Doublet Group distance statistics: 53148

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 1, 0, 0, 0, 1, 4, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.005, 0.012, 0.020, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.012 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.007, 0.014, 0.021, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.014 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.014, 0.022, 0.030, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.022 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.010, 0.018, 0.027, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.018 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.014, 0.024, 0.034, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.024 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.015, 0.025, 0.036, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.025 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.015, 0.026, 0.036, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.026 std_dev=0.011
O2	A	0, 0.038, 0.066, 0.095, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.066 std_dev=0.029
N4	A	0, 0.044, 0.075, 0.106, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.075 std_dev=0.031
C2'	A	0, 0.056, 0.113, 0.171, 0.186 max_d=0.186 avg_d=0.113 std_dev=0.058
O4'	A	0, 0.038, 0.100, 0.161, 0.207 max_d=0.207 avg_d=0.100 std_dev=0.061
C4'	A	0, 0.045, 0.121, 0.198, 0.225 max_d=0.225 avg_d=0.121 std_dev=0.077
C3'	A	0, 0.113, 0.207, 0.301, 0.352 max_d=0.352 avg_d=0.207 std_dev=0.094
O2'	A	0, 0.096, 0.194, 0.292, 0.349 max_d=0.349 avg_d=0.194 std_dev=0.098
O3'	A	0, 0.184, 0.318, 0.452, 0.512 max_d=0.512 avg_d=0.318 std_dev=0.134
C5'	A	0, 0.098, 0.266, 0.435, 0.553 max_d=0.553 avg_d=0.266 std_dev=0.168
N7	B	0, 0.152, 0.374, 0.597, 0.639 max_d=0.639 avg_d=0.374 std_dev=0.222
O5'	A	0, 0.190, 0.432, 0.674, 0.841 max_d=0.841 avg_d=0.432 std_dev=0.242
C8	B	0, 0.118, 0.364, 0.611, 0.712 max_d=0.712 avg_d=0.364 std_dev=0.246
C5	B	0, 0.150, 0.424, 0.699, 0.705 max_d=0.705 avg_d=0.424 std_dev=0.274
C4	B	0, 0.136, 0.433, 0.729, 0.818 max_d=0.818 avg_d=0.433 std_dev=0.296
N9	B	0, 0.104, 0.401, 0.698, 0.837 max_d=0.837 avg_d=0.401 std_dev=0.297
O4'	B	0, 0.248, 0.556, 0.865, 0.994 max_d=0.994 avg_d=0.556 std_dev=0.309
N3	B	0, 0.160, 0.485, 0.810, 0.903 max_d=0.903 avg_d=0.485 std_dev=0.325
C6	B	0, 0.145, 0.480, 0.816, 0.947 max_d=0.947 avg_d=0.480 std_dev=0.335
O5'	B	0, 0.281, 0.618, 0.955, 1.108 max_d=1.108 avg_d=0.618 std_dev=0.337
OP2	B	0, 0.291, 0.628, 0.965, 1.075 max_d=1.075 avg_d=0.628 std_dev=0.337
C1'	B	0, 0.120, 0.478, 0.835, 0.992 max_d=0.992 avg_d=0.478 std_dev=0.357
C2	B	0, 0.176, 0.533, 0.891, 0.951 max_d=0.951 avg_d=0.533 std_dev=0.358
P	A	0, 0.341, 0.702, 1.064, 1.327 max_d=1.327 avg_d=0.702 std_dev=0.361
