Doublet Group distance statistics: 53146

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 3, 5, 1, 1, 1, 4, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.008, 0.011, 0.015, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.011 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.003, 0.007, 0.011, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.007 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.011, 0.016, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.016 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.005, 0.010, 0.015, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.010 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.012, 0.018, 0.024, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.018 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.006, 0.013, 0.019, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.013, 0.019, 0.026, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.019 std_dev=0.006
O2	A	0, 0.019, 0.034, 0.049, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.034 std_dev=0.015
N4	A	0, 0.024, 0.045, 0.065, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.045 std_dev=0.020
O4'	A	0, 0.045, 0.271, 0.498, 1.024 max_d=1.024 avg_d=0.271 std_dev=0.226
C2'	A	0, 0.164, 0.398, 0.632, 1.038 max_d=1.038 avg_d=0.398 std_dev=0.234
N7	B	0, 0.449, 0.746, 1.043, 1.130 max_d=1.130 avg_d=0.746 std_dev=0.297
O6	B	0, 0.485, 0.785, 1.085, 1.215 max_d=1.215 avg_d=0.785 std_dev=0.300
C4'	A	0, 0.114, 0.424, 0.735, 1.621 max_d=1.621 avg_d=0.424 std_dev=0.310
O2'	B	0, 0.421, 0.736, 1.051, 1.590 max_d=1.590 avg_d=0.736 std_dev=0.315
C5	B	0, 0.506, 0.822, 1.137, 1.318 max_d=1.318 avg_d=0.822 std_dev=0.316
C8	B	0, 0.421, 0.742, 1.063, 1.256 max_d=1.256 avg_d=0.742 std_dev=0.321
C3'	A	0, 0.290, 0.611, 0.933, 1.643 max_d=1.643 avg_d=0.611 std_dev=0.321
C6	B	0, 0.547, 0.873, 1.200, 1.413 max_d=1.413 avg_d=0.873 std_dev=0.327
C3'	B	0, 0.397, 0.741, 1.086, 1.494 max_d=1.494 avg_d=0.741 std_dev=0.344
C2'	B	0, 0.460, 0.806, 1.152, 1.498 max_d=1.498 avg_d=0.806 std_dev=0.346
C4	B	0, 0.529, 0.878, 1.226, 1.491 max_d=1.491 avg_d=0.878 std_dev=0.349
O3'	B	0, 0.399, 0.748, 1.098, 1.476 max_d=1.476 avg_d=0.748 std_dev=0.349
N9	B	0, 0.468, 0.818, 1.168, 1.356 max_d=1.356 avg_d=0.818 std_dev=0.350
N1	B	0, 0.607, 0.981, 1.355, 1.696 max_d=1.696 avg_d=0.981 std_dev=0.374
C1'	B	0, 0.423, 0.800, 1.177, 1.517 max_d=1.517 avg_d=0.800 std_dev=0.377
O4'	B	0, 0.454, 0.838, 1.223, 1.700 max_d=1.700 avg_d=0.838 std_dev=0.384
N3	B	0, 0.584, 0.969, 1.353, 1.751 max_d=1.751 avg_d=0.969 std_dev=0.385
O2'	A	0, 0.223, 0.610, 0.996, 1.551 max_d=1.551 avg_d=0.610 std_dev=0.387
C2	B	0, 0.624, 1.021, 1.418, 1.853 max_d=1.853 avg_d=1.021 std_dev=0.397
C4'	B	0, 0.395, 0.810, 1.224, 1.789 max_d=1.789 avg_d=0.810 std_dev=0.415
