Doublet Group distance statistics: 53197

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 6, 2, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.005, 0.011, 0.016, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.011 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.005, 0.010, 0.015, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.010 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.009, 0.016, 0.023, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.016 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.007, 0.015, 0.023, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.015 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.005, 0.015, 0.025, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.015 std_dev=0.010
N2	A	0, 0.011, 0.024, 0.038, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.024 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.013, 0.027, 0.042, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.027 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.008, 0.023, 0.037, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.023 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.003, 0.023, 0.042, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.023 std_dev=0.020
O6	A	0, 0.026, 0.050, 0.073, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.050 std_dev=0.023
N7	A	0, 0.019, 0.051, 0.084, 0.116 max_d=0.116 avg_d=0.051 std_dev=0.033
C8	A	0, 0.010, 0.046, 0.083, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.046 std_dev=0.036
C4	B	0, 0.162, 0.300, 0.438, 0.597 max_d=0.597 avg_d=0.300 std_dev=0.138
N4	B	0, 0.183, 0.333, 0.482, 0.585 max_d=0.585 avg_d=0.333 std_dev=0.150
C5	B	0, 0.165, 0.318, 0.471, 0.583 max_d=0.583 avg_d=0.318 std_dev=0.153
N3	B	0, 0.140, 0.312, 0.483, 0.627 max_d=0.627 avg_d=0.312 std_dev=0.171
C6	B	0, 0.141, 0.328, 0.515, 0.644 max_d=0.644 avg_d=0.328 std_dev=0.187
C2	B	0, 0.135, 0.323, 0.512, 0.649 max_d=0.649 avg_d=0.323 std_dev=0.189
N1	B	0, 0.129, 0.324, 0.520, 0.648 max_d=0.648 avg_d=0.324 std_dev=0.195
O2	B	0, 0.167, 0.387, 0.606, 0.839 max_d=0.839 avg_d=0.387 std_dev=0.219
C1'	B	0, 0.142, 0.386, 0.630, 0.866 max_d=0.866 avg_d=0.386 std_dev=0.244
O4'	B	0, -0.060, 0.559, 1.177, 2.464 max_d=2.464 avg_d=0.559 std_dev=0.619
C2'	B	0, -0.102, 0.518, 1.137, 2.485 max_d=2.485 avg_d=0.518 std_dev=0.619
O4'	A	0, -0.284, 0.387, 1.058, 2.600 max_d=2.600 avg_d=0.387 std_dev=0.671
C2'	A	0, -0.355, 0.382, 1.119, 2.814 max_d=2.814 avg_d=0.382 std_dev=0.737
C4'	B	0, -0.137, 0.627, 1.390, 3.035 max_d=3.035 avg_d=0.627 std_dev=0.764
O2'	B	0, -0.117, 0.721, 1.560, 3.412 max_d=3.412 avg_d=0.721 std_dev=0.838
O2'	A	0, -0.454, 0.427, 1.308, 3.337 max_d=3.337 avg_d=0.427 std_dev=0.881
C3'	B	0, -0.281, 0.619, 1.518, 3.527 max_d=3.527 avg_d=0.619 std_dev=0.899
C4'	A	0, -0.335, 0.584, 1.503, 3.611 max_d=3.611 avg_d=0.584 std_dev=0.919