C4'	B	0, 0.317, 0.681, 1.046, 1.172 max_d=1.172 avg_d=0.681 std_dev=0.365
C5'	B	0, 0.405, 0.773, 1.141, 1.169 max_d=1.169 avg_d=0.773 std_dev=0.368
N1	B	0, 0.160, 0.535, 0.909, 1.086 max_d=1.086 avg_d=0.535 std_dev=0.375
O6	B	0, 0.120, 0.497, 0.875, 1.102 max_d=1.102 avg_d=0.497 std_dev=0.378
OP2	A	0, 0.470, 0.856, 1.242, 1.447 max_d=1.447 avg_d=0.856 std_dev=0.386
P	B	0, 0.255, 0.652, 1.050, 1.111 max_d=1.111 avg_d=0.652 std_dev=0.397
N2	B	0, 0.187, 0.589, 0.991, 1.112 max_d=1.112 avg_d=0.589 std_dev=0.402
C3'	B	0, 0.240, 0.649, 1.058, 1.185 max_d=1.185 avg_d=0.649 std_dev=0.409
C2'	B	0, 0.167, 0.587, 1.007, 1.168 max_d=1.168 avg_d=0.587 std_dev=0.420
OP1	A	0, 0.405, 0.846, 1.288, 1.646 max_d=1.646 avg_d=0.846 std_dev=0.441
O2'	B	0, 0.193, 0.696, 1.199, 1.388 max_d=1.388 avg_d=0.696 std_dev=0.503
O3'	B	0, 0.298, 0.807, 1.315, 1.352 max_d=1.352 avg_d=0.807 std_dev=0.508
OP1	B	0, 0.244, 0.779, 1.314, 1.626 max_d=1.626 avg_d=0.779 std_dev=0.535

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.01	0.01	0.03	0.04	0.02	0.02
C2	0.02	0.00	0.06	0.03	0.01	0.02	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.04	0.01	0.06	0.09	0.06	0.06
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.03	0.03	0.06	0.05	0.10	0.00	0.01	0.01	0.03	0.04	0.03	0.03
C3'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.03	0.04	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.03
C4	0.02	0.01	0.05	0.04	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.04	0.02	0.13	0.18	0.13	0.14
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.06	0.02	0.02	0.04	0.05	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02
C5	0.02	0.01	0.04	0.06	0.01	0.06	0.00	0.11	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.06	0.04	0.15	0.20	0.14	0.16
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.09	0.00	0.11	0.00	0.10	0.05	0.07	0.10	0.03	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02
C6	0.02	0.02	0.03	0.06	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.06	0.04	0.13	0.15	0.11	0.12
N1	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.07	0.09	0.06	0.06
N3	0.02	0.01	0.06	0.03	0.01	0.02	0.02	0.07	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.09	0.03	0.02	0.10	0.13	0.10	0.11
N4	0.02	0.01	0.05	0.04	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.04	0.03	0.15	0.20	0.15	0.17
O2	0.04	0.00	0.10	0.07	0.01	0.05	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.14	0.09	0.04	0.02	0.04	0.03	0.02
O2'	0.02	0.09	0.00	0.01	0.07	0.02	0.04	0.02	0.03	0.04	0.09	0.07	0.14	0.00	0.01	0.03	0.04	0.06	0.04	0.03
O3'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.02	0.06	0.03	0.06	0.02	0.03	0.04	0.09	0.01	0.00	0.01	0.04	0.04	0.05	0.04
O4'	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.02	0.03	0.04	0.03	0.01	0.00	0.03	0.05	0.02	0.02
