Doublet Group distance statistics: 53114

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 6, 14, 9, 9, 12, 20, 14, 11, 4, 2, 2, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.008, 0.013, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.006, 0.013, 0.020, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.013 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.001, 0.009, 0.017, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.009 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.004, 0.013, 0.022, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.005, 0.015, 0.024, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.015 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.003, 0.014, 0.025, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.014 std_dev=0.011
N1	A	0, -0.001, 0.011, 0.023, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.011 std_dev=0.012
O2	A	0, 0.012, 0.035, 0.059, 0.182 max_d=0.182 avg_d=0.035 std_dev=0.024
O4	A	0, 0.016, 0.049, 0.082, 0.161 max_d=0.161 avg_d=0.049 std_dev=0.033
O4'	A	0, 0.021, 0.120, 0.219, 0.572 max_d=0.572 avg_d=0.120 std_dev=0.099
C2'	A	0, 0.004, 0.117, 0.229, 0.622 max_d=0.622 avg_d=0.117 std_dev=0.112
C4'	A	0, 0.073, 0.210, 0.347, 0.731 max_d=0.731 avg_d=0.210 std_dev=0.137
O2'	A	0, 0.014, 0.155, 0.295, 0.765 max_d=0.765 avg_d=0.155 std_dev=0.141
N7	B	0, 0.291, 0.450, 0.609, 1.007 max_d=1.007 avg_d=0.450 std_dev=0.159
C8	B	0, 0.245, 0.405, 0.564, 1.176 max_d=1.176 avg_d=0.405 std_dev=0.159
C3'	A	0, 0.084, 0.244, 0.404, 0.890 max_d=0.890 avg_d=0.244 std_dev=0.160
N9	B	0, 0.223, 0.436, 0.649, 1.445 max_d=1.445 avg_d=0.436 std_dev=0.213
C5	B	0, 0.304, 0.523, 0.741, 1.181 max_d=1.181 avg_d=0.523 std_dev=0.219
O4'	B	0, 0.246, 0.468, 0.690, 1.494 max_d=1.494 avg_d=0.468 std_dev=0.222
C1'	B	0, 0.216, 0.445, 0.673, 1.611 max_d=1.611 avg_d=0.445 std_dev=0.228
O3'	A	0, 0.163, 0.393, 0.622, 1.188 max_d=1.188 avg_d=0.393 std_dev=0.229
P	A	0, 0.090, 0.327, 0.564, 1.321 max_d=1.321 avg_d=0.327 std_dev=0.237
C5'	A	0, 0.077, 0.322, 0.568, 1.379 max_d=1.379 avg_d=0.322 std_dev=0.246
OP1	A	0, 0.116, 0.366, 0.616, 1.182 max_d=1.182 avg_d=0.366 std_dev=0.250
C4	B	0, 0.263, 0.517, 0.771, 1.487 max_d=1.487 avg_d=0.517 std_dev=0.254
C6	B	0, 0.357, 0.623, 0.889, 1.110 max_d=1.110 avg_d=0.623 std_dev=0.266
O6	B	0, 0.394, 0.667, 0.939, 1.169 max_d=1.169 avg_d=0.667 std_dev=0.272
O5'	A	0, 0.027, 0.331, 0.635, 1.570 max_d=1.570 avg_d=0.331 std_dev=0.304
OP2	A	0, 0.087, 0.399, 0.711, 1.616 max_d=1.616 avg_d=0.399 std_dev=0.312
N3	B	0, 0.273, 0.592, 0.911, 1.739 max_d=1.739 avg_d=0.592 std_dev=0.319
N1	B	0, 0.362, 0.691, 1.019, 1.351 max_d=1.351 avg_d=0.691 std_dev=0.328
