28	0.27	0.04
C5'	1.79	2.30	1.54	1.22	2.37	1.15	2.75	0.82	2.87	2.59	2.63	2.12	2.13	2.90	2.24	1.29	1.13	1.57	0.96	3.10	0.83	0.71	0.87
C6	1.87	3.69	1.92	1.31	2.87	1.15	2.83	0.93	3.28	1.82	3.70	3.90	3.27	2.17	2.20	1.81	1.01	1.43	0.52	3.17	0.26	0.26	0.10
C8	1.72	3.32	1.65	1.03	2.84	0.82	3.26	0.54	3.77	2.36	3.73	3.31	2.87	2.94	2.30	1.53	0.81	1.23	0.27	4.06	0.28	0.28	0.01
N1	1.76	3.21	1.82	1.28	2.53	1.18	2.35	0.99	2.64	1.50	3.07	3.42	2.96	1.71	1.97	1.68	1.00	1.41	0.55	2.45	0.27	0.27	0.09
N3	1.51	2.43	1.41	0.93	2.20	0.85	2.28	0.54	2.43	1.74	2.51	2.42	2.26	2.00	1.86	1.25	0.77	1.19	0.25	2.38	0.35	0.31	0.08
N6	1.94	4.05	2.06	1.42	2.97	1.22	2.90	1.03	3.45	1.79	4.04	4.44	3.51	2.14	2.24	1.98	1.08	1.47	0.59	3.34	0.23	0.24	0.15
N7	1.85	3.70	1.83	1.18	3.02	0.97	3.33	0.70	3.92	2.28	4.06	3.79	3.19	2.83	2.38	1.73	0.91	1.35	0.37	4.12	0.27	0.27	0.05
N9	1.58	2.85	1.47	0.91	2.56	0.74	2.95	0.43	3.29	2.24	3.19	2.78	2.52	2.76	2.13	1.33	0.73	1.14	0.20	3.49	0.30	0.29	0.06
O2'	0.72	1.69	0.57	0.05	1.69	0.25	2.34	0.58	2.60	1.92	2.21	1.47	1.39	2.55	1.41	0.48	0.01	0.19	0.70	3.02	1.04	0.99	0.85
O3'	0.86	1.70	0.55	0.07	1.75	0.13	2.35	0.50	2.58	2.07	2.21	1.47	1.43	2.60	1.53	0.38	0.05	0.44	0.44	2.99	0.63	0.76	0.54
O4'	1.61	2.38	1.45	1.06	2.34	0.94	2.74	0.67	2.92	2.40	2.72	2.24	2.16	2.79	2.11	1.23	0.94	1.31	0.63	3.15	0.40	0.36	0.52
O5'	2.24	2.59	1.97	1.65	2.67	1.60	2.95	1.17	3.01	2.87	2.82	2.44	2.48	3.07	2.60	1.76	1.59	2.03	1.30	3.15	1.05	0.89	1.09
OP1	2.64	2.92	2.40	2.23	2.97	2.24	3.15	1.89	3.20	3.07	3.09	2.81	2.83	3.21	2.90	2.10	2.14	2.56	2.23	3.30	2.14	2.00	2.14
OP2	2.14	2.39	1.86	1.55	2.46	1.54	2.67	1.02	2.73	2.62	2.58	2.27	2.30	2.78	2.40	1.71	1.55	1.95	1.19	2.86	0.94	0.73	0.94
P	2.51	2.71	2.26	2.01	2.81	1.99	3.01	1.52	3.05	2.99	2.90	2.58	2.64	3.13	2.78	2.05	1.99	2.36	1.73	3.15	1.50	1.34	1.52

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.15	0.00	0.30	0.01	0.01	0.31	0.19
C2	0.02	0.00	0.27	0.29	0.00	0.33	0.00	0.78	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.23	0.26	0.12	0.18	0.01	0.52	0.30	0.39
C2'	0.00	0.27	0.00	0.00	0.10	0.02	0.02	0.15	0.04	0.23	0.17	0.36	0.29	0.18	0.06	0.00	0.01	0.01	0.19	0.01	0.00	0.27	0.10
C3'	0.01	0.29	0.00	0.00	0.01	0.01	0.22	0.00	0.13	0.54	0.09	0.47	0.31	0.49	0.21	0.01	0.01	0.02	0.20	0.23	0.11	0.36	0.19
C4	0.01	0.00	0.10	0.01	0.00	0.11	0.00	0.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.19	0.05	0.06	0.29	0.01	0.12	0.29	0.14