O5'	0.03	0.06	0.03	0.02	0.13	0.02	0.15	0.01	0.13	0.07	0.10	0.15	0.02	0.04	0.04	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.04	0.09	0.04	0.03	0.18	0.03	0.20	0.01	0.15	0.09	0.13	0.20	0.04	0.06	0.04	0.05	0.01	0.00	0.02	0.00
OP2	0.02	0.06	0.03	0.03	0.13	0.03	0.14	0.02	0.11	0.06	0.10	0.15	0.03	0.04	0.05	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00
P	0.02	0.06	0.03	0.03	0.14	0.02	0.16	0.02	0.12	0.06	0.11	0.17	0.02	0.03	0.04	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.21	0.17	0.16	0.20	0.17	0.20	0.15	0.22	0.19	0.22	0.22	0.20	0.20	0.19	0.17	0.15	0.20	0.19	0.23	0.09	0.13	0.14
C2	0.19	0.20	0.19	0.18	0.20	0.17	0.20	0.15	0.21	0.20	0.21	0.21	0.20	0.20	0.20	0.19	0.18	0.19	0.19	0.22	0.11	0.11	0.13
C2'	0.18	0.24	0.15	0.12	0.20	0.13	0.22	0.10	0.25	0.19	0.26	0.25	0.21	0.21	0.19	0.17	0.12	0.18	0.17	0.29	0.07	0.07	0.07
C3'	0.13	0.19	0.10	0.07	0.15	0.07	0.17	0.05	0.21	0.14	0.21	0.20	0.16	0.16	0.14	0.10	0.06	0.12	0.10	0.24	0.14	0.03	0.05
C4	0.19	0.17	0.16	0.15	0.17	0.19	0.17	0.18	0.17	0.18	0.18	0.17	0.17	0.17	0.18	0.17	0.14	0.22	0.21	0.20	0.11	0.12	0.16
C4'	0.13	0.18	0.11	0.10	0.15	0.10	0.17	0.09	0.19	0.14	0.19	0.18	0.16	0.16	0.14	0.11	0.09	0.14	0.12	0.22	0.14	0.09	0.09
C5	0.19	0.17	0.14	0.13	0.17	0.19	0.17	0.20	0.17	0.18	0.17	0.17	0.17	0.17	0.18	0.15	0.11	0.23	0.22	0.19	0.11	0.15	0.18
C5'	0.11	0.14	0.12	0.13	0.12	0.10	0.13	0.10	0.15	0.12	0.15	0.14	0.13	0.13	0.12	0.10	0.13	0.11	0.10	0.17	0.20	0.08	0.11
C6	0.19	0.18	0.14	0.13	0.17	0.18	0.17	0.19	0.18	0.18	0.18	0.18	0.17	0.17	0.18	0.16	0.12	0.22	0.21	0.19	0.10	0.16	0.17
N1	0.19	0.19	0.16	0.15	0.18	0.17	0.19	0.16	0.19	0.18	0.20	0.20	0.19	0.18	0.19	0.17	0.14	0.20	0.20	0.21	0.09	0.12	0.14
N3	0.20	0.19	0.19	0.18	0.19	0.18	0.19	0.17	0.19	0.20	0.20	0.20	0.19	0.19	0.20	0.19	0.18	0.21	0.20	0.21	0.12	0.12	0.14
N4	0.20	0.16	0.15	0.15	0.16	0.21	0.15	0.21	0.17	0.19	0.17	0.16	0.16	0.15	0.18	0.17	0.13	0.25	0.22	0.21	0.13	0.14	0.18
O2	0.20	0.22	0.22	0.20	0.21	0.17	0.22	0.14	0.23	0.21	0.23	0.22	0.21	0.22	0.21	0.21	0.20	0.18	0.18	0.24	0.11	0.11	0.13
O2'	0.21	0.28	0.19	0.16	0.24	0.16	0.26	0.12	0.30	0.22	0.30	0.30	0.25	0.24	0.22	0.20	0.16	0.20	0.19	0.33	0.06	0.09	0.09
O3'	0.14	0.22	0.09	0.05	0.17	0.05	0.20	0.03	0.24	0.15	0.25	0.23	0.18	0.18	0.15	0.11	0.04	0.12	0.09	0.28	0.17	0.03	0.04
O4'	0.16	0.18	0.14	0.13	0.17	0.14	0.17	0.14	0.19	0.16	0.19	0.19	0.17	0.17	0.16	0.14	0.11	0.17	0.17	0.21	0.11	0.14	0.13
O5'	0.15	0.15	0.18	0.19	0.16	0.15	0.15	0.14	0.15	0.16	0.15	0.15	0.16	0.15	0.16	0.15	0.19	0.15	0.14	0.15	0.22	0.14	0.16
OP1	0.14	0.14	0.22	0.23	0.15	0.14	0.13	0.13	0.11	0.14	0.12	0.14	0.15	0.13	0.15	0.18	0.24	0.13	0.14	0.09	0.23	0.13	0.15
OP2	0.11	0.11	0.15	0.18	0.11	0.12	0.11	0.14	0.11	0.12	0.11	0.11	0.11	0.11	0.12	0.12	0.20	0.12	0.12	0.13	0.24	0.11	0.13
P	0.13	0.12	0.18	0.20	0.13	0.14	0.12	0.14	0.11	0.13	0.11	0.12	0.13	0.12	0.14	0.15	0.22	0.13	0.13	0.11	0.24	0.12	0.15

