Doublet Group distance statistics: 53135

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 1, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.006, 0.010, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.006 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.000, 0.004, 0.009, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.004 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.002, 0.006, 0.011, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.006 std_dev=0.004
C4	A	0, 0.003, 0.008, 0.013, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.008 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.003, 0.009, 0.014, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.000, 0.010, 0.019, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.010 std_dev=0.009
O2	A	0, 0.008, 0.018, 0.028, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.018 std_dev=0.010
O4	A	0, 0.011, 0.032, 0.052, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.032 std_dev=0.020
O2'	A	0, 0.059, 0.178, 0.298, 0.364 max_d=0.364 avg_d=0.178 std_dev=0.119
C2'	A	0, 0.073, 0.222, 0.370, 0.434 max_d=0.434 avg_d=0.222 std_dev=0.148
O4'	A	0, 0.085, 0.243, 0.401, 0.438 max_d=0.438 avg_d=0.243 std_dev=0.158
C2	B	0, 0.221, 0.484, 0.748, 0.963 max_d=0.963 avg_d=0.484 std_dev=0.263
C4'	A	0, 0.152, 0.416, 0.681, 0.719 max_d=0.719 avg_d=0.416 std_dev=0.265
C3'	A	0, 0.143, 0.409, 0.674, 0.742 max_d=0.742 avg_d=0.409 std_dev=0.266
C4	B	0, 0.279, 0.549, 0.820, 0.875 max_d=0.875 avg_d=0.549 std_dev=0.270
N3	B	0, 0.232, 0.537, 0.841, 0.952 max_d=0.952 avg_d=0.537 std_dev=0.305
N9	B	0, 0.351, 0.682, 1.012, 1.182 max_d=1.182 avg_d=0.682 std_dev=0.331
N2	B	0, 0.250, 0.607, 0.964, 1.288 max_d=1.288 avg_d=0.607 std_dev=0.357
O3'	A	0, 0.210, 0.581, 0.952, 1.036 max_d=1.036 avg_d=0.581 std_dev=0.371
O4'	B	0, 0.436, 0.820, 1.205, 1.231 max_d=1.231 avg_d=0.820 std_dev=0.385
N1	B	0, 0.011, 0.432, 0.854, 1.528 max_d=1.528 avg_d=0.432 std_dev=0.421
C4'	B	0, 0.435, 0.860, 1.285, 1.344 max_d=1.344 avg_d=0.860 std_dev=0.425
C5'	A	0, 0.278, 0.716, 1.154, 1.264 max_d=1.264 avg_d=0.716 std_dev=0.438
C5	B	0, 0.129, 0.582, 1.034, 1.694 max_d=1.694 avg_d=0.582 std_dev=0.452
C8	B	0, 0.318, 0.771, 1.224, 1.628 max_d=1.628 avg_d=0.771 std_dev=0.453
C1'	B	0, 0.344, 0.836, 1.329, 1.631 max_d=1.631 avg_d=0.836 std_dev=0.493
O5'	A	0, 0.462, 1.021, 1.580, 2.147 max_d=2.147 avg_d=1.021 std_dev=0.559
C6	B	0, -0.013, 0.549, 1.111, 2.037 max_d=2.037 avg_d=0.549 std_dev=0.562
C5'	B	0, 0.362, 0.954, 1.545, 2.116 max_d=2.116 avg_d=0.954 std_dev=0.591
N7	B	0, 0.155, 0.753, 1.351, 2.192 max_d=2.192 avg_d=0.753 std_dev=0.598
O5'	B	0, 0.396, 1.009, 1.622, 2.137 max_d=2.137 avg_d=1.009 std_dev=0.613
C3'	B	0, 0.599, 1.234, 1.869, 2.013 max_d=2.013 avg_d=1.234 std_dev=0.635
