Doublet Group distance statistics: 53129

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 4, 2, 14, 8, 9, 6, 11, 8, 5, 4, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.007, 0.012, 0.017, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.012 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.004, 0.011, 0.017, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.011 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.024, 0.035, 0.045, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.035 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.036, 0.049, 0.062, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.049 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.035, 0.048, 0.062, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.048 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.036, 0.049, 0.063, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.049 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.035, 0.048, 0.062, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.048 std_dev=0.013
O2	A	0, 0.081, 0.111, 0.141, 0.159 max_d=0.159 avg_d=0.111 std_dev=0.030
O4	A	0, 0.160, 0.228, 0.296, 0.334 max_d=0.334 avg_d=0.228 std_dev=0.068
O4'	A	0, 0.074, 0.165, 0.255, 0.527 max_d=0.527 avg_d=0.165 std_dev=0.091
C2'	A	0, 0.188, 0.290, 0.392, 0.587 max_d=0.587 avg_d=0.290 std_dev=0.102
O2'	A	0, 0.286, 0.429, 0.571, 0.765 max_d=0.765 avg_d=0.429 std_dev=0.143
C4'	A	0, 0.069, 0.213, 0.358, 0.752 max_d=0.752 avg_d=0.213 std_dev=0.145
C3'	A	0, 0.220, 0.366, 0.512, 0.859 max_d=0.859 avg_d=0.366 std_dev=0.146
O3'	A	0, 0.384, 0.598, 0.812, 1.253 max_d=1.253 avg_d=0.598 std_dev=0.214
O5'	A	0, 0.208, 0.426, 0.644, 1.057 max_d=1.057 avg_d=0.426 std_dev=0.218
C5'	A	0, 0.194, 0.435, 0.677, 1.321 max_d=1.321 avg_d=0.435 std_dev=0.241
C6	B	0, 0.481, 0.735, 0.990, 1.552 max_d=1.552 avg_d=0.735 std_dev=0.255
N1	B	0, 0.439, 0.704, 0.968, 1.335 max_d=1.335 avg_d=0.704 std_dev=0.265
P	A	0, 0.395, 0.671, 0.947, 1.242 max_d=1.242 avg_d=0.671 std_dev=0.276
O6	B	0, 0.527, 0.804, 1.082, 1.976 max_d=1.976 avg_d=0.804 std_dev=0.277
C5	B	0, 0.455, 0.738, 1.021, 1.589 max_d=1.589 avg_d=0.738 std_dev=0.283
OP2	A	0, 0.439, 0.742, 1.045, 1.700 max_d=1.700 avg_d=0.742 std_dev=0.303
C2	B	0, 0.427, 0.731, 1.035, 1.359 max_d=1.359 avg_d=0.731 std_dev=0.304
C4	B	0, 0.453, 0.759, 1.064, 1.528 max_d=1.528 avg_d=0.759 std_dev=0.306
N3	B	0, 0.480, 0.790, 1.101, 1.508 max_d=1.508 avg_d=0.790 std_dev=0.311
N7	B	0, 0.464, 0.783, 1.103, 2.079 max_d=2.079 avg_d=0.783 std_dev=0.319
N2	B	0, 0.441, 0.765, 1.088, 1.516 max_d=1.516 avg_d=0.765 std_dev=0.323
N9	B	0, 0.481, 0.814, 1.148, 1.650 max_d=1.650 avg_d=0.814 std_dev=0.333
C8	B	0, 0.459, 0.800, 1.140, 1.896 max_d=1.896 avg_d=0.800 std_dev=0.341
OP1	A	0, 0.492, 0.846, 1.200, 1.647 max_d=1.647 avg_d=0.846 std_dev=0.354