C4'	B	0, 0.348, 0.683, 1.017, 1.602 max_d=1.602 avg_d=0.683 std_dev=0.335
C2'	B	0, 0.322, 0.667, 1.012, 1.778 max_d=1.778 avg_d=0.667 std_dev=0.345
C2	B	0, 0.323, 0.671, 1.019, 1.646 max_d=1.646 avg_d=0.671 std_dev=0.348
O2'	B	0, 0.386, 0.755, 1.124, 2.003 max_d=2.003 avg_d=0.755 std_dev=0.369
C3'	B	0, 0.369, 0.767, 1.166, 1.713 max_d=1.713 avg_d=0.767 std_dev=0.399
N2	B	0, 0.347, 0.757, 1.167, 1.835 max_d=1.835 avg_d=0.757 std_dev=0.410
C5'	B	0, 0.351, 0.813, 1.275, 1.731 max_d=1.731 avg_d=0.813 std_dev=0.462
O5'	B	0, 0.330, 0.799, 1.269, 2.871 max_d=2.871 avg_d=0.799 std_dev=0.470
O3'	B	0, 0.443, 1.019, 1.594, 2.001 max_d=2.001 avg_d=1.019 std_dev=0.575
P	B	0, 0.359, 1.035, 1.712, 3.581 max_d=3.581 avg_d=1.035 std_dev=0.676
OP2	B	0, 0.346, 1.030, 1.714, 3.614 max_d=3.614 avg_d=1.030 std_dev=0.684
OP1	B	0, 0.380, 1.144, 1.908, 4.117 max_d=4.117 avg_d=1.144 std_dev=0.764

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.04	0.03	0.02	0.03	0.00	0.07	0.06	0.29	0.09
C2	0.02	0.00	0.06	0.06	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.07	0.02	0.02	0.16	0.09	0.26	0.09
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.06	0.02	0.05	0.11	0.00	0.02	0.05	0.01	0.13	0.12	0.19	0.05
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.09	0.01	0.11	0.02	0.10	0.05	0.07	0.09	0.02	0.01	0.10	0.01	0.19	0.17	0.14	0.10
C4	0.02	0.01	0.04	0.09	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.12	0.01	0.02	0.26	0.13	0.21	0.13
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.00	0.06	0.01	0.05	0.02	0.03	0.05	0.04	0.02	0.06	0.00	0.02	0.08	0.23	0.05
C5	0.01	0.01	0.05	0.11	0.01	0.06	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.13	0.01	0.02	0.28	0.13	0.20	0.13
C5'	0.02	0.04	0.02	0.02	0.07	0.01	0.08	0.00	0.07	0.04	0.05	0.05	0.04	0.04	0.08	0.02	0.01	0.09	0.20	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.12	0.02	0.03	0.24	0.11	0.24	0.10
N1	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.05	0.02	0.01	0.16	0.09	0.27	0.09
N3	0.02	0.00	0.05	0.07	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.09	0.02	0.02	0.21	0.11	0.23	0.10
O2	0.04	0.01	0.11	0.09	0.01	0.05	0.02	0.05	0.02	0.02	0.01	0.00	0.11	0.11	0.02	0.04	0.12	0.09	0.28	0.10
O2'	0.03	0.06	0.00	0.02	0.03	0.04	0.03	0.04	0.04	0.02	0.05	0.11	0.00	0.04	0.04	0.03	0.06	0.12	0.21	0.05
O3'	0.02	0.07	0.02	0.01	0.12	0.02	0.13	0.04	0.12	0.05	0.09	0.11	0.04	0.00	0.13	0.02	0.18	0.24	0.12	0.14
O4	0.03	0.02	0.05	0.10	0.01	0.06	0.01	0.08	0.02	0.02	0.02	0.02	0.04	0.13	0.00	0.03	0.28	0.15	0.19	0.15
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.04	0.03	0.02	0.03	0.00	0.09	0.07	0.34	0.14