P	A	0, 0.608, 1.267, 1.925, 2.298 max_d=2.298 avg_d=1.267 std_dev=0.659
OP2	A	0, 0.508, 1.190, 1.872, 2.109 max_d=2.109 avg_d=1.190 std_dev=0.682
O6	B	0, -0.034, 0.738, 1.510, 2.785 max_d=2.785 avg_d=0.738 std_dev=0.772
C2'	B	0, 0.496, 1.305, 2.114, 2.470 max_d=2.470 avg_d=1.305 std_dev=0.809
P	B	0, 0.774, 1.587, 2.400, 2.531 max_d=2.531 avg_d=1.587 std_dev=0.813
OP1	A	0, 0.820, 1.669, 2.518, 2.862 max_d=2.862 avg_d=1.669 std_dev=0.849
O3'	B	0, 0.748, 1.603, 2.459, 2.572 max_d=2.572 avg_d=1.603 std_dev=0.856
OP1	B	0, 0.913, 1.914, 2.914, 2.867 max_d=2.867 avg_d=1.914 std_dev=1.000
OP2	B	0, 0.774, 1.824, 2.873, 3.120 max_d=3.120 avg_d=1.824 std_dev=1.049
O2'	B	0, 0.593, 1.754, 2.915, 3.220 max_d=3.220 avg_d=1.754 std_dev=1.161

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.13	0.10	0.32	0.11
C2	0.02	0.00	0.06	0.09	0.00	0.05	0.01	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.09	0.00	0.02	0.27	0.20	0.35	0.20
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.05	0.11	0.00	0.01	0.03	0.01	0.19	0.25	0.17	0.09
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.06	0.00	0.04	0.01	0.04	0.04	0.09	0.12	0.01	0.00	0.07	0.01	0.27	0.35	0.10	0.18
C4	0.01	0.00	0.03	0.06	0.00	0.07	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.07	0.00	0.03	0.38	0.28	0.38	0.29
C4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.07	0.00	0.07	0.00	0.06	0.04	0.06	0.04	0.03	0.01	0.08	0.00	0.01	0.13	0.28	0.04
C5	0.01	0.01	0.04	0.04	0.00	0.07	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.04	0.38	0.27	0.35	0.28
C5'	0.03	0.10	0.01	0.01	0.16	0.00	0.17	0.00	0.14	0.10	0.14	0.07	0.03	0.03	0.18	0.01	0.01	0.15	0.30	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.04	0.00	0.06	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.04	0.00	0.04	0.33	0.21	0.34	0.21
N1	0.01	0.00	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.03	0.00	0.02	0.26	0.18	0.34	0.17
N3	0.02	0.00	0.05	0.09	0.00	0.06	0.01	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.10	0.00	0.02	0.33	0.25	0.37	0.25
O2	0.02	0.00	0.11	0.12	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.13	0.01	0.03	0.23	0.18	0.35	0.18
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.05	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.06	0.09	0.00	0.03	0.05	0.04	0.05	0.19	0.22	0.03
O3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.07	0.01	0.04	0.03	0.04	0.03	0.10	0.13	0.03	0.00	0.08	0.01	0.25	0.45	0.12	0.25
O4	0.01	0.00	0.03	0.07	0.00	0.08	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.08	0.00	0.03	0.39	0.31	0.39	0.32
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.02	0.03	0.04	0.01	0.03	0.00	0.09	0.07	0.40	0.18
