Doublet Group distance statistics: 53131

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 3, 3, 3, 1, 1, 3, 6, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.004, 0.010, 0.015, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.010 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.004, 0.009, 0.014, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.009, 0.016, 0.023, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.009, 0.016, 0.024, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.016 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.005, 0.012, 0.020, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.010, 0.018, 0.026, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.018 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.010, 0.020, 0.030, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.020 std_dev=0.010
O2	A	0, 0.025, 0.044, 0.063, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.044 std_dev=0.019
O4	A	0, 0.036, 0.074, 0.112, 0.165 max_d=0.165 avg_d=0.074 std_dev=0.038
O4'	A	0, 0.021, 0.113, 0.205, 0.442 max_d=0.442 avg_d=0.113 std_dev=0.092
C2'	A	0, 0.028, 0.124, 0.221, 0.417 max_d=0.417 avg_d=0.124 std_dev=0.097
O2'	A	0, 0.040, 0.152, 0.265, 0.434 max_d=0.434 avg_d=0.152 std_dev=0.112
C4'	A	0, 0.056, 0.190, 0.324, 0.581 max_d=0.581 avg_d=0.190 std_dev=0.134
C3'	A	0, 0.061, 0.205, 0.349, 0.636 max_d=0.636 avg_d=0.205 std_dev=0.144
C5'	A	0, 0.083, 0.312, 0.541, 1.018 max_d=1.018 avg_d=0.312 std_dev=0.229
O3'	A	0, 0.096, 0.338, 0.579, 0.890 max_d=0.890 avg_d=0.338 std_dev=0.241
O5'	A	0, 0.084, 0.335, 0.587, 0.905 max_d=0.905 avg_d=0.335 std_dev=0.251
P	A	0, 0.181, 0.437, 0.694, 0.842 max_d=0.842 avg_d=0.437 std_dev=0.257
OP2	A	0, 0.232, 0.508, 0.784, 1.070 max_d=1.070 avg_d=0.508 std_dev=0.276
C2	B	0, 0.364, 0.652, 0.939, 1.094 max_d=1.094 avg_d=0.652 std_dev=0.287
N1	B	0, 0.420, 0.708, 0.995, 1.161 max_d=1.161 avg_d=0.708 std_dev=0.287
C5	B	0, 0.435, 0.738, 1.042, 1.143 max_d=1.143 avg_d=0.738 std_dev=0.303
N2	B	0, 0.363, 0.669, 0.976, 1.196 max_d=1.196 avg_d=0.669 std_dev=0.306
C6	B	0, 0.449, 0.757, 1.066, 1.174 max_d=1.174 avg_d=0.757 std_dev=0.309
N3	B	0, 0.332, 0.647, 0.963, 1.056 max_d=1.056 avg_d=0.647 std_dev=0.315
C4	B	0, 0.369, 0.686, 1.002, 1.116 max_d=1.116 avg_d=0.686 std_dev=0.317
OP1	A	0, 0.204, 0.528, 0.851, 1.113 max_d=1.113 avg_d=0.528 std_dev=0.323
N7	B	0, 0.478, 0.824, 1.169, 1.338 max_d=1.338 avg_d=0.824 std_dev=0.345
C3'	B	0, 0.498, 0.872, 1.245, 1.650 max_d=1.650 avg_d=0.872 std_dev=0.373
O6	B	0, 0.487, 0.862, 1.238, 1.508 max_d=1.508 avg_d=0.862 std_dev=0.376
C2'	B	0, 0.546, 0.924, 1.302, 1.717 max_d=1.717 avg_d=0.924 std_dev=0.378
C1'	B	0, 0.474, 0.859, 1.243, 1.529 max_d=1.529 avg_d=0.859 std_dev=0.385
C8	B	0, 0.435, 0.820, 1.205, 1.375 max_d=1.375 avg_d=0.820 std_dev=0.385
