Doublet Group distance statistics: 53191

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 6, 6, 11, 3, 8, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.006, 0.011, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.006 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.000, 0.005, 0.010, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.005 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.002, 0.008, 0.013, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.008 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.002, 0.008, 0.014, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.008 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.002, 0.009, 0.015, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.009 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.002, 0.009, 0.015, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.009 std_dev=0.007
N9	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.009 std_dev=0.007
N7	A	0, 0.002, 0.012, 0.022, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.012 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.002, 0.012, 0.022, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.012 std_dev=0.010
O6	A	0, 0.001, 0.011, 0.021, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.011 std_dev=0.010
C8	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.014 std_dev=0.010
N2	A	0, 0.003, 0.016, 0.029, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.016 std_dev=0.013
N1	B	0, 0.161, 0.345, 0.529, 0.809 max_d=0.809 avg_d=0.345 std_dev=0.184
C6	B	0, 0.173, 0.373, 0.573, 1.111 max_d=1.111 avg_d=0.373 std_dev=0.200
C2	B	0, 0.142, 0.373, 0.604, 1.057 max_d=1.057 avg_d=0.373 std_dev=0.231
C5	B	0, 0.141, 0.385, 0.629, 1.543 max_d=1.543 avg_d=0.385 std_dev=0.244
C4	B	0, 0.107, 0.361, 0.615, 1.602 max_d=1.602 avg_d=0.361 std_dev=0.254
N3	B	0, 0.122, 0.376, 0.631, 1.488 max_d=1.488 avg_d=0.376 std_dev=0.255
C1'	B	0, 0.122, 0.405, 0.688, 1.456 max_d=1.456 avg_d=0.405 std_dev=0.283
O2	B	0, 0.109, 0.462, 0.814, 1.879 max_d=1.879 avg_d=0.462 std_dev=0.352
N4	B	0, 0.012, 0.399, 0.787, 2.584 max_d=2.584 avg_d=0.399 std_dev=0.388
O4'	B	0, -0.046, 0.463, 0.972, 3.155 max_d=3.155 avg_d=0.463 std_dev=0.509
C2'	B	0, -0.057, 0.498, 1.054, 3.536 max_d=3.536 avg_d=0.498 std_dev=0.556
C4'	B	0, -0.206, 0.537, 1.280, 4.822 max_d=4.822 avg_d=0.537 std_dev=0.743
O4'	A	0, -0.413, 0.332, 1.078, 2.649 max_d=2.649 avg_d=0.332 std_dev=0.746
O2'	B	0, -0.142, 0.617, 1.375, 4.684 max_d=4.684 avg_d=0.617 std_dev=0.759
C2'	A	0, -0.402, 0.360, 1.122, 2.773 max_d=2.773 avg_d=0.360 std_dev=0.762
C3'	B	0, -0.271, 0.546, 1.362, 5.261 max_d=5.261 avg_d=0.546 std_dev=0.817
C4'	A	0, -0.482, 0.500, 1.481, 3.813 max_d=3.813 avg_d=0.500 std_dev=0.981
O2'	A	0, -0.516, 0.529, 1.574, 3.843 max_d=3.843 avg_d=0.529 std_dev=1.045
O3'	B	0, -0.385, 0.670, 1.725, 6.523 max_d=6.523 avg_d=0.670 std_dev=1.055
