Doublet Group distance statistics: 53141

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.005, 0.010, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.005 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.000, 0.007, 0.014, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.000, 0.008, 0.016, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.000, 0.010, 0.019, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.000, 0.012, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.000, 0.012, 0.024, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.012 std_dev=0.012
N4	A	0, 0.000, 0.023, 0.047, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.023 std_dev=0.023
O2	A	0, 0.000, 0.035, 0.071, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.035 std_dev=0.035
N9	B	0, 0.000, 0.222, 0.443, 0.443 max_d=0.443 avg_d=0.222 std_dev=0.222
C8	B	0, 0.000, 0.229, 0.457, 0.457 max_d=0.457 avg_d=0.229 std_dev=0.229
C1'	B	0, 0.000, 0.281, 0.561, 0.561 max_d=0.561 avg_d=0.281 std_dev=0.281
C4	B	0, 0.000, 0.290, 0.581, 0.581 max_d=0.581 avg_d=0.290 std_dev=0.290
N7	B	0, 0.000, 0.292, 0.585, 0.585 max_d=0.585 avg_d=0.292 std_dev=0.292
C5	B	0, 0.000, 0.331, 0.662, 0.662 max_d=0.662 avg_d=0.331 std_dev=0.331
N3	B	0, 0.000, 0.354, 0.708, 0.708 max_d=0.708 avg_d=0.354 std_dev=0.354
O3'	B	0, 0.000, 0.408, 0.817, 0.817 max_d=0.817 avg_d=0.408 std_dev=0.408
C6	B	0, 0.000, 0.434, 0.868, 0.868 max_d=0.868 avg_d=0.434 std_dev=0.434
C2	B	0, 0.000, 0.443, 0.887, 0.887 max_d=0.887 avg_d=0.443 std_dev=0.443
N1	B	0, 0.000, 0.486, 0.971, 0.971 max_d=0.971 avg_d=0.486 std_dev=0.486
N6	B	0, 0.000, 0.495, 0.990, 0.990 max_d=0.990 avg_d=0.495 std_dev=0.495
O4'	B	0, 0.000, 0.538, 1.076, 1.076 max_d=1.076 avg_d=0.538 std_dev=0.538
C4'	B	0, 0.000, 0.596, 1.193, 1.193 max_d=1.193 avg_d=0.596 std_dev=0.596
C3'	B	0, 0.000, 0.694, 1.388, 1.388 max_d=1.388 avg_d=0.694 std_dev=0.694
C2'	B	0, 0.000, 0.924, 1.848, 1.848 max_d=1.848 avg_d=0.924 std_dev=0.924
O5'	B	0, 0.000, 1.000, 2.000, 2.000 max_d=2.000 avg_d=1.000 std_dev=1.000
O4'	A	0, 0.000, 1.210, 2.421, 2.421 max_d=2.421 avg_d=1.210 std_dev=1.210
C5'	B	0, 0.000, 1.259, 2.518, 2.518 max_d=2.518 avg_d=1.259 std_dev=1.259
C2'	A	0, 0.000, 1.282, 2.565, 2.565 max_d=2.565 avg_d=1.282 std_dev=1.282
C4'	A	0, 0.000, 1.472, 2.945, 2.945 max_d=2.945 avg_d=1.472 std_dev=1.472
O2'	B	0, 0.000, 1.716, 3.432, 3.432 max_d=3.432 avg_d=1.716 std_dev=1.716
C3'	A	0, 0.000, 1.741, 3.482, 3.482 max_d=3.482 avg_d=1.741 std_dev=1.741
P	B	0, 0.000, 1.808, 3.617, 3.617 max_d=3.617 avg_d=1.808 std_dev=1.808
OP2	B	0, 0.000, 1.885, 3.770, 3.770 max_d=3.770 avg_d=1.885 std_dev=1.885
