Doublet Group distance statistics: 53174

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.006, 0.011, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.006 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.000, 0.006, 0.012, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.001, 0.007, 0.013, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.001, 0.011, 0.020, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.001, 0.011, 0.020, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.011 std_dev=0.010
N1	A	0, -0.001, 0.009, 0.019, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.009 std_dev=0.010
O2	A	0, 0.004, 0.017, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.017 std_dev=0.012
N4	A	0, -0.004, 0.021, 0.047, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.021 std_dev=0.025
C2'	A	0, -0.015, 0.121, 0.257, 0.311 max_d=0.311 avg_d=0.121 std_dev=0.136
C1'	B	0, 0.040, 0.177, 0.314, 0.333 max_d=0.333 avg_d=0.177 std_dev=0.137
O2'	B	0, 0.037, 0.177, 0.316, 0.341 max_d=0.341 avg_d=0.177 std_dev=0.139
N9	B	0, -0.020, 0.133, 0.286, 0.348 max_d=0.348 avg_d=0.133 std_dev=0.153
O2'	A	0, -0.031, 0.124, 0.279, 0.343 max_d=0.343 avg_d=0.124 std_dev=0.155
N7	B	0, 0.049, 0.209, 0.369, 0.388 max_d=0.388 avg_d=0.209 std_dev=0.160
C8	B	0, 0.056, 0.218, 0.381, 0.391 max_d=0.391 avg_d=0.218 std_dev=0.163
C4	B	0, 0.069, 0.244, 0.419, 0.405 max_d=0.405 avg_d=0.244 std_dev=0.175
C2'	B	0, 0.056, 0.232, 0.409, 0.429 max_d=0.429 avg_d=0.232 std_dev=0.177
O4'	A	0, -0.028, 0.155, 0.339, 0.413 max_d=0.413 avg_d=0.155 std_dev=0.184
C5	B	0, 0.072, 0.258, 0.443, 0.429 max_d=0.429 avg_d=0.258 std_dev=0.185
O4'	B	0, 0.076, 0.268, 0.460, 0.442 max_d=0.442 avg_d=0.268 std_dev=0.192
C4'	B	0, 0.066, 0.314, 0.563, 0.608 max_d=0.608 avg_d=0.314 std_dev=0.249
C3'	B	0, 0.071, 0.332, 0.593, 0.637 max_d=0.637 avg_d=0.332 std_dev=0.261
C3'	A	0, -0.019, 0.247, 0.513, 0.616 max_d=0.616 avg_d=0.247 std_dev=0.266
C4'	A	0, -0.029, 0.263, 0.554, 0.669 max_d=0.669 avg_d=0.263 std_dev=0.292
N3	B	0, 0.051, 0.353, 0.656, 0.738 max_d=0.738 avg_d=0.353 std_dev=0.302
C6	B	0, 0.054, 0.389, 0.725, 0.819 max_d=0.819 avg_d=0.389 std_dev=0.336
C5'	B	0, 0.079, 0.421, 0.762, 0.836 max_d=0.836 avg_d=0.421 std_dev=0.341
O3'	A	0, -0.028, 0.320, 0.668, 0.803 max_d=0.803 avg_d=0.320 std_dev=0.348
O5'	B	0, 0.098, 0.458, 0.819, 0.882 max_d=0.882 avg_d=0.458 std_dev=0.361
O3'	B	0, 0.071, 0.443, 0.815, 0.910 max_d=0.910 avg_d=0.443 std_dev=0.372
O6	B	0, 0.054, 0.439, 0.824, 0.937 max_d=0.937 avg_d=0.439 std_dev=0.385
OP2	B	0, 0.088, 0.476, 0.864, 0.949 max_d=0.949 avg_d=0.476 std_dev=0.388
O5'	A	0, -0.061, 0.359, 0.779, 0.948 max_d=0.948 avg_d=0.359 std_dev=0.420
