Doublet Group distance statistics: 53161

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.005, 0.009, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.005 std_dev=0.005
N7	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.000, 0.016, 0.033, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C8	A	0, 0.000, 0.018, 0.035, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.018 std_dev=0.018
C6	A	0, 0.000, 0.022, 0.045, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.022 std_dev=0.022
N1	A	0, 0.000, 0.023, 0.047, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.023 std_dev=0.023
N3	A	0, 0.000, 0.026, 0.052, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.026 std_dev=0.026
C2	A	0, 0.000, 0.027, 0.054, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.027 std_dev=0.027
N9	A	0, 0.000, 0.030, 0.059, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.030 std_dev=0.030
N6	A	0, 0.000, 0.040, 0.079, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.040 std_dev=0.040
C1'	A	0, 0.000, 0.045, 0.091, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.045 std_dev=0.045
O4'	A	0, 0.000, 0.072, 0.144, 0.144 max_d=0.144 avg_d=0.072 std_dev=0.072
C2'	A	0, 0.000, 0.087, 0.173, 0.173 max_d=0.173 avg_d=0.087 std_dev=0.087
C4'	A	0, 0.000, 0.295, 0.590, 0.590 max_d=0.590 avg_d=0.295 std_dev=0.295
C3'	A	0, 0.000, 0.330, 0.660, 0.660 max_d=0.660 avg_d=0.330 std_dev=0.330
O5'	A	0, 0.000, 0.331, 0.661, 0.661 max_d=0.661 avg_d=0.331 std_dev=0.331
N3	B	0, 0.000, 0.378, 0.756, 0.756 max_d=0.756 avg_d=0.378 std_dev=0.378
C2	B	0, 0.000, 0.380, 0.760, 0.760 max_d=0.760 avg_d=0.380 std_dev=0.380
C2'	B	0, 0.000, 0.385, 0.771, 0.771 max_d=0.771 avg_d=0.385 std_dev=0.385
O2'	A	0, 0.000, 0.390, 0.781, 0.781 max_d=0.781 avg_d=0.390 std_dev=0.390
O2	B	0, 0.000, 0.402, 0.804, 0.804 max_d=0.804 avg_d=0.402 std_dev=0.402
N1	B	0, 0.000, 0.406, 0.813, 0.813 max_d=0.813 avg_d=0.406 std_dev=0.406
OP2	B	0, 0.000, 0.412, 0.824, 0.824 max_d=0.824 avg_d=0.412 std_dev=0.412
C1'	B	0, 0.000, 0.418, 0.835, 0.835 max_d=0.835 avg_d=0.418 std_dev=0.418
C4	B	0, 0.000, 0.423, 0.847, 0.847 max_d=0.847 avg_d=0.423 std_dev=0.423
C5	B	0, 0.000, 0.440, 0.881, 0.881 max_d=0.881 avg_d=0.440 std_dev=0.440
C6	B	0, 0.000, 0.443, 0.885, 0.885 max_d=0.885 avg_d=0.443 std_dev=0.443
N4	B	0, 0.000, 0.465, 0.929, 0.929 max_d=0.929 avg_d=0.465 std_dev=0.465
C5'	A	0, 0.000, 0.499, 0.998, 0.998 max_d=0.998 avg_d=0.499 std_dev=0.499
O3'	B	0, 0.000, 0.503, 1.005, 1.005 max_d=1.005 avg_d=0.503 std_dev=0.503
O4'	B	0, 0.000, 0.521, 1.042, 1.042 max_d=1.042 avg_d=0.521 std_dev=0.521
O2'	B	0, 0.000, 0.549, 1.098, 1.098 max_d=1.098 avg_d=0.549 std_dev=0.549
C3'	B	0, 0.000, 0.550, 1.100, 1.100 max_d=1.100 avg_d=0.550 std_dev=0.550
