Doublet Group distance statistics: 53185

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 1, 0, 3, 1, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.006, 0.011, 0.015, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.011 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.000, 0.006, 0.013, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.006 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.010, 0.017, 0.024, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.017 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.007, 0.015, 0.022, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.015 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.010, 0.018, 0.025, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.018 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.008, 0.017, 0.025, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.017 std_dev=0.008
N3	A	0, -0.002, 0.010, 0.022, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.010 std_dev=0.012
O2	A	0, 0.028, 0.047, 0.066, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.047 std_dev=0.019
N4	A	0, 0.029, 0.052, 0.076, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.052 std_dev=0.024
O4'	A	0, -0.018, 0.106, 0.230, 0.445 max_d=0.445 avg_d=0.106 std_dev=0.124
C2'	A	0, -0.006, 0.125, 0.255, 0.493 max_d=0.493 avg_d=0.125 std_dev=0.130
O2'	A	0, 0.031, 0.184, 0.338, 0.591 max_d=0.591 avg_d=0.184 std_dev=0.154
C4'	A	0, -0.002, 0.177, 0.356, 0.661 max_d=0.661 avg_d=0.177 std_dev=0.179
C3'	A	0, -0.012, 0.198, 0.408, 0.785 max_d=0.785 avg_d=0.198 std_dev=0.210
N1	B	0, 0.152, 0.377, 0.601, 0.732 max_d=0.732 avg_d=0.377 std_dev=0.224
C6	B	0, 0.172, 0.406, 0.640, 0.695 max_d=0.695 avg_d=0.406 std_dev=0.234
C4	B	0, 0.179, 0.418, 0.657, 0.791 max_d=0.791 avg_d=0.418 std_dev=0.239
C2	B	0, 0.124, 0.371, 0.618, 0.868 max_d=0.868 avg_d=0.371 std_dev=0.247
C5	B	0, 0.186, 0.439, 0.692, 0.887 max_d=0.887 avg_d=0.439 std_dev=0.253
N3	B	0, 0.127, 0.385, 0.643, 0.933 max_d=0.933 avg_d=0.385 std_dev=0.258
N6	B	0, 0.173, 0.449, 0.726, 0.889 max_d=0.889 avg_d=0.449 std_dev=0.276
N9	B	0, 0.190, 0.480, 0.770, 0.967 max_d=0.967 avg_d=0.480 std_dev=0.290
C1'	B	0, 0.206, 0.497, 0.788, 0.910 max_d=0.910 avg_d=0.497 std_dev=0.291
O2'	B	0, 0.199, 0.493, 0.787, 1.020 max_d=1.020 avg_d=0.493 std_dev=0.294
C2'	B	0, 0.206, 0.501, 0.796, 0.903 max_d=0.903 avg_d=0.501 std_dev=0.295
O3'	A	0, -0.006, 0.291, 0.588, 1.104 max_d=1.104 avg_d=0.291 std_dev=0.297
C5'	A	0, -0.017, 0.305, 0.627, 1.196 max_d=1.196 avg_d=0.305 std_dev=0.322
O4'	B	0, 0.205, 0.543, 0.881, 1.169 max_d=1.169 avg_d=0.543 std_dev=0.338
N7	B	0, 0.166, 0.516, 0.865, 1.339 max_d=1.339 avg_d=0.516 std_dev=0.350