O5'	0.07	0.16	0.13	0.19	0.26	0.02	0.28	0.01	0.24	0.16	0.21	0.12	0.06	0.18	0.28	0.09	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.06	0.09	0.12	0.17	0.13	0.08	0.13	0.09	0.11	0.09	0.11	0.09	0.12	0.24	0.15	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.29	0.26	0.19	0.14	0.21	0.23	0.20	0.20	0.24	0.27	0.23	0.28	0.21	0.12	0.19	0.34	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.09	0.05	0.10	0.13	0.05	0.13	0.02	0.10	0.09	0.10	0.10	0.05	0.14	0.15	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.12	0.26	0.36	0.12	0.27	0.12	0.31	0.13	0.12	0.12	0.11	0.12	0.12	0.12	0.23	0.44	0.15	0.29	0.15	0.55	0.59	0.46
C2	0.10	0.11	0.16	0.22	0.09	0.15	0.11	0.16	0.13	0.09	0.12	0.11	0.09	0.11	0.09	0.14	0.26	0.12	0.38	0.15	0.52	0.57	0.50
C2'	0.19	0.20	0.33	0.42	0.19	0.27	0.20	0.29	0.20	0.19	0.20	0.20	0.20	0.20	0.19	0.29	0.52	0.14	0.18	0.21	0.43	0.45	0.31
C3'	0.19	0.21	0.35	0.43	0.21	0.27	0.21	0.27	0.21	0.20	0.21	0.21	0.21	0.21	0.20	0.31	0.54	0.14	0.16	0.22	0.36	0.32	0.23
C4	0.11	0.15	0.12	0.14	0.13	0.12	0.13	0.14	0.17	0.11	0.17	0.16	0.13	0.11	0.11	0.11	0.17	0.13	0.37	0.19	0.43	0.44	0.41
C4'	0.15	0.13	0.30	0.40	0.13	0.28	0.13	0.33	0.14	0.13	0.14	0.13	0.13	0.13	0.14	0.26	0.52	0.14	0.20	0.16	0.46	0.43	0.32
C5	0.10	0.15	0.13	0.17	0.12	0.13	0.13	0.14	0.16	0.10	0.17	0.16	0.12	0.11	0.10	0.12	0.21	0.12	0.32	0.19	0.42	0.44	0.38
C5'	0.14	0.13	0.28	0.38	0.12	0.26	0.13	0.30	0.14	0.12	0.14	0.13	0.12	0.13	0.13	0.24	0.49	0.13	0.19	0.16	0.42	0.38	0.29
C6	0.10	0.12	0.16	0.23	0.10	0.16	0.12	0.17	0.15	0.09	0.14	0.13	0.10	0.10	0.09	0.14	0.29	0.11	0.30	0.17	0.45	0.48	0.40
N1	0.11	0.11	0.19	0.26	0.10	0.19	0.11	0.21	0.13	0.10	0.13	0.11	0.10	0.11	0.10	0.17	0.32	0.12	0.32	0.15	0.51	0.55	0.45
N3	0.10	0.12	0.11	0.14	0.10	0.12	0.11	0.12	0.14	0.09	0.13	0.12	0.10	0.10	0.09	0.10	0.17	0.12	0.39	0.16	0.47	0.50	0.46
O2	0.12	0.12	0.19	0.26	0.12	0.19	0.13	0.20	0.14	0.11	0.13	0.12	0.12	0.13	0.12	0.17	0.29	0.13	0.43	0.15	0.59	0.65	0.58
O2'	0.21	0.20	0.37	0.49	0.20	0.34	0.19	0.39	0.19	0.19	0.20	0.20	0.20	0.19	0.20	0.33	0.61	0.17	0.21	0.20	0.50	0.51	0.35
O3'	0.24	0.27	0.42	0.50	0.26	0.31	0.26	0.29	0.26	0.24	0.27	0.27	0.26	0.25	0.25	0.37	0.63	0.17	0.20	0.26	0.30	0.23	0.20
O4	0.15	0.19	0.15	0.17	0.16	0.16	0.16	0.18	0.19	0.14	0.20	0.20	0.17	0.14	0.15	0.15	0.18	0.16	0.39	0.22	0.41	0.41	0.40
O4'	0.14	0.09	0.24	0.36	0.09	0.28	0.10	0.34	0.11	0.10	0.11	0.09	0.09	0.10	0.11	0.22	0.45	0.16	0.28	0.14	0.54	0.55	0.44
O5'	0.23	0.19	0.34	0.42	0.21	0.30	0.20	0.31	0.19	0.21	0.19	0.19	0.20	0.20	0.22	0.32	0.52	0.22	0.18	0.18	0.37	0.34	0.26
OP1	0.18	0.17	0.31	0.40	0.16	0.28	0.17	0.30	0.19	0.17	0.19	0.18	0.17	0.16	0.17	0.29	0.51	0.18	0.20	0.21	0.35	0.29	0.25
OP2	0.21	0.30	0.25	0.26	0.26	0.20	0.28	0.20	0.31	0.23	0.31	0.30	0.27	0.26	0.24	0.22	0.33	0.19	0.29	0.33	0.43	0.40	0.35
P	0.13	0.16	0.25	0.32	0.14	0.21	0.15	0.23	0.17	0.13	0.17	0.16	0.14	0.14	0.13	0.22	0.42	0.12	0.17	0.19	0.37	0.33	0.26