O2'	A	0, 0.000, 1.915, 3.830, 3.830 max_d=3.830 avg_d=1.915 std_dev=1.915
O3'	A	0, 0.000, 2.016, 4.031, 4.031 max_d=4.031 avg_d=2.016 std_dev=2.016
OP1	B	0, 0.000, 2.737, 5.474, 5.474 max_d=5.474 avg_d=2.737 std_dev=2.737
C5'	A	0, 0.000, 2.923, 5.846, 5.846 max_d=5.846 avg_d=2.923 std_dev=2.923
O5'	A	0, 0.000, 3.684, 7.367, 7.367 max_d=7.367 avg_d=3.684 std_dev=3.684
P	A	0, 0.000, 5.068, 10.136, 10.136 max_d=10.136 avg_d=5.068 std_dev=5.068
OP2	A	0, 0.000, 5.552, 11.105, 11.105 max_d=11.105 avg_d=5.552 std_dev=5.552
OP1	A	0, 0.000, 6.060, 12.120, 12.120 max_d=12.120 avg_d=6.060 std_dev=6.060

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.24	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03
C2	0.00	0.00	0.03	0.03	0.00	0.19	0.00	0.36	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.11	0.06	0.24	0.42	0.27	0.72	0.41
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.06	0.10	0.07	0.02	0.02	0.02	0.08	0.00	0.01	0.01	0.25	0.32	0.08	0.15
C3'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.30	0.01	0.44	0.02	0.42	0.19	0.13	0.32	0.20	0.02	0.01	0.02	0.01	0.19	0.40	0.14
C4	0.01	0.00	0.02	0.30	0.00	0.13	0.00	0.18	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.32	0.08	0.02	0.33	0.70	0.01	0.46
C4'	0.01	0.19	0.01	0.01	0.13	0.00	0.36	0.00	0.39	0.08	0.10	0.14	0.47	0.26	0.00	0.00	0.00	0.14	0.31	0.04
C5	0.01	0.00	0.06	0.44	0.00	0.36	0.00	0.58	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.37	0.11	0.22	0.87	1.30	0.67	1.07
C5'	0.02	0.36	0.10	0.02	0.18	0.00	0.58	0.00	0.61	0.09	0.22	0.20	0.83	0.15	0.18	0.00	0.00	0.16	0.33	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.42	0.01	0.39	0.00	0.61	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.32	0.04	0.28	0.88	1.15	0.72	1.01
N1	0.00	0.00	0.02	0.19	0.00	0.08	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.18	0.07	0.01	0.16	0.31	0.01	0.23
N3	0.00	0.00	0.02	0.13	0.00	0.10	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.21	0.02	0.17	0.23	0.00	0.63	0.20
N4	0.01	0.00	0.02	0.32	0.00	0.14	0.01	0.20	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.35	0.12	0.02	0.37	0.83	0.00	0.52
O2	0.01	0.01	0.08	0.20	0.00	0.47	0.01	0.83	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.15	0.44	1.08	1.02	1.42	1.14
O2'	0.01	0.11	0.00	0.02	0.32	0.26	0.37	0.15	0.32	0.18	0.21	0.35	0.07	0.00	0.01	0.17	0.12	0.25	0.02	0.06
O3'	0.24	0.06	0.01	0.01	0.08	0.00	0.11	0.18	0.04	0.07	0.02	0.12	0.15	0.01	0.00	0.13	0.15	0.02	0.85	0.39
O4'	0.00	0.24	0.01	0.02	0.02	0.00	0.22	0.00	0.28	0.01	0.17	0.02	0.44	0.17	0.13	0.00	0.06	0.06	0.07	0.04
O5'	0.01	0.42	0.25	0.01	0.33	0.00	0.87	0.00	0.88	0.16	0.23	0.37	1.08	0.12	0.15	0.06	0.00	0.03	0.00	0.00
