Doublet Group distance statistics: 53154

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.002, 0.004, 0.007, 0.007 max_d=0.007 avg_d=0.004 std_dev=0.002
C2	A	0, 0.002, 0.006, 0.009, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.006 std_dev=0.003
C4	A	0, 0.003, 0.007, 0.011, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.007 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.004, 0.009, 0.014, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.005, 0.011, 0.018, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.014 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.004, 0.015, 0.026, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.015 std_dev=0.011
O2	A	0, 0.003, 0.014, 0.025, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.014 std_dev=0.011
N4	A	0, 0.006, 0.030, 0.055, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.030 std_dev=0.024
O4'	A	0, 0.019, 0.091, 0.163, 0.160 max_d=0.160 avg_d=0.091 std_dev=0.072
C2'	A	0, 0.018, 0.095, 0.173, 0.195 max_d=0.195 avg_d=0.095 std_dev=0.077
O2'	A	0, 0.023, 0.160, 0.298, 0.367 max_d=0.367 avg_d=0.160 std_dev=0.138
O4	B	0, 0.055, 0.203, 0.350, 0.364 max_d=0.364 avg_d=0.203 std_dev=0.147
C3'	A	0, 0.041, 0.192, 0.343, 0.322 max_d=0.322 avg_d=0.192 std_dev=0.151
N3	B	0, 0.074, 0.235, 0.397, 0.390 max_d=0.390 avg_d=0.235 std_dev=0.162
C4'	A	0, 0.045, 0.217, 0.389, 0.376 max_d=0.376 avg_d=0.217 std_dev=0.172
C4	B	0, 0.077, 0.251, 0.425, 0.402 max_d=0.402 avg_d=0.251 std_dev=0.174
O2	B	0, 0.097, 0.311, 0.524, 0.518 max_d=0.518 avg_d=0.311 std_dev=0.213
C2	B	0, 0.096, 0.312, 0.527, 0.489 max_d=0.489 avg_d=0.312 std_dev=0.215
O3'	A	0, 0.061, 0.298, 0.536, 0.553 max_d=0.553 avg_d=0.298 std_dev=0.238
C5	B	0, 0.084, 0.362, 0.641, 0.757 max_d=0.757 avg_d=0.362 std_dev=0.279
C5'	A	0, 0.088, 0.393, 0.698, 0.678 max_d=0.678 avg_d=0.393 std_dev=0.305
N1	B	0, 0.107, 0.412, 0.717, 0.793 max_d=0.793 avg_d=0.412 std_dev=0.305
O5'	A	0, 0.072, 0.416, 0.759, 0.823 max_d=0.823 avg_d=0.416 std_dev=0.344
C6	B	0, 0.095, 0.439, 0.784, 0.941 max_d=0.941 avg_d=0.439 std_dev=0.344
C1'	B	0, 0.130, 0.529, 0.928, 1.029 max_d=1.029 avg_d=0.529 std_dev=0.399
O4'	B	0, 0.147, 0.566, 0.985, 0.925 max_d=0.925 avg_d=0.566 std_dev=0.419
C2'	B	0, 0.120, 0.559, 0.998, 1.184 max_d=1.184 avg_d=0.559 std_dev=0.439
O5'	B	0, 0.138, 0.578, 1.018, 1.030 max_d=1.030 avg_d=0.578 std_dev=0.440
C5'	B	0, 0.111, 0.559, 1.008, 1.059 max_d=1.059 avg_d=0.559 std_dev=0.449
P	B	0, 0.078, 0.541, 1.005, 1.090 max_d=1.090 avg_d=0.541 std_dev=0.464
OP1	B	0, 0.108, 0.573, 1.039, 1.093 max_d=1.093 avg_d=0.573 std_dev=0.465
C4'	B	0, 0.164, 0.642, 1.120, 1.058 max_d=1.058 avg_d=0.642 std_dev=0.478
P	A	0, 0.101, 0.588, 1.076, 1.156 max_d=1.156 avg_d=0.588 std_dev=0.487
OP2	A	0, 0.105, 0.627, 1.150, 1.229 max_d=1.229 avg_d=0.627 std_dev=0.523
C3'	B	0, 0.164, 0.688, 1.211, 1.321 max_d=1.321 avg_d=0.688 std_dev=0.524
OP2	B	0, 0.159, 0.698, 1.237, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.698 std_dev=0.539
O2'	B	0, 0.105, 0.656, 1.207, 1.543 max_d=1.543 avg_d=0.656 std_dev=0.551
O3'	B	0, 0.191, 0.853, 1.515, 1.713 max_d=1.713 avg_d=0.853 std_dev=0.662
OP1	A	0, 0.114, 0.813, 1.511, 1.648 max_d=1.648 avg_d=0.813 std_dev=0.698

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.07	0.05	0.13	0.08
