Doublet Group distance statistics: 53153

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 2, 0, 3, 1, 1, 3, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.004, 0.008, 0.012, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.006, 0.010, 0.015, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.005, 0.011, 0.016, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.011 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.006, 0.014, 0.022, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.014 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.007, 0.016, 0.024, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.016 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.008, 0.017, 0.026, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.017 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.007, 0.017, 0.026, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.017 std_dev=0.010
O2	A	0, 0.019, 0.040, 0.060, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.040 std_dev=0.020
N4	A	0, 0.016, 0.039, 0.063, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.039 std_dev=0.023
O4'	A	0, 0.044, 0.185, 0.326, 0.472 max_d=0.472 avg_d=0.185 std_dev=0.141
C2'	A	0, 0.059, 0.229, 0.399, 0.566 max_d=0.566 avg_d=0.229 std_dev=0.170
C4'	A	0, 0.096, 0.276, 0.457, 0.663 max_d=0.663 avg_d=0.276 std_dev=0.181
O2'	A	0, 0.072, 0.323, 0.573, 0.823 max_d=0.823 avg_d=0.323 std_dev=0.250
C3'	A	0, 0.101, 0.352, 0.603, 0.854 max_d=0.854 avg_d=0.352 std_dev=0.251
O4	B	0, 0.201, 0.488, 0.774, 1.260 max_d=1.260 avg_d=0.488 std_dev=0.286
C5	B	0, 0.261, 0.547, 0.834, 1.229 max_d=1.229 avg_d=0.547 std_dev=0.287
C4	B	0, 0.247, 0.555, 0.864, 1.364 max_d=1.364 avg_d=0.555 std_dev=0.309
C6	B	0, 0.289, 0.615, 0.942, 1.274 max_d=1.274 avg_d=0.615 std_dev=0.326
C5'	A	0, 0.177, 0.518, 0.859, 1.222 max_d=1.222 avg_d=0.518 std_dev=0.341
N1	B	0, 0.327, 0.700, 1.073, 1.429 max_d=1.429 avg_d=0.700 std_dev=0.373
O3'	A	0, 0.153, 0.531, 0.909, 1.304 max_d=1.304 avg_d=0.531 std_dev=0.378
P	B	0, 0.348, 0.734, 1.121, 1.316 max_d=1.316 avg_d=0.734 std_dev=0.386
N3	B	0, 0.318, 0.705, 1.093, 1.569 max_d=1.569 avg_d=0.705 std_dev=0.387
C1'	B	0, 0.365, 0.774, 1.183, 1.474 max_d=1.474 avg_d=0.774 std_dev=0.409
O5'	B	0, 0.381, 0.796, 1.210, 1.481 max_d=1.481 avg_d=0.796 std_dev=0.415
O5'	A	0, 0.208, 0.627, 1.046, 1.374 max_d=1.374 avg_d=0.627 std_dev=0.419
C5'	B	0, 0.305, 0.726, 1.147, 1.340 max_d=1.340 avg_d=0.726 std_dev=0.421
C2	B	0, 0.368, 0.789, 1.211, 1.630 max_d=1.630 avg_d=0.789 std_dev=0.421
O4'	B	0, 0.392, 0.830, 1.268, 1.488 max_d=1.488 avg_d=0.830 std_dev=0.438
C2'	B	0, 0.354, 0.844, 1.335, 1.705 max_d=1.705 avg_d=0.844 std_dev=0.490
O2	B	0, 0.478, 0.983, 1.487, 1.855 max_d=1.855 avg_d=0.983 std_dev=0.505
C4'	B	0, 0.415, 0.925, 1.434, 1.639 max_d=1.639 avg_d=0.925 std_dev=0.509
P	A	0, 0.218, 0.800, 1.383, 1.952 max_d=1.952 avg_d=0.800 std_dev=0.582
OP2	A	0, 0.156, 0.750, 1.344, 2.105 max_d=2.105 avg_d=0.750 std_dev=0.594
O2'	B	0, 0.321, 0.954, 1.587, 2.174 max_d=2.174 avg_d=0.954 std_dev=0.633
C3'	B	0, 0.649, 1.295, 1.942, 2.238 max_d=2.238 avg_d=1.295 std_dev=0.647
OP2	B	0, 0.705, 1.368, 2.032, 2.573 max_d=2.573 avg_d=1.368 std_dev=0.663
OP1	A	0, 0.275, 0.971, 1.668, 2.270 max_d=2.270 avg_d=0.971 std_dev=0.696