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.23	0.02	0.20	0.16	0.21
C2	0.03	0.00	0.12	0.15	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.18	0.04	0.22	0.02	0.15	0.15	0.20
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.06	0.01	0.03	0.01	0.05	0.06	0.09	0.15	0.12	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.04	0.19	0.26	0.16
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.08	0.00	0.06	0.01	0.08	0.10	0.12	0.18	0.13	0.07	0.04	0.02	0.01	0.01	0.31	0.07	0.34	0.42	0.36
C4	0.01	0.01	0.06	0.08	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.09	0.02	0.25	0.01	0.19	0.18	0.23
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.05	0.05	0.08	0.05	0.04	0.03	0.06	0.02	0.00	0.02	0.04	0.09	0.10	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.07	0.02	0.28	0.01	0.23	0.23	0.28
C5'	0.02	0.08	0.01	0.01	0.06	0.01	0.07	0.00	0.08	0.08	0.08	0.10	0.07	0.08	0.05	0.06	0.03	0.01	0.01	0.08	0.18	0.09	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.08	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.09	0.02	0.28	0.01	0.22	0.22	0.27
C8	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.11	0.03	0.32	0.02	0.29	0.28	0.32
N1	0.03	0.01	0.09	0.12	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.15	0.03	0.25	0.01	0.18	0.18	0.23
N2	0.04	0.01	0.15	0.18	0.02	0.08	0.01	0.10	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.12	0.24	0.05	0.20	0.02	0.13	0.13	0.18
N3	0.03	0.01	0.12	0.13	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.16	0.04	0.21	0.02	0.15	0.14	0.19
N7	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.09	0.02	0.32	0.02	0.29	0.29	0.32
N9	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.27	0.02	0.22	0.20	0.25
O2'	0.01	0.09	0.00	0.02	0.04	0.06	0.03	0.06	0.05	0.04	0.07	0.12	0.09	0.03	0.01	0.00	0.03	0.04	0.13	0.05	0.22	0.26	0.17
O3'	0.01	0.18	0.01	0.01	0.09	0.02	0.07	0.03	0.09	0.11	0.15	0.24	0.16	0.09	0.04	0.03	0.00	0.01	0.61	0.09	0.71	0.73	0.69
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.05	0.04	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.39	0.03	0.39	0.31	0.37
O5'	0.23	0.22	0.11	0.31	0.25	0.02	0.28	0.01	0.28	0.32	0.25	0.20	0.21	0.32	0.27	0.13	0.61	0.39	0.00	0.29	0.02	0.01	0.00
O6	0.02	0.02	0.04	0.07	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.05	0.09	0.03	0.29	0.00	0.24	0.25	0.29
OP1	0.20	0.15	0.19	0.34	0.19	0.09	0.23	0.18	0.22	0.29	0.18	0.13	0.15	0.29	0.22	0.22	0.71	0.39	0.02	0.24	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.15	0.26	0.42	0.18	0.10	0.23	0.09	0.22	0.28	0.18	0.13	0.14	0.29	0.20	0.26	0.73	0.31	0.01	0.25	0.01	0.00	0.01
P	0.21	0.20	0.16	0.36	0.23	0.02	0.28	0.01	0.27	0.32	0.23	0.18	0.19	0.32	0.25	0.17	0.69	0.37	0.00	0.29	0.01	0.01	0.00