N9	B	0, 0.359, 0.746, 1.133, 1.339 max_d=1.339 avg_d=0.746 std_dev=0.387
O4'	B	0, 0.493, 0.897, 1.301, 1.559 max_d=1.559 avg_d=0.897 std_dev=0.404
C4'	B	0, 0.498, 0.960, 1.423, 1.810 max_d=1.810 avg_d=0.960 std_dev=0.462
C5'	B	0, 0.514, 1.023, 1.531, 1.891 max_d=1.891 avg_d=1.023 std_dev=0.509
O3'	B	0, 0.474, 0.987, 1.501, 2.074 max_d=2.074 avg_d=0.987 std_dev=0.513
O2'	B	0, 0.704, 1.249, 1.795, 2.510 max_d=2.510 avg_d=1.249 std_dev=0.545
P	B	0, 0.620, 1.242, 1.864, 2.342 max_d=2.342 avg_d=1.242 std_dev=0.622
OP2	B	0, 0.627, 1.288, 1.948, 2.691 max_d=2.691 avg_d=1.288 std_dev=0.661
O5'	B	0, 0.521, 1.241, 1.960, 2.873 max_d=2.873 avg_d=1.241 std_dev=0.719
OP1	B	0, 0.648, 1.426, 2.205, 3.009 max_d=3.009 avg_d=1.426 std_dev=0.779

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.00	0.10	0.11	0.12	0.10
C2	0.02	0.00	0.08	0.10	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.11	0.01	0.02	0.15	0.17	0.24	0.16
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.02	0.03	0.01	0.04	0.02	0.07	0.12	0.01	0.02	0.05	0.01	0.06	0.15	0.12	0.06
C3'	0.02	0.10	0.00	0.00	0.09	0.01	0.09	0.02	0.08	0.06	0.10	0.13	0.01	0.01	0.09	0.02	0.11	0.18	0.17	0.12
C4	0.02	0.01	0.04	0.09	0.00	0.05	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.11	0.00	0.03	0.23	0.28	0.35	0.26
C4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.03	0.04	0.06	0.08	0.02	0.06	0.01	0.01	0.12	0.04	0.04
C5	0.02	0.01	0.03	0.09	0.01	0.07	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.11	0.01	0.04	0.25	0.28	0.33	0.26
C5'	0.02	0.06	0.01	0.02	0.14	0.01	0.16	0.00	0.14	0.07	0.10	0.05	0.08	0.05	0.15	0.01	0.01	0.13	0.03	0.02
C6	0.02	0.01	0.04	0.08	0.01	0.07	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.09	0.01	0.03	0.22	0.21	0.24	0.19
N1	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.06	0.01	0.02	0.15	0.15	0.20	0.14
N3	0.02	0.00	0.07	0.10	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.12	0.01	0.03	0.19	0.23	0.30	0.21
O2	0.03	0.01	0.12	0.13	0.01	0.06	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.00	0.11	0.16	0.01	0.03	0.12	0.14	0.22	0.14
O2'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.04	0.08	0.03	0.08	0.03	0.02	0.06	0.11	0.00	0.04	0.05	0.04	0.06	0.14	0.09	0.05
O3'	0.02	0.11	0.02	0.01	0.11	0.02	0.11	0.05	0.09	0.06	0.12	0.16	0.04	0.00	0.13	0.03	0.20	0.28	0.28	0.22
O4	0.02	0.01	0.05	0.09	0.00	0.06	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.13	0.00	0.04	0.24	0.32	0.38	0.29
O4'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.04	0.03	0.04	0.00	0.12	0.15	0.16	0.16