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.06	0.05	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.05	0.03	0.08	0.08	0.03
C2	0.05	0.00	0.08	0.09	0.01	0.05	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.12	0.04	0.09	0.02	0.09	0.13	0.07
C2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.05	0.03	0.07	0.10	0.08	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.05	0.05	0.14	0.07
C3'	0.02	0.09	0.01	0.00	0.06	0.01	0.05	0.02	0.06	0.04	0.08	0.10	0.08	0.04	0.03	0.02	0.01	0.02	0.11	0.07	0.05	0.14	0.09
C4	0.02	0.01	0.04	0.06	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.07	0.01	0.08	0.03	0.07	0.13	0.06
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.05	0.04	0.06	0.05	0.06	0.02	0.04	0.01	0.01	0.01	0.06	0.10	0.04	0.02
C5	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.06	0.03	0.11	0.02	0.09	0.13	0.08
C5'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.04	0.01	0.07	0.00	0.07	0.07	0.06	0.06	0.04	0.08	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.09	0.11	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.06	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.07	0.08	0.03	0.12	0.01	0.09	0.13	0.08
C8	0.02	0.01	0.03	0.04	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.05	0.11	0.04	0.07	0.12	0.06
N1	0.04	0.01	0.07	0.08	0.02	0.04	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.11	0.03	0.10	0.02	0.09	0.13	0.08
N2	0.06	0.01	0.10	0.10	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.14	0.14	0.06	0.08	0.03	0.09	0.13	0.07
N3	0.05	0.01	0.08	0.08	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.09	0.11	0.05	0.08	0.03	0.08	0.13	0.06
N7	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.06	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.05	0.13	0.04	0.10	0.13	0.09
N9	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.07	0.03	0.06	0.12	0.04
O2'	0.01	0.11	0.00	0.02	0.05	0.04	0.04	0.04	0.07	0.02	0.10	0.14	0.09	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.06	0.09	0.09	0.02
O3'	0.02	0.12	0.01	0.01	0.07	0.01	0.06	0.03	0.08	0.04	0.11	0.14	0.11	0.05	0.04	0.01	0.00	0.01	0.14	0.09	0.05	0.12	0.09
O4'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.05	0.03	0.06	0.05	0.05	0.01	0.03	0.01	0.00	0.11	0.06	0.13	0.06	0.07
O5'	0.05	0.09	0.06	0.11	0.08	0.01	0.11	0.01	0.12	0.11	0.10	0.08	0.08	0.13	0.07	0.02	0.14	0.11	0.00	0.14	0.02	0.01	0.01
O6	0.03	0.02	0.05	0.07	0.03	0.06	0.02	0.09	0.01	0.04	0.02	0.03	0.03	0.04	0.03	0.06	0.09	0.06	0.14	0.00	0.10	0.12	0.10
OP1	0.08	0.09	0.05	0.05	0.07	0.10	0.09	0.11	0.09	0.07	0.09	0.09	0.08	0.10	0.06	0.09	0.05	0.13	0.02	0.10	0.00	0.02	0.01
OP2	0.08	0.13	0.14	0.14	0.13	0.04	0.13	0.02	0.13	0.12	0.13	0.13	0.13	0.13	0.12	0.09	0.12	0.06	0.01	0.12	0.02	0.00	0.01
P	0.03	0.07	0.07	0.09	0.06	0.02	0.08	0.01	0.08	0.06	0.08	0.07	0.06	0.09	0.04	0.02	0.09	0.07	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00