Doublet Group distance statistics: 53139

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 2, 3, 2, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.005, 0.014, 0.022, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.014 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.015, 0.026, 0.037, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.026 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.024, 0.039, 0.054, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.039 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.021, 0.039, 0.056, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.039 std_dev=0.017
C6	A	0, 0.023, 0.041, 0.058, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.041 std_dev=0.017
C2	A	0, 0.027, 0.047, 0.068, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.047 std_dev=0.020
C1'	A	0, 0.031, 0.052, 0.074, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.052 std_dev=0.021
O2	A	0, 0.065, 0.115, 0.166, 0.178 max_d=0.178 avg_d=0.115 std_dev=0.050
N4	A	0, 0.074, 0.128, 0.181, 0.198 max_d=0.198 avg_d=0.128 std_dev=0.054
C3'	A	0, 0.239, 0.465, 0.692, 0.723 max_d=0.723 avg_d=0.465 std_dev=0.226
O4'	A	0, 0.269, 0.525, 0.782, 0.790 max_d=0.790 avg_d=0.525 std_dev=0.256
C5	B	0, 0.376, 0.645, 0.913, 1.004 max_d=1.004 avg_d=0.645 std_dev=0.269
C6	B	0, 0.352, 0.623, 0.894, 0.971 max_d=0.971 avg_d=0.623 std_dev=0.271
N6	B	0, 0.372, 0.657, 0.942, 1.030 max_d=1.030 avg_d=0.657 std_dev=0.285
C4	B	0, 0.317, 0.618, 0.919, 1.194 max_d=1.194 avg_d=0.618 std_dev=0.301
C2'	A	0, 0.435, 0.739, 1.043, 1.038 max_d=1.038 avg_d=0.739 std_dev=0.304
P	A	0, 0.413, 0.723, 1.032, 1.065 max_d=1.065 avg_d=0.723 std_dev=0.309
C8	B	0, 0.434, 0.748, 1.062, 1.032 max_d=1.032 avg_d=0.748 std_dev=0.314
N7	B	0, 0.410, 0.725, 1.039, 0.972 max_d=0.972 avg_d=0.725 std_dev=0.315
N9	B	0, 0.357, 0.680, 1.003, 1.234 max_d=1.234 avg_d=0.680 std_dev=0.323
C4'	A	0, 0.360, 0.683, 1.007, 1.035 max_d=1.035 avg_d=0.683 std_dev=0.324
N3	B	0, 0.267, 0.594, 0.920, 1.349 max_d=1.349 avg_d=0.594 std_dev=0.327
O5'	A	0, 0.147, 0.485, 0.823, 1.276 max_d=1.276 avg_d=0.485 std_dev=0.338
C2	B	0, 0.246, 0.585, 0.924, 1.296 max_d=1.296 avg_d=0.585 std_dev=0.339
N1	B	0, 0.236, 0.577, 0.919, 1.121 max_d=1.121 avg_d=0.577 std_dev=0.341
OP2	B	0, 0.346, 0.713, 1.080, 1.438 max_d=1.438 avg_d=0.713 std_dev=0.367
C1'	B	0, 0.354, 0.722, 1.090, 1.484 max_d=1.484 avg_d=0.722 std_dev=0.368
OP1	A	0, 0.451, 0.820, 1.190, 1.262 max_d=1.262 avg_d=0.820 std_dev=0.370
OP2	A	0, 0.495, 0.882, 1.269, 1.300 max_d=1.300 avg_d=0.882 std_dev=0.387
O4'	B	0, 0.323, 0.735, 1.148, 1.660 max_d=1.660 avg_d=0.735 std_dev=0.413
O3'	A	0, 0.097, 0.559, 1.021, 1.777 max_d=1.777 avg_d=0.559 std_dev=0.462
