Doublet Group distance statistics: 53178

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 2, 3, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.016 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.010, 0.024, 0.037, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.024 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.008, 0.022, 0.037, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.022 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.017, 0.032, 0.047, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.032 std_dev=0.015
C6	A	0, 0.019, 0.034, 0.049, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.034 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.020, 0.036, 0.052, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.036 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.018, 0.038, 0.057, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.038 std_dev=0.019
O2	A	0, 0.052, 0.092, 0.133, 0.147 max_d=0.147 avg_d=0.092 std_dev=0.041
N4	A	0, 0.052, 0.095, 0.138, 0.158 max_d=0.158 avg_d=0.095 std_dev=0.043
O4'	A	0, 0.028, 0.088, 0.147, 0.220 max_d=0.220 avg_d=0.088 std_dev=0.060
C4'	A	0, 0.053, 0.138, 0.224, 0.286 max_d=0.286 avg_d=0.138 std_dev=0.085
C2'	A	0, 0.104, 0.196, 0.289, 0.286 max_d=0.286 avg_d=0.196 std_dev=0.092
C3'	A	0, 0.116, 0.223, 0.331, 0.349 max_d=0.349 avg_d=0.223 std_dev=0.108
O2'	A	0, 0.156, 0.292, 0.429, 0.415 max_d=0.415 avg_d=0.292 std_dev=0.136
O3'	A	0, 0.190, 0.364, 0.538, 0.574 max_d=0.574 avg_d=0.364 std_dev=0.174
C5'	A	0, 0.104, 0.280, 0.455, 0.675 max_d=0.675 avg_d=0.280 std_dev=0.175
O5'	A	0, 0.193, 0.435, 0.677, 0.842 max_d=0.842 avg_d=0.435 std_dev=0.242
O2	B	0, 0.317, 0.652, 0.987, 0.993 max_d=0.993 avg_d=0.652 std_dev=0.335
P	A	0, 0.280, 0.627, 0.974, 1.113 max_d=1.113 avg_d=0.627 std_dev=0.347
C2	B	0, 0.344, 0.739, 1.134, 1.281 max_d=1.281 avg_d=0.739 std_dev=0.395
N3	B	0, 0.362, 0.761, 1.159, 1.331 max_d=1.331 avg_d=0.761 std_dev=0.398
O2'	B	0, 0.249, 0.693, 1.136, 1.421 max_d=1.421 avg_d=0.693 std_dev=0.444
N4	B	0, 0.412, 0.895, 1.377, 1.693 max_d=1.693 avg_d=0.895 std_dev=0.483
N1	B	0, 0.358, 0.842, 1.325, 1.576 max_d=1.576 avg_d=0.842 std_dev=0.483
C4	B	0, 0.382, 0.869, 1.355, 1.658 max_d=1.658 avg_d=0.869 std_dev=0.486
C1'	B	0, 0.356, 0.844, 1.333, 1.584 max_d=1.584 avg_d=0.844 std_dev=0.488
C2'	B	0, 0.341, 0.837, 1.332, 1.600 max_d=1.600 avg_d=0.837 std_dev=0.495
O4'	B	0, 0.439, 1.015, 1.590, 1.860 max_d=1.860 avg_d=1.015 std_dev=0.575
C6	B	0, 0.380, 0.968, 1.556, 1.938 max_d=1.938 avg_d=0.968 std_dev=0.588
C5	B	0, 0.386, 0.976, 1.567, 1.980 max_d=1.980 avg_d=0.976 std_dev=0.590
C3'	B	0, 0.421, 1.041, 1.661, 1.947 max_d=1.947 avg_d=1.041 std_dev=0.620
OP1	A	0, 0.113, 0.760, 1.407, 2.643 max_d=2.643 avg_d=0.760 std_dev=0.647
C4'	B	0, 0.443, 1.109, 1.774, 2.062 max_d=2.062 avg_d=1.109 std_dev=0.666
OP2	A	0, 0.366, 1.036, 1.705, 2.652 max_d=2.652 avg_d=1.036 std_dev=0.670
O3'	B	0, 0.447, 1.121, 1.795, 2.128 max_d=2.128 avg_d=1.121 std_dev=0.674
O5'	B	0, 0.377, 1.105, 1.833, 2.217 max_d=2.217 avg_d=1.105 std_dev=0.728
C5'	B	0, 0.543, 1.368, 2.193, 2.765 max_d=2.765 avg_d=1.368 std_dev=0.825
P	B	0, 0.594, 1.493, 2.393, 2.854 max_d=2.854 avg_d=1.493 std_dev=0.899
OP1	B	0, 0.689, 1.660, 2.631, 3.160 max_d=3.160 avg_d=1.660 std_dev=0.971
OP2	B	0, 0.774, 1.761, 2.748, 3.133 max_d=3.133 avg_d=1.761 std_dev=0.987

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.04	0.09	0.01	0.02	0.00	0.05	0.52	0.33	0.10