C3'	A	0, -0.471, 0.628, 1.727, 4.255 max_d=4.255 avg_d=0.628 std_dev=1.099
O3'	B	0, -0.461, 0.858, 2.176, 5.166 max_d=5.166 avg_d=0.858 std_dev=1.319
O3'	A	0, -0.691, 0.845, 2.381, 5.915 max_d=5.915 avg_d=0.845 std_dev=1.536
C5'	B	0, -0.713, 0.866, 2.444, 6.032 max_d=6.032 avg_d=0.866 std_dev=1.579
C5'	A	0, -0.686, 0.998, 2.681, 6.551 max_d=6.551 avg_d=0.998 std_dev=1.684
O5'	B	0, -1.008, 0.878, 2.764, 7.096 max_d=7.096 avg_d=0.878 std_dev=1.886
O5'	A	0, -1.006, 1.033, 3.073, 7.778 max_d=7.778 avg_d=1.033 std_dev=2.040
P	B	0, -1.470, 1.245, 3.961, 10.196 max_d=10.196 avg_d=1.245 std_dev=2.716
P	A	0, -1.503, 1.354, 4.211, 10.802 max_d=10.802 avg_d=1.354 std_dev=2.857
OP2	B	0, -1.542, 1.466, 4.474, 11.373 max_d=11.373 avg_d=1.466 std_dev=3.008
OP1	B	0, -1.603, 1.513, 4.629, 11.765 max_d=11.765 avg_d=1.513 std_dev=3.116
OP2	A	0, -1.725, 1.407, 4.539, 11.768 max_d=11.768 avg_d=1.407 std_dev=3.132
OP1	A	0, -1.610, 1.555, 4.721, 12.019 max_d=12.019 avg_d=1.555 std_dev=3.165

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.01	0.03	0.09	0.08
C2	0.02	0.00	0.07	0.33	0.00	0.45	0.00	0.75	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.29	0.29	0.37	0.91	0.01	1.01	1.17	1.03
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.03	0.05	0.08	0.06	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.04	0.12	0.06	0.04
C3'	0.00	0.33	0.00	0.00	0.12	0.00	0.03	0.01	0.08	0.27	0.23	0.44	0.32	0.20	0.06	0.01	0.00	0.01	0.05	0.04	0.15	0.05	0.07
C4	0.01	0.00	0.04	0.12	0.00	0.17	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.10	0.17	0.26	0.00	0.28	0.26	0.23
C4'	0.00	0.45	0.01	0.00	0.17	0.00	0.03	0.00	0.12	0.32	0.31	0.59	0.43	0.23	0.06	0.03	0.03	0.01	0.01	0.06	0.04	0.02	0.01
C5	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.03	0.04	0.09	0.01	0.10	0.17	0.16
C5'	0.02	0.75	0.01	0.01	0.25	0.00	0.06	0.00	0.19	0.51	0.52	1.03	0.69	0.40	0.10	0.03	0.02	0.01	0.00	0.10	0.05	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.08	0.00	0.12	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.08	0.12	0.19	0.00	0.21	0.20	0.17
C8	0.01	0.01	0.03	0.27	0.00	0.32	0.00	0.51	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	0.21	0.24	0.71	0.01	0.70	0.90	0.83
N1	0.01	0.00	0.05	0.23	0.00	0.31	0.01	0.52	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.21	0.21	0.26	0.61	0.00	0.69	0.79	0.68
N2	0.03	0.00	0.08	0.44	0.00	0.59	0.01	1.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.38	0.39	0.46	1.27	0.01	1.46	1.74	1.52
N3	0.02	0.00	0.06	0.32	0.00	0.43	0.00	0.69	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.27	0.26	0.38	0.82	0.00	0.86	0.94	0.86
N7	0.00	0.00	0.02	0.20	0.00	0.23	0.00	0.40	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.11	0.16	0.15	0.58	0.01	0.62	0.83	0.74
N9	0.00	0.01	0.01	0.06	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.03	0.17	0.01	0.14	0.24	0.22