C3'	A	0, -0.512, 0.549, 1.611, 4.308 max_d=4.308 avg_d=0.549 std_dev=1.062
C5'	B	0, -0.440, 0.688, 1.816, 7.079 max_d=7.079 avg_d=0.688 std_dev=1.128
O5'	B	0, -0.526, 0.673, 1.873, 7.441 max_d=7.441 avg_d=0.673 std_dev=1.199
O3'	A	0, -0.556, 0.720, 1.996, 6.010 max_d=6.010 avg_d=0.720 std_dev=1.276
P	B	0, -0.782, 0.871, 2.524, 10.055 max_d=10.055 avg_d=0.871 std_dev=1.653
OP1	B	0, -0.682, 1.103, 2.888, 10.670 max_d=10.670 avg_d=1.103 std_dev=1.785
C5'	A	0, -0.927, 0.895, 2.717, 6.696 max_d=6.696 avg_d=0.895 std_dev=1.822
OP2	B	0, -0.875, 0.950, 2.776, 11.284 max_d=11.284 avg_d=0.950 std_dev=1.826
O5'	A	0, -1.069, 1.022, 3.113, 7.443 max_d=7.443 avg_d=1.022 std_dev=2.091
P	A	0, -1.565, 1.383, 4.332, 10.372 max_d=10.372 avg_d=1.383 std_dev=2.949
OP1	A	0, -1.637, 1.468, 4.574, 10.927 max_d=10.927 avg_d=1.468 std_dev=3.106
OP2	A	0, -1.843, 1.607, 5.058, 12.247 max_d=12.247 avg_d=1.607 std_dev=3.451

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01	0.15	0.00	0.14	0.02	0.19	0.21	0.13
C2	0.02	0.00	0.16	0.37	0.00	0.52	0.00	0.87	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.45	0.18	0.45	1.12	0.01	1.38	1.51	1.27
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.08	0.01	0.05	0.11	0.08	0.07	0.13	0.19	0.15	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.26	0.06	0.27	0.30	0.27
C3'	0.01	0.37	0.00	0.00	0.23	0.00	0.19	0.01	0.25	0.10	0.33	0.43	0.35	0.10	0.09	0.01	0.01	0.02	0.14	0.23	0.29	0.15	0.16
C4	0.01	0.00	0.08	0.23	0.00	0.24	0.00	0.32	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.26	0.10	0.22	0.45	0.01	0.55	0.57	0.44
C4'	0.01	0.52	0.01	0.00	0.24	0.00	0.11	0.00	0.21	0.25	0.39	0.66	0.50	0.16	0.03	0.16	0.01	0.00	0.01	0.15	0.08	0.15	0.02
C5	0.01	0.00	0.05	0.19	0.00	0.11	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.21	0.09	0.08	0.32	0.01	0.47	0.37	0.30
C5'	0.05	0.87	0.11	0.01	0.32	0.00	0.14	0.00	0.30	0.50	0.63	1.16	0.79	0.37	0.10	0.05	0.12	0.01	0.01	0.21	0.10	0.13	0.01
C6	0.02	0.00	0.08	0.25	0.01	0.21	0.00	0.30	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.29	0.13	0.17	0.48	0.00	0.68	0.67	0.51
C8	0.01	0.01	0.07	0.10	0.00	0.25	0.00	0.50	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.13	0.09	0.24	0.67	0.01	0.82	0.67	0.75
N1	0.02	0.00	0.13	0.33	0.01	0.39	0.00	0.63	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.39	0.17	0.33	0.85	0.00	1.13	1.22	0.98
N2	0.03	0.00	0.19	0.43	0.01	0.66	0.01	1.16	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.53	0.22	0.54	1.45	0.01	1.83	2.08	1.74
N3	0.02	0.00	0.15	0.35	0.00	0.50	0.00	0.79	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.41	0.15	0.46	0.99	0.01	1.10	1.21	1.04
N7	0.00	0.00	0.04	0.10	0.00	0.16	0.00	0.37	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.12	0.08	0.13	0.53	0.01	0.73	0.51	0.62
N9	0.00	0.01	0.02	0.09	0.00	0.03	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.08	0.01	0.23	0.01	0.33	0.24	0.23
