Doublet Group distance statistics: 53169

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 9, 12, 10, 2, 1, 3, 0, 1, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.005, 0.009, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.005 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.001, 0.006, 0.011, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.006 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.001, 0.009, 0.017, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.009 std_dev=0.008
N1	A	0, -0.002, 0.008, 0.017, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.008 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.000, 0.010, 0.019, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.010 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.001, 0.011, 0.021, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.011 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.000, 0.011, 0.021, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.011 std_dev=0.010
O2	A	0, 0.005, 0.025, 0.045, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.025 std_dev=0.020
N4	A	0, 0.000, 0.030, 0.060, 0.113 max_d=0.113 avg_d=0.030 std_dev=0.030
O4'	A	0, 0.017, 0.079, 0.141, 0.283 max_d=0.283 avg_d=0.079 std_dev=0.062
C2'	A	0, 0.015, 0.085, 0.155, 0.363 max_d=0.363 avg_d=0.085 std_dev=0.070
O2'	A	0, 0.048, 0.132, 0.217, 0.426 max_d=0.426 avg_d=0.132 std_dev=0.084
C4'	A	0, 0.030, 0.125, 0.220, 0.471 max_d=0.471 avg_d=0.125 std_dev=0.095
C3'	A	0, 0.054, 0.150, 0.247, 0.511 max_d=0.511 avg_d=0.150 std_dev=0.097
O3'	A	0, 0.115, 0.247, 0.378, 0.750 max_d=0.750 avg_d=0.247 std_dev=0.131
O2	B	0, 0.208, 0.344, 0.480, 0.671 max_d=0.671 avg_d=0.344 std_dev=0.136
C5'	A	0, 0.070, 0.231, 0.393, 0.802 max_d=0.802 avg_d=0.231 std_dev=0.161
C2	B	0, 0.200, 0.362, 0.524, 0.732 max_d=0.732 avg_d=0.362 std_dev=0.162
O5'	A	0, 0.101, 0.264, 0.427, 1.009 max_d=1.009 avg_d=0.264 std_dev=0.163
C3'	B	0, 0.183, 0.368, 0.552, 0.782 max_d=0.782 avg_d=0.368 std_dev=0.184
C1'	B	0, 0.165, 0.360, 0.555, 0.890 max_d=0.890 avg_d=0.360 std_dev=0.195
N1	B	0, 0.179, 0.379, 0.579, 0.887 max_d=0.887 avg_d=0.379 std_dev=0.200
P	A	0, 0.157, 0.360, 0.562, 1.294 max_d=1.294 avg_d=0.360 std_dev=0.203
O3'	B	0, 0.155, 0.365, 0.576, 1.022 max_d=1.022 avg_d=0.365 std_dev=0.211
N3	B	0, 0.203, 0.418, 0.632, 1.049 max_d=1.049 avg_d=0.418 std_dev=0.215
C4'	B	0, 0.190, 0.408, 0.627, 1.216 max_d=1.216 avg_d=0.408 std_dev=0.218
O4'	B	0, 0.160, 0.391, 0.621, 1.208 max_d=1.208 avg_d=0.391 std_dev=0.231
C5'	B	0, 0.236, 0.506, 0.776, 1.596 max_d=1.596 avg_d=0.506 std_dev=0.270
C2'	B	0, 0.127, 0.398, 0.669, 1.788 max_d=1.788 avg_d=0.398 std_dev=0.271
C6	B	0, 0.172, 0.457, 0.743, 1.317 max_d=1.317 avg_d=0.457 std_dev=0.286
O5'	B	0, 0.262, 0.559, 0.856, 1.513 max_d=1.513 avg_d=0.559 std_dev=0.297
OP1	A	0, 0.193, 0.494, 0.795, 1.851 max_d=1.851 avg_d=0.494 std_dev=0.301
C4	B	0, 0.189, 0.497, 0.805, 1.432 max_d=1.432 avg_d=0.497 std_dev=0.308
P	B	0, 0.286, 0.623, 0.960, 2.065 max_d=2.065 avg_d=0.623 std_dev=0.337
C5	B	0, 0.176, 0.517, 0.859, 1.467 max_d=1.467 avg_d=0.517 std_dev=0.341
OP2	A	0, 0.154, 0.534, 0.914, 2.627 max_d=2.627 avg_d=0.534 std_dev=0.380
O4	B	0, 0.196, 0.584, 0.972, 1.780 max_d=1.780 avg_d=0.584 std_dev=0.388
OP1	B	0, 0.264, 0.709, 1.154, 2.422 max_d=2.422 avg_d=0.709 std_dev=0.445