OP1	B	0, 0.216, 1.023, 1.830, 2.829 max_d=2.829 avg_d=1.023 std_dev=0.807
O3'	B	0, 1.019, 2.186, 3.352, 3.685 max_d=3.685 avg_d=2.186 std_dev=1.166

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.04	0.11	0.05
C2	0.01	0.00	0.05	0.04	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.05	0.02	0.09	0.11	0.20	0.12
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.02	0.05	0.01	0.06	0.01	0.04	0.02	0.11	0.00	0.01	0.01	0.05	0.06	0.09	0.05
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.08	0.01	0.12	0.02	0.12	0.05	0.05	0.08	0.08	0.02	0.01	0.01	0.04	0.07	0.05	0.04
C4	0.01	0.00	0.02	0.08	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.10	0.01	0.12	0.18	0.24	0.17
C4'	0.00	0.02	0.02	0.01	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.03	0.05	0.02	0.06	0.02	0.00	0.01	0.08	0.03	0.02
C5	0.01	0.00	0.05	0.12	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.15	0.02	0.12	0.17	0.22	0.16
C5'	0.02	0.05	0.01	0.02	0.09	0.01	0.10	0.00	0.08	0.05	0.07	0.10	0.04	0.07	0.03	0.01	0.01	0.09	0.01	0.02
C6	0.01	0.00	0.06	0.12	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.14	0.03	0.10	0.12	0.16	0.12
N1	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.07	0.08	0.16	0.09
N3	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.06	0.02	0.11	0.16	0.23	0.15
N4	0.01	0.01	0.02	0.08	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.11	0.02	0.13	0.21	0.27	0.19
O2	0.01	0.01	0.11	0.08	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.14	0.11	0.04	0.09	0.10	0.20	0.11
O2'	0.02	0.08	0.00	0.02	0.03	0.06	0.03	0.07	0.04	0.02	0.07	0.03	0.14	0.00	0.03	0.05	0.04	0.10	0.06	0.05
O3'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.10	0.02	0.15	0.03	0.14	0.05	0.06	0.11	0.11	0.03	0.00	0.02	0.05	0.10	0.08	0.06
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.04	0.05	0.02	0.00	0.03	0.06	0.09	0.04
O5'	0.04	0.09	0.05	0.04	0.12	0.01	0.12	0.01	0.10	0.07	0.11	0.13	0.09	0.04	0.05	0.03	0.00	0.03	0.02	0.00
OP1	0.04	0.11	0.06	0.07	0.18	0.08	0.17	0.09	0.12	0.08	0.16	0.21	0.10	0.10	0.10	0.06	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.20	0.09	0.05	0.24	0.03	0.22	0.01	0.16	0.16	0.23	0.27	0.20	0.06	0.08	0.09	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.12	0.05	0.04	0.17	0.02	0.16	0.02	0.12	0.09	0.15	0.19	0.11	0.05	0.06	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.10	0.09	0.12	0.08	0.15	0.14	0.15	0.15	0.13	0.08	0.11	0.09	0.23	0.08	0.18	0.21	0.82	1.09	0.25
C2	0.06	0.07	0.06	0.06	0.06	0.09	0.07	0.15	0.07	0.05	0.09	0.09	0.09	0.11	0.10	0.10	0.21	0.81	1.08	0.27
C2'	0.14	0.12	0.07	0.09	0.09	0.12	0.12	0.13	0.13	0.12	0.11	0.14	0.10	0.21	0.08	0.16	0.20	0.82	1.07	0.25
C3'	0.23	0.22	0.17	0.19	0.18	0.20	0.19	0.15	0.21	0.22	0.21	0.24	0.20	0.32	0.17	0.24	0.17	0.86	1.03	0.19
C4	0.05	0.07	0.05	0.06	0.07	0.09	0.07	0.14	0.07	0.04	0.10	0.10	0.09	0.09	0.11	0.10	0.21	0.83	1.08	0.26
C4'	0.24	0.19	0.18	0.21	0.16	0.23	0.21	0.18	0.23	0.22	0.16	0.20	0.19	0.35	0.13	0.26	0.20	0.86	1.06	0.21
C5	0.13	0.08	0.07	0.10	0.09	0.14	0.16	0.14	0.15	0.11	0.08	0.09	0.07	0.18	0.07	0.17	0.22	0.84	1.07	0.24
C5'	0.28	0.22	0.21	0.26	0.18	0.27	0.22	0.20	0.25	0.25	0.18	0.23	0.23	0.40	0.14	0.29	0.19	0.89	1.02	0.19
C6	0.15	0.11	0.09	0.12	0.10	0.16	0.16	0.15	0.17	0.14	0.09	0.11	0.10	0.23	0.09	0.19	0.21	0.84	1.08	0.24
N1	0.12	0.08	0.06	0.09	0.06	0.13	0.12	0.14	0.13	0.10	0.07	0.10	0.07	0.19	0.06	0.16	0.20	0.83	1.09	0.25
