Doublet Group distance statistics: 53193

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 2, 5, 3, 3, 2, 1, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.008, 0.013, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.008 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.010 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.004, 0.011, 0.018, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.011 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.005, 0.013, 0.021, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.003, 0.012, 0.021, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.004, 0.014, 0.025, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.014 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.005, 0.017, 0.030, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.017 std_dev=0.012
N2	A	0, 0.008, 0.025, 0.041, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.025 std_dev=0.016
O6	A	0, 0.006, 0.023, 0.040, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.023 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.005, 0.025, 0.045, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.025 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.006, 0.030, 0.053, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.030 std_dev=0.023
O4'	A	0, 0.025, 0.220, 0.416, 0.738 max_d=0.738 avg_d=0.220 std_dev=0.196
C2'	A	0, 0.035, 0.247, 0.460, 0.780 max_d=0.780 avg_d=0.247 std_dev=0.212
C2	B	0, 0.162, 0.375, 0.589, 0.910 max_d=0.910 avg_d=0.375 std_dev=0.213
N3	B	0, 0.132, 0.352, 0.571, 0.876 max_d=0.876 avg_d=0.352 std_dev=0.219
C4	B	0, 0.140, 0.375, 0.610, 0.901 max_d=0.901 avg_d=0.375 std_dev=0.235
N1	B	0, 0.137, 0.387, 0.637, 0.953 max_d=0.953 avg_d=0.387 std_dev=0.250
O2'	A	0, 0.048, 0.303, 0.558, 0.888 max_d=0.888 avg_d=0.303 std_dev=0.255
O2	B	0, 0.207, 0.465, 0.724, 0.965 max_d=0.965 avg_d=0.465 std_dev=0.258
N4	B	0, 0.169, 0.429, 0.689, 1.020 max_d=1.020 avg_d=0.429 std_dev=0.260
C5	B	0, 0.200, 0.463, 0.726, 0.997 max_d=0.997 avg_d=0.463 std_dev=0.263
C4'	A	0, 0.062, 0.337, 0.613, 1.102 max_d=1.102 avg_d=0.337 std_dev=0.275
C6	B	0, 0.174, 0.450, 0.725, 1.186 max_d=1.186 avg_d=0.450 std_dev=0.275
C1'	B	0, 0.169, 0.466, 0.764, 1.184 max_d=1.184 avg_d=0.466 std_dev=0.298
C3'	A	0, 0.072, 0.394, 0.716, 1.242 max_d=1.242 avg_d=0.394 std_dev=0.322
O4'	B	0, 0.150, 0.486, 0.822, 1.379 max_d=1.379 avg_d=0.486 std_dev=0.336
C2'	B	0, 0.184, 0.538, 0.892, 1.457 max_d=1.457 avg_d=0.538 std_dev=0.354
C3'	B	0, 0.170, 0.527, 0.885, 1.686 max_d=1.686 avg_d=0.527 std_dev=0.357
C4'	B	0, 0.152, 0.523, 0.894, 1.694 max_d=1.694 avg_d=0.523 std_dev=0.371
C5'	B	0, 0.116, 0.552, 0.988, 1.884 max_d=1.884 avg_d=0.552 std_dev=0.436
O3'	A	0, 0.127, 0.573, 1.020, 1.703 max_d=1.703 avg_d=0.573 std_dev=0.446