C4'	0.00	0.33	0.02	0.01	0.11	0.00	0.03	0.01	0.05	0.32	0.21	0.46	0.33	0.24	0.07	0.21	0.02	0.00	0.01	0.02	0.04	0.11	0.01
C5	0.01	0.00	0.02	0.22	0.00	0.03	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.19	0.13	0.02	0.61	0.00	0.09	0.69	0.48
C5'	0.09	0.78	0.15	0.00	0.34	0.01	0.11	0.00	0.27	0.41	0.57	1.00	0.72	0.29	0.02	0.06	0.19	0.01	0.00	0.15	0.12	0.15	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.13	0.00	0.05	0.00	0.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.22	0.09	0.04	0.46	0.01	0.05	0.52	0.31
C8	0.01	0.00	0.23	0.54	0.00	0.32	0.00	0.41	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.34	0.08	1.10	0.00	0.51	1.22	0.99
N1	0.02	0.00	0.17	0.09	0.00	0.21	0.00	0.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.24	0.10	0.09	0.09	0.01	0.34	0.04	0.10
N2	0.02	0.00	0.36	0.47	0.00	0.46	0.00	1.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.23	0.40	0.14	0.48	0.01	0.75	0.69	0.72
N3	0.02	0.00	0.29	0.31	0.00	0.33	0.00	0.72	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.21	0.29	0.12	0.16	0.01	0.45	0.24	0.34
N7	0.00	0.00	0.18	0.49	0.00	0.24	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.34	0.05	1.04	0.00	0.46	1.23	0.97
N9	0.00	0.00	0.06	0.21	0.00	0.07	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.06	0.01	0.56	0.01	0.12	0.59	0.43
O2'	0.01	0.23	0.00	0.01	0.19	0.21	0.19	0.06	0.22	0.10	0.24	0.23	0.21	0.14	0.12	0.00	0.05	0.12	0.25	0.22	0.14	0.34	0.19
O3'	0.15	0.26	0.01	0.01	0.05	0.02	0.13	0.19	0.09	0.34	0.10	0.40	0.29	0.34	0.06	0.05	0.00	0.11	0.19	0.18	0.16	0.47	0.25
O4'	0.00	0.12	0.01	0.02	0.06	0.00	0.02	0.01	0.04	0.08	0.09	0.14	0.12	0.05	0.01	0.12	0.11	0.00	0.25	0.02	0.00	0.23	0.14
O5'	0.30	0.18	0.19	0.20	0.29	0.01	0.61	0.00	0.46	1.10	0.09	0.48	0.16	1.04	0.56	0.25	0.19	0.25	0.00	0.62	0.00	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.01	0.23	0.01	0.02	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.22	0.18	0.02	0.62	0.00	0.08	0.75	0.50
OP1	0.01	0.52	0.00	0.11	0.12	0.04	0.09	0.12	0.05	0.51	0.34	0.75	0.45	0.46	0.12	0.14	0.16	0.00	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00
OP2	0.31	0.30	0.27	0.36	0.29	0.11	0.69	0.15	0.52	1.22	0.04	0.69	0.24	1.23	0.59	0.34	0.47	0.23	0.02	0.75	0.01	0.00	0.01
P	0.19	0.39	0.10	0.19	0.14	0.01	0.48	0.01	0.31	0.99	0.10	0.72	0.34	0.97	0.43	0.19	0.25	0.14	0.00	0.50	0.00	0.01	0.00