OP2	B	0, 0.249, 0.703, 1.158, 2.558 max_d=2.558 avg_d=0.703 std_dev=0.454
O2'	B	0, -0.029, 0.453, 0.935, 3.425 max_d=3.425 avg_d=0.453 std_dev=0.482

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.06	0.19	0.09	0.08
C2	0.02	0.00	0.04	0.05	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.06	0.02	0.11	0.24	0.17	0.11
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.04	0.04	0.08	0.00	0.01	0.01	0.02	0.11	0.11	0.03
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.03	0.05	0.05	0.08	0.02	0.01	0.01	0.05	0.07	0.12	0.05
C4	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.06	0.02	0.15	0.26	0.24	0.14
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.03	0.02	0.03	0.04	0.03	0.04	0.02	0.00	0.01	0.08	0.08	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.06	0.03	0.15	0.25	0.23	0.14
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.06	0.00	0.07	0.00	0.06	0.03	0.05	0.07	0.04	0.04	0.03	0.01	0.01	0.08	0.11	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.05	0.03	0.13	0.24	0.17	0.12
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.10	0.23	0.14	0.10
N3	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.07	0.02	0.13	0.25	0.21	0.13
N4	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.07	0.02	0.16	0.26	0.28	0.16
O2	0.03	0.00	0.08	0.08	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.07	0.09	0.04	0.09	0.23	0.14	0.10
O2'	0.01	0.04	0.00	0.02	0.04	0.04	0.04	0.04	0.03	0.02	0.04	0.05	0.07	0.00	0.03	0.03	0.04	0.12	0.09	0.05
O3'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.06	0.02	0.06	0.03	0.05	0.03	0.07	0.07	0.09	0.03	0.00	0.01	0.10	0.12	0.16	0.09
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.04	0.03	0.01	0.00	0.08	0.19	0.10	0.09
O5'	0.06	0.11	0.02	0.05	0.15	0.01	0.15	0.01	0.13	0.10	0.13	0.16	0.09	0.04	0.10	0.08	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.19	0.24	0.11	0.07	0.26	0.08	0.25	0.08	0.24	0.23	0.25	0.26	0.23	0.12	0.12	0.19	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.17	0.11	0.12	0.24	0.08	0.23	0.11	0.17	0.14	0.21	0.28	0.14	0.09	0.16	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.11	0.03	0.05	0.14	0.03	0.14	0.01	0.12	0.10	0.13	0.16	0.10	0.05	0.09	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.12	0.23	0.10	0.14	0.20	0.14	0.23	0.14	0.13	0.13	0.11	0.33	0.10	0.15	0.21	0.18	0.23	0.18	0.20
C2	0.13	0.10	0.21	0.11	0.11	0.21	0.12	0.22	0.12	0.12	0.11	0.09	0.26	0.16	0.12	0.23	0.16	0.21	0.19	0.18
C2'	0.12	0.13	0.22	0.10	0.15	0.17	0.15	0.19	0.14	0.13	0.15	0.13	0.28	0.07	0.16	0.18	0.15	0.18	0.17	0.17
C3'	0.11	0.14	0.20	0.10	0.15	0.16	0.14	0.17	0.13	0.12	0.15	0.14	0.25	0.09	0.16	0.16	0.15	0.16	0.17	0.16
C4	0.14	0.09	0.19	0.14	0.09	0.20	0.09	0.20	0.10	0.11	0.09	0.08	0.21	0.21	0.10	0.22	0.15	0.20	0.21	0.15
C4'	0.11	0.12	0.20	0.07	0.14	0.16	0.13	0.18	0.13	0.12	0.13	0.13	0.31	0.06	0.14	0.16	0.14	0.20	0.17	0.16
C5	0.12	0.10	0.20	0.13	0.11	0.20	0.10	0.19	0.10	0.10	0.11	0.09	0.23	0.21	0.13	0.22	0.14	0.19	0.19	0.15
C5'	0.10	0.12	0.17	0.06	0.12	0.13	0.12	0.15	0.12	0.11	0.12	0.13	0.30	0.06	0.13	0.14	0.11	0.21	0.16	0.14
C6	0.12	0.12	0.22	0.11	0.13	0.20	0.13	0.21	0.12	0.11	0.13	0.11	0.29	0.16	0.14	0.21	0.15	0.20	0.18	0.18
N1	0.13	0.11	0.22	0.11	0.13	0.21	0.13	0.22	0.13	0.12	0.12	0.10	0.30	0.14	0.14	0.22	0.17	0.22	0.19	0.19
N3	0.13	0.09	0.20	0.13	0.10	0.20	0.10	0.20	0.11	0.11	0.09	0.09	0.23	0.19	0.11	0.22	0.15	0.20	0.20	0.16
