Doublet Group distance statistics: 53190

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 5, 13, 12, 5, 8, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.012, 0.017, 0.022, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.017 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.009, 0.015, 0.021, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.015 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.014, 0.020, 0.026, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.020 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.010, 0.016, 0.022, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.016 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.004, 0.010, 0.016, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.006, 0.012, 0.019, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.012 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.009, 0.017, 0.025, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.017 std_dev=0.008
N9	A	0, 0.010, 0.020, 0.029, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.020 std_dev=0.009
O6	A	0, 0.023, 0.034, 0.045, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.034 std_dev=0.011
N2	A	0, 0.007, 0.019, 0.032, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.019 std_dev=0.012
N7	A	0, 0.015, 0.030, 0.045, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.030 std_dev=0.015
C8	A	0, 0.013, 0.032, 0.050, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.032 std_dev=0.018
N1	B	0, 0.168, 0.314, 0.460, 0.653 max_d=0.653 avg_d=0.314 std_dev=0.146
C6	B	0, 0.186, 0.352, 0.518, 0.677 max_d=0.677 avg_d=0.352 std_dev=0.166
C2	B	0, 0.153, 0.323, 0.493, 1.023 max_d=1.023 avg_d=0.323 std_dev=0.170
C1'	B	0, 0.139, 0.325, 0.511, 0.828 max_d=0.828 avg_d=0.325 std_dev=0.186
N3	B	0, 0.162, 0.351, 0.540, 1.260 max_d=1.260 avg_d=0.351 std_dev=0.189
C5	B	0, 0.182, 0.371, 0.561, 1.071 max_d=1.071 avg_d=0.371 std_dev=0.190
C4	B	0, 0.169, 0.364, 0.560, 1.265 max_d=1.265 avg_d=0.364 std_dev=0.195
C2'	A	0, 0.044, 0.254, 0.464, 1.295 max_d=1.295 avg_d=0.254 std_dev=0.210
O4'	A	0, -0.059, 0.165, 0.389, 1.324 max_d=1.324 avg_d=0.165 std_dev=0.224
O2	B	0, 0.114, 0.345, 0.577, 1.490 max_d=1.490 avg_d=0.345 std_dev=0.231
C2'	B	0, 0.220, 0.462, 0.704, 1.110 max_d=1.110 avg_d=0.462 std_dev=0.242
O4'	B	0, 0.061, 0.310, 0.558, 1.370 max_d=1.370 avg_d=0.310 std_dev=0.249
N4	B	0, 0.169, 0.436, 0.704, 1.814 max_d=1.814 avg_d=0.436 std_dev=0.268
C4'	A	0, -0.086, 0.246, 0.578, 1.960 max_d=1.960 avg_d=0.246 std_dev=0.332
C3'	A	0, -0.004, 0.333, 0.670, 1.883 max_d=1.883 avg_d=0.333 std_dev=0.337
O2'	B	0, 0.231, 0.568, 0.905, 1.627 max_d=1.627 avg_d=0.568 std_dev=0.337
C4'	B	0, 0.049, 0.388, 0.727, 1.599 max_d=1.599 avg_d=0.388 std_dev=0.339
C3'	B	0, 0.102, 0.450, 0.798, 1.765 max_d=1.765 avg_d=0.450 std_dev=0.348
O2'	A	0, 0.002, 0.397, 0.791, 2.135 max_d=2.135 avg_d=0.397 std_dev=0.395