O2'	B	0, 0.814, 1.277, 1.741, 1.617 max_d=1.617 avg_d=1.277 std_dev=0.464
C2'	B	0, 0.495, 0.961, 1.426, 1.694 max_d=1.694 avg_d=0.961 std_dev=0.466
P	B	0, 0.260, 0.732, 1.204, 1.875 max_d=1.875 avg_d=0.732 std_dev=0.472
C5'	B	0, 0.688, 1.164, 1.640, 1.671 max_d=1.671 avg_d=1.164 std_dev=0.476
C4'	B	0, 0.297, 0.795, 1.293, 1.873 max_d=1.873 avg_d=0.795 std_dev=0.498
O2'	A	0, 0.881, 1.404, 1.927, 1.868 max_d=1.868 avg_d=1.404 std_dev=0.523
OP1	B	0, 0.279, 0.823, 1.368, 2.138 max_d=2.138 avg_d=0.823 std_dev=0.545
C3'	B	0, 0.338, 0.885, 1.432, 2.160 max_d=2.160 avg_d=0.885 std_dev=0.547
O5'	B	0, 0.332, 0.903, 1.473, 2.262 max_d=2.262 avg_d=0.903 std_dev=0.571
C5'	A	0, 0.829, 1.481, 2.133, 2.098 max_d=2.098 avg_d=1.481 std_dev=0.652
O3'	B	0, 0.391, 1.182, 1.974, 2.937 max_d=2.937 avg_d=1.182 std_dev=0.791

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.01	0.03	0.03	0.01	0.02	0.05	0.02	0.01	0.05	0.04	0.11	0.02	0.30	0.01	0.07	0.08	0.07	0.06
C2	0.06	0.00	0.23	0.07	0.02	0.08	0.02	0.15	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.33	0.22	0.07	0.13	0.09	0.05	0.07
C2'	0.01	0.23	0.00	0.01	0.10	0.02	0.04	0.17	0.10	0.04	0.20	0.12	0.37	0.01	0.07	0.04	0.32	0.33	0.37	0.34
C3'	0.03	0.07	0.01	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.06	0.03	0.07	0.05	0.16	0.02	0.01	0.01	0.09	0.13	0.04	0.08
C4	0.03	0.02	0.10	0.05	0.00	0.08	0.01	0.17	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.26	0.24	0.07	0.15	0.12	0.10	0.12
C4'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.08	0.00	0.05	0.01	0.03	0.03	0.09	0.09	0.15	0.13	0.01	0.00	0.01	0.06	0.06	0.01
C5	0.02	0.02	0.04	0.05	0.01	0.05	0.00	0.12	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.13	0.28	0.08	0.10	0.08	0.07	0.06
C5'	0.05	0.15	0.17	0.01	0.17	0.01	0.12	0.00	0.08	0.08	0.18	0.20	0.19	0.05	0.18	0.02	0.01	0.05	0.08	0.01
C6	0.02	0.01	0.10	0.06	0.01	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.09	0.29	0.07	0.06	0.05	0.06	0.02
N1	0.01	0.02	0.04	0.03	0.02	0.03	0.02	0.08	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.13	0.26	0.03	0.07	0.05	0.05	0.02
N3	0.05	0.01	0.20	0.07	0.01	0.09	0.01	0.18	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.35	0.21	0.07	0.17	0.13	0.10	0.12
N4	0.04	0.03	0.12	0.05	0.01	0.09	0.02	0.20	0.02	0.02	0.03	0.00	0.02	0.29	0.24	0.08	0.19	0.16	0.15	0.17
O2	0.11	0.01	0.37	0.16	0.01	0.15	0.02	0.19	0.03	0.03	0.01	0.02	0.00	0.43	0.22	0.12	0.18	0.11	0.06	0.09
O2'	0.02	0.33	0.01	0.02	0.26	0.13	0.13	0.05	0.09	0.13	0.35	0.29	0.43	0.00	0.07	0.09	0.32	0.36	0.50	0.38
O3'	0.30	0.22	0.07	0.01	0.24	0.01	0.28	0.18	0.29	0.26	0.21	0.24	0.22	0.07	0.00	0.18	0.17	0.31	0.19	0.21
O4'	0.01	0.07	0.04	0.01	0.07	0.00	0.08	0.02	0.07	0.03	0.07	0.08	0.12	0.09	0.18	0.00	0.07	0.06	0.13	0.08