O5'	0.13	0.27	0.19	0.27	0.38	0.01	0.38	0.01	0.33	0.26	0.33	0.23	0.05	0.25	0.39	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.10	0.20	0.25	0.35	0.28	0.13	0.27	0.15	0.21	0.18	0.25	0.18	0.19	0.45	0.31	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.32	0.35	0.17	0.10	0.38	0.28	0.35	0.30	0.34	0.34	0.37	0.35	0.22	0.12	0.39	0.40	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.11	0.20	0.09	0.18	0.29	0.04	0.28	0.01	0.21	0.17	0.25	0.18	0.03	0.25	0.32	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.17	0.18	0.18	0.15	0.14	0.26	0.22	0.29	0.27	0.13	0.35	0.14	0.34	0.17	0.14	0.23	0.20	0.60	0.45	1.43	1.12	1.00
C2	0.20	0.20	0.37	0.28	0.24	0.17	0.35	0.24	0.43	0.30	0.34	0.23	0.19	0.38	0.23	0.34	0.30	0.27	0.57	0.55	1.28	0.98	0.87
C2'	0.22	0.29	0.27	0.30	0.19	0.21	0.17	0.18	0.16	0.20	0.21	0.42	0.26	0.21	0.19	0.26	0.28	0.21	0.53	0.22	1.43	1.12	0.98
C3'	0.19	0.25	0.24	0.26	0.15	0.17	0.15	0.18	0.12	0.21	0.17	0.40	0.22	0.23	0.17	0.30	0.29	0.18	0.56	0.20	1.47	1.15	1.02
C4	0.27	0.27	0.46	0.34	0.28	0.23	0.39	0.31	0.48	0.35	0.38	0.29	0.26	0.43	0.28	0.52	0.38	0.33	0.61	0.62	1.27	0.99	0.88
C4'	0.14	0.17	0.18	0.16	0.11	0.14	0.22	0.27	0.19	0.30	0.09	0.35	0.11	0.35	0.18	0.33	0.28	0.18	0.65	0.33	1.53	1.20	1.10
C5	0.23	0.22	0.36	0.28	0.25	0.21	0.37	0.31	0.45	0.34	0.32	0.29	0.22	0.43	0.25	0.38	0.31	0.30	0.65	0.61	1.36	1.08	0.97
C5'	0.15	0.14	0.18	0.15	0.15	0.19	0.29	0.36	0.25	0.38	0.08	0.34	0.07	0.44	0.22	0.32	0.29	0.24	0.73	0.41	1.58	1.26	1.16
C6	0.18	0.18	0.28	0.23	0.21	0.18	0.34	0.28	0.40	0.32	0.26	0.29	0.17	0.41	0.22	0.24	0.26	0.26	0.65	0.57	1.41	1.13	1.01
N1	0.16	0.16	0.27	0.22	0.20	0.16	0.32	0.25	0.39	0.30	0.25	0.28	0.15	0.38	0.20	0.21	0.25	0.24	0.61	0.55	1.38	1.08	0.96
N3	0.26	0.27	0.46	0.34	0.28	0.21	0.38	0.28	0.47	0.33	0.39	0.27	0.25	0.41	0.27	0.51	0.37	0.31	0.58	0.59	1.23	0.95	0.83
O2	0.18	0.19	0.38	0.29	0.23	0.16	0.33	0.22	0.40	0.28	0.34	0.18	0.17	0.34	0.22	0.32	0.30	0.25	0.53	0.49	1.22	0.92	0.80
O2'	0.29	0.36	0.32	0.35	0.25	0.28	0.20	0.22	0.23	0.21	0.34	0.45	0.32	0.18	0.24	0.42	0.36	0.26	0.50	0.25	1.43	1.12	0.98
O3'	0.27	0.31	0.33	0.34	0.20	0.25	0.14	0.20	0.12	0.20	0.24	0.42	0.28	0.17	0.22	0.47	0.39	0.22	0.50	0.13	1.44	1.12	0.99
O4	0.31	0.30	0.53	0.38	0.31	0.26	0.41	0.33	0.50	0.36	0.41	0.31	0.29	0.44	0.30	0.64	0.43	0.36	0.61	0.63	1.21	0.94	0.83
O4'	0.14	0.13	0.14	0.13	0.16	0.17	0.31	0.31	0.32	0.35	0.11	0.32	0.08	0.43	0.21	0.22	0.26	0.23	0.67	0.51	1.51	1.19	1.09
O5'	0.14	0.21	0.15	0.16	0.12	0.14	0.17	0.27	0.17	0.21	0.14	0.34	0.19	0.26	0.14	0.16	0.20	0.20	0.63	0.28	1.61	1.35	1.19
OP1	0.12	0.21	0.11	0.10	0.10	0.15	0.21	0.35	0.20	0.28	0.11	0.38	0.17	0.35	0.15	0.22	0.22	0.22	0.73	0.35	1.70	1.47	1.31
OP2	0.38	0.45	0.40	0.40	0.31	0.35	0.22	0.40	0.19	0.23	0.30	0.62	0.44	0.23	0.30	0.32	0.29	0.38	0.73	0.23	1.69	1.50	1.31
P	0.23	0.31	0.19	0.22	0.18	0.23	0.17	0.37	0.16	0.21	0.18	0.47	0.29	0.26	0.18	0.13	0.18	0.29	0.73	0.29	1.71	1.49	1.32

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.00	0.00	0.02	0.23	0.00	0.26	0.01	0.70	0.62	0.45