C2	B	0, 0.020, 0.475, 0.931, 1.089 max_d=1.089 avg_d=0.475 std_dev=0.455
P	B	0, 0.074, 0.541, 1.009, 1.142 max_d=1.142 avg_d=0.541 std_dev=0.468
N1	B	0, 0.021, 0.490, 0.959, 1.122 max_d=1.122 avg_d=0.490 std_dev=0.469
C5'	A	0, -0.085, 0.388, 0.861, 1.054 max_d=1.054 avg_d=0.388 std_dev=0.473
OP2	A	0, -0.079, 0.497, 1.074, 1.305 max_d=1.305 avg_d=0.497 std_dev=0.576
N2	B	0, -0.006, 0.614, 1.234, 1.463 max_d=1.463 avg_d=0.614 std_dev=0.620
P	A	0, -0.119, 0.514, 1.147, 1.405 max_d=1.405 avg_d=0.514 std_dev=0.633
OP1	B	0, 0.034, 0.697, 1.361, 1.590 max_d=1.590 avg_d=0.697 std_dev=0.664
OP1	A	0, -0.182, 0.691, 1.565, 1.923 max_d=1.923 avg_d=0.691 std_dev=0.873

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.06	0.05	0.01
C2	0.02	0.00	0.03	0.07	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.08	0.02	0.10	0.14	0.07	0.07
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.03	0.10	0.07	0.02
C3'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.05	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.08	0.07	0.09	0.03	0.00	0.00	0.04	0.11	0.06	0.02
C4	0.01	0.00	0.02	0.05	0.00	0.05	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.06	0.01	0.14	0.16	0.12	0.11
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.04	0.03	0.04	0.06	0.01	0.06	0.01	0.00	0.00	0.08	0.03	0.01
C5	0.00	0.00	0.04	0.02	0.01	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.02	0.03	0.12	0.11	0.05	0.08
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.09	0.00	0.09	0.00	0.07	0.04	0.08	0.12	0.03	0.06	0.01	0.00	0.01	0.06	0.00	0.02
C6	0.00	0.00	0.05	0.03	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.03	0.04	0.08	0.07	0.02	0.03
N1	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.03	0.01	0.06	0.09	0.02	0.03
N3	0.02	0.00	0.02	0.08	0.00	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.08	0.01	0.13	0.17	0.12	0.11
N4	0.01	0.00	0.01	0.07	0.00	0.06	0.01	0.12	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.07	0.02	0.17	0.19	0.17	0.15
O2	0.02	0.00	0.07	0.09	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.10	0.04	0.08	0.14	0.07	0.07
O2'	0.00	0.06	0.00	0.03	0.07	0.06	0.05	0.06	0.04	0.04	0.07	0.07	0.06	0.00	0.04	0.06	0.03	0.15	0.04	0.04
O3'	0.00	0.08	0.01	0.00	0.06	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.08	0.07	0.10	0.04	0.00	0.01	0.06	0.14	0.06	0.03
O4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.04	0.06	0.01	0.00	0.01	0.03	0.05	0.02
O5'	0.02	0.10	0.03	0.04	0.14	0.00	0.12	0.01	0.08	0.06	0.13	0.17	0.08	0.03	0.06	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00
OP1	0.06	0.14	0.10	0.11	0.16	0.08	0.11	0.06	0.07	0.09	0.17	0.19	0.14	0.15	0.14	0.03	0.03	0.00	0.02	0.01
