Doublet Group distance statistics: 53157

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C1'	A	0, 0.003, 0.012, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.004, 0.015, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.004, 0.015, 0.027, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.005, 0.019, 0.032, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.019 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.006, 0.019, 0.033, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.019 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.004, 0.018, 0.032, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.018 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.006, 0.024, 0.041, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.024 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.006, 0.030, 0.054, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.030 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.007, 0.032, 0.057, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.032 std_dev=0.025
N6	A	0, 0.007, 0.042, 0.078, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.042 std_dev=0.035
O2	B	0, 0.071, 0.246, 0.421, 0.393 max_d=0.393 avg_d=0.246 std_dev=0.175
C2	B	0, 0.103, 0.380, 0.657, 0.651 max_d=0.651 avg_d=0.380 std_dev=0.277
N3	B	0, 0.129, 0.454, 0.779, 0.740 max_d=0.740 avg_d=0.454 std_dev=0.325
O4'	A	0, 0.005, 0.367, 0.729, 0.859 max_d=0.859 avg_d=0.367 std_dev=0.362
N1	B	0, 0.106, 0.531, 0.955, 1.039 max_d=1.039 avg_d=0.531 std_dev=0.425
C4	B	0, 0.172, 0.614, 1.055, 1.023 max_d=1.023 avg_d=0.614 std_dev=0.442
C2'	A	0, -0.013, 0.431, 0.875, 1.042 max_d=1.042 avg_d=0.431 std_dev=0.444
C1'	B	0, 0.079, 0.573, 1.067, 1.205 max_d=1.205 avg_d=0.573 std_dev=0.494
N4	B	0, 0.200, 0.698, 1.197, 1.129 max_d=1.129 avg_d=0.698 std_dev=0.498
C4'	A	0, 0.109, 0.620, 1.130, 1.250 max_d=1.250 avg_d=0.620 std_dev=0.511
C3'	A	0, 0.096, 0.633, 1.170, 1.313 max_d=1.313 avg_d=0.633 std_dev=0.537
C5	B	0, 0.186, 0.736, 1.287, 1.323 max_d=1.323 avg_d=0.736 std_dev=0.550
C6	B	0, 0.142, 0.702, 1.261, 1.368 max_d=1.368 avg_d=0.702 std_dev=0.559
O5'	A	0, 0.174, 0.745, 1.316, 1.386 max_d=1.386 avg_d=0.745 std_dev=0.571
O2'	B	0, 0.218, 0.804, 1.389, 1.378 max_d=1.378 avg_d=0.804 std_dev=0.586
C2'	B	0, 0.197, 0.797, 1.397, 1.447 max_d=1.447 avg_d=0.797 std_dev=0.600
C5'	A	0, 0.198, 0.893, 1.587, 1.694 max_d=1.694 avg_d=0.893 std_dev=0.694
O2'	A	0, -0.024, 0.674, 1.372, 1.636 max_d=1.636 avg_d=0.674 std_dev=0.698
OP1	B	0, 0.000, 0.778, 1.556, 1.841 max_d=1.841 avg_d=0.778 std_dev=0.778
O4'	B	0, 0.112, 0.925, 1.737, 1.978 max_d=1.978 avg_d=0.925 std_dev=0.813
O3'	A	0, 0.084, 0.904, 1.723, 1.984 max_d=1.984 avg_d=0.904 std_dev=0.819