O3'	B	0, 0.256, 0.708, 1.160, 1.946 max_d=1.946 avg_d=0.708 std_dev=0.452
O2'	B	0, 0.234, 0.692, 1.149, 1.578 max_d=1.578 avg_d=0.692 std_dev=0.457
C5'	A	0, 0.074, 0.605, 1.135, 1.994 max_d=1.994 avg_d=0.605 std_dev=0.530
O5'	A	0, 0.103, 0.673, 1.243, 1.649 max_d=1.649 avg_d=0.673 std_dev=0.570
O5'	B	0, 0.055, 0.629, 1.202, 2.476 max_d=2.476 avg_d=0.629 std_dev=0.574
P	B	0, -0.110, 0.806, 1.722, 4.510 max_d=4.510 avg_d=0.806 std_dev=0.916
OP1	B	0, -0.080, 0.950, 1.980, 5.012 max_d=5.012 avg_d=0.950 std_dev=1.030
OP1	A	0, -0.001, 1.114, 2.230, 3.592 max_d=3.592 avg_d=1.114 std_dev=1.116
P	A	0, -0.114, 1.101, 2.315, 3.655 max_d=3.655 avg_d=1.101 std_dev=1.214
OP2	B	0, -0.435, 0.925, 2.286, 6.913 max_d=6.913 avg_d=0.925 std_dev=1.360
OP2	A	0, -0.593, 1.596, 3.785, 6.254 max_d=6.254 avg_d=1.596 std_dev=2.189

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.15	0.01	0.11	0.42	0.10
C2	0.02	0.00	0.15	0.20	0.01	0.09	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.23	0.03	0.36	0.01	0.31	0.31	0.31
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.06	0.01	0.03	0.01	0.05	0.09	0.10	0.18	0.15	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01	0.25	0.04	0.27	0.48	0.10
C3'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.09	0.00	0.07	0.02	0.10	0.14	0.16	0.24	0.18	0.11	0.04	0.01	0.01	0.02	0.36	0.10	0.51	0.33	0.17
C4	0.01	0.01	0.06	0.09	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.09	0.01	0.38	0.01	0.31	0.36	0.36
C4'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.07	0.07	0.08	0.10	0.08	0.07	0.03	0.03	0.02	0.00	0.01	0.08	0.11	0.71	0.24
C5	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.06	0.00	0.14	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.07	0.01	0.48	0.01	0.45	0.75	0.58
C5'	0.02	0.15	0.01	0.02	0.11	0.00	0.14	0.00	0.16	0.11	0.16	0.15	0.12	0.13	0.08	0.03	0.03	0.01	0.01	0.18	0.32	0.34	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.07	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.11	0.01	0.50	0.00	0.51	0.83	0.63
C8	0.01	0.01	0.09	0.14	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.16	0.03	0.48	0.01	0.40	0.73	0.58
N1	0.02	0.01	0.10	0.16	0.01	0.08	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.18	0.02	0.44	0.01	0.43	0.57	0.48
N2	0.03	0.01	0.18	0.24	0.01	0.10	0.01	0.15	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.15	0.30	0.04	0.33	0.02	0.28	0.27	0.24
N3	0.02	0.01	0.15	0.18	0.00	0.08	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.20	0.03	0.31	0.01	0.24	0.24	0.23
N7	0.01	0.01	0.07	0.11	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.13	0.03	0.54	0.01	0.52	1.02	0.73
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.34	0.01	0.25	0.28	0.30
O2'	0.02	0.11	0.00	0.01	0.04	0.03	0.03	0.03	0.04	0.06	0.07	0.15	0.10	0.05	0.02	0.00	0.03	0.03	0.07	0.03	0.16	0.97	0.34