N2	B	0, 0.693, 1.144, 1.596, 2.146 max_d=2.146 avg_d=1.144 std_dev=0.452
O3'	A	0, 0.363, 0.816, 1.269, 2.362 max_d=2.362 avg_d=0.816 std_dev=0.453
C5'	A	0, 0.202, 0.663, 1.125, 2.137 max_d=2.137 avg_d=0.663 std_dev=0.461
C5'	B	0, 0.286, 0.820, 1.355, 1.983 max_d=1.983 avg_d=0.820 std_dev=0.534
O5'	B	0, 0.023, 0.823, 1.623, 3.763 max_d=3.763 avg_d=0.823 std_dev=0.800
O5'	A	0, -0.171, 0.736, 1.642, 4.230 max_d=4.230 avg_d=0.736 std_dev=0.906
OP2	B	0, -0.222, 0.823, 1.867, 5.029 max_d=5.029 avg_d=0.823 std_dev=1.045
P	B	0, -0.180, 0.895, 1.969, 5.085 max_d=5.085 avg_d=0.895 std_dev=1.074
P	A	0, -0.430, 0.838, 2.107, 5.966 max_d=5.966 avg_d=0.838 std_dev=1.269
OP2	A	0, -0.312, 1.059, 2.430, 6.606 max_d=6.606 avg_d=1.059 std_dev=1.371
OP1	B	0, -0.398, 1.023, 2.443, 6.547 max_d=6.547 avg_d=1.023 std_dev=1.420
OP1	A	0, -0.602, 0.887, 2.376, 6.986 max_d=6.986 avg_d=0.887 std_dev=1.489

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.16	0.01	0.06	0.35	0.14	0.10
C2	0.01	0.00	0.10	0.11	0.01	0.03	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.10	0.12	0.08	0.12	0.29	0.33	0.14
C2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.08	0.03	0.10	0.17	0.10	0.05	0.09	0.09	0.14	0.01	0.05	0.01	0.12	0.37	0.12	0.17
C3'	0.02	0.11	0.01	0.00	0.21	0.00	0.23	0.04	0.20	0.12	0.16	0.23	0.07	0.02	0.01	0.02	0.19	0.37	0.15	0.19
C4	0.01	0.01	0.08	0.21	0.00	0.09	0.00	0.22	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.16	0.18	0.02	0.26	0.37	0.59	0.36
C4'	0.02	0.03	0.03	0.00	0.09	0.00	0.15	0.01	0.16	0.05	0.03	0.10	0.10	0.16	0.03	0.01	0.02	0.39	0.10	0.18
C5	0.01	0.01	0.10	0.23	0.00	0.15	0.00	0.28	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.19	0.22	0.09	0.36	0.45	0.65	0.46
C5'	0.10	0.14	0.17	0.04	0.22	0.01	0.28	0.00	0.26	0.16	0.16	0.24	0.13	0.09	0.12	0.02	0.01	0.06	0.12	0.01
C6	0.01	0.01	0.10	0.20	0.01	0.16	0.00	0.26	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.19	0.12	0.32	0.40	0.50	0.38
N1	0.00	0.01	0.05	0.12	0.00	0.05	0.00	0.16	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.13	0.02	0.15	0.31	0.33	0.19
N3	0.01	0.00	0.09	0.16	0.00	0.03	0.00	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.13	0.06	0.17	0.29	0.46	0.22
N4	0.01	0.01	0.09	0.23	0.00	0.10	0.01	0.24	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.18	0.20	0.02	0.29	0.40	0.67	0.41
O2	0.02	0.00	0.14	0.07	0.01	0.10	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.15	0.18	0.15	0.13	0.33	0.23	0.08
O2'	0.03	0.10	0.01	0.02	0.16	0.16	0.19	0.09	0.18	0.10	0.13	0.18	0.15	0.00	0.10	0.09	0.15	0.33	0.12	0.15
O3'	0.16	0.12	0.05	0.01	0.18	0.03	0.22	0.12	0.19	0.13	0.13	0.20	0.18	0.10	0.00	0.13	0.23	0.44	0.23	0.26
O4'	0.01	0.08	0.01	0.02	0.02	0.01	0.09	0.02	0.12	0.02	0.06	0.02	0.15	0.09	0.13	0.00	0.07	0.35	0.13	0.12