O5'	0.07	0.13	0.32	0.09	0.15	0.01	0.10	0.01	0.06	0.07	0.17	0.19	0.18	0.32	0.17	0.07	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.08	0.09	0.33	0.13	0.12	0.06	0.08	0.05	0.05	0.05	0.13	0.16	0.11	0.36	0.31	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.07	0.05	0.37	0.04	0.10	0.06	0.07	0.08	0.06	0.05	0.10	0.15	0.06	0.50	0.19	0.13	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.07	0.34	0.08	0.12	0.01	0.06	0.01	0.02	0.02	0.12	0.17	0.09	0.38	0.21	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.11	0.18	0.22	0.09	0.07	0.09	0.12	0.10	0.09	0.11	0.09	0.11	0.09	0.09	0.53	0.17	0.06	0.13	0.18	0.20	0.15
C2	0.11	0.13	0.25	0.24	0.10	0.09	0.10	0.12	0.11	0.09	0.13	0.11	0.11	0.09	0.10	0.60	0.24	0.05	0.15	0.20	0.21	0.16
C2'	0.08	0.16	0.19	0.21	0.09	0.13	0.11	0.23	0.16	0.11	0.18	0.12	0.19	0.11	0.08	0.48	0.20	0.09	0.20	0.33	0.33	0.29
C3'	0.07	0.11	0.18	0.22	0.09	0.06	0.10	0.10	0.11	0.09	0.12	0.09	0.13	0.10	0.08	0.51	0.16	0.04	0.12	0.16	0.18	0.13
C4	0.09	0.10	0.24	0.25	0.08	0.10	0.07	0.12	0.08	0.07	0.09	0.09	0.07	0.06	0.09	0.58	0.23	0.06	0.15	0.18	0.20	0.15
C4'	0.12	0.12	0.25	0.19	0.11	0.05	0.10	0.11	0.10	0.11	0.11	0.11	0.10	0.11	0.12	0.64	0.17	0.05	0.08	0.13	0.13	0.10
C5	0.10	0.13	0.20	0.22	0.10	0.08	0.10	0.11	0.12	0.08	0.13	0.11	0.13	0.09	0.10	0.54	0.18	0.05	0.14	0.17	0.19	0.15
C5'	0.22	0.17	0.38	0.11	0.18	0.11	0.17	0.18	0.16	0.20	0.16	0.17	0.15	0.18	0.20	0.78	0.16	0.13	0.09	0.15	0.14	0.14
C6	0.10	0.15	0.18	0.22	0.11	0.08	0.11	0.12	0.14	0.08	0.15	0.12	0.16	0.09	0.10	0.53	0.17	0.06	0.14	0.17	0.20	0.15
N1	0.11	0.14	0.21	0.22	0.11	0.08	0.11	0.12	0.13	0.09	0.14	0.12	0.14	0.10	0.10	0.57	0.19	0.05	0.14	0.18	0.20	0.15
N3	0.10	0.10	0.26	0.25	0.09	0.11	0.08	0.12	0.08	0.08	0.10	0.10	0.08	0.07	0.09	0.60	0.27	0.06	0.15	0.20	0.21	0.16
N4	0.08	0.07	0.25	0.27	0.06	0.13	0.04	0.12	0.04	0.05	0.05	0.07	0.05	0.04	0.07	0.57	0.27	0.10	0.16	0.18	0.18	0.15
O2	0.09	0.12	0.25	0.27	0.10	0.11	0.09	0.13	0.11	0.08	0.12	0.11	0.11	0.08	0.09	0.60	0.28	0.06	0.17	0.23	0.23	0.18
O2'	0.22	0.17	0.24	0.29	0.15	0.35	0.16	0.48	0.17	0.26	0.21	0.13	0.23	0.24	0.21	0.42	0.32	0.32	0.42	0.59	0.57	0.56
O3'	0.35	0.42	0.42	0.31	0.38	0.33	0.38	0.36	0.41	0.33	0.43	0.40	0.42	0.35	0.36	0.71	0.42	0.33	0.28	0.32	0.32	0.31
O4'	0.14	0.16	0.26	0.19	0.13	0.05	0.12	0.09	0.13	0.12	0.15	0.14	0.12	0.11	0.13	0.66	0.17	0.07	0.08	0.13	0.13	0.09
O5'	0.22	0.19	0.39	0.12	0.19	0.10	0.19	0.16	0.18	0.21	0.18	0.19	0.18	0.20	0.21	0.75	0.17	0.13	0.09	0.15	0.14	0.13
OP1	0.20	0.17	0.41	0.11	0.18	0.08	0.17	0.15	0.17	0.19	0.17	0.17	0.16	0.18	0.19	0.76	0.19	0.10	0.07	0.16	0.13	0.11
OP2	0.21	0.17	0.42	0.13	0.18	0.10	0.17	0.16	0.16	0.19	0.16	0.17	0.15	0.18	0.19	0.75	0.23	0.11	0.09	0.17	0.15	0.12