C2	0.01	0.00	0.04	0.08	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.08	0.01	0.16	0.20	0.28	0.21
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.02	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.04	0.03	0.05	0.05
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.07	0.05	0.07	0.07	0.11	0.01	0.00	0.00	0.07	0.06	0.06	0.07
C4	0.01	0.01	0.01	0.06	0.00	0.06	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.07	0.01	0.18	0.28	0.37	0.27
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.07	0.04	0.05	0.07	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.01
C5	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.08	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.08	0.01	0.14	0.23	0.32	0.24
C5'	0.02	0.10	0.01	0.00	0.15	0.00	0.16	0.00	0.13	0.09	0.13	0.17	0.08	0.03	0.02	0.01	0.00	0.08	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.07	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.08	0.01	0.10	0.14	0.23	0.16
N1	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.12	0.13	0.22	0.16
N3	0.01	0.00	0.02	0.07	0.00	0.05	0.00	0.13	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.09	0.01	0.19	0.26	0.35	0.26
N4	0.01	0.01	0.01	0.07	0.00	0.07	0.01	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.08	0.02	0.19	0.33	0.42	0.31
O2	0.01	0.00	0.07	0.11	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.06	0.12	0.01	0.16	0.18	0.27	0.20
O2'	0.02	0.03	0.00	0.01	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.01	0.03	0.03	0.06	0.00	0.02	0.06	0.05	0.05	0.05	0.05
O3'	0.00	0.08	0.01	0.00	0.07	0.01	0.08	0.02	0.08	0.05	0.09	0.08	0.12	0.02	0.00	0.01	0.11	0.13	0.12	0.13
O4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.00	0.10	0.10	0.12	0.09
O5'	0.07	0.16	0.04	0.07	0.18	0.01	0.14	0.00	0.10	0.12	0.19	0.19	0.16	0.05	0.11	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01
OP1	0.05	0.20	0.03	0.06	0.28	0.05	0.23	0.08	0.14	0.13	0.26	0.33	0.18	0.05	0.13	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.13	0.28	0.05	0.06	0.37	0.01	0.32	0.01	0.23	0.22	0.35	0.42	0.27	0.05	0.12	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.21	0.05	0.07	0.27	0.01	0.24	0.01	0.16	0.16	0.26	0.31	0.20	0.05	0.13	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.09	0.08	0.12	0.07	0.18	0.10	0.23	0.11	0.11	0.07	0.09	0.03	0.09	0.04	0.18	0.29	0.51	0.53	0.41
C2	0.15	0.13	0.12	0.16	0.10	0.22	0.12	0.27	0.14	0.14	0.11	0.13	0.06	0.11	0.07	0.21	0.31	0.53	0.56	0.44
C2'	0.12	0.12	0.10	0.13	0.10	0.18	0.11	0.24	0.12	0.12	0.11	0.12	0.05	0.08	0.08	0.18	0.29	0.51	0.53	0.42
C3'	0.08	0.09	0.08	0.09	0.07	0.13	0.06	0.19	0.07	0.08	0.08	0.09	0.08	0.06	0.07	0.12	0.22	0.49	0.46	0.36
C4	0.14	0.13	0.10	0.14	0.10	0.19	0.11	0.24	0.12	0.13	0.11	0.13	0.05	0.10	0.06	0.19	0.28	0.50	0.49	0.39
C4'	0.04	0.04	0.04	0.05	0.03	0.10	0.02	0.18	0.03	0.03	0.04	0.04	0.08	0.03	0.05	0.10	0.20	0.49	0.46	0.36
C5	0.12	0.10	0.08	0.11	0.07	0.16	0.10	0.19	0.11	0.11	0.08	0.11	0.05	0.08	0.04	0.17	0.25	0.47	0.44	0.35
C5'	0.10	0.12	0.14	0.12	0.14	0.10	0.11	0.18	0.10	0.10	0.14	0.12	0.19	0.14	0.16	0.09	0.11	0.48	0.42	0.32
C6	0.12	0.10	0.07	0.11	0.07	0.16	0.10	0.20	0.11	0.11	0.07	0.10	0.06	0.09	0.04	0.17	0.26	0.48	0.46	0.36
N1	0.14	0.11	0.09	0.13	0.08	0.19	0.11	0.24	0.12	0.13	0.09	0.11	0.04	0.09	0.05	0.19	0.29	0.51	0.52	0.41