O5'	0.06	0.12	0.12	0.19	0.26	0.02	0.36	0.01	0.32	0.15	0.17	0.29	0.13	0.15	0.23	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.35	0.29	0.37	0.37	0.37	0.39	0.45	0.06	0.40	0.31	0.29	0.40	0.33	0.33	0.44	0.35	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.14	0.33	0.12	0.15	0.59	0.10	0.65	0.12	0.50	0.33	0.46	0.67	0.23	0.12	0.23	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.10	0.14	0.17	0.19	0.36	0.18	0.46	0.01	0.38	0.19	0.22	0.41	0.08	0.15	0.26	0.12	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.07	0.11	0.18	0.06	0.13	0.06	0.20	0.06	0.07	0.07	0.08	0.07	0.07	0.06	0.15	0.24	0.08	0.46	0.06	0.77	0.84	0.66
C2	0.10	0.11	0.14	0.19	0.10	0.15	0.10	0.22	0.10	0.10	0.11	0.11	0.10	0.10	0.10	0.16	0.24	0.10	0.49	0.10	0.80	0.85	0.69
C2'	0.10	0.15	0.15	0.16	0.11	0.11	0.10	0.18	0.11	0.10	0.15	0.17	0.13	0.09	0.10	0.22	0.21	0.08	0.47	0.12	0.77	0.82	0.66
C3'	0.33	0.31	0.35	0.19	0.32	0.21	0.31	0.15	0.30	0.31	0.30	0.31	0.32	0.30	0.32	0.46	0.19	0.29	0.24	0.28	0.55	0.64	0.45
C4	0.09	0.13	0.14	0.17	0.11	0.13	0.11	0.18	0.13	0.09	0.14	0.14	0.12	0.10	0.10	0.16	0.21	0.09	0.44	0.13	0.68	0.79	0.62
C4'	0.24	0.29	0.25	0.10	0.26	0.12	0.24	0.08	0.26	0.21	0.29	0.31	0.28	0.21	0.23	0.36	0.09	0.20	0.31	0.26	0.60	0.73	0.52
C5	0.07	0.10	0.11	0.17	0.08	0.11	0.07	0.15	0.09	0.07	0.10	0.11	0.09	0.07	0.07	0.15	0.21	0.08	0.39	0.09	0.61	0.74	0.55
C5'	0.41	0.49	0.41	0.29	0.43	0.31	0.41	0.26	0.44	0.36	0.49	0.52	0.47	0.36	0.40	0.52	0.26	0.37	0.33	0.43	0.52	0.68	0.47
C6	0.07	0.08	0.11	0.17	0.07	0.11	0.06	0.16	0.07	0.07	0.08	0.09	0.07	0.07	0.07	0.15	0.22	0.08	0.41	0.07	0.65	0.77	0.58
N1	0.07	0.08	0.12	0.18	0.07	0.13	0.07	0.19	0.08	0.07	0.09	0.09	0.08	0.07	0.07	0.15	0.23	0.08	0.45	0.08	0.74	0.82	0.64
N3	0.11	0.13	0.15	0.18	0.12	0.16	0.12	0.21	0.13	0.11	0.13	0.14	0.13	0.12	0.12	0.17	0.23	0.11	0.48	0.13	0.78	0.85	0.69
N4	0.11	0.17	0.15	0.16	0.15	0.13	0.15	0.17	0.17	0.11	0.17	0.17	0.16	0.13	0.12	0.17	0.19	0.10	0.42	0.17	0.65	0.76	0.60
O2	0.11	0.11	0.15	0.20	0.11	0.18	0.11	0.25	0.10	0.11	0.11	0.11	0.11	0.11	0.11	0.17	0.26	0.12	0.52	0.10	0.87	0.88	0.74
O2'	0.24	0.31	0.31	0.41	0.26	0.34	0.24	0.41	0.27	0.21	0.30	0.33	0.29	0.21	0.23	0.30	0.47	0.24	0.72	0.26	1.06	1.07	0.92
O3'	0.37	0.40	0.40	0.21	0.37	0.22	0.35	0.13	0.35	0.33	0.38	0.42	0.40	0.31	0.36	0.53	0.21	0.31	0.27	0.32	0.63	0.71	0.51
O4'	0.15	0.19	0.15	0.14	0.16	0.11	0.16	0.15	0.17	0.13	0.19	0.19	0.18	0.14	0.15	0.23	0.17	0.13	0.39	0.18	0.67	0.79	0.58
O5'	0.54	0.66	0.57	0.41	0.58	0.43	0.55	0.32	0.60	0.47	0.66	0.70	0.63	0.47	0.53	0.70	0.41	0.49	0.14	0.58	0.27	0.46	0.23
OP1	0.81	0.99	0.86	0.68	0.85	0.69	0.78	0.54	0.84	0.68	0.96	1.08	0.94	0.67	0.78	1.03	0.72	0.73	0.31	0.78	0.15	0.32	0.16
OP2	1.03	1.13	1.07	0.95	1.05	0.95	1.01	0.85	1.04	0.94	1.12	1.15	1.10	0.92	1.01	1.20	0.99	0.98	0.65	0.99	0.54	0.42	0.51