O3'	0.02	0.23	0.02	0.01	0.09	0.02	0.07	0.03	0.11	0.16	0.18	0.30	0.20	0.13	0.04	0.03	0.00	0.02	0.31	0.11	0.62	0.59	0.21
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.04	0.03	0.03	0.01	0.03	0.02	0.00	0.07	0.02	0.17	0.55	0.21
O5'	0.15	0.36	0.25	0.36	0.38	0.01	0.48	0.01	0.50	0.48	0.44	0.33	0.31	0.54	0.34	0.07	0.31	0.07	0.00	0.54	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.04	0.10	0.01	0.08	0.01	0.18	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.11	0.02	0.54	0.00	0.60	1.08	0.76
OP1	0.11	0.31	0.27	0.51	0.31	0.11	0.45	0.32	0.51	0.40	0.43	0.28	0.24	0.52	0.25	0.16	0.62	0.17	0.01	0.60	0.00	0.01	0.01
OP2	0.42	0.31	0.48	0.33	0.36	0.71	0.75	0.34	0.83	0.73	0.57	0.27	0.24	1.02	0.28	0.97	0.59	0.55	0.02	1.08	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.31	0.10	0.17	0.36	0.24	0.58	0.01	0.63	0.58	0.48	0.24	0.23	0.73	0.30	0.34	0.21	0.21	0.00	0.76	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.16	0.34	0.30	0.20	0.27	0.20	0.20	0.17	0.17	0.16	0.27	0.26	0.44	0.36	0.22	0.17	0.23	0.30	0.16
C2	0.30	0.16	0.33	0.28	0.25	0.28	0.28	0.21	0.24	0.19	0.16	0.32	0.32	0.43	0.30	0.27	0.17	0.19	0.17	0.14
C2'	0.33	0.20	0.43	0.39	0.14	0.38	0.14	0.32	0.15	0.20	0.14	0.23	0.36	0.57	0.48	0.32	0.27	0.35	0.40	0.24
C3'	0.31	0.18	0.38	0.35	0.14	0.36	0.14	0.31	0.15	0.19	0.12	0.24	0.30	0.51	0.42	0.32	0.26	0.32	0.35	0.22
C4	0.27	0.18	0.32	0.27	0.18	0.26	0.20	0.19	0.18	0.18	0.12	0.28	0.33	0.42	0.30	0.25	0.19	0.17	0.18	0.16
C4'	0.23	0.17	0.32	0.30	0.21	0.27	0.20	0.20	0.18	0.17	0.18	0.28	0.22	0.41	0.36	0.21	0.16	0.26	0.35	0.18
C5	0.29	0.22	0.31	0.25	0.15	0.26	0.19	0.20	0.18	0.21	0.13	0.25	0.35	0.40	0.26	0.26	0.24	0.19	0.27	0.26
C5'	0.24	0.19	0.33	0.31	0.20	0.27	0.19	0.20	0.18	0.19	0.19	0.25	0.24	0.40	0.35	0.23	0.19	0.23	0.29	0.17
C6	0.30	0.23	0.29	0.23	0.15	0.26	0.21	0.21	0.20	0.22	0.14	0.27	0.35	0.37	0.23	0.28	0.26	0.21	0.36	0.32
C8	0.27	0.21	0.32	0.28	0.15	0.26	0.16	0.19	0.16	0.20	0.14	0.23	0.33	0.41	0.30	0.25	0.24	0.19	0.23	0.22
N1	0.30	0.19	0.30	0.24	0.20	0.27	0.26	0.21	0.22	0.20	0.11	0.31	0.33	0.39	0.24	0.29	0.22	0.17	0.26	0.24
N2	0.32	0.18	0.35	0.31	0.29	0.32	0.34	0.25	0.30	0.22	0.21	0.34	0.30	0.46	0.33	0.29	0.18	0.27	0.25	0.16
N3	0.28	0.16	0.34	0.29	0.23	0.28	0.25	0.21	0.21	0.18	0.16	0.31	0.32	0.45	0.32	0.25	0.16	0.21	0.22	0.13
N7	0.29	0.24	0.31	0.26	0.15	0.25	0.17	0.20	0.18	0.22	0.16	0.22	0.35	0.40	0.27	0.26	0.27	0.22	0.32	0.29
N9	0.26	0.18	0.33	0.28	0.17	0.26	0.18	0.19	0.16	0.18	0.13	0.26	0.31	0.43	0.32	0.24	0.20	0.18	0.20	0.16
O2'	0.32	0.21	0.46	0.43	0.17	0.38	0.16	0.32	0.15	0.19	0.17	0.25	0.35	0.60	0.54	0.29	0.27	0.43	0.56	0.33
O3'	0.36	0.20	0.44	0.42	0.13	0.43	0.14	0.39	0.17	0.22	0.12	0.24	0.33	0.58	0.51	0.38	0.32	0.42	0.45	0.30
O4'	0.25	0.21	0.33	0.32	0.26	0.27	0.25	0.20	0.23	0.21	0.23	0.32	0.24	0.41	0.35	0.22	0.18	0.23	0.31	0.19
