Doublet Group distance statistics: 53198

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 2, 2