C1'	B	0, 0.550, 0.933, 1.315, 1.947 max_d=1.947 avg_d=0.933 std_dev=0.383
C2'	B	0, 0.641, 1.075, 1.508, 1.997 max_d=1.997 avg_d=1.075 std_dev=0.433
O4'	B	0, 0.553, 1.022, 1.491, 2.442 max_d=2.442 avg_d=1.022 std_dev=0.469
O2'	B	0, 0.711, 1.207, 1.704, 2.276 max_d=2.276 avg_d=1.207 std_dev=0.497
C3'	B	0, 0.684, 1.209, 1.734, 2.755 max_d=2.755 avg_d=1.209 std_dev=0.525
C4'	B	0, 0.672, 1.209, 1.745, 2.982 max_d=2.982 avg_d=1.209 std_dev=0.537
C5'	B	0, 0.699, 1.343, 1.987, 4.005 max_d=4.005 avg_d=1.343 std_dev=0.644
O3'	B	0, 0.794, 1.484, 2.175, 3.745 max_d=3.745 avg_d=1.484 std_dev=0.690
O5'	B	0, 0.587, 1.439, 2.291, 5.750 max_d=5.750 avg_d=1.439 std_dev=0.852
P	B	0, 0.583, 1.581, 2.579, 7.125 max_d=7.125 avg_d=1.581 std_dev=0.998
OP2	B	0, 0.711, 1.805, 2.899, 7.644 max_d=7.644 avg_d=1.805 std_dev=1.094
OP1	B	0, 0.536, 1.869, 3.203, 9.589 max_d=9.589 avg_d=1.869 std_dev=1.333

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.00	0.06	0.07	0.12	0.09
C2	0.02	0.00	0.05	0.08	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.09	0.01	0.03	0.11	0.13	0.21	0.16
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.06	0.03	0.05	0.09	0.00	0.02	0.06	0.01	0.04	0.13	0.07	0.06
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.08	0.01	0.08	0.02	0.07	0.05	0.09	0.09	0.02	0.01	0.10	0.01	0.08	0.18	0.14	0.12
C4	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.11	0.00	0.03	0.16	0.22	0.30	0.23
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.00	0.06	0.01	0.05	0.03	0.04	0.04	0.05	0.02	0.06	0.00	0.02	0.08	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.06	0.08	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.04	0.16	0.23	0.30	0.23
C5'	0.02	0.05	0.01	0.02	0.09	0.01	0.11	0.00	0.09	0.05	0.07	0.04	0.05	0.05	0.10	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.07	0.01	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.04	0.14	0.17	0.23	0.19
N1	0.00	0.01	0.03	0.05	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.01	0.11	0.12	0.18	0.15
N3	0.01	0.00	0.05	0.09	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.10	0.01	0.02	0.14	0.18	0.26	0.20
O2	0.03	0.00	0.09	0.09	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.11	0.01	0.05	0.10	0.11	0.19	0.14
O2'	0.02	0.06	0.00	0.02	0.06	0.05	0.05	0.05	0.04	0.02	0.06	0.08	0.00	0.04	0.07	0.05	0.04	0.14	0.06	0.05
O3'	0.02	0.09	0.02	0.01	0.11	0.02	0.10	0.05	0.08	0.05	0.10	0.11	0.04	0.00	0.12	0.02	0.14	0.30	0.25	0.21
O4	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.12	0.00	0.03	0.17	0.26	0.33	0.25
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.02	0.05	0.05	0.02	0.03	0.00	0.07	0.07	0.14	0.12