C4'	B	0, 0.000, 0.565, 1.129, 1.129 max_d=1.129 avg_d=0.565 std_dev=0.565
P	B	0, 0.000, 0.625, 1.249, 1.249 max_d=1.249 avg_d=0.625 std_dev=0.625
OP1	B	0, 0.000, 0.669, 1.339, 1.339 max_d=1.339 avg_d=0.669 std_dev=0.669
P	A	0, 0.000, 0.681, 1.361, 1.361 max_d=1.361 avg_d=0.681 std_dev=0.681
O5'	B	0, 0.000, 0.798, 1.595, 1.595 max_d=1.595 avg_d=0.798 std_dev=0.798
OP2	A	0, 0.000, 0.820, 1.641, 1.641 max_d=1.641 avg_d=0.820 std_dev=0.820
OP1	A	0, 0.000, 0.889, 1.779, 1.779 max_d=1.779 avg_d=0.889 std_dev=0.889
C5'	B	0, 0.000, 0.901, 1.803, 1.803 max_d=1.803 avg_d=0.901 std_dev=0.901
O3'	A	0, 0.000, 0.990, 1.980, 1.980 max_d=1.980 avg_d=0.990 std_dev=0.990

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.04	0.04	0.00	0.05	0.05	0.05	0.01	0.00	0.01	0.30	0.00	0.00	0.04	0.07	0.01
C2	0.05	0.00	0.07	0.14	0.01	0.08	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.14	0.57	0.02	0.01	0.00	0.18	0.06
C2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.05	0.03	0.05	0.01	0.07	0.03	0.07	0.06	0.08	0.04	0.02	0.00	0.12	0.03	0.04	0.04	0.14	0.06
C3'	0.02	0.14	0.01	0.00	0.06	0.00	0.03	0.02	0.07	0.06	0.11	0.13	0.06	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00	0.15	0.12	0.20	0.15
C4	0.03	0.01	0.05	0.06	0.00	0.02	0.01	0.10	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.13	0.42	0.01	0.03	0.03	0.15	0.06
C4'	0.02	0.08	0.03	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.09	0.04	0.08	0.00	0.08	0.02	0.01	0.06	0.00	0.00	0.05	0.02	0.02
C5	0.03	0.01	0.05	0.03	0.01	0.02	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.17	0.36	0.00	0.06	0.09	0.19	0.11
C5'	0.04	0.04	0.01	0.02	0.10	0.00	0.16	0.00	0.15	0.22	0.09	0.02	0.17	0.24	0.12	0.00	0.07	0.01	0.00	0.06	0.00	0.00
C6	0.04	0.01	0.07	0.07	0.02	0.01	0.01	0.15	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.20	0.43	0.01	0.06	0.09	0.21	0.12
C8	0.00	0.01	0.03	0.06	0.01	0.09	0.01	0.22	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.12	0.17	0.00	0.07	0.09	0.11	0.10
N1	0.05	0.00	0.07	0.11	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.18	0.52	0.01	0.04	0.05	0.21	0.10
N3	0.05	0.00	0.06	0.13	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.11	0.55	0.02	0.00	0.03	0.15	0.03
N6	0.05	0.01	0.08	0.06	0.03	0.00	0.03	0.17	0.01	0.04	0.00	0.02	0.00	0.04	0.04	0.22	0.40	0.02	0.06	0.12	0.20	0.13
N7	0.01	0.01	0.04	0.04	0.01	0.08	0.00	0.24	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.16	0.22	0.01	0.09	0.14	0.17	0.14
N9	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.12	0.03	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.00	0.08	0.29	0.00	0.03	0.02	0.11	0.04
O2'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.13	0.01	0.17	0.00	0.20	0.12	0.18	0.11	0.22	0.16	0.08	0.00	0.11	0.03	0.05	0.06	0.13	0.07
O3'	0.30	0.57	0.12	0.01	0.42	0.06	0.36	0.07	0.43	0.17	0.52	0.55	0.40	0.22	0.29	0.11	0.00	0.19	0.25	0.32	0.36	0.28