O2'	0.01	0.29	0.00	0.01	0.12	0.03	0.04	0.03	0.10	0.17	0.21	0.38	0.27	0.11	0.02	0.00	0.03	0.03	0.03	0.07	0.15	0.04	0.05
O3'	0.01	0.29	0.01	0.00	0.10	0.03	0.03	0.02	0.08	0.21	0.21	0.39	0.26	0.16	0.04	0.03	0.00	0.02	0.07	0.05	0.25	0.10	0.14
O4'	0.00	0.37	0.01	0.01	0.17	0.01	0.04	0.01	0.12	0.24	0.26	0.46	0.38	0.15	0.03	0.03	0.02	0.00	0.05	0.07	0.06	0.07	0.08
O5'	0.06	0.91	0.03	0.05	0.26	0.01	0.09	0.00	0.19	0.71	0.61	1.27	0.82	0.58	0.17	0.03	0.07	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.04	0.04	0.00	0.06	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.05	0.07	0.09	0.00	0.11	0.13	0.12
OP1	0.03	1.01	0.12	0.15	0.28	0.04	0.10	0.05	0.21	0.70	0.69	1.46	0.86	0.62	0.14	0.15	0.25	0.06	0.01	0.11	0.00	0.00	0.00
OP2	0.09	1.17	0.06	0.05	0.26	0.02	0.17	0.02	0.20	0.90	0.79	1.74	0.94	0.83	0.24	0.04	0.10	0.07	0.01	0.13	0.00	0.00	0.00
P	0.08	1.03	0.04	0.07	0.23	0.01	0.16	0.01	0.17	0.83	0.68	1.52	0.86	0.74	0.22	0.05	0.14	0.08	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.09	0.51	0.22	0.09	0.43	0.17	0.81	0.20	0.11	0.10	0.10	0.13	0.61	0.44	0.66	0.79	1.00	1.11	1.05
C2	0.14	0.14	0.25	0.11	0.14	0.27	0.16	0.49	0.16	0.14	0.15	0.15	0.16	0.31	0.21	0.39	0.54	0.56	1.22	0.77
C2'	0.65	0.42	0.09	0.38	0.45	1.06	0.66	1.49	0.77	0.62	0.36	0.37	0.34	0.18	0.11	1.26	1.45	1.66	1.61	1.67
C3'	0.30	0.25	0.32	0.03	0.56	0.65	0.82	1.17	0.76	0.43	0.33	0.58	0.13	0.56	0.35	0.85	1.28	1.70	1.66	1.70
C4	0.15	0.10	0.34	0.23	0.09	0.23	0.18	0.43	0.20	0.14	0.10	0.09	0.13	0.35	0.38	0.46	0.41	0.42	0.86	0.57
C4'	0.33	0.23	0.99	0.65	0.20	0.04	0.36	0.58	0.20	0.13	0.11	0.31	0.43	1.27	0.99	0.25	0.71	1.25	1.20	1.22
C5	0.20	0.15	0.25	0.31	0.08	0.11	0.16	0.15	0.20	0.18	0.11	0.06	0.17	0.18	0.44	0.35	0.10	0.23	0.39	0.13
C5'	0.74	0.47	1.44	1.19	0.19	0.57	0.35	0.03	0.08	0.39	0.20	0.41	0.77	1.78	1.63	0.27	0.23	0.88	0.87	0.82
C6	0.21	0.19	0.17	0.25	0.10	0.12	0.15	0.13	0.18	0.19	0.16	0.05	0.22	0.12	0.35	0.28	0.13	0.37	0.39	0.15
C8	0.21	0.10	0.41	0.47	0.08	0.10	0.17	0.16	0.22	0.17	0.10	0.09	0.15	0.29	0.66	0.46	0.07	0.13	0.20	0.07
N1	0.17	0.18	0.18	0.16	0.14	0.17	0.15	0.27	0.17	0.17	0.18	0.12	0.20	0.18	0.25	0.31	0.26	0.25	0.82	0.37
N2	0.12	0.14	0.24	0.08	0.16	0.32	0.16	0.60	0.15	0.13	0.17	0.20	0.16	0.34	0.13	0.40	0.69	0.77	1.49	0.99
N3	0.12	0.11	0.33	0.12	0.12	0.32	0.17	0.61	0.17	0.12	0.12	0.13	0.12	0.41	0.26	0.47	0.66	0.74	1.29	0.93
N7	0.24	0.13	0.28	0.46	0.08	0.11	0.16	0.13	0.22	0.20	0.10	0.09	0.17	0.13	0.60	0.33	0.29	0.46	0.15	0.31
N9	0.14	0.09	0.44	0.30	0.08	0.26	0.18	0.48	0.21	0.13	0.09	0.08	0.13	0.44	0.50	0.54	0.43	0.49	0.75	0.59
O2'	0.76	0.45	0.23	0.62	0.33	1.37	0.49	1.86	0.66	0.62	0.33	0.23	0.43	0.18	0.39	1.46	1.70	2.03	1.76	1.93
O3'	0.53	0.42	0.06	0.36	0.71	1.00	0.98	1.61	0.96	0.64	0.48	0.72	0.24	0.33	0.05	1.11	1.73	2.39	2.07	2.29
O4'	0.51	0.39	1.15	0.81	0.10	0.18	0.08	0.32	0.15	0.36	0.26	0.11	0.52	1.33	1.07	0.10	0.41	0.78	0.90	0.82