P	0.21	0.17	0.41	0.11	0.18	0.08	0.17	0.15	0.15	0.19	0.16	0.17	0.14	0.18	0.20	0.78	0.19	0.11	0.07	0.15	0.13	0.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.00	0.01	0.29	0.00	0.11	0.10	0.13	0.12
C2	0.03	0.00	0.18	0.11	0.02	0.05	0.03	0.11	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.03	0.14	0.31	0.14	0.07	0.07	0.09	0.10
C2'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.10	0.02	0.05	0.19	0.09	0.11	0.14	0.18	0.05	0.06	0.01	0.00	0.03	0.02	0.40	0.37	0.46	0.43
C3'	0.02	0.11	0.00	0.00	0.17	0.00	0.24	0.01	0.23	0.26	0.18	0.08	0.26	0.29	0.17	0.01	0.01	0.02	0.09	0.05	0.05	0.06
C4	0.01	0.02	0.10	0.17	0.00	0.02	0.01	0.08	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.20	0.08	0.06	0.06	0.08	0.09
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.04	0.11	0.03	0.05	0.06	0.10	0.05	0.23	0.01	0.01	0.01	0.07	0.07	0.02
C5	0.01	0.03	0.05	0.24	0.01	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.22	0.14	0.06	0.08	0.08	0.10	0.09
C5'	0.06	0.11	0.19	0.01	0.08	0.01	0.10	0.00	0.11	0.11	0.11	0.10	0.12	0.12	0.07	0.07	0.19	0.03	0.01	0.07	0.09	0.02
C6	0.02	0.01	0.09	0.23	0.01	0.04	0.01	0.11	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.20	0.15	0.09	0.08	0.09	0.11	0.10
C8	0.02	0.03	0.11	0.26	0.01	0.11	0.01	0.11	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.29	0.15	0.05	0.09	0.08	0.08	0.09
N1	0.02	0.01	0.14	0.18	0.02	0.03	0.02	0.11	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.15	0.22	0.12	0.06	0.07	0.10	0.10
N3	0.03	0.00	0.18	0.08	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.13	0.34	0.13	0.07	0.08	0.09	0.10
N6	0.02	0.01	0.05	0.26	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.25	0.15	0.08	0.10	0.12	0.14	0.12
N7	0.02	0.03	0.06	0.29	0.01	0.10	0.01	0.12	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.00	0.01	0.30	0.18	0.03	0.11	0.11	0.12	0.11
N9	0.00	0.03	0.01	0.17	0.01	0.05	0.01	0.07	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.00	0.16	0.14	0.02	0.06	0.07	0.08	0.09
O2'	0.01	0.14	0.00	0.01	0.13	0.23	0.22	0.07	0.20	0.29	0.15	0.13	0.25	0.30	0.16	0.00	0.03	0.15	0.35	0.32	0.57	0.42
O3'	0.29	0.31	0.03	0.01	0.20	0.01	0.14	0.19	0.15	0.15	0.22	0.34	0.15	0.18	0.14	0.03	0.00	0.20	0.18	0.34	0.25	0.22
O4'	0.00	0.14	0.02	0.02	0.08	0.01	0.06	0.03	0.09	0.05	0.12	0.13	0.08	0.03	0.02	0.15	0.20	0.00	0.12	0.13	0.11	0.09
O5'	0.11	0.07	0.40	0.09	0.06	0.01	0.08	0.01	0.08	0.09	0.06	0.07	0.10	0.11	0.06	0.35	0.18	0.12	0.00	0.01	0.03	0.01
OP1	0.10	0.07	0.37	0.05	0.06	0.07	0.08	0.07	0.09	0.08	0.07	0.08	0.12	0.11	0.07	0.32	0.34	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.09	0.46	0.05	0.08	0.07	0.10	0.09	0.11	0.08	0.10	0.09	0.14	0.12	0.08	0.57	0.25	0.11	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.10	0.43	0.06	0.09	0.02	0.09	0.02	0.10	0.09	0.10	0.10	0.12	0.11	0.09	0.42	0.22	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00