OP2	A	0, 0.337, 1.165, 1.993, 1.846 max_d=1.846 avg_d=1.165 std_dev=0.828
P	A	0, 0.235, 1.109, 1.984, 2.137 max_d=2.137 avg_d=1.109 std_dev=0.874
C3'	B	0, 0.218, 1.162, 2.107, 2.313 max_d=2.313 avg_d=1.162 std_dev=0.944
C4'	B	0, 0.153, 1.195, 2.236, 2.538 max_d=2.538 avg_d=1.195 std_dev=1.042
O3'	B	0, 0.325, 1.478, 2.632, 2.815 max_d=2.815 avg_d=1.478 std_dev=1.154
C5'	B	0, 0.193, 1.485, 2.777, 3.149 max_d=3.149 avg_d=1.485 std_dev=1.292
O5'	B	0, -0.160, 1.236, 2.633, 3.188 max_d=3.188 avg_d=1.236 std_dev=1.397
P	B	0, -0.157, 1.274, 2.704, 3.272 max_d=3.272 avg_d=1.274 std_dev=1.431
OP1	A	0, -0.025, 1.682, 3.389, 4.023 max_d=4.023 avg_d=1.682 std_dev=1.707
OP2	B	0, -0.167, 2.058, 4.283, 5.148 max_d=5.148 avg_d=2.058 std_dev=2.225

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.25	0.00	0.07	0.10	0.56	0.25
C2	0.01	0.00	0.29	0.21	0.01	0.09	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.10	0.16	0.22	0.10	0.30	0.93	0.37
C2'	0.01	0.29	0.00	0.00	0.14	0.05	0.07	0.11	0.14	0.17	0.24	0.27	0.09	0.08	0.02	0.00	0.01	0.02	0.34	0.21	0.78	0.40
C3'	0.01	0.21	0.00	0.00	0.22	0.01	0.29	0.01	0.31	0.25	0.28	0.17	0.33	0.31	0.19	0.01	0.01	0.01	0.06	0.15	0.14	0.07
C4	0.00	0.01	0.14	0.22	0.00	0.02	0.01	0.08	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.10	0.10	0.13	0.09	0.33	0.90	0.31
C4'	0.02	0.09	0.05	0.01	0.02	0.00	0.06	0.01	0.04	0.15	0.04	0.09	0.06	0.13	0.07	0.32	0.02	0.00	0.01	0.11	0.11	0.02
C5	0.01	0.01	0.07	0.29	0.01	0.06	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.22	0.10	0.07	0.14	0.49	1.02	0.30
C5'	0.02	0.16	0.11	0.01	0.08	0.01	0.07	0.00	0.09	0.13	0.12	0.15	0.08	0.11	0.05	0.20	0.19	0.01	0.01	0.22	0.37	0.05
C6	0.02	0.01	0.14	0.31	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.16	0.11	0.11	0.14	0.52	1.06	0.31
C8	0.01	0.01	0.17	0.25	0.01	0.15	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.38	0.13	0.09	0.19	0.51	0.92	0.20
N1	0.02	0.01	0.24	0.28	0.02	0.04	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.02	0.04	0.10	0.17	0.11	0.42	1.01	0.35
N3	0.01	0.01	0.27	0.17	0.00	0.09	0.00	0.15	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.11	0.20	0.21	0.09	0.24	0.85	0.35
N6	0.01	0.03	0.09	0.33	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.02	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.23	0.15	0.09	0.18	0.63	1.10	0.28
N7	0.01	0.01	0.08	0.31	0.00	0.13	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.36	0.18	0.03	0.21	0.61	1.05	0.23
N9	0.01	0.01	0.02	0.19	0.00	0.07	0.01	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.21	0.08	0.02	0.09	0.31	0.79	0.25
O2'	0.02	0.10	0.00	0.01	0.10	0.32	0.22	0.20	0.16	0.38	0.04	0.11	0.23	0.36	0.21	0.00	0.05	0.19	0.17	0.11	0.61	0.24