O5'	0.75	0.49	1.42	1.32	0.32	0.74	0.54	0.28	0.19	0.36	0.17	0.58	0.87	1.65	1.77	0.39	0.06	0.56	0.69	0.52
O6	0.24	0.22	0.13	0.29	0.10	0.16	0.13	0.23	0.17	0.21	0.17	0.07	0.26	0.14	0.37	0.21	0.35	0.73	0.16	0.44
OP1	0.87	0.54	1.45	1.42	0.41	1.01	0.65	0.57	0.24	0.39	0.14	0.73	1.01	1.82	2.03	0.63	0.21	0.61	0.53	0.43
OP2	0.96	0.68	1.50	1.69	0.40	1.32	0.63	1.09	0.17	0.50	0.25	0.78	1.21	1.68	2.14	0.87	0.86	0.34	0.32	0.43
P	1.07	0.74	1.69	1.75	0.25	1.28	0.47	0.88	0.06	0.59	0.32	0.59	1.21	1.95	2.32	0.86	0.57	0.12	0.26	0.07

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.16	0.22	0.10
C2	0.01	0.00	0.04	0.17	0.00	0.26	0.00	0.36	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.14	0.23	0.38	0.67	0.09	0.40
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.04	0.03	0.04	0.04	0.06	0.00	0.02	0.01	0.04	0.12	0.15	0.04
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.10	0.00	0.28	0.02	0.31	0.07	0.11	0.10	0.41	0.01	0.00	0.01	0.03	0.15	0.14	0.04
C4	0.01	0.00	0.04	0.10	0.00	0.06	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.11	0.01	0.25	0.24	0.85	0.33
C4'	0.00	0.26	0.01	0.00	0.06	0.00	0.29	0.01	0.35	0.04	0.18	0.06	0.55	0.04	0.01	0.00	0.01	0.10	0.12	0.02
C5	0.01	0.00	0.04	0.28	0.00	0.29	0.00	0.51	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.27	0.19	0.72	0.60	1.38	0.89
C5'	0.02	0.36	0.02	0.02	0.13	0.01	0.51	0.00	0.56	0.09	0.26	0.13	0.81	0.04	0.02	0.02	0.00	0.08	0.19	0.01
C6	0.00	0.00	0.04	0.31	0.00	0.35	0.00	0.56	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.13	0.28	0.25	0.77	0.62	1.21	0.86
N1	0.00	0.00	0.03	0.07	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.01	0.18	0.19	0.50	0.21
N3	0.01	0.00	0.04	0.11	0.00	0.18	0.00	0.26	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.09	0.16	0.27	0.63	0.25	0.29
N4	0.01	0.00	0.04	0.10	0.00	0.06	0.00	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.12	0.02	0.25	0.26	0.94	0.35
O2	0.01	0.00	0.06	0.41	0.00	0.55	0.00	0.81	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.25	0.35	0.44	0.94	1.22	0.65	0.99
O2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.03	0.04	0.11	0.04	0.13	0.01	0.10	0.04	0.25	0.00	0.05	0.03	0.03	0.13	0.13	0.04
O3'	0.01	0.14	0.02	0.00	0.11	0.01	0.27	0.02	0.28	0.06	0.09	0.12	0.35	0.05	0.00	0.01	0.05	0.27	0.27	0.07
O4'	0.00	0.23	0.01	0.01	0.01	0.00	0.19	0.02	0.25	0.01	0.16	0.02	0.44	0.03	0.01	0.00	0.07	0.18	0.13	0.09
O5'	0.08	0.38	0.04	0.03	0.25	0.01	0.72	0.00	0.77	0.18	0.27	0.25	0.94	0.03	0.05	0.07	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.16	0.67	0.12	0.15	0.24	0.10	0.60	0.08	0.62	0.19	0.63	0.26	1.22	0.13	0.27	0.18	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.22	0.09	0.15	0.14	0.85	0.12	1.38	0.19	1.21	0.50	0.25	0.94	0.65	0.13	0.27	0.13	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.10	0.40	0.04	0.04	0.33	0.02	0.89	0.01	0.86	0.21	0.29	0.35	0.99	0.04	0.07	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00