O4'	0.00	0.02	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.19	0.00	0.14	0.20	0.12	0.17
O5'	0.00	0.01	0.04	0.15	0.03	0.00	0.06	0.00	0.06	0.07	0.04	0.00	0.06	0.09	0.03	0.05	0.25	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.04	0.00	0.04	0.12	0.03	0.05	0.09	0.06	0.09	0.09	0.05	0.03	0.12	0.14	0.02	0.06	0.32	0.20	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.07	0.18	0.14	0.20	0.15	0.02	0.19	0.00	0.21	0.11	0.21	0.15	0.20	0.17	0.11	0.13	0.36	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01
P	0.01	0.06	0.06	0.15	0.06	0.02	0.11	0.00	0.12	0.10	0.10	0.03	0.13	0.14	0.04	0.07	0.28	0.17	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.04	0.11	0.06	0.13	0.10	0.02	0.10	0.15	0.10	0.10	0.11	0.09	0.11	0.23	0.05	0.00	0.04	0.17	0.06	0.02
C2	0.08	0.09	0.15	0.21	0.06	0.06	0.09	0.22	0.11	0.11	0.06	0.03	0.08	0.34	0.15	0.05	0.09	0.23	0.01	0.07
C2'	0.02	0.10	0.02	0.06	0.12	0.04	0.11	0.17	0.10	0.09	0.12	0.12	0.10	0.19	0.01	0.01	0.02	0.13	0.07	0.00
C3'	0.05	0.00	0.02	0.02	0.01	0.09	0.01	0.10	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.17	0.03	0.08	0.04	0.08	0.16	0.08
C4	0.03	0.09	0.08	0.16	0.08	0.02	0.09	0.14	0.09	0.08	0.09	0.07	0.08	0.24	0.09	0.01	0.02	0.18	0.05	0.02
C4'	0.02	0.05	0.05	0.13	0.03	0.04	0.04	0.12	0.05	0.05	0.04	0.01	0.07	0.23	0.07	0.02	0.02	0.16	0.10	0.01
C5	0.03	0.03	0.03	0.14	0.03	0.09	0.04	0.06	0.03	0.02	0.04	0.03	0.00	0.15	0.08	0.08	0.05	0.14	0.08	0.03
C5'	0.12	0.15	0.17	0.27	0.12	0.08	0.14	0.24	0.15	0.15	0.13	0.10	0.15	0.34	0.21	0.09	0.12	0.28	0.02	0.11
C6	0.06	0.02	0.02	0.15	0.01	0.09	0.01	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.14	0.10	0.10	0.07	0.14	0.08	0.04
C8	0.01	0.06	0.02	0.12	0.07	0.09	0.07	0.06	0.06	0.05	0.08	0.08	0.05	0.15	0.05	0.07	0.05	0.13	0.08	0.03
N1	0.01	0.00	0.09	0.19	0.00	0.02	0.02	0.13	0.03	0.02	0.01	0.01	0.05	0.27	0.14	0.04	0.00	0.19	0.06	0.01
N3	0.09	0.13	0.14	0.19	0.11	0.05	0.12	0.22	0.13	0.14	0.11	0.08	0.14	0.32	0.13	0.06	0.10	0.23	0.01	0.07
N6	0.12	0.07	0.04	0.13	0.04	0.16	0.03	0.04	0.05	0.07	0.05	0.04	0.12	0.01	0.09	0.16	0.15	0.10	0.11	0.09
N7	0.06	0.02	0.01	0.11	0.03	0.13	0.03	0.01	0.02	0.01	0.04	0.04	0.01	0.09	0.04	0.11	0.10	0.10	0.10	0.07
N9	0.03	0.10	0.06	0.14	0.10	0.04	0.10	0.12	0.09	0.09	0.11	0.09	0.09	0.21	0.07	0.02	0.01	0.16	0.05	0.01
O2'	0.06	0.05	0.09	0.09	0.08	0.12	0.06	0.12	0.04	0.02	0.08	0.09	0.04	0.09	0.17	0.07	0.04	0.04	0.15	0.08
O3'	0.49	0.43	0.43	0.40	0.42	0.51	0.43	0.31	0.44	0.44	0.42	0.42	0.41	0.23	0.42	0.52	0.46	0.36	0.60	0.51
O4'	0.07	0.13	0.10	0.18	0.11	0.00	0.11	0.14	0.12	0.12	0.12	0.10	0.14	0.25	0.10	0.03	0.06	0.21	0.03	0.05
O5'	0.07	0.17	0.11	0.19	0.19	0.01	0.18	0.19	0.16	0.15	0.19	0.20	0.15	0.25	0.13	0.03	0.07	0.22	0.02	0.07