P	0.77	0.92	0.80	0.65	0.80	0.66	0.76	0.53	0.81	0.66	0.91	0.98	0.88	0.65	0.75	0.95	0.68	0.70	0.31	0.78	0.18	0.28	0.15

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.03	0.12	0.07
C2	0.01	0.00	0.11	0.17	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.17	0.05	0.14	0.01	0.15	0.36	0.19
C2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.07	0.01	0.05	0.03	0.08	0.04	0.10	0.12	0.10	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.13	0.07	0.13	0.14	0.13
C3'	0.01	0.17	0.01	0.00	0.13	0.01	0.15	0.02	0.17	0.09	0.18	0.17	0.14	0.12	0.09	0.02	0.01	0.01	0.19	0.18	0.18	0.12	0.17
C4	0.01	0.00	0.07	0.13	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.12	0.03	0.17	0.01	0.19	0.36	0.23
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.00	0.07	0.07	0.05	0.04	0.03	0.08	0.04	0.10	0.02	0.00	0.01	0.08	0.06	0.07	0.02
C5	0.01	0.01	0.05	0.15	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.15	0.03	0.25	0.01	0.32	0.49	0.33
C5'	0.01	0.05	0.03	0.02	0.06	0.00	0.10	0.00	0.10	0.11	0.08	0.05	0.04	0.12	0.06	0.09	0.05	0.02	0.00	0.12	0.05	0.14	0.01
C6	0.01	0.01	0.08	0.17	0.01	0.07	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.18	0.04	0.25	0.00	0.34	0.53	0.35
C8	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.09	0.04	0.29	0.01	0.33	0.43	0.36
N1	0.01	0.00	0.10	0.18	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.19	0.04	0.20	0.01	0.25	0.46	0.27
N2	0.02	0.01	0.12	0.17	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.18	0.06	0.11	0.01	0.11	0.32	0.15
N3	0.01	0.00	0.10	0.14	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.14	0.04	0.11	0.01	0.10	0.29	0.15
N7	0.01	0.01	0.03	0.12	0.00	0.08	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.13	0.04	0.32	0.01	0.41	0.55	0.42
N9	0.00	0.01	0.02	0.09	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.07	0.02	0.16	0.01	0.17	0.29	0.21
O2'	0.01	0.11	0.00	0.02	0.07	0.10	0.08	0.09	0.09	0.04	0.11	0.12	0.10	0.06	0.04	0.00	0.06	0.08	0.09	0.10	0.07	0.10	0.09
O3'	0.02	0.17	0.02	0.01	0.12	0.02	0.15	0.05	0.18	0.09	0.19	0.18	0.14	0.13	0.07	0.06	0.00	0.01	0.22	0.20	0.24	0.15	0.20
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.04	0.04	0.04	0.06	0.04	0.04	0.02	0.08	0.01	0.00	0.08	0.04	0.07	0.09	0.07
O5'	0.04	0.14	0.13	0.19	0.17	0.01	0.25	0.00	0.25	0.29	0.20	0.11	0.11	0.32	0.16	0.09	0.22	0.08	0.00	0.29	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.07	0.18	0.01	0.08	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.20	0.04	0.29	0.00	0.42	0.60	0.41
OP1	0.03	0.15	0.13	0.18	0.19	0.06	0.32	0.05	0.34	0.33	0.25	0.11	0.10	0.41	0.17	0.07	0.24	0.07	0.01	0.42	0.00	0.00	0.00
OP2	0.12	0.36	0.14	0.12	0.36	0.07	0.49	0.14	0.53	0.43	0.46	0.32	0.29	0.55	0.29	0.10	0.15	0.09	0.02	0.60	0.00	0.00	0.00
P	0.07	0.19	0.13	0.17	0.23	0.02	0.33	0.01	0.35	0.36	0.27	0.15	0.15	0.42	0.21	0.09	0.20	0.07	0.00	0.41	0.00	0.00	0.00