O2'	0.01	0.45	0.00	0.01	0.26	0.16	0.21	0.05	0.29	0.13	0.39	0.53	0.41	0.12	0.10	0.00	0.02	0.10	0.17	0.27	0.21	0.25	0.22
O3'	0.15	0.18	0.01	0.01	0.10	0.01	0.09	0.12	0.13	0.09	0.17	0.22	0.15	0.08	0.08	0.02	0.00	0.10	0.17	0.14	0.45	0.10	0.29
O4'	0.00	0.45	0.01	0.02	0.22	0.00	0.08	0.01	0.17	0.24	0.33	0.54	0.46	0.13	0.01	0.10	0.10	0.00	0.06	0.12	0.16	0.21	0.11
O5'	0.14	1.12	0.26	0.14	0.45	0.01	0.32	0.01	0.48	0.67	0.85	1.45	0.99	0.53	0.23	0.17	0.17	0.06	0.00	0.41	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.06	0.23	0.01	0.15	0.01	0.21	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.27	0.14	0.12	0.41	0.00	0.63	0.56	0.43
OP1	0.19	1.38	0.27	0.29	0.55	0.08	0.47	0.10	0.68	0.82	1.13	1.83	1.10	0.73	0.33	0.21	0.45	0.16	0.01	0.63	0.00	0.00	0.00
OP2	0.21	1.51	0.30	0.15	0.57	0.15	0.37	0.13	0.67	0.67	1.22	2.08	1.21	0.51	0.24	0.25	0.10	0.21	0.01	0.56	0.00	0.00	0.00
P	0.13	1.27	0.27	0.16	0.44	0.02	0.30	0.01	0.51	0.75	0.98	1.74	1.04	0.62	0.23	0.22	0.29	0.11	0.00	0.43	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.26	0.28	0.21	0.27	0.19	0.45	0.22	0.75	0.17	0.20	0.24	0.23	0.38	0.37	0.18	0.42	0.82	1.06	1.11	1.11
C2	0.18	0.26	0.21	0.18	0.16	0.28	0.15	0.51	0.14	0.17	0.27	0.16	0.34	0.44	0.17	0.26	0.68	0.92	1.12	0.97
C2'	0.64	0.48	0.63	0.94	0.36	1.12	0.47	1.48	0.58	0.57	0.38	0.31	0.51	0.45	0.83	1.02	1.52	1.77	1.72	1.80
C3'	0.42	0.41	0.41	0.73	0.50	0.86	0.60	1.32	0.57	0.45	0.42	0.51	0.41	0.32	0.59	0.73	1.50	1.89	1.98	1.96
C4	0.18	0.27	0.22	0.16	0.12	0.29	0.15	0.52	0.13	0.16	0.25	0.13	0.36	0.46	0.17	0.29	0.66	0.84	0.99	0.91
C4'	0.58	0.42	0.54	0.33	0.15	0.46	0.14	0.73	0.22	0.40	0.29	0.17	0.56	0.81	0.30	0.51	0.90	1.29	1.43	1.35
C5	0.16	0.23	0.29	0.15	0.11	0.20	0.19	0.37	0.15	0.13	0.21	0.15	0.34	0.54	0.26	0.24	0.53	0.66	0.77	0.72
C5'	1.00	0.68	1.02	0.70	0.20	0.74	0.17	0.66	0.35	0.67	0.43	0.25	0.91	1.41	0.81	0.82	0.77	1.18	1.44	1.24
C6	0.15	0.21	0.30	0.16	0.15	0.18	0.20	0.32	0.14	0.12	0.20	0.22	0.31	0.55	0.27	0.20	0.51	0.63	0.76	0.69
C8	0.19	0.26	0.30	0.17	0.12	0.25	0.22	0.43	0.20	0.16	0.20	0.13	0.39	0.53	0.30	0.31	0.52	0.64	0.68	0.70
N1	0.15	0.23	0.25	0.14	0.14	0.21	0.17	0.39	0.13	0.14	0.23	0.16	0.32	0.49	0.20	0.21	0.58	0.76	0.93	0.81
N2	0.19	0.27	0.19	0.23	0.19	0.31	0.16	0.55	0.15	0.18	0.28	0.21	0.34	0.41	0.20	0.27	0.72	1.01	1.23	1.04
N3	0.20	0.28	0.19	0.21	0.17	0.34	0.14	0.59	0.13	0.18	0.28	0.19	0.35	0.41	0.17	0.31	0.74	0.99	1.18	1.05
N7	0.18	0.22	0.35	0.21	0.16	0.20	0.23	0.32	0.20	0.14	0.20	0.19	0.36	0.60	0.37	0.25	0.46	0.55	0.60	0.61
N9	0.21	0.27	0.23	0.17	0.13	0.33	0.19	0.57	0.15	0.17	0.23	0.15	0.38	0.44	0.18	0.34	0.68	0.85	0.94	0.92
O2'	0.87	0.52	0.91	1.25	0.27	1.48	0.37	1.83	0.57	0.65	0.34	0.25	0.60	0.81	1.20	1.29	1.69	2.01	1.74	1.93
O3'	0.61	0.49	0.68	1.08	0.48	1.20	0.60	1.72	0.65	0.58	0.44	0.44	0.48	0.47	0.99	0.95	1.85	2.42	2.28	2.40
O4'	0.70	0.56	0.68	0.44	0.33	0.42	0.39	0.48	0.51	0.59	0.43	0.22	0.63	0.89	0.50	0.52	0.62	0.83	1.01	0.92