C2	0.03	0.00	0.28	0.18	0.01	0.09	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.26	0.32	0.17	0.38	0.00	1.07	0.86	0.69
C2'	0.01	0.28	0.00	0.00	0.13	0.01	0.06	0.19	0.10	0.18	0.20	0.36	0.29	0.13	0.04	0.00	0.03	0.02	0.28	0.07	0.65	0.29	0.29
C3'	0.02	0.18	0.00	0.00	0.14	0.00	0.16	0.02	0.17	0.17	0.17	0.21	0.16	0.18	0.11	0.01	0.00	0.02	0.35	0.18	0.38	0.30	0.21
C4	0.01	0.01	0.13	0.14	0.00	0.03	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.13	0.22	0.09	0.44	0.01	1.11	0.88	0.76
C4'	0.02	0.09	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.04	0.13	0.05	0.13	0.09	0.11	0.04	0.20	0.04	0.01	0.02	0.05	0.35	0.31	0.12
C5	0.01	0.00	0.06	0.16	0.00	0.05	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.21	0.17	0.04	0.55	0.01	1.33	1.02	0.95
C5'	0.07	0.13	0.19	0.02	0.14	0.01	0.20	0.00	0.18	0.28	0.14	0.16	0.13	0.28	0.16	0.05	0.18	0.03	0.01	0.21	0.33	0.31	0.01
C6	0.01	0.00	0.10	0.17	0.00	0.04	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.20	0.07	0.55	0.00	1.39	1.05	0.97
C8	0.01	0.01	0.18	0.17	0.00	0.13	0.00	0.28	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.33	0.14	0.11	0.61	0.01	1.30	0.98	0.97
N1	0.02	0.00	0.20	0.17	0.01	0.05	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.17	0.26	0.13	0.47	0.00	1.25	0.97	0.85
N2	0.04	0.00	0.36	0.21	0.01	0.13	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.39	0.39	0.20	0.32	0.01	0.99	0.80	0.60
N3	0.03	0.01	0.29	0.16	0.00	0.09	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.27	0.32	0.17	0.34	0.00	0.97	0.79	0.61
N7	0.00	0.00	0.13	0.18	0.00	0.11	0.00	0.28	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.33	0.14	0.06	0.64	0.01	1.46	1.09	1.07
N9	0.00	0.01	0.04	0.11	0.01	0.04	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.15	0.16	0.01	0.45	0.01	1.04	0.83	0.73
O2'	0.02	0.26	0.00	0.01	0.13	0.20	0.21	0.05	0.18	0.33	0.17	0.39	0.27	0.33	0.15	0.00	0.09	0.12	0.10	0.23	0.61	0.38	0.20
O3'	0.23	0.32	0.03	0.00	0.22	0.04	0.17	0.18	0.20	0.14	0.26	0.39	0.32	0.14	0.16	0.09	0.00	0.15	0.35	0.18	0.37	0.38	0.31
O4'	0.00	0.17	0.02	0.02	0.09	0.01	0.04	0.03	0.07	0.11	0.13	0.20	0.17	0.06	0.01	0.12	0.15	0.00	0.33	0.05	0.65	0.61	0.49
O5'	0.26	0.38	0.28	0.35	0.44	0.02	0.55	0.01	0.55	0.61	0.47	0.32	0.34	0.64	0.45	0.10	0.35	0.33	0.00	0.60	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.00	0.07	0.18	0.01	0.05	0.01	0.21	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.23	0.18	0.05	0.60	0.00	1.50	1.13	1.07
OP1	0.70	1.07	0.65	0.38	1.11	0.35	1.33	0.33	1.39	1.30	1.25	0.99	0.97	1.46	1.04	0.61	0.37	0.65	0.01	1.50	0.00	0.00	0.00
OP2	0.62	0.86	0.29	0.30	0.88	0.31	1.02	0.31	1.05	0.98	0.97	0.80	0.79	1.09	0.83	0.38	0.38	0.61	0.02	1.13	0.00	0.00	0.00
P	0.45	0.69	0.29	0.21	0.76	0.12	0.95	0.01	0.97	0.97	0.85	0.60	0.61	1.07	0.73	0.20	0.31	0.49	0.00	1.07	0.00	0.00	0.00