O5'	0.06	0.11	0.04	0.08	0.16	0.02	0.16	0.01	0.14	0.11	0.14	0.10	0.04	0.14	0.17	0.07	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.07	0.13	0.13	0.18	0.22	0.08	0.23	0.05	0.17	0.12	0.18	0.11	0.14	0.30	0.26	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.21	0.07	0.14	0.30	0.03	0.30	0.02	0.23	0.18	0.26	0.19	0.06	0.25	0.33	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.16	0.06	0.12	0.23	0.02	0.23	0.01	0.19	0.15	0.20	0.14	0.05	0.21	0.25	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.18	0.14	0.16	0.12	0.19	0.17	0.30	0.16	0.21	0.13	0.30	0.15	0.25	0.14	0.15	0.18	0.15	0.46	0.27	0.34	0.65	0.38
C2	0.15	0.15	0.15	0.13	0.17	0.20	0.25	0.36	0.29	0.24	0.19	0.23	0.14	0.29	0.18	0.17	0.14	0.19	0.47	0.40	0.40	0.70	0.43
C2'	0.12	0.23	0.17	0.16	0.12	0.13	0.15	0.21	0.14	0.19	0.18	0.33	0.18	0.23	0.13	0.19	0.19	0.12	0.46	0.24	0.35	0.55	0.34
C3'	0.12	0.23	0.18	0.17	0.12	0.14	0.13	0.19	0.13	0.17	0.19	0.33	0.19	0.20	0.12	0.19	0.20	0.14	0.49	0.18	0.42	0.57	0.39
C4	0.18	0.18	0.21	0.17	0.20	0.22	0.27	0.37	0.30	0.25	0.24	0.21	0.18	0.30	0.20	0.24	0.22	0.22	0.50	0.39	0.47	0.71	0.48
C4'	0.11	0.22	0.16	0.17	0.11	0.16	0.12	0.23	0.11	0.18	0.18	0.32	0.17	0.20	0.12	0.17	0.20	0.13	0.46	0.15	0.36	0.62	0.37
C5	0.15	0.15	0.17	0.14	0.17	0.19	0.23	0.33	0.26	0.23	0.18	0.21	0.15	0.28	0.17	0.19	0.18	0.19	0.51	0.35	0.46	0.70	0.47
C5'	0.11	0.20	0.15	0.17	0.11	0.15	0.13	0.22	0.11	0.18	0.16	0.30	0.16	0.20	0.12	0.17	0.21	0.12	0.49	0.14	0.39	0.64	0.40
C6	0.13	0.15	0.14	0.13	0.14	0.18	0.21	0.31	0.22	0.22	0.14	0.24	0.14	0.26	0.15	0.16	0.16	0.17	0.51	0.32	0.43	0.70	0.45
N1	0.13	0.15	0.13	0.13	0.14	0.19	0.21	0.32	0.22	0.22	0.13	0.26	0.14	0.27	0.15	0.15	0.15	0.16	0.49	0.34	0.39	0.69	0.43
N3	0.18	0.18	0.20	0.16	0.21	0.22	0.28	0.39	0.32	0.26	0.25	0.20	0.18	0.31	0.21	0.22	0.19	0.22	0.49	0.41	0.45	0.72	0.47
O2	0.15	0.15	0.14	0.13	0.17	0.22	0.27	0.38	0.32	0.25	0.20	0.26	0.14	0.31	0.18	0.16	0.14	0.19	0.45	0.43	0.38	0.70	0.42
O2'	0.12	0.27	0.16	0.17	0.13	0.17	0.14	0.27	0.14	0.19	0.26	0.37	0.20	0.22	0.12	0.17	0.19	0.15	0.39	0.18	0.30	0.50	0.28
O3'	0.16	0.28	0.21	0.22	0.17	0.19	0.16	0.23	0.17	0.18	0.25	0.36	0.23	0.20	0.15	0.21	0.24	0.20	0.51	0.19	0.49	0.53	0.41
O4	0.21	0.22	0.26	0.22	0.23	0.25	0.29	0.40	0.33	0.26	0.28	0.22	0.22	0.31	0.23	0.29	0.28	0.24	0.51	0.40	0.50	0.71	0.50
O4'	0.14	0.19	0.16	0.20	0.13	0.21	0.17	0.32	0.15	0.21	0.14	0.30	0.16	0.24	0.15	0.16	0.23	0.17	0.48	0.22	0.36	0.68	0.40
O5'	0.11	0.18	0.15	0.15	0.11	0.13	0.15	0.21	0.13	0.19	0.12	0.28	0.14	0.22	0.12	0.17	0.20	0.12	0.52	0.20	0.42	0.65	0.43
OP1	0.15	0.17	0.15	0.16	0.14	0.16	0.20	0.24	0.17	0.26	0.14	0.27	0.14	0.29	0.18	0.16	0.20	0.15	0.47	0.24	0.38	0.61	0.38
OP2	0.17	0.22	0.24	0.23	0.16	0.17	0.19	0.22	0.18	0.22	0.16	0.32	0.20	0.26	0.17	0.26	0.30	0.17	0.58	0.26	0.47	0.71	0.49
P	0.12	0.19	0.18	0.19	0.12	0.15	0.15	0.21	0.13	0.19	0.13	0.30	0.16	0.22	0.13	0.20	0.25	0.14	0.55	0.20	0.43	0.69	0.46

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.05	0.04	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.08	0.02	0.16	0.21	0.18