C3'	B	0, 0.201, 0.557, 0.914, 1.093 max_d=1.093 avg_d=0.557 std_dev=0.357
C8	B	0, 0.167, 0.532, 0.897, 1.347 max_d=1.347 avg_d=0.532 std_dev=0.365
O5'	A	0, -0.027, 0.357, 0.740, 1.450 max_d=1.450 avg_d=0.357 std_dev=0.383
C4'	B	0, 0.177, 0.588, 0.999, 1.401 max_d=1.401 avg_d=0.588 std_dev=0.411
C5'	B	0, 0.135, 0.648, 1.162, 1.861 max_d=1.861 avg_d=0.648 std_dev=0.513
O5'	B	0, 0.122, 0.637, 1.151, 1.925 max_d=1.925 avg_d=0.637 std_dev=0.514
O3'	B	0, 0.172, 0.703, 1.234, 1.727 max_d=1.727 avg_d=0.703 std_dev=0.531
OP2	B	0, 0.177, 0.764, 1.351, 2.282 max_d=2.282 avg_d=0.764 std_dev=0.587
P	B	0, 0.151, 0.758, 1.365, 2.245 max_d=2.245 avg_d=0.758 std_dev=0.607
OP1	B	0, 0.227, 0.855, 1.484, 2.194 max_d=2.194 avg_d=0.855 std_dev=0.628
P	A	0, -0.130, 0.511, 1.152, 2.364 max_d=2.364 avg_d=0.511 std_dev=0.641
OP2	A	0, -0.147, 0.554, 1.256, 2.579 max_d=2.579 avg_d=0.554 std_dev=0.701
OP1	A	0, -0.149, 0.599, 1.346, 2.741 max_d=2.741 avg_d=0.599 std_dev=0.748

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.04	0.06	0.05	0.03
C2	0.01	0.00	0.06	0.05	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.07	0.06	0.02	0.08	0.10	0.10	0.08
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.02	0.06	0.01	0.05	0.03	0.12	0.00	0.01	0.00	0.04	0.11	0.06	0.07
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.11	0.03	0.05	0.05	0.10	0.01	0.00	0.01	0.02	0.11	0.05	0.06
C4	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.07	0.02	0.09	0.12	0.16	0.11
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.07	0.01	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.12	0.02	0.10	0.15	0.20	0.14
C5'	0.02	0.05	0.02	0.01	0.06	0.01	0.07	0.00	0.06	0.04	0.05	0.07	0.06	0.03	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02
C6	0.00	0.00	0.06	0.11	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.12	0.03	0.09	0.11	0.16	0.11
N1	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.06	0.07	0.09	0.06
N3	0.02	0.00	0.05	0.05	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.06	0.06	0.02	0.08	0.10	0.13	0.10
N4	0.02	0.02	0.03	0.05	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.04	0.07	0.02	0.09	0.13	0.17	0.13
O2	0.02	0.01	0.12	0.10	0.02	0.04	0.02	0.06	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.11	0.13	0.02	0.10	0.14	0.11	0.10
O2'	0.02	0.07	0.00	0.01	0.03	0.03	0.02	0.03	0.03	0.03	0.06	0.04	0.11	0.00	0.03	0.02	0.03	0.10	0.05	0.05
O3'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.07	0.01	0.12	0.02	0.12	0.03	0.06	0.07	0.13	0.03	0.00	0.01	0.03	0.13	0.07	0.07
O4'	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.03	0.06	0.03