O5'	0.10	0.15	0.06	0.11	0.23	0.01	0.25	0.01	0.22	0.15	0.19	0.12	0.06	0.20	0.24	0.12	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.11	0.17	0.15	0.18	0.28	0.12	0.28	0.13	0.21	0.15	0.23	0.14	0.14	0.28	0.32	0.15	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.24	0.12	0.17	0.35	0.04	0.33	0.03	0.24	0.20	0.30	0.22	0.09	0.28	0.38	0.16	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.16	0.06	0.12	0.26	0.04	0.26	0.02	0.19	0.14	0.21	0.14	0.05	0.22	0.29	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.07	0.13	0.07	0.12	0.12	0.19	0.32	0.18	0.23	0.07	0.15	0.06	0.26	0.16	0.16	0.10	0.11	0.27	0.27	0.55	0.49	0.41
C2	0.19	0.14	0.17	0.11	0.21	0.18	0.29	0.36	0.32	0.28	0.23	0.13	0.14	0.33	0.23	0.18	0.10	0.17	0.28	0.40	0.41	0.43	0.31
C2'	0.09	0.18	0.09	0.12	0.08	0.22	0.14	0.41	0.14	0.18	0.14	0.28	0.13	0.23	0.10	0.11	0.13	0.14	0.33	0.28	0.60	0.51	0.46
C3'	0.10	0.19	0.11	0.14	0.09	0.26	0.12	0.46	0.12	0.15	0.15	0.28	0.15	0.19	0.10	0.11	0.15	0.18	0.37	0.21	0.63	0.52	0.47
C4	0.24	0.22	0.22	0.19	0.26	0.26	0.31	0.41	0.34	0.30	0.28	0.20	0.21	0.34	0.26	0.22	0.16	0.24	0.37	0.41	0.35	0.37	0.27
C4'	0.08	0.12	0.10	0.08	0.06	0.18	0.10	0.39	0.08	0.16	0.09	0.20	0.08	0.18	0.09	0.14	0.10	0.12	0.31	0.13	0.60	0.50	0.44
C5	0.20	0.17	0.18	0.15	0.22	0.22	0.28	0.39	0.29	0.27	0.22	0.16	0.17	0.31	0.22	0.20	0.12	0.19	0.33	0.37	0.40	0.40	0.30
C5'	0.08	0.10	0.10	0.07	0.06	0.19	0.10	0.40	0.08	0.15	0.07	0.18	0.08	0.17	0.09	0.14	0.10	0.13	0.35	0.13	0.62	0.53	0.47
C6	0.16	0.11	0.16	0.10	0.18	0.17	0.24	0.36	0.25	0.25	0.16	0.13	0.12	0.29	0.19	0.18	0.09	0.15	0.29	0.34	0.46	0.44	0.34
N1	0.16	0.09	0.15	0.08	0.17	0.15	0.24	0.34	0.25	0.25	0.15	0.12	0.10	0.29	0.19	0.17	0.09	0.13	0.27	0.34	0.47	0.46	0.36
N3	0.23	0.21	0.21	0.17	0.26	0.25	0.32	0.40	0.35	0.31	0.29	0.18	0.21	0.35	0.26	0.21	0.14	0.23	0.34	0.42	0.35	0.38	0.27
O2	0.19	0.12	0.17	0.10	0.22	0.17	0.30	0.34	0.34	0.29	0.23	0.13	0.13	0.34	0.23	0.18	0.09	0.16	0.25	0.42	0.43	0.44	0.32
O2'	0.09	0.25	0.09	0.15	0.09	0.22	0.08	0.41	0.10	0.14	0.22	0.33	0.18	0.18	0.08	0.10	0.16	0.17	0.39	0.18	0.71	0.59	0.55
O3'	0.16	0.27	0.16	0.22	0.15	0.33	0.12	0.52	0.14	0.14	0.22	0.35	0.23	0.16	0.13	0.14	0.22	0.26	0.43	0.18	0.68	0.54	0.51
O4	0.28	0.27	0.25	0.24	0.29	0.32	0.34	0.45	0.36	0.32	0.32	0.25	0.26	0.36	0.29	0.25	0.21	0.29	0.43	0.42	0.32	0.35	0.27
O4'	0.14	0.08	0.16	0.09	0.13	0.11	0.18	0.32	0.15	0.22	0.08	0.14	0.08	0.24	0.16	0.19	0.13	0.11	0.28	0.20	0.56	0.49	0.42
O5'	0.11	0.12	0.13	0.12	0.11	0.19	0.15	0.39	0.14	0.19	0.10	0.19	0.11	0.21	0.13	0.15	0.13	0.14	0.37	0.20	0.62	0.57	0.49
OP1	0.17	0.14	0.17	0.16	0.16	0.21	0.21	0.39	0.19	0.26	0.12	0.21	0.13	0.29	0.19	0.20	0.16	0.17	0.43	0.26	0.71	0.67	0.58
OP2	0.18	0.21	0.17	0.21	0.18	0.26	0.20	0.41	0.19	0.23	0.17	0.28	0.20	0.25	0.19	0.17	0.26	0.23	0.45	0.25	0.67	0.66	0.57
P	0.11	0.14	0.10	0.13	0.10	0.21	0.13	0.40	0.12	0.17	0.10	0.22	0.12	0.20	0.12	0.13	0.15	0.16	0.40	0.18	0.64	0.61	0.52

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.16	0.01	0.43	0.12	0.15