C5'	B	0, 0.074, 0.503, 0.931, 2.259 max_d=2.259 avg_d=0.503 std_dev=0.428
O5'	B	0, 0.094, 0.527, 0.961, 2.447 max_d=2.447 avg_d=0.527 std_dev=0.434
O3'	B	0, -0.008, 0.470, 0.949, 2.793 max_d=2.793 avg_d=0.470 std_dev=0.478
C5'	A	0, -0.024, 0.465, 0.953, 2.707 max_d=2.707 avg_d=0.465 std_dev=0.488
O3'	A	0, -0.089, 0.407, 0.903, 2.498 max_d=2.498 avg_d=0.407 std_dev=0.496
P	B	0, 0.045, 0.678, 1.312, 3.653 max_d=3.653 avg_d=0.678 std_dev=0.633
OP1	B	0, 0.032, 0.755, 1.478, 4.170 max_d=4.170 avg_d=0.755 std_dev=0.723
O5'	A	0, -0.247, 0.532, 1.312, 4.934 max_d=4.934 avg_d=0.532 std_dev=0.780
OP2	B	0, -0.105, 0.742, 1.590, 5.634 max_d=5.634 avg_d=0.742 std_dev=0.848
P	A	0, -0.495, 0.604, 1.704, 7.296 max_d=7.296 avg_d=0.604 std_dev=1.099
OP1	A	0, -0.593, 0.680, 1.953, 7.980 max_d=7.980 avg_d=0.680 std_dev=1.273
OP2	A	0, -0.536, 0.783, 2.102, 8.541 max_d=8.541 avg_d=0.783 std_dev=1.319

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.13	0.00	0.14	0.01	0.14	0.24	0.12
C2	0.02	0.00	0.14	0.09	0.01	0.10	0.01	0.24	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.18	0.16	0.14	0.23	0.01	0.12	0.32	0.16
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.07	0.01	0.03	0.12	0.06	0.10	0.10	0.17	0.14	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01	0.13	0.04	0.21	0.17	0.07
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.09	0.00	0.12	0.02	0.12	0.13	0.10	0.09	0.08	0.14	0.08	0.01	0.01	0.02	0.12	0.14	0.27	0.21	0.10
C4	0.01	0.01	0.07	0.09	0.00	0.08	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.11	0.09	0.08	0.27	0.01	0.15	0.35	0.19
C4'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.08	0.00	0.10	0.00	0.11	0.11	0.11	0.11	0.09	0.12	0.07	0.12	0.02	0.00	0.01	0.12	0.23	0.10	0.12
C5	0.01	0.01	0.03	0.12	0.00	0.10	0.00	0.27	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.13	0.05	0.04	0.37	0.01	0.30	0.44	0.30
C5'	0.09	0.24	0.12	0.02	0.23	0.00	0.27	0.00	0.29	0.24	0.28	0.23	0.21	0.28	0.19	0.07	0.11	0.01	0.01	0.31	0.09	0.13	0.01
C6	0.01	0.00	0.06	0.12	0.01	0.11	0.01	0.29	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.07	0.07	0.38	0.00	0.29	0.46	0.30
C8	0.01	0.01	0.10	0.13	0.00	0.11	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.18	0.08	0.08	0.41	0.01	0.41	0.47	0.36
N1	0.01	0.00	0.10	0.10	0.01	0.11	0.01	0.28	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.11	0.11	0.30	0.00	0.15	0.39	0.22
N2	0.02	0.00	0.17	0.09	0.01	0.11	0.01	0.23	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.23	0.20	0.17	0.18	0.01	0.20	0.29	0.17
N3	0.01	0.00	0.14	0.08	0.00	0.09	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.17	0.16	0.14	0.19	0.01	0.13	0.29	0.14
N7	0.01	0.01	0.07	0.14	0.00	0.12	0.00	0.28	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.18	0.07	0.04	0.44	0.01	0.47	0.52	0.41
N9	0.00	0.01	0.02	0.08	0.00	0.07	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.06	0.01	0.28	0.01	0.19	0.34	0.20