O5'	0.04	0.08	0.04	0.02	0.09	0.01	0.10	0.01	0.09	0.06	0.08	0.09	0.10	0.03	0.03	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.06	0.10	0.11	0.11	0.12	0.07	0.15	0.04	0.11	0.07	0.10	0.13	0.14	0.10	0.13	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.05	0.10	0.06	0.05	0.16	0.01	0.20	0.01	0.16	0.09	0.13	0.17	0.11	0.05	0.07	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.03	0.08	0.07	0.06	0.11	0.02	0.14	0.02	0.11	0.06	0.10	0.13	0.10	0.05	0.07	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.25	0.07	0.26	0.31	0.12	0.36	0.11	0.38	0.09	0.18	0.08	0.09	0.11	0.14	0.18	0.27	0.42	0.32	0.30	0.27	0.29	0.31
C2	0.23	0.08	0.25	0.26	0.12	0.26	0.12	0.26	0.11	0.17	0.10	0.09	0.12	0.15	0.17	0.24	0.37	0.24	0.19	0.17	0.20	0.20
C2'	0.20	0.07	0.20	0.25	0.08	0.30	0.09	0.32	0.10	0.11	0.08	0.08	0.13	0.11	0.12	0.22	0.37	0.27	0.24	0.21	0.22	0.24
C3'	0.13	0.09	0.13	0.19	0.08	0.24	0.12	0.25	0.14	0.12	0.11	0.08	0.17	0.14	0.09	0.16	0.32	0.20	0.19	0.17	0.17	0.18
C4	0.19	0.08	0.22	0.22	0.11	0.20	0.12	0.20	0.11	0.15	0.10	0.08	0.12	0.14	0.15	0.21	0.32	0.19	0.14	0.13	0.16	0.14
C4'	0.20	0.11	0.21	0.27	0.11	0.32	0.12	0.35	0.12	0.14	0.11	0.11	0.14	0.14	0.14	0.22	0.39	0.27	0.30	0.26	0.28	0.29
C5	0.23	0.10	0.25	0.27	0.12	0.29	0.12	0.29	0.11	0.16	0.10	0.11	0.12	0.14	0.16	0.25	0.36	0.27	0.23	0.19	0.23	0.22
C5'	0.18	0.14	0.19	0.26	0.13	0.30	0.15	0.33	0.15	0.15	0.15	0.13	0.17	0.16	0.14	0.20	0.38	0.25	0.30	0.25	0.28	0.28
C6	0.25	0.09	0.27	0.31	0.12	0.35	0.11	0.36	0.10	0.17	0.09	0.10	0.11	0.14	0.17	0.28	0.41	0.31	0.29	0.25	0.27	0.28
N1	0.24	0.08	0.26	0.29	0.12	0.32	0.11	0.33	0.10	0.17	0.09	0.09	0.11	0.14	0.17	0.26	0.40	0.29	0.26	0.22	0.25	0.26
N3	0.20	0.09	0.23	0.22	0.12	0.20	0.12	0.19	0.12	0.16	0.11	0.10	0.13	0.14	0.16	0.21	0.33	0.19	0.13	0.12	0.16	0.14
N4	0.14	0.09	0.19	0.17	0.12	0.13	0.12	0.13	0.12	0.14	0.11	0.09	0.13	0.14	0.13	0.15	0.26	0.13	0.11	0.13	0.12	0.10
O2	0.24	0.10	0.26	0.27	0.13	0.27	0.13	0.26	0.12	0.18	0.11	0.10	0.13	0.15	0.19	0.25	0.38	0.24	0.19	0.16	0.20	0.20
O2'	0.23	0.06	0.23	0.28	0.08	0.34	0.08	0.37	0.09	0.13	0.07	0.08	0.12	0.11	0.14	0.24	0.39	0.30	0.28	0.25	0.26	0.28
O3'	0.09	0.09	0.08	0.14	0.09	0.20	0.16	0.22	0.17	0.15	0.12	0.07	0.21	0.19	0.09	0.12	0.28	0.16	0.15	0.14	0.13	0.14
O4'	0.26	0.10	0.27	0.33	0.14	0.38	0.13	0.41	0.11	0.19	0.10	0.11	0.12	0.16	0.19	0.27	0.43	0.33	0.34	0.31	0.33	0.35
O5'	0.11	0.14	0.12	0.18	0.11	0.20	0.13	0.21	0.15	0.13	0.15	0.12	0.17	0.15	0.10	0.13	0.31	0.15	0.20	0.15	0.19	0.18
OP1	0.16	0.14	0.17	0.15	0.14	0.10	0.18	0.10	0.17	0.26	0.16	0.11	0.20	0.25	0.20	0.15	0.17	0.13	0.13	0.20	0.15	0.13
OP2	0.24	0.15	0.23	0.20	0.16	0.19	0.18	0.18	0.16	0.29	0.16	0.12	0.19	0.26	0.24	0.23	0.16	0.23	0.18	0.28	0.19	0.20