O5'	0.94	0.68	0.98	0.58	0.41	0.59	0.41	0.50	0.29	0.61	0.47	0.59	0.96	1.45	0.74	0.70	0.69	1.16	1.54	1.25
O6	0.15	0.17	0.35	0.23	0.22	0.18	0.24	0.26	0.16	0.12	0.18	0.33	0.27	0.59	0.34	0.19	0.47	0.55	0.64	0.60
OP1	1.06	0.77	1.17	0.78	0.80	0.72	0.89	0.44	0.56	0.68	0.62	1.11	1.16	1.74	1.03	0.79	0.68	1.15	1.76	1.27
OP2	1.30	0.76	1.45	1.12	0.38	1.15	0.40	0.79	0.32	0.76	0.40	0.74	1.16	2.08	1.39	1.12	0.59	0.92	1.37	1.00
P	1.02	0.67	1.13	0.71	0.48	0.71	0.57	0.47	0.29	0.59	0.41	0.78	1.05	1.71	0.95	0.78	0.63	1.19	1.69	1.27

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.09	0.00	0.10	0.15	0.10	0.10
C2	0.01	0.00	0.12	0.09	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.14	0.12	0.06	0.27	0.30	0.24	0.28
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.03	0.01	0.10	0.03	0.12	0.01	0.09	0.03	0.23	0.00	0.01	0.01	0.18	0.25	0.12	0.16
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.16	0.00	0.27	0.02	0.28	0.10	0.08	0.17	0.23	0.01	0.00	0.01	0.23	0.30	0.11	0.19
C4	0.01	0.01	0.03	0.16	0.00	0.09	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.12	0.11	0.02	0.36	0.36	0.56	0.42
C4'	0.00	0.07	0.01	0.00	0.09	0.00	0.17	0.00	0.18	0.05	0.06	0.10	0.17	0.10	0.01	0.00	0.01	0.12	0.15	0.03
C5	0.01	0.01	0.10	0.27	0.00	0.17	0.00	0.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.11	0.21	0.06	0.50	0.47	0.77	0.58
C5'	0.02	0.13	0.03	0.02	0.18	0.00	0.30	0.00	0.29	0.10	0.12	0.19	0.26	0.08	0.06	0.01	0.01	0.12	0.23	0.01
C6	0.01	0.01	0.12	0.28	0.00	0.18	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.20	0.08	0.47	0.41	0.63	0.51
N1	0.00	0.01	0.01	0.10	0.01	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.05	0.01	0.24	0.23	0.28	0.24
N3	0.01	0.00	0.09	0.08	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.09	0.04	0.29	0.32	0.34	0.32
N4	0.01	0.01	0.03	0.17	0.00	0.10	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.14	0.13	0.02	0.39	0.41	0.65	0.47
O2	0.02	0.00	0.23	0.23	0.01	0.17	0.01	0.26	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.19	0.26	0.11	0.40	0.43	0.38	0.43
O2'	0.01	0.14	0.00	0.01	0.12	0.10	0.11	0.08	0.09	0.08	0.15	0.14	0.19	0.00	0.04	0.07	0.06	0.21	0.10	0.08
O3'	0.09	0.12	0.01	0.00	0.11	0.01	0.21	0.06	0.20	0.05	0.09	0.13	0.26	0.04	0.00	0.06	0.22	0.39	0.13	0.23
O4'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.02	0.00	0.06	0.01	0.08	0.01	0.04	0.02	0.11	0.07	0.06	0.00	0.05	0.08	0.15	0.07
O5'	0.10	0.27	0.18	0.23	0.36	0.01	0.50	0.01	0.47	0.24	0.29	0.39	0.40	0.06	0.22	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.15	0.30	0.25	0.30	0.36	0.12	0.47	0.12	0.41	0.23	0.32	0.41	0.43	0.21	0.39	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.24	0.12	0.11	0.56	0.15	0.77	0.23	0.63	0.28	0.34	0.65	0.38	0.10	0.13	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.28	0.16	0.19	0.42	0.03	0.58	0.01	0.51	0.24	0.32	0.47	0.43	0.08	0.23	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00