OP2	0.05	0.07	0.07	0.06	0.12	0.03	0.05	0.00	0.02	0.02	0.12	0.17	0.07	0.04	0.06	0.05	0.03	0.02	0.00	0.00
P	0.01	0.07	0.02	0.02	0.11	0.01	0.08	0.02	0.03	0.03	0.11	0.15	0.07	0.04	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.19	0.03	0.03	0.12	0.03	0.13	0.02	0.17	0.07	0.19	0.22	0.16	0.09	0.08	0.01	0.07	0.07	0.03	0.17	0.04	0.04	0.02
C2	0.04	0.20	0.04	0.04	0.11	0.02	0.12	0.02	0.17	0.04	0.20	0.24	0.16	0.07	0.05	0.05	0.07	0.05	0.02	0.18	0.00	0.02	0.00
C2'	0.08	0.21	0.05	0.05	0.14	0.05	0.14	0.04	0.18	0.08	0.21	0.24	0.18	0.10	0.10	0.04	0.10	0.07	0.05	0.19	0.05	0.06	0.04
C3'	0.06	0.17	0.03	0.01	0.10	0.02	0.10	0.01	0.13	0.06	0.16	0.20	0.14	0.07	0.07	0.04	0.05	0.07	0.01	0.14	0.02	0.02	0.01
C4	0.04	0.21	0.04	0.05	0.11	0.04	0.12	0.05	0.17	0.04	0.20	0.25	0.17	0.07	0.05	0.06	0.07	0.05	0.03	0.18	0.02	0.03	0.02
C4'	0.07	0.15	0.05	0.03	0.09	0.04	0.08	0.02	0.11	0.07	0.14	0.18	0.12	0.07	0.07	0.06	0.04	0.08	0.03	0.12	0.01	0.02	0.03
C5	0.05	0.18	0.03	0.02	0.12	0.01	0.12	0.02	0.15	0.06	0.18	0.20	0.16	0.08	0.07	0.02	0.06	0.05	0.01	0.16	0.01	0.02	0.01
C5'	0.07	0.10	0.08	0.07	0.05	0.06	0.05	0.05	0.07	0.08	0.09	0.13	0.08	0.07	0.06	0.10	0.06	0.09	0.06	0.07	0.05	0.05	0.06
C6	0.06	0.18	0.04	0.04	0.11	0.02	0.12	0.01	0.15	0.07	0.17	0.20	0.15	0.08	0.08	0.03	0.08	0.06	0.02	0.16	0.03	0.03	0.01
N1	0.06	0.19	0.02	0.01	0.12	0.02	0.12	0.01	0.16	0.06	0.19	0.22	0.16	0.09	0.07	0.00	0.07	0.06	0.02	0.17	0.03	0.03	0.02
N3	0.04	0.21	0.06	0.07	0.10	0.04	0.11	0.04	0.17	0.03	0.21	0.26	0.16	0.07	0.04	0.08	0.09	0.05	0.04	0.18	0.02	0.03	0.02
N4	0.04	0.24	0.09	0.10	0.11	0.09	0.12	0.08	0.18	0.02	0.23	0.29	0.19	0.06	0.03	0.11	0.11	0.06	0.06	0.19	0.06	0.04	0.05
O2	0.04	0.20	0.05	0.05	0.10	0.02	0.11	0.02	0.17	0.04	0.21	0.25	0.15	0.07	0.05	0.06	0.08	0.05	0.02	0.18	0.00	0.03	0.01
O2'	0.09	0.27	0.07	0.06	0.18	0.05	0.19	0.03	0.24	0.11	0.27	0.31	0.23	0.14	0.12	0.06	0.10	0.08	0.04	0.25	0.04	0.06	0.03
O3'	0.06	0.17	0.03	0.00	0.10	0.02	0.09	0.02	0.13	0.06	0.16	0.20	0.14	0.06	0.06	0.04	0.06	0.06	0.00	0.14	0.03	0.02	0.02
O4'	0.07	0.17	0.03	0.01	0.11	0.03	0.11	0.01	0.15	0.08	0.17	0.20	0.15	0.09	0.08	0.03	0.05	0.08	0.03	0.15	0.03	0.03	0.01
O5'	0.10	0.06	0.10	0.08	0.05	0.08	0.06	0.07	0.04	0.11	0.05	0.08	0.04	0.09	0.08	0.12	0.06	0.11	0.08	0.05	0.06	0.07	0.08
OP1	0.06	0.06	0.09	0.07	0.04	0.04	0.05	0.01	0.05	0.09	0.05	0.08	0.05	0.08	0.06	0.13	0.08	0.07	0.02	0.05	0.03	0.01	0.02
OP2	0.07	0.05	0.10	0.09	0.04	0.07	0.06	0.06	0.04	0.11	0.03	0.08	0.04	0.10	0.07	0.12	0.08	0.08	0.09	0.05	0.07	0.07	0.09
P	0.07	0.08	0.08	0.07	0.05	0.05	0.05	0.03	0.05	0.09	0.07	0.10	0.07	0.08	0.06	0.11	0.07	0.08	0.05	0.06	0.03	0.04	0.05