P	0.11	0.15	0.11	0.10	0.11	0.07	0.14	0.07	0.15	0.19	0.16	0.10	0.18	0.19	0.14	0.10	0.18	0.09	0.10	0.14	0.12	0.08

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.01	0.07	0.17	0.05	0.06
C2	0.03	0.00	0.18	0.14	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.15	0.21	0.10	0.15	0.19	0.16	0.15
C2'	0.01	0.18	0.00	0.01	0.11	0.01	0.10	0.01	0.13	0.06	0.17	0.16	0.12	0.07	0.05	0.00	0.06	0.01	0.04	0.18	0.08	0.05
C3'	0.02	0.14	0.01	0.00	0.11	0.01	0.12	0.01	0.13	0.09	0.15	0.12	0.13	0.11	0.08	0.03	0.02	0.02	0.05	0.19	0.06	0.05
C4	0.01	0.01	0.11	0.11	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.14	0.07	0.14	0.20	0.13	0.13
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.07	0.03	0.04	0.05	0.06	0.03	0.06	0.03	0.00	0.01	0.12	0.04	0.02
C5	0.00	0.01	0.10	0.12	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.15	0.05	0.17	0.23	0.18	0.17
C5'	0.02	0.09	0.01	0.01	0.06	0.00	0.09	0.00	0.10	0.12	0.10	0.07	0.12	0.11	0.06	0.05	0.03	0.01	0.01	0.09	0.04	0.03
C6	0.01	0.00	0.13	0.13	0.00	0.03	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.11	0.18	0.08	0.19	0.24	0.21	0.20
C8	0.01	0.01	0.06	0.09	0.01	0.07	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.10	0.04	0.16	0.25	0.17	0.17
N1	0.02	0.01	0.17	0.15	0.01	0.03	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.21	0.10	0.18	0.22	0.20	0.18
N3	0.02	0.01	0.16	0.12	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.12	0.18	0.09	0.13	0.18	0.13	0.12
N6	0.01	0.01	0.12	0.13	0.00	0.05	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.11	0.18	0.09	0.21	0.27	0.25	0.23
N7	0.01	0.00	0.07	0.11	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.08	0.14	0.01	0.18	0.26	0.21	0.20
N9	0.00	0.02	0.05	0.08	0.01	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.08	0.01	0.12	0.20	0.10	0.11
O2'	0.01	0.15	0.00	0.03	0.07	0.06	0.08	0.05	0.11	0.08	0.14	0.12	0.11	0.08	0.04	0.00	0.13	0.06	0.03	0.16	0.06	0.03
O3'	0.07	0.21	0.06	0.02	0.14	0.03	0.15	0.03	0.18	0.10	0.21	0.18	0.18	0.14	0.08	0.13	0.00	0.05	0.08	0.27	0.11	0.12
O4'	0.01	0.10	0.01	0.02	0.07	0.00	0.05	0.01	0.08	0.04	0.10	0.09	0.09	0.01	0.01	0.06	0.05	0.00	0.07	0.12	0.08	0.06
O5'	0.07	0.15	0.04	0.05	0.14	0.01	0.17	0.01	0.19	0.16	0.18	0.13	0.21	0.18	0.12	0.03	0.08	0.07	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.17	0.19	0.18	0.19	0.20	0.12	0.23	0.09	0.24	0.25	0.22	0.18	0.27	0.26	0.20	0.16	0.27	0.12	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.05	0.16	0.08	0.06	0.13	0.04	0.18	0.04	0.21	0.17	0.20	0.13	0.25	0.21	0.10	0.06	0.11	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.15	0.05	0.05	0.13	0.02	0.17	0.03	0.20	0.17	0.18	0.12	0.23	0.20	0.11	0.03	0.12	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00