N3	0.04	0.09	0.09	0.08	0.09	0.08	0.05	0.16	0.05	0.04	0.12	0.11	0.12	0.07	0.14	0.08	0.22	0.81	1.08	0.28
N4	0.06	0.12	0.10	0.09	0.13	0.09	0.06	0.16	0.06	0.07	0.16	0.14	0.14	0.05	0.20	0.09	0.22	0.83	1.07	0.27
O2	0.06	0.08	0.09	0.08	0.09	0.08	0.07	0.17	0.07	0.05	0.10	0.10	0.11	0.10	0.12	0.09	0.22	0.80	1.07	0.29
O2'	0.14	0.11	0.06	0.09	0.08	0.14	0.12	0.16	0.13	0.12	0.10	0.13	0.09	0.21	0.07	0.17	0.23	0.79	1.11	0.29
O3'	0.25	0.26	0.20	0.21	0.22	0.21	0.20	0.15	0.22	0.24	0.25	0.29	0.24	0.34	0.20	0.25	0.16	0.87	1.02	0.19
O4'	0.22	0.15	0.16	0.20	0.13	0.23	0.20	0.19	0.22	0.20	0.12	0.15	0.16	0.33	0.12	0.25	0.22	0.83	1.09	0.24
O5'	0.30	0.26	0.24	0.27	0.21	0.29	0.24	0.22	0.27	0.28	0.23	0.28	0.25	0.41	0.17	0.31	0.20	0.90	0.99	0.17
OP1	0.30	0.26	0.24	0.29	0.20	0.30	0.22	0.24	0.25	0.27	0.23	0.29	0.26	0.43	0.16	0.32	0.19	0.92	0.92	0.20
OP2	0.26	0.25	0.22	0.25	0.18	0.25	0.19	0.21	0.22	0.24	0.22	0.28	0.24	0.37	0.15	0.27	0.19	0.91	0.93	0.21
P	0.32	0.27	0.26	0.30	0.21	0.31	0.24	0.25	0.27	0.29	0.23	0.29	0.27	0.44	0.17	0.33	0.21	0.92	0.94	0.19

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.09	0.01	0.00	0.04	0.50	0.41	0.11
C2	0.01	0.00	0.08	0.05	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.12	0.12	0.01	0.05	0.08	0.71	0.66	0.14
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.02	0.01	0.06	0.04	0.07	0.01	0.05	0.14	0.00	0.03	0.03	0.01	0.07	0.38	0.22	0.12
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.04	0.09	0.02	0.01	0.03	0.01	0.05	0.17	0.12	0.07
C4	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.08	0.00	0.02	0.12	0.86	0.90	0.19
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.05	0.00	0.01	0.15	0.09	0.04
C5	0.01	0.01	0.06	0.05	0.00	0.05	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.05	0.01	0.04	0.15	0.87	0.93	0.22
C5'	0.02	0.06	0.04	0.01	0.10	0.00	0.12	0.00	0.10	0.06	0.08	0.04	0.02	0.04	0.11	0.01	0.01	0.11	0.12	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.06	0.01	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.02	0.08	0.04	0.01	0.05	0.14	0.79	0.80	0.20
N1	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.08	0.01	0.01	0.08	0.68	0.63	0.14
N3	0.01	0.00	0.05	0.04	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.11	0.00	0.04	0.09	0.80	0.79	0.16
O2	0.02	0.00	0.14	0.09	0.01	0.02	0.01	0.04	0.02	0.02	0.01	0.00	0.23	0.16	0.01	0.07	0.09	0.65	0.56	0.15
O2'	0.01	0.12	0.00	0.02	0.06	0.02	0.08	0.02	0.08	0.03	0.10	0.23	0.00	0.05	0.07	0.01	0.08	0.41	0.21	0.15
O3'	0.09	0.12	0.03	0.01	0.08	0.02	0.05	0.04	0.04	0.08	0.11	0.16	0.05	0.00	0.09	0.06	0.07	0.17	0.15	0.08
O4	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.09	0.00	0.03	0.12	0.89	0.95	0.20
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.04	0.07	0.01	0.06	0.03	0.00	0.06	0.42	0.37	0.11
O5'	0.04	0.08	0.07	0.05	0.12	0.01	0.15	0.01	0.14	0.08	0.09	0.09	0.08	0.07	0.12	0.06	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.50	0.71	0.38	0.17	0.86	0.15	0.87	0.11	0.79	0.68	0.80	0.65	0.41	0.17	0.89	0.42	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.41	0.66	0.22	0.12	0.90	0.09	0.93	0.12	0.80	0.63	0.79	0.56	0.21	0.15	0.95	0.37	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.11	0.14	0.12	0.07	0.19	0.04	0.22	0.01	0.20	0.14	0.16	0.15	0.15	0.08	0.20	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00