O2'	0.02	0.18	0.00	0.01	0.11	0.12	0.13	0.07	0.14	0.18	0.15	0.23	0.17	0.18	0.09	0.00	0.03	0.09	0.15	0.15	0.19	0.23	0.10
O3'	0.13	0.16	0.02	0.01	0.09	0.02	0.05	0.11	0.07	0.08	0.11	0.20	0.16	0.07	0.06	0.03	0.00	0.11	0.10	0.06	0.37	0.26	0.13
O4'	0.00	0.14	0.01	0.02	0.08	0.00	0.04	0.01	0.07	0.08	0.11	0.17	0.14	0.04	0.01	0.09	0.11	0.00	0.13	0.05	0.15	0.24	0.16
O5'	0.14	0.23	0.13	0.12	0.27	0.01	0.37	0.01	0.38	0.41	0.30	0.18	0.19	0.44	0.28	0.15	0.10	0.13	0.00	0.43	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.04	0.14	0.01	0.12	0.01	0.31	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.06	0.05	0.43	0.00	0.39	0.52	0.37
OP1	0.14	0.12	0.21	0.27	0.15	0.23	0.30	0.09	0.29	0.41	0.15	0.20	0.13	0.47	0.19	0.19	0.37	0.15	0.01	0.39	0.00	0.01	0.01
OP2	0.24	0.32	0.17	0.21	0.35	0.10	0.44	0.13	0.46	0.47	0.39	0.29	0.29	0.52	0.34	0.23	0.26	0.24	0.01	0.52	0.01	0.00	0.00
P	0.12	0.16	0.07	0.10	0.19	0.12	0.30	0.01	0.30	0.36	0.22	0.17	0.14	0.41	0.20	0.10	0.13	0.16	0.00	0.37	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.16	0.20	0.20	0.18	0.21	0.15	0.24	0.13	0.12	0.19	0.20	0.20	0.32	0.36	0.19	0.20	0.20	0.26	0.27
C2	0.18	0.10	0.18	0.19	0.17	0.17	0.20	0.18	0.21	0.13	0.14	0.23	0.18	0.18	0.22	0.17	0.21	0.33	0.45	0.35
C2'	0.12	0.15	0.13	0.16	0.16	0.18	0.16	0.22	0.15	0.12	0.18	0.18	0.20	0.27	0.39	0.17	0.22	0.18	0.32	0.29
C3'	0.16	0.19	0.15	0.35	0.21	0.35	0.20	0.37	0.19	0.18	0.21	0.22	0.20	0.22	0.59	0.25	0.19	0.33	0.15	0.19
C4	0.16	0.10	0.20	0.18	0.17	0.17	0.16	0.16	0.15	0.10	0.17	0.22	0.16	0.25	0.28	0.15	0.16	0.21	0.30	0.27
C4'	0.28	0.30	0.23	0.44	0.32	0.44	0.30	0.45	0.29	0.29	0.32	0.32	0.30	0.23	0.66	0.35	0.29	0.45	0.27	0.31
C5	0.17	0.08	0.24	0.21	0.18	0.17	0.18	0.16	0.16	0.12	0.15	0.23	0.13	0.27	0.28	0.14	0.16	0.21	0.27	0.26
C5'	0.40	0.44	0.35	0.56	0.44	0.51	0.41	0.52	0.39	0.41	0.45	0.44	0.45	0.32	0.78	0.41	0.40	0.60	0.45	0.45
C6	0.18	0.07	0.23	0.22	0.19	0.18	0.21	0.17	0.19	0.14	0.12	0.25	0.16	0.26	0.25	0.15	0.18	0.27	0.32	0.29
C8	0.14	0.13	0.24	0.21	0.18	0.19	0.15	0.19	0.13	0.11	0.18	0.22	0.17	0.32	0.34	0.15	0.16	0.16	0.18	0.22
N1	0.18	0.08	0.20	0.20	0.17	0.17	0.22	0.18	0.21	0.15	0.10	0.24	0.18	0.21	0.22	0.16	0.19	0.31	0.40	0.33
N2	0.18	0.13	0.17	0.19	0.17	0.20	0.22	0.22	0.22	0.15	0.16	0.24	0.19	0.16	0.20	0.19	0.25	0.40	0.56	0.41
N3	0.17	0.12	0.18	0.18	0.17	0.17	0.17	0.18	0.17	0.12	0.17	0.22	0.17	0.21	0.25	0.17	0.20	0.28	0.41	0.33
N7	0.16	0.11	0.26	0.22	0.19	0.19	0.17	0.18	0.15	0.12	0.17	0.23	0.13	0.31	0.32	0.14	0.17	0.19	0.21	0.24
N9	0.14	0.14	0.21	0.19	0.17	0.18	0.15	0.18	0.13	0.10	0.18	0.21	0.18	0.30	0.33	0.16	0.16	0.17	0.23	0.24
O2'	0.25	0.18	0.27	0.19	0.19	0.28	0.24	0.37	0.27	0.21	0.19	0.20	0.20	0.38	0.24	0.31	0.48	0.45	0.61	0.59
O3'	0.31	0.31	0.28	0.47	0.35	0.49	0.37	0.52	0.36	0.33	0.33	0.36	0.29	0.26	0.66	0.40	0.31	0.46	0.23	0.27
O4'	0.21	0.27	0.15	0.32	0.30	0.33	0.30	0.35	0.27	0.25	0.29	0.32	0.27	0.24	0.52	0.30	0.24	0.33	0.23	0.27