N3	0.16	0.14	0.13	0.17	0.11	0.22	0.13	0.28	0.15	0.15	0.13	0.14	0.08	0.13	0.09	0.21	0.32	0.53	0.56	0.44
N4	0.15	0.15	0.12	0.15	0.12	0.20	0.12	0.24	0.13	0.15	0.14	0.16	0.07	0.11	0.09	0.19	0.28	0.49	0.47	0.39
O2	0.16	0.13	0.13	0.18	0.11	0.23	0.13	0.29	0.15	0.15	0.11	0.13	0.08	0.13	0.08	0.22	0.33	0.53	0.60	0.47
O2'	0.13	0.11	0.11	0.14	0.10	0.20	0.12	0.27	0.13	0.13	0.09	0.10	0.05	0.08	0.08	0.19	0.32	0.54	0.57	0.46
O3'	0.09	0.10	0.11	0.11	0.09	0.12	0.08	0.19	0.09	0.09	0.10	0.11	0.14	0.10	0.09	0.11	0.19	0.47	0.44	0.35
O4'	0.12	0.08	0.07	0.10	0.06	0.16	0.09	0.21	0.11	0.10	0.06	0.08	0.08	0.09	0.04	0.17	0.26	0.50	0.49	0.38
O5'	0.08	0.09	0.14	0.11	0.14	0.05	0.13	0.09	0.11	0.09	0.11	0.06	0.20	0.15	0.16	0.03	0.03	0.39	0.30	0.22
OP1	0.36	0.36	0.44	0.41	0.38	0.32	0.38	0.30	0.37	0.36	0.37	0.34	0.52	0.45	0.39	0.29	0.25	0.37	0.29	0.27
OP2	0.33	0.31	0.38	0.36	0.40	0.32	0.41	0.31	0.39	0.34	0.34	0.26	0.41	0.38	0.42	0.30	0.25	0.39	0.30	0.28
P	0.25	0.25	0.31	0.28	0.30	0.21	0.30	0.21	0.28	0.25	0.27	0.22	0.37	0.31	0.33	0.20	0.14	0.37	0.26	0.22

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.08	0.23	0.09	0.11
C2	0.01	0.00	0.06	0.03	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.12	0.08	0.02	0.06	0.12	0.36	0.18	0.19
C2'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.02	0.00	0.06	0.02	0.08	0.01	0.03	0.10	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.21	0.06	0.09
C3'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.06	0.13	0.06	0.06
C4	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.05	0.00	0.04	0.17	0.43	0.30	0.27
C4'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.04	0.02	0.03	0.06	0.01	0.02	0.04	0.00	0.01	0.07	0.06	0.03
C5	0.01	0.01	0.06	0.05	0.01	0.04	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.04	0.01	0.08	0.17	0.42	0.31	0.29
C5'	0.03	0.08	0.02	0.01	0.10	0.00	0.09	0.00	0.08	0.06	0.09	0.08	0.02	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.07	0.01
C6	0.01	0.01	0.08	0.05	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.04	0.01	0.10	0.16	0.37	0.25	0.25
N1	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.05	0.02	0.01	0.12	0.33	0.17	0.18
N3	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.07	0.01	0.04	0.14	0.41	0.24	0.23
O2	0.03	0.00	0.10	0.05	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.20	0.11	0.02	0.12	0.09	0.34	0.14	0.16
O2'	0.00	0.12	0.01	0.01	0.04	0.01	0.09	0.02	0.10	0.03	0.09	0.20	0.00	0.03	0.04	0.01	0.04	0.23	0.05	0.10
O3'	0.05	0.08	0.04	0.01	0.05	0.02	0.04	0.01	0.04	0.05	0.07	0.11	0.03	0.00	0.04	0.04	0.07	0.13	0.08	0.06
O4	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.04	0.00	0.04	0.18	0.44	0.32	0.29
O4'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.10	0.01	0.04	0.12	0.01	0.04	0.04	0.00	0.08	0.12	0.09	0.06
O5'	0.08	0.12	0.04	0.06	0.17	0.01	0.17	0.00	0.16	0.12	0.14	0.09	0.04	0.07	0.18	0.08	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.23	0.36	0.21	0.13	0.43	0.07	0.42	0.01	0.37	0.33	0.41	0.34	0.23	0.13	0.44	0.12	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.09	0.18	0.06	0.06	0.30	0.06	0.31	0.07	0.25	0.17	0.24	0.14	0.05	0.08	0.32	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.19	0.09	0.06	0.27	0.03	0.29	0.01	0.25	0.18	0.23	0.16	0.10	0.06	0.29	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00