OP1	0.01	0.27	0.32	0.19	0.70	0.14	1.30	0.16	1.15	0.31	0.00	0.83	1.02	0.25	0.02	0.06	0.03	0.00	0.00	0.00
OP2	0.00	0.72	0.08	0.40	0.01	0.31	0.67	0.33	0.72	0.01	0.63	0.00	1.42	0.02	0.85	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.03	0.41	0.15	0.14	0.46	0.04	1.07	0.01	1.01	0.23	0.20	0.52	1.14	0.06	0.39	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.31	0.14	0.12	0.19	0.10	0.19	0.13	0.28	0.04	0.33	0.25	0.30	0.09	0.11	0.42	0.03	0.13	0.26	0.05	0.19	0.06
C2	0.07	0.29	0.22	0.09	0.20	0.13	0.22	0.20	0.30	0.07	0.33	0.24	0.34	0.13	0.12	0.55	0.04	0.19	0.31	0.11	0.26	0.17
C2'	0.20	0.45	0.11	0.17	0.32	0.26	0.32	0.33	0.42	0.15	0.48	0.38	0.46	0.20	0.22	0.44	0.00	0.33	0.47	0.22	0.36	0.31
C3'	0.23	0.07	0.49	0.18	0.16	0.11	0.15	0.02	0.08	0.25	0.04	0.12	0.05	0.21	0.21	0.85	0.39	0.08	0.19	0.02	0.20	0.09
C4	0.07	0.29	0.18	0.13	0.20	0.14	0.23	0.22	0.31	0.06	0.32	0.24	0.34	0.12	0.11	0.51	0.02	0.17	0.35	0.16	0.36	0.20
C4'	0.23	0.28	0.39	0.07	0.24	0.09	0.24	0.04	0.26	0.21	0.28	0.26	0.26	0.21	0.23	0.73	0.27	0.12	0.23	0.04	0.33	0.13
C5	0.07	0.31	0.07	0.18	0.19	0.12	0.20	0.17	0.30	0.02	0.34	0.25	0.35	0.06	0.10	0.37	0.00	0.12	0.31	0.04	0.31	0.10
C5'	0.49	0.81	0.59	0.22	0.61	0.24	0.59	0.02	0.72	0.39	0.83	0.72	0.73	0.44	0.50	0.97	0.45	0.33	0.23	0.16	0.47	0.21
C6	0.08	0.31	0.07	0.17	0.19	0.10	0.18	0.14	0.29	0.02	0.34	0.25	0.32	0.06	0.10	0.36	0.01	0.11	0.28	0.03	0.26	0.06
N1	0.08	0.31	0.14	0.13	0.19	0.11	0.20	0.15	0.29	0.05	0.34	0.25	0.33	0.09	0.11	0.44	0.02	0.14	0.29	0.00	0.24	0.09
N3	0.07	0.29	0.25	0.09	0.20	0.15	0.23	0.24	0.30	0.08	0.32	0.23	0.34	0.15	0.12	0.59	0.04	0.21	0.34	0.19	0.33	0.23
N4	0.05	0.25	0.21	0.13	0.19	0.16	0.22	0.27	0.27	0.06	0.28	0.21	0.28	0.14	0.10	0.56	0.02	0.19	0.39	0.26	0.45	0.27
O2	0.06	0.28	0.28	0.05	0.19	0.12	0.22	0.20	0.29	0.08	0.31	0.23	0.32	0.14	0.12	0.61	0.05	0.20	0.30	0.12	0.23	0.19
O2'	0.74	1.10	0.40	0.64	0.90	0.72	0.88	0.73	1.02	0.64	1.12	1.00	1.03	0.69	0.76	0.13	0.48	0.84	0.83	0.45	0.57	0.58
O3'	0.05	0.37	0.21	0.05	0.19	0.13	0.20	0.22	0.33	0.00	0.41	0.27	0.37	0.06	0.08	0.57	0.16	0.18	0.37	0.16	0.32	0.23
O4'	0.13	0.17	0.26	0.03	0.14	0.04	0.14	0.05	0.17	0.12	0.18	0.16	0.18	0.13	0.13	0.57	0.13	0.07	0.23	0.02	0.30	0.08
O5'	0.74	1.22	0.84	0.44	0.93	0.41	0.91	0.12	1.09	0.61	1.25	1.08	1.11	0.68	0.76	1.26	0.69	0.52	0.16	0.19	0.49	0.22
OP1	1.57	2.34	1.61	1.18	1.86	1.14	1.77	0.73	2.05	1.32	2.34	2.13	1.99	1.39	1.59	2.07	1.50	1.30	0.36	0.18	0.16	0.18
OP2	0.37	1.12	0.50	0.01	0.67	0.14	0.63	0.59	0.90	0.19	1.15	0.90	0.91	0.29	0.41	1.02	0.29	0.00	0.90	1.17	1.35	1.11
P	1.04	1.69	1.12	0.66	1.29	0.59	1.24	0.19	1.48	0.84	1.71	1.51	1.46	0.92	1.06	1.61	0.96	0.73	0.13	0.34	0.59	0.30