C2	0.04	0.00	0.04	0.05	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.05	0.04	0.09	0.67	0.43	0.12
C2'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.06	0.01	0.05	0.02	0.04	0.02	0.05	0.06	0.08	0.01	0.02	0.01	0.05	0.32	0.22	0.04
C3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.08	0.01	0.08	0.02	0.06	0.03	0.06	0.09	0.08	0.02	0.01	0.01	0.06	0.13	0.12	0.04
C4	0.04	0.01	0.06	0.08	0.00	0.07	0.01	0.10	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.09	0.05	0.13	0.68	0.42	0.11
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.07	0.00	0.07	0.01	0.06	0.03	0.05	0.08	0.08	0.03	0.02	0.00	0.02	0.19	0.12	0.04
C5	0.02	0.01	0.05	0.08	0.01	0.07	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.09	0.05	0.13	0.65	0.40	0.11
C5'	0.01	0.05	0.02	0.02	0.10	0.01	0.10	0.00	0.08	0.04	0.07	0.11	0.08	0.03	0.03	0.01	0.01	0.06	0.06	0.01
C6	0.02	0.02	0.04	0.06	0.02	0.06	0.01	0.08	0.00	0.00	0.02	0.03	0.02	0.03	0.07	0.05	0.11	0.63	0.39	0.12
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.04	0.00	0.00	0.02	0.03	0.03	0.01	0.03	0.02	0.08	0.62	0.40	0.12
N3	0.04	0.01	0.05	0.06	0.01	0.05	0.01	0.07	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.05	0.06	0.04	0.11	0.70	0.44	0.11
N4	0.04	0.01	0.06	0.09	0.00	0.08	0.02	0.11	0.03	0.03	0.01	0.00	0.02	0.05	0.10	0.05	0.14	0.67	0.42	0.11
O2	0.09	0.01	0.08	0.08	0.01	0.08	0.02	0.08	0.02	0.03	0.02	0.02	0.00	0.10	0.08	0.09	0.10	0.66	0.42	0.14
O2'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.05	0.03	0.04	0.03	0.03	0.01	0.05	0.05	0.10	0.00	0.03	0.02	0.05	0.31	0.20	0.04
O3'	0.02	0.05	0.02	0.01	0.09	0.02	0.09	0.03	0.07	0.03	0.06	0.10	0.08	0.03	0.00	0.02	0.08	0.06	0.13	0.07
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.05	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.04	0.05	0.09	0.02	0.02	0.00	0.04	0.48	0.31	0.12
O5'	0.05	0.09	0.05	0.06	0.13	0.02	0.13	0.01	0.11	0.08	0.11	0.14	0.10	0.05	0.08	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.52	0.67	0.32	0.13	0.68	0.19	0.65	0.06	0.63	0.62	0.70	0.67	0.66	0.31	0.06	0.48	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.33	0.43	0.22	0.12	0.42	0.12	0.40	0.06	0.39	0.40	0.44	0.42	0.42	0.20	0.13	0.31	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.10	0.12	0.04	0.04	0.11	0.04	0.11	0.01	0.12	0.12	0.11	0.11	0.14	0.04	0.07	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.05	0.15	0.06	0.06	0.17	0.20	0.09	0.30	0.06	0.06	0.20	0.20	0.20	0.06	0.07	0.14	0.12	0.24	0.10	0.15
C2	0.08	0.14	0.05	0.07	0.17	0.21	0.09	0.28	0.06	0.06	0.19	0.20	0.17	0.05	0.08	0.17	0.13	0.23	0.08	0.14
C2'	0.07	0.13	0.07	0.08	0.16	0.21	0.07	0.29	0.04	0.04	0.19	0.20	0.17	0.07	0.08	0.16	0.14	0.27	0.11	0.17
C3'	0.08	0.12	0.07	0.09	0.13	0.21	0.05	0.29	0.05	0.03	0.17	0.17	0.17	0.08	0.09	0.17	0.18	0.30	0.15	0.20
C4	0.11	0.13	0.07	0.08	0.14	0.21	0.06	0.24	0.05	0.05	0.17	0.17	0.18	0.08	0.08	0.20	0.18	0.27	0.11	0.18
C4'	0.05	0.14	0.07	0.05	0.14	0.19	0.06	0.30	0.05	0.05	0.18	0.17	0.20	0.08	0.05	0.14	0.17	0.28	0.16	0.19
C5	0.11	0.12	0.07	0.08	0.12	0.22	0.05	0.26	0.06	0.05	0.16	0.14	0.19	0.07	0.07	0.20	0.18	0.29	0.15	0.20
C5'	0.07	0.15	0.10	0.05	0.13	0.18	0.07	0.29	0.07	0.07	0.18	0.15	0.21	0.12	0.05	0.15	0.22	0.31	0.20	0.23
C6	0.08	0.12	0.06	0.07	0.12	0.21	0.04	0.28	0.04	0.04	0.16	0.14	0.18	0.07	0.08	0.18	0.15	0.27	0.13	0.18
N1	0.06	0.14	0.05	0.06	0.15	0.20	0.07	0.28	0.04	0.05	0.18	0.19	0.19	0.05	0.08	0.15	0.12	0.25	0.09	0.14
N3	0.10	0.14	0.06	0.08	0.16	0.21	0.09	0.25	0.06	0.06	0.19	0.21	0.17	0.07	0.08	0.18	0.16	0.24	0.08	0.16