N4	0.16	0.10	0.18	0.16	0.09	0.20	0.09	0.20	0.11	0.12	0.09	0.12	0.19	0.24	0.09	0.23	0.15	0.22	0.24	0.15
O2	0.13	0.10	0.21	0.11	0.12	0.21	0.13	0.23	0.13	0.12	0.11	0.09	0.27	0.15	0.12	0.23	0.17	0.22	0.19	0.19
O2'	0.12	0.13	0.21	0.09	0.15	0.19	0.14	0.21	0.14	0.12	0.15	0.12	0.28	0.07	0.16	0.19	0.16	0.21	0.17	0.18
O3'	0.12	0.14	0.18	0.11	0.15	0.16	0.14	0.18	0.13	0.12	0.15	0.15	0.21	0.13	0.16	0.16	0.16	0.15	0.19	0.16
O4'	0.12	0.13	0.23	0.10	0.15	0.19	0.15	0.22	0.15	0.13	0.14	0.12	0.37	0.11	0.15	0.20	0.18	0.25	0.19	0.21
O5'	0.05	0.11	0.18	0.05	0.10	0.09	0.08	0.12	0.07	0.08	0.12	0.14	0.28	0.01	0.11	0.06	0.10	0.15	0.13	0.10
OP1	0.24	0.25	0.22	0.06	0.26	0.25	0.26	0.23	0.25	0.25	0.26	0.25	0.38	0.02	0.26	0.29	0.17	0.23	0.22	0.18
OP2	0.13	0.22	0.19	0.12	0.18	0.12	0.13	0.17	0.11	0.16	0.22	0.27	0.30	0.03	0.19	0.06	0.11	0.30	0.11	0.13
P	0.04	0.07	0.10	0.02	0.06	0.13	0.06	0.14	0.06	0.05	0.07	0.10	0.22	0.01	0.07	0.10	0.09	0.19	0.14	0.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.12	0.01	0.00	0.06	0.13	0.15	0.05
C2	0.02	0.00	0.07	0.07	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.08	0.01	0.05	0.04	0.26	0.23	0.06
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.01	0.07	0.07	0.08	0.01	0.05	0.13	0.00	0.02	0.03	0.01	0.14	0.13	0.27	0.16
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.08	0.00	0.07	0.01	0.06	0.05	0.08	0.08	0.01	0.01	0.09	0.00	0.06	0.10	0.11	0.06
C4	0.01	0.01	0.03	0.08	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.03	0.00	0.02	0.06	0.38	0.27	0.10
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.02	0.03	0.05	0.07	0.02	0.03	0.00	0.01	0.05	0.09	0.03
C5	0.01	0.01	0.07	0.07	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.03	0.01	0.05	0.07	0.38	0.26	0.10
C5'	0.03	0.03	0.07	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.02	0.03	0.05	0.03	0.08	0.03	0.01	0.01	0.09	0.14	0.01
C6	0.01	0.01	0.08	0.06	0.01	0.04	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.13	0.03	0.01	0.06	0.07	0.31	0.23	0.08
N1	0.00	0.01	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.06	0.01	0.01	0.04	0.24	0.20	0.06
N3	0.01	0.00	0.05	0.08	0.00	0.03	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.10	0.06	0.01	0.03	0.04	0.32	0.26	0.08
O2	0.03	0.00	0.13	0.08	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.16	0.11	0.02	0.08	0.04	0.22	0.21	0.06
O2'	0.02	0.10	0.00	0.01	0.12	0.07	0.14	0.03	0.13	0.07	0.10	0.16	0.00	0.03	0.13	0.05	0.12	0.14	0.28	0.16
O3'	0.12	0.08	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.08	0.03	0.06	0.06	0.11	0.03	0.00	0.04	0.09	0.10	0.10	0.15	0.09
O4	0.01	0.01	0.03	0.09	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.04	0.00	0.03	0.07	0.41	0.29	0.11
O4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.03	0.08	0.05	0.09	0.03	0.00	0.04	0.16	0.08	0.06
O5'	0.06	0.04	0.14	0.06	0.06	0.01	0.07	0.01	0.07	0.04	0.04	0.04	0.12	0.10	0.07	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.13	0.26	0.13	0.10	0.38	0.05	0.38	0.09	0.31	0.24	0.32	0.22	0.14	0.10	0.41	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.23	0.27	0.11	0.27	0.09	0.26	0.14	0.23	0.20	0.26	0.21	0.28	0.15	0.29	0.08	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.06	0.16	0.06	0.10	0.03	0.10	0.01	0.08	0.06	0.08	0.06	0.16	0.09	0.11	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00