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.04	0.05	0.01	0.01	0.00	0.03	0.25	0.00	0.13	0.00	0.10	0.07
C2	0.05	0.00	0.34	0.15	0.00	0.16	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.46	0.13	0.28	0.02	0.48	0.03	0.34
C2'	0.00	0.34	0.00	0.00	0.16	0.01	0.04	0.09	0.11	0.23	0.25	0.34	0.05	0.15	0.02	0.00	0.04	0.02	0.24	0.13	0.23	0.32
C3'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.12	0.00	0.12	0.02	0.13	0.08	0.15	0.13	0.13	0.10	0.09	0.01	0.01	0.01	0.10	0.15	0.07	0.05
C4	0.02	0.00	0.16	0.12	0.00	0.07	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.15	0.16	0.14	0.22	0.14	0.16
C4'	0.01	0.16	0.01	0.00	0.07	0.00	0.03	0.01	0.08	0.12	0.13	0.15	0.06	0.07	0.03	0.17	0.00	0.01	0.02	0.06	0.07	0.05
C5	0.01	0.00	0.04	0.12	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.12	0.08	0.20	0.18	0.20	0.10
C5'	0.03	0.24	0.09	0.02	0.08	0.01	0.02	0.00	0.11	0.22	0.20	0.21	0.08	0.14	0.06	0.06	0.13	0.06	0.00	0.08	0.07	0.01
C6	0.02	0.00	0.11	0.13	0.00	0.08	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.05	0.11	0.15	0.13	0.33	0.13	0.20
C8	0.02	0.00	0.23	0.08	0.00	0.12	0.00	0.22	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.44	0.12	0.14	0.39	0.19	0.37	0.18
N1	0.04	0.00	0.25	0.15	0.01	0.13	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.28	0.12	0.23	0.06	0.46	0.06	0.30
N3	0.05	0.00	0.34	0.13	0.00	0.15	0.00	0.21	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.46	0.15	0.28	0.04	0.38	0.05	0.28
N6	0.01	0.01	0.05	0.13	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.10	0.11	0.15	0.32	0.14	0.18
N7	0.01	0.00	0.15	0.10	0.00	0.07	0.00	0.14	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.36	0.10	0.06	0.33	0.06	0.34	0.10
N9	0.00	0.01	0.02	0.09	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.12	0.16	0.01	0.23	0.01	0.21	0.02
O2'	0.03	0.46	0.00	0.01	0.13	0.17	0.08	0.06	0.05	0.44	0.28	0.46	0.06	0.36	0.12	0.00	0.03	0.13	0.17	0.04	0.30	0.29
O3'	0.25	0.13	0.04	0.01	0.15	0.00	0.12	0.13	0.11	0.12	0.12	0.15	0.10	0.10	0.16	0.03	0.00	0.16	0.02	0.34	0.17	0.07
O4'	0.00	0.28	0.02	0.01	0.16	0.01	0.08	0.06	0.15	0.14	0.23	0.28	0.11	0.06	0.01	0.13	0.16	0.00	0.25	0.03	0.18	0.02
O5'	0.13	0.02	0.24	0.10	0.14	0.02	0.20	0.00	0.13	0.39	0.06	0.04	0.15	0.33	0.23	0.17	0.02	0.25	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.00	0.48	0.13	0.15	0.22	0.06	0.18	0.08	0.33	0.19	0.46	0.38	0.32	0.06	0.01	0.04	0.34	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.03	0.23	0.07	0.14	0.07	0.20	0.07	0.13	0.37	0.06	0.05	0.14	0.34	0.21	0.30	0.17	0.18	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.34	0.32	0.05	0.16	0.05	0.10	0.01	0.20	0.18	0.30	0.28	0.18	0.10	0.02	0.29	0.07	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00