O3'	0.25	0.16	0.01	0.01	0.10	0.02	0.10	0.19	0.11	0.13	0.10	0.20	0.15	0.18	0.08	0.05	0.00	0.17	0.15	0.37	0.25	0.39
O4'	0.00	0.22	0.02	0.01	0.13	0.00	0.07	0.01	0.11	0.09	0.17	0.21	0.09	0.03	0.02	0.19	0.17	0.00	0.06	0.17	0.23	0.18
O5'	0.07	0.10	0.34	0.06	0.09	0.01	0.14	0.01	0.14	0.19	0.11	0.09	0.18	0.21	0.09	0.17	0.15	0.06	0.00	0.02	0.05	0.02
OP1	0.10	0.30	0.21	0.15	0.33	0.11	0.49	0.22	0.52	0.51	0.42	0.24	0.63	0.61	0.31	0.11	0.37	0.17	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.56	0.93	0.78	0.14	0.90	0.11	1.02	0.37	1.06	0.92	1.01	0.85	1.10	1.05	0.79	0.61	0.25	0.23	0.05	0.02	0.00	0.00
P	0.25	0.37	0.40	0.07	0.31	0.02	0.30	0.05	0.31	0.20	0.35	0.35	0.28	0.23	0.25	0.24	0.39	0.18	0.02	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.02	0.06	0.11	0.13	0.09	0.10	0.08	0.05	0.05	0.04	0.09	0.11	0.03	0.14	0.23	0.06	0.24	0.56	0.50	0.19
C2	0.03	0.06	0.10	0.11	0.06	0.10	0.07	0.05	0.06	0.06	0.06	0.06	0.06	0.18	0.23	0.04	0.29	0.54	0.37	0.14
C2'	0.26	0.31	0.26	0.26	0.29	0.31	0.27	0.27	0.26	0.28	0.31	0.31	0.33	0.28	0.36	0.26	0.45	0.30	0.28	0.04
C3'	0.19	0.09	0.28	0.33	0.05	0.36	0.06	0.31	0.10	0.12	0.05	0.07	0.12	0.35	0.48	0.21	0.46	0.30	0.25	0.05
C4	0.04	0.06	0.07	0.10	0.08	0.11	0.08	0.09	0.06	0.06	0.07	0.07	0.05	0.13	0.21	0.06	0.22	0.58	0.59	0.25
C4'	0.11	0.20	0.13	0.15	0.26	0.08	0.23	0.06	0.19	0.17	0.25	0.29	0.18	0.16	0.28	0.10	0.20	0.66	0.54	0.26
C5	0.07	0.07	0.03	0.06	0.08	0.13	0.08	0.14	0.08	0.08	0.07	0.07	0.06	0.08	0.18	0.06	0.15	0.63	0.80	0.36
C5'	0.18	0.27	0.17	0.17	0.31	0.07	0.29	0.08	0.25	0.23	0.31	0.34	0.25	0.17	0.28	0.16	0.12	0.78	0.71	0.38
C6	0.08	0.08	0.02	0.06	0.09	0.14	0.10	0.16	0.09	0.09	0.08	0.08	0.07	0.06	0.19	0.06	0.15	0.64	0.82	0.38
C8	0.06	0.07	0.06	0.08	0.09	0.12	0.09	0.13	0.08	0.07	0.08	0.09	0.05	0.08	0.18	0.07	0.14	0.63	0.84	0.38
N1	0.06	0.09	0.03	0.08	0.09	0.12	0.09	0.10	0.09	0.08	0.08	0.08	0.08	0.14	0.22	0.05	0.22	0.60	0.58	0.26
N3	0.03	0.06	0.11	0.12	0.07	0.10	0.07	0.05	0.05	0.05	0.07	0.07	0.04	0.17	0.23	0.05	0.28	0.53	0.38	0.14
N6	0.10	0.10	0.08	0.07	0.10	0.15	0.12	0.22	0.12	0.11	0.09	0.10	0.07	0.04	0.19	0.06	0.06	0.69	1.06	0.52
N7	0.07	0.07	0.04	0.05	0.08	0.13	0.09	0.17	0.08	0.08	0.07	0.07	0.06	0.05	0.16	0.07	0.11	0.66	0.96	0.44
N9	0.05	0.07	0.08	0.10	0.09	0.10	0.09	0.08	0.07	0.06	0.09	0.10	0.05	0.12	0.21	0.06	0.20	0.59	0.64	0.27
O2'	0.05	0.17	0.15	0.23	0.18	0.07	0.12	0.11	0.08	0.10	0.21	0.23	0.20	0.21	0.37	0.06	0.17	0.53	0.50	0.23
O3'	0.20	0.33	0.24	0.29	0.44	0.20	0.41	0.22	0.33	0.29	0.42	0.49	0.29	0.27	0.41	0.17	0.15	0.56	0.43	0.22
O4'	0.22	0.31	0.22	0.20	0.35	0.08	0.32	0.12	0.28	0.27	0.35	0.37	0.30	0.18	0.22	0.20	0.11	0.79	0.68	0.38
O5'	0.04	0.13	0.15	0.21	0.18	0.22	0.15	0.22	0.10	0.09	0.18	0.21	0.11	0.21	0.37	0.03	0.24	0.62	0.69	0.29