N4	0.15	0.12	0.09	0.10	0.14	0.22	0.06	0.23	0.06	0.07	0.17	0.17	0.18	0.14	0.10	0.22	0.23	0.29	0.14	0.21
O2	0.09	0.14	0.06	0.08	0.17	0.22	0.10	0.29	0.07	0.07	0.19	0.21	0.16	0.05	0.08	0.17	0.13	0.23	0.09	0.15
O2'	0.06	0.14	0.06	0.08	0.17	0.21	0.09	0.30	0.05	0.05	0.20	0.22	0.17	0.06	0.08	0.15	0.13	0.26	0.10	0.16
O3'	0.09	0.11	0.08	0.10	0.13	0.22	0.05	0.29	0.06	0.04	0.16	0.17	0.16	0.09	0.10	0.18	0.19	0.32	0.17	0.22
O4'	0.05	0.16	0.07	0.06	0.15	0.20	0.08	0.31	0.06	0.07	0.19	0.18	0.21	0.09	0.08	0.14	0.15	0.26	0.13	0.17
O5'	0.08	0.19	0.12	0.05	0.16	0.15	0.10	0.25	0.08	0.10	0.21	0.19	0.25	0.13	0.04	0.12	0.18	0.28	0.17	0.18
OP1	0.56	0.64	0.48	0.36	0.61	0.42	0.55	0.44	0.54	0.58	0.65	0.61	0.70	0.54	0.25	0.51	0.43	0.32	0.39	0.39
OP2	0.45	0.42	0.37	0.31	0.42	0.43	0.43	0.47	0.44	0.44	0.41	0.41	0.43	0.39	0.21	0.48	0.38	0.39	0.36	0.36
P	0.06	0.19	0.11	0.02	0.15	0.13	0.08	0.26	0.06	0.09	0.21	0.17	0.27	0.15	0.03	0.06	0.15	0.25	0.13	0.14

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.02	0.02	0.04	0.02	0.01	0.02	0.03	0.04	0.01	0.01	0.01	0.17	0.18	0.09	0.08
C2	0.02	0.00	0.06	0.08	0.01	0.04	0.02	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.07	0.03	0.23	0.20	0.09	0.13
C2'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.05	0.01	0.05	0.03	0.10	0.00	0.02	0.01	0.16	0.24	0.04	0.12
C3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.07	0.01	0.08	0.02	0.08	0.04	0.08	0.08	0.10	0.02	0.01	0.02	0.19	0.28	0.03	0.15
C4	0.03	0.01	0.03	0.07	0.00	0.09	0.01	0.24	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.05	0.06	0.04	0.31	0.25	0.18	0.21
C4'	0.02	0.04	0.02	0.01	0.09	0.00	0.11	0.01	0.10	0.05	0.06	0.09	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.13	0.19	0.03
C5	0.02	0.02	0.04	0.08	0.01	0.11	0.00	0.27	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.09	0.04	0.34	0.27	0.19	0.23
C5'	0.04	0.14	0.02	0.02	0.24	0.01	0.27	0.00	0.23	0.14	0.19	0.26	0.08	0.03	0.04	0.01	0.01	0.19	0.27	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.08	0.01	0.10	0.00	0.23	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.08	0.04	0.31	0.24	0.13	0.19
N1	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.05	0.01	0.14	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.24	0.21	0.09	0.14
N3	0.02	0.01	0.05	0.08	0.00	0.06	0.01	0.19	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.06	0.07	0.03	0.26	0.22	0.13	0.17
N4	0.03	0.01	0.03	0.08	0.01	0.09	0.02	0.26	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.08	0.04	0.34	0.28	0.23	0.25
O2	0.04	0.01	0.10	0.10	0.02	0.04	0.02	0.08	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.10	0.12	0.04	0.18	0.18	0.07	0.11
O2'	0.01	0.06	0.00	0.02	0.05	0.03	0.04	0.03	0.03	0.02	0.06	0.05	0.10	0.00	0.04	0.04	0.04	0.16	0.11	0.04
O3'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.06	0.01	0.09	0.04	0.08	0.03	0.07	0.08	0.12	0.04	0.00	0.01	0.16	0.26	0.06	0.13
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.03	0.04	0.04	0.04	0.01	0.00	0.16	0.16	0.14	0.07
O5'	0.17	0.23	0.16	0.19	0.31	0.01	0.34	0.01	0.31	0.24	0.26	0.34	0.18	0.04	0.16	0.16	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.18	0.20	0.24	0.28	0.25	0.13	0.27	0.19	0.24	0.21	0.22	0.28	0.18	0.16	0.26	0.16	0.02	0.00	0.03	0.01
OP2	0.09	0.09	0.04	0.03	0.18	0.19	0.19	0.27	0.13	0.09	0.13	0.23	0.07	0.11	0.06	0.14	0.02	0.03	0.00	0.02
P	0.08	0.13	0.12	0.15	0.21	0.03	0.23	0.01	0.19	0.14	0.17	0.25	0.11	0.04	0.13	0.07	0.00	0.01	0.02	0.00