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.04	0.03	0.02	0.02
C2	0.03	0.00	0.07	0.04	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.13	0.06	0.01	0.07	0.01	0.08	0.10	0.08
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.06	0.03	0.06	0.08	0.06	0.03	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.06	0.03	0.04	0.03
C3'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.08	0.03	0.05	0.03	0.07	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.06	0.04	0.05	0.04
C4	0.02	0.01	0.04	0.03	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.02	0.01	0.08	0.02	0.08	0.09	0.08
C4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.05	0.02	0.02	0.02	0.05	0.02	0.03	0.01	0.00	0.00	0.04	0.02	0.01	0.01
C5	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.05	0.00	0.11	0.01	0.12	0.13	0.12
C5'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.07	0.08	0.06	0.02	0.03	0.10	0.05	0.03	0.02	0.00	0.01	0.09	0.02	0.00	0.01
C6	0.03	0.01	0.06	0.05	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.10	0.05	0.01	0.11	0.01	0.13	0.15	0.13
C8	0.01	0.00	0.03	0.08	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.09	0.01	0.11	0.01	0.10	0.09	0.10
N1	0.03	0.01	0.06	0.03	0.01	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.12	0.04	0.01	0.10	0.01	0.11	0.14	0.11
N2	0.02	0.00	0.08	0.05	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.15	0.08	0.01	0.06	0.02	0.06	0.10	0.07
N3	0.03	0.00	0.06	0.03	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.06	0.01	0.06	0.01	0.06	0.08	0.06
N7	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.09	0.00	0.12	0.02	0.14	0.14	0.13
N9	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00	0.07	0.02	0.06	0.06	0.06
O2'	0.01	0.13	0.01	0.01	0.08	0.03	0.07	0.03	0.10	0.02	0.12	0.15	0.12	0.03	0.03	0.00	0.02	0.02	0.02	0.10	0.03	0.03	0.02
O3'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.02	0.01	0.05	0.02	0.05	0.09	0.04	0.08	0.06	0.09	0.03	0.02	0.00	0.00	0.06	0.06	0.08	0.06	0.07
O4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.04	0.03
O5'	0.03	0.07	0.03	0.03	0.08	0.00	0.11	0.01	0.11	0.11	0.10	0.06	0.06	0.12	0.07	0.02	0.06	0.03	0.00	0.13	0.00	0.02	0.00
O6	0.04	0.01	0.06	0.06	0.02	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.10	0.06	0.01	0.13	0.00	0.15	0.18	0.15
OP1	0.03	0.08	0.03	0.04	0.08	0.02	0.12	0.02	0.13	0.10	0.11	0.06	0.06	0.14	0.06	0.03	0.08	0.04	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00
OP2	0.02	0.10	0.04	0.05	0.09	0.01	0.13	0.00	0.15	0.09	0.14	0.10	0.08	0.14	0.06	0.03	0.06	0.04	0.02	0.18	0.01	0.00	0.00
P	0.02	0.08	0.03	0.04	0.08	0.01	0.12	0.01	0.13	0.10	0.11	0.07	0.06	0.13	0.06	0.02	0.07	0.03	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00