OP1	0.07	0.16	0.14	0.24	0.20	0.01	0.19	0.19	0.16	0.14	0.19	0.22	0.15	0.25	0.20	0.01	0.07	0.24	0.05	0.07
OP2	0.23	0.37	0.28	0.36	0.44	0.15	0.42	0.37	0.37	0.34	0.42	0.47	0.33	0.36	0.30	0.17	0.22	0.39	0.25	0.25
P	0.11	0.22	0.17	0.27	0.26	0.04	0.25	0.23	0.22	0.20	0.25	0.28	0.19	0.28	0.22	0.05	0.10	0.27	0.09	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.03	0.01	0.01	0.11	0.01	0.00	0.03	0.03	0.07	0.01	0.05	0.00	0.00	0.12	0.10	0.02
C2	0.03	0.00	0.02	0.14	0.02	0.01	0.01	0.22	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.12	0.12	0.02	0.01	0.03	0.18	0.08
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.03	0.01	0.14	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.00	0.06	0.02	0.07	0.11	0.10	0.05
C3'	0.02	0.14	0.00	0.00	0.19	0.00	0.18	0.01	0.16	0.13	0.16	0.20	0.12	0.01	0.00	0.01	0.25	0.03	0.24	0.17
C4	0.03	0.02	0.00	0.19	0.00	0.05	0.00	0.33	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.10	0.12	0.00	0.07	0.00	0.18	0.07
C4'	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.07	0.02	0.02	0.06	0.08	0.23	0.04	0.00	0.01	0.22	0.07	0.08
C5	0.01	0.01	0.01	0.18	0.00	0.08	0.00	0.34	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.10	0.03	0.10	0.00	0.18	0.07
C5'	0.11	0.22	0.14	0.01	0.33	0.00	0.34	0.00	0.28	0.21	0.29	0.36	0.14	0.10	0.01	0.00	0.00	0.01	0.16	0.00
C6	0.01	0.00	0.02	0.16	0.00	0.07	0.00	0.28	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.10	0.03	0.06	0.02	0.17	0.07
N1	0.00	0.01	0.01	0.13	0.02	0.02	0.01	0.21	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.07	0.10	0.00	0.02	0.05	0.16	0.07
N3	0.03	0.00	0.01	0.16	0.01	0.02	0.00	0.29	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.13	0.12	0.01	0.04	0.02	0.18	0.07
N4	0.03	0.02	0.01	0.20	0.00	0.06	0.00	0.36	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.10	0.13	0.01	0.09	0.02	0.17	0.06
O2	0.07	0.00	0.07	0.12	0.01	0.08	0.01	0.14	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.11	0.15	0.06	0.04	0.03	0.19	0.09
O2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.10	0.23	0.06	0.10	0.04	0.07	0.13	0.10	0.11	0.00	0.13	0.13	0.18	0.02	0.17	0.15
O3'	0.05	0.12	0.06	0.00	0.12	0.04	0.10	0.01	0.10	0.10	0.12	0.13	0.15	0.13	0.00	0.04	0.23	0.08	0.13	0.11
O4'	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.06	0.13	0.04	0.00	0.04	0.16	0.03	0.03
O5'	0.00	0.01	0.07	0.25	0.07	0.01	0.10	0.00	0.06	0.02	0.04	0.09	0.04	0.18	0.23	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00
OP1	0.12	0.03	0.11	0.03	0.00	0.22	0.00	0.01	0.02	0.05	0.02	0.02	0.03	0.02	0.08	0.16	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.18	0.10	0.24	0.18	0.07	0.18	0.16	0.17	0.16	0.18	0.17	0.19	0.17	0.13	0.03	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.02	0.08	0.05	0.17	0.07	0.08	0.07	0.00	0.07	0.07	0.07	0.06	0.09	0.15	0.11	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00