OP1	0.33	0.20	0.50	0.63	0.15	0.64	0.20	0.69	0.25	0.26	0.14	0.12	0.20	0.57	0.87	0.37	0.61	0.51	0.56	0.30
OP2	1.03	0.94	1.03	1.00	0.90	0.93	0.96	0.89	0.99	0.99	0.90	0.86	0.93	1.04	0.93	1.04	0.95	1.79	2.03	1.52
P	0.40	0.42	0.31	0.23	0.43	0.19	0.44	0.16	0.42	0.42	0.43	0.43	0.41	0.29	0.18	0.40	0.20	1.04	1.20	0.74

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01	0.04	0.04	0.03	0.03	0.05	0.01	0.40	0.41	0.12	0.09
C2	0.03	0.00	0.11	0.07	0.00	0.03	0.02	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.12	0.01	0.54	0.23	0.64	0.41
C2'	0.00	0.11	0.00	0.01	0.07	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.11	0.08	0.15	0.01	0.05	0.01	0.24	0.34	0.31	0.14
C3'	0.02	0.07	0.01	0.00	0.02	0.01	0.09	0.03	0.10	0.01	0.07	0.02	0.12	0.05	0.02	0.02	0.15	0.18	0.34	0.16
C4	0.03	0.00	0.07	0.02	0.00	0.06	0.01	0.30	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.09	0.02	0.01	0.64	0.26	1.26	0.77
C4'	0.02	0.03	0.02	0.01	0.06	0.00	0.13	0.00	0.13	0.04	0.01	0.06	0.08	0.11	0.05	0.00	0.03	0.36	0.46	0.25
C5	0.01	0.02	0.01	0.09	0.01	0.13	0.00	0.37	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.09	0.01	0.64	0.30	1.34	0.81
C5'	0.07	0.16	0.01	0.03	0.30	0.00	0.37	0.00	0.34	0.21	0.21	0.32	0.09	0.12	0.13	0.07	0.00	0.10	0.07	0.04
C6	0.01	0.01	0.03	0.10	0.02	0.13	0.00	0.34	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.03	0.10	0.01	0.61	0.21	1.00	0.64
N1	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.21	0.00	0.00	0.03	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.53	0.24	0.60	0.39
N3	0.04	0.01	0.11	0.07	0.00	0.01	0.01	0.21	0.02	0.03	0.00	0.00	0.01	0.13	0.11	0.02	0.60	0.19	0.96	0.60
N4	0.04	0.01	0.08	0.02	0.00	0.06	0.01	0.32	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.10	0.03	0.01	0.65	0.33	1.46	0.87
O2	0.03	0.01	0.15	0.12	0.01	0.08	0.02	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.18	0.19	0.01	0.48	0.33	0.37	0.25
O2'	0.03	0.13	0.01	0.05	0.09	0.11	0.02	0.12	0.03	0.05	0.13	0.10	0.18	0.00	0.10	0.04	0.14	0.51	0.69	0.32
O3'	0.05	0.12	0.05	0.02	0.02	0.05	0.09	0.13	0.10	0.01	0.11	0.03	0.19	0.10	0.00	0.04	0.15	0.23	0.79	0.36
O4'	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.04	0.04	0.00	0.39	0.44	0.05	0.08
O5'	0.40	0.54	0.24	0.15	0.64	0.03	0.64	0.00	0.61	0.53	0.60	0.65	0.48	0.14	0.15	0.39	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.41	0.23	0.34	0.18	0.26	0.36	0.30	0.10	0.21	0.24	0.19	0.33	0.33	0.51	0.23	0.44	0.02	0.00	0.02	0.00
OP2	0.12	0.64	0.31	0.34	1.26	0.46	1.34	0.07	1.00	0.60	0.96	1.46	0.37	0.69	0.79	0.05	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.09	0.41	0.14	0.16	0.77	0.25	0.81	0.04	0.64	0.39	0.60	0.87	0.25	0.32	0.36	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00