O5'	0.31	0.26	0.34	0.66	0.25	0.62	0.25	0.67	0.27	0.27	0.26	0.25	0.28	0.28	0.89	0.41	0.54	0.79	0.56	0.60
O6	0.19	0.11	0.26	0.25	0.21	0.19	0.22	0.19	0.20	0.16	0.13	0.27	0.17	0.28	0.26	0.16	0.19	0.29	0.33	0.30
OP1	0.49	0.26	0.51	0.92	0.32	0.95	0.45	1.08	0.51	0.42	0.23	0.29	0.17	0.30	0.98	0.69	0.97	1.37	1.07	1.13
OP2	0.61	0.53	0.76	1.05	0.50	0.88	0.52	0.95	0.55	0.56	0.50	0.47	0.53	0.68	1.20	0.64	0.89	1.33	1.11	1.07
P	0.55	0.37	0.64	1.00	0.37	0.91	0.45	0.97	0.50	0.47	0.33	0.33	0.33	0.49	1.19	0.66	0.87	1.23	0.99	1.01

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.11	0.00	0.09	0.10	0.16	0.14
C2	0.01	0.00	0.08	0.12	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.14	0.07	0.02	0.15	0.18	0.23	0.21
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.02	0.00	0.06	0.06	0.08	0.01	0.06	0.03	0.15	0.00	0.03	0.01	0.22	0.29	0.41	0.30
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.15	0.00	0.13	0.02	0.11	0.09	0.14	0.16	0.11	0.02	0.01	0.01	0.12	0.28	0.31	0.21
C4	0.01	0.01	0.02	0.15	0.00	0.08	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.12	0.08	0.01	0.13	0.31	0.33	0.27
C4'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.08	0.00	0.08	0.00	0.07	0.05	0.07	0.09	0.05	0.09	0.01	0.00	0.01	0.11	0.10	0.05
C5	0.01	0.01	0.06	0.13	0.00	0.08	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.07	0.03	0.13	0.37	0.42	0.33
C5'	0.02	0.10	0.06	0.02	0.14	0.00	0.14	0.00	0.11	0.07	0.12	0.16	0.09	0.04	0.07	0.01	0.01	0.06	0.04	0.01
C6	0.01	0.01	0.08	0.11	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.04	0.04	0.12	0.28	0.36	0.30
N1	0.00	0.01	0.01	0.09	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.05	0.01	0.10	0.13	0.20	0.18
N3	0.01	0.00	0.06	0.14	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.14	0.07	0.02	0.15	0.23	0.27	0.23
N4	0.01	0.01	0.03	0.16	0.00	0.09	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.13	0.09	0.02	0.14	0.37	0.38	0.30
O2	0.02	0.00	0.15	0.11	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.21	0.10	0.04	0.19	0.23	0.29	0.24
O2'	0.01	0.14	0.00	0.02	0.12	0.09	0.11	0.04	0.10	0.08	0.14	0.13	0.21	0.00	0.05	0.08	0.12	0.29	0.43	0.26
O3'	0.11	0.07	0.03	0.01	0.08	0.01	0.07	0.07	0.04	0.05	0.07	0.09	0.10	0.05	0.00	0.07	0.05	0.25	0.29	0.14
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.04	0.08	0.07	0.00	0.05	0.07	0.14	0.14
O5'	0.09	0.15	0.22	0.12	0.13	0.01	0.13	0.01	0.12	0.10	0.15	0.14	0.19	0.12	0.05	0.05	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.10	0.18	0.29	0.28	0.31	0.11	0.37	0.06	0.28	0.13	0.23	0.37	0.23	0.29	0.25	0.07	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.16	0.23	0.41	0.31	0.33	0.10	0.42	0.04	0.36	0.20	0.27	0.38	0.29	0.43	0.29	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.14	0.21	0.30	0.21	0.27	0.05	0.33	0.01	0.30	0.18	0.23	0.30	0.24	0.26	0.14	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00