C2	0.03	0.00	0.11	0.09	0.01	0.16	0.01	0.31	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.10	0.13	0.16	0.01	0.33	0.35	0.21
C2'	0.00	0.11	0.00	0.01	0.05	0.02	0.03	0.02	0.04	0.08	0.07	0.14	0.11	0.06	0.02	0.01	0.03	0.01	0.05	0.04	0.41	0.16	0.12
C3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.06	0.00	0.07	0.02	0.07	0.06	0.08	0.11	0.09	0.07	0.05	0.02	0.01	0.02	0.06	0.08	0.35	0.22	0.11
C4	0.02	0.01	0.05	0.06	0.00	0.10	0.00	0.22	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.07	0.07	0.13	0.01	0.36	0.25	0.19
C4'	0.01	0.16	0.02	0.00	0.10	0.00	0.10	0.01	0.12	0.05	0.15	0.18	0.15	0.07	0.05	0.10	0.02	0.00	0.01	0.12	0.38	0.12	0.11
C5	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.10	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.08	0.04	0.19	0.01	0.36	0.30	0.24
C5'	0.04	0.31	0.02	0.02	0.22	0.01	0.23	0.00	0.27	0.15	0.30	0.35	0.28	0.19	0.13	0.09	0.05	0.01	0.01	0.27	0.22	0.23	0.02
C6	0.02	0.01	0.04	0.07	0.01	0.12	0.01	0.27	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.09	0.06	0.17	0.00	0.33	0.34	0.24
C8	0.01	0.01	0.08	0.06	0.01	0.05	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.07	0.07	0.27	0.02	0.42	0.25	0.26
N1	0.03	0.00	0.07	0.08	0.01	0.15	0.01	0.30	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.10	0.10	0.14	0.01	0.30	0.36	0.22
N2	0.04	0.01	0.14	0.11	0.01	0.18	0.01	0.35	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.15	0.13	0.16	0.26	0.01	0.35	0.41	0.27
N3	0.03	0.00	0.11	0.09	0.00	0.15	0.01	0.28	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.09	0.13	0.13	0.01	0.36	0.28	0.19
N7	0.01	0.01	0.06	0.07	0.01	0.07	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.09	0.06	0.26	0.02	0.41	0.29	0.28
N9	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.05	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.02	0.19	0.01	0.40	0.20	0.20
O2'	0.03	0.11	0.01	0.02	0.05	0.10	0.04	0.09	0.06	0.07	0.09	0.15	0.10	0.06	0.02	0.00	0.05	0.07	0.12	0.06	0.48	0.13	0.17
O3'	0.02	0.10	0.03	0.01	0.07	0.02	0.08	0.05	0.09	0.07	0.10	0.13	0.09	0.09	0.04	0.05	0.00	0.03	0.18	0.10	0.39	0.28	0.19
O4'	0.01	0.13	0.01	0.02	0.07	0.00	0.04	0.01	0.06	0.07	0.10	0.16	0.13	0.06	0.02	0.07	0.03	0.00	0.20	0.06	0.42	0.10	0.16
O5'	0.16	0.16	0.05	0.06	0.13	0.01	0.19	0.01	0.17	0.27	0.14	0.26	0.13	0.26	0.19	0.12	0.18	0.20	0.00	0.20	0.02	0.02	0.01
O6	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.12	0.01	0.27	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.10	0.06	0.20	0.00	0.35	0.37	0.27
OP1	0.43	0.33	0.41	0.35	0.36	0.38	0.36	0.22	0.33	0.42	0.30	0.35	0.36	0.41	0.40	0.48	0.39	0.42	0.02	0.35	0.00	0.01	0.00
OP2	0.12	0.35	0.16	0.22	0.25	0.12	0.30	0.23	0.34	0.25	0.36	0.41	0.28	0.29	0.20	0.13	0.28	0.10	0.02	0.37	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.21	0.12	0.11	0.19	0.11	0.24	0.02	0.24	0.26	0.22	0.27	0.19	0.28	0.20	0.17	0.19	0.16	0.01	0.27	0.00	0.01	0.00