O5'	0.32	0.36	0.37	0.35	0.51	0.32	0.49	0.28	0.40	0.35	0.44	0.62	0.33	0.43	0.37	0.30	0.30	0.31	0.38	0.34
O6	0.30	0.26	0.28	0.22	0.15	0.26	0.21	0.24	0.22	0.24	0.19	0.25	0.34	0.34	0.21	0.30	0.31	0.29	0.52	0.42
OP1	0.34	0.24	0.47	0.42	0.33	0.36	0.31	0.27	0.24	0.24	0.25	0.46	0.33	0.63	0.52	0.30	0.24	0.26	0.27	0.22
OP2	0.41	0.34	0.52	0.44	0.73	0.47	0.62	0.36	0.38	0.30	0.56	1.04	0.39	0.81	0.56	0.40	0.33	0.28	0.44	0.35
P	0.27	0.33	0.34	0.30	0.60	0.28	0.53	0.22	0.38	0.29	0.49	0.79	0.29	0.49	0.36	0.25	0.27	0.25	0.38	0.31

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.06	0.00	0.13	0.08	0.23	0.07
C2	0.01	0.00	0.09	0.09	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.11	0.03	0.26	0.24	0.23	0.24
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.06	0.02	0.07	0.02	0.07	0.03	0.08	0.07	0.15	0.00	0.06	0.01	0.19	0.20	0.30	0.12
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.08	0.01	0.10	0.02	0.10	0.05	0.09	0.09	0.13	0.02	0.02	0.02	0.26	0.31	0.25	0.17
C4	0.01	0.01	0.06	0.08	0.00	0.05	0.00	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.11	0.02	0.37	0.42	0.62	0.49
C4'	0.00	0.03	0.02	0.01	0.05	0.00	0.06	0.00	0.06	0.03	0.03	0.05	0.04	0.05	0.04	0.00	0.01	0.07	0.40	0.14
C5	0.01	0.01	0.07	0.10	0.00	0.06	0.00	0.15	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.13	0.03	0.39	0.44	0.69	0.54
C5'	0.03	0.08	0.02	0.02	0.13	0.00	0.15	0.00	0.13	0.08	0.10	0.14	0.05	0.05	0.07	0.01	0.01	0.18	0.21	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.10	0.01	0.06	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.12	0.03	0.34	0.33	0.46	0.41
N1	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.25	0.21	0.21	0.23
N3	0.01	0.00	0.08	0.09	0.00	0.03	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.11	0.03	0.32	0.33	0.42	0.37
N4	0.01	0.01	0.07	0.09	0.00	0.05	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.13	0.03	0.40	0.49	0.75	0.57
O2	0.02	0.01	0.15	0.13	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.14	0.17	0.04	0.20	0.17	0.18	0.14
O2'	0.03	0.09	0.00	0.02	0.06	0.05	0.05	0.05	0.05	0.03	0.08	0.06	0.14	0.00	0.13	0.04	0.08	0.14	0.57	0.23
O3'	0.06	0.11	0.06	0.02	0.11	0.04	0.13	0.07	0.12	0.05	0.11	0.13	0.17	0.13	0.00	0.05	0.26	0.39	0.43	0.26
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.04	0.04	0.05	0.00	0.07	0.07	0.28	0.10
O5'	0.13	0.26	0.19	0.26	0.37	0.01	0.39	0.01	0.34	0.25	0.32	0.40	0.20	0.08	0.26	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.08	0.24	0.20	0.31	0.42	0.07	0.44	0.18	0.33	0.21	0.33	0.49	0.17	0.14	0.39	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.23	0.23	0.30	0.25	0.62	0.40	0.69	0.21	0.46	0.21	0.42	0.75	0.18	0.57	0.43	0.28	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.07	0.24	0.12	0.17	0.49	0.14	0.54	0.01	0.41	0.23	0.37	0.57	0.14	0.23	0.26	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00