C2	0.04	0.00	0.13	0.14	0.01	0.20	0.01	0.39	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.16	0.12	0.37	0.01	0.23	0.44	0.26
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.06	0.01	0.05	0.01	0.06	0.08	0.09	0.17	0.14	0.07	0.02	0.00	0.03	0.01	0.22	0.06	0.22	0.36	0.24
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.09	0.01	0.09	0.02	0.10	0.06	0.12	0.16	0.13	0.08	0.05	0.02	0.01	0.02	0.36	0.10	0.40	0.44	0.35
C4	0.02	0.01	0.06	0.09	0.00	0.11	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.09	0.06	0.23	0.01	0.18	0.33	0.20
C4'	0.01	0.20	0.01	0.01	0.11	0.00	0.09	0.00	0.12	0.03	0.17	0.24	0.19	0.04	0.04	0.05	0.02	0.00	0.01	0.11	0.15	0.12	0.07
C5	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.09	0.00	0.20	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.09	0.04	0.22	0.01	0.24	0.34	0.22
C5'	0.03	0.39	0.01	0.02	0.23	0.00	0.20	0.00	0.27	0.07	0.35	0.47	0.35	0.12	0.10	0.05	0.06	0.01	0.01	0.25	0.30	0.15	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.12	0.01	0.27	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.11	0.06	0.27	0.01	0.22	0.38	0.20
C8	0.02	0.01	0.08	0.06	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.08	0.06	0.15	0.02	0.31	0.28	0.27
N1	0.03	0.00	0.09	0.12	0.01	0.17	0.01	0.35	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.13	0.09	0.33	0.01	0.19	0.42	0.21
N2	0.05	0.01	0.17	0.16	0.01	0.24	0.01	0.47	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.20	0.20	0.15	0.45	0.01	0.35	0.54	0.37
N3	0.04	0.00	0.14	0.13	0.00	0.19	0.01	0.35	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.14	0.13	0.33	0.01	0.21	0.39	0.24
N7	0.01	0.01	0.07	0.08	0.01	0.04	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.09	0.04	0.17	0.02	0.32	0.31	0.26
N9	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.14	0.02	0.21	0.27	0.22
O2'	0.02	0.15	0.00	0.02	0.08	0.05	0.07	0.05	0.09	0.09	0.12	0.20	0.14	0.08	0.03	0.00	0.05	0.06	0.09	0.09	0.14	0.27	0.13
O3'	0.02	0.16	0.03	0.01	0.09	0.02	0.09	0.06	0.11	0.08	0.13	0.20	0.14	0.09	0.05	0.05	0.00	0.02	0.37	0.11	0.54	0.59	0.45
O4'	0.00	0.12	0.01	0.02	0.06	0.00	0.04	0.01	0.06	0.06	0.09	0.15	0.13	0.04	0.01	0.06	0.02	0.00	0.11	0.05	0.16	0.20	0.22
O5'	0.08	0.37	0.22	0.36	0.23	0.01	0.22	0.01	0.27	0.15	0.33	0.45	0.33	0.17	0.14	0.09	0.37	0.11	0.00	0.26	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.11	0.01	0.25	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.09	0.11	0.05	0.26	0.00	0.26	0.38	0.21
OP1	0.16	0.23	0.22	0.40	0.18	0.15	0.24	0.30	0.22	0.31	0.19	0.35	0.21	0.32	0.21	0.14	0.54	0.16	0.01	0.26	0.00	0.01	0.00
OP2	0.21	0.44	0.36	0.44	0.33	0.12	0.34	0.15	0.38	0.28	0.42	0.54	0.39	0.31	0.27	0.27	0.59	0.20	0.01	0.38	0.01	0.00	0.01
P	0.18	0.26	0.24	0.35	0.20	0.07	0.22	0.02	0.20	0.27	0.21	0.37	0.24	0.26	0.22	0.13	0.45	0.22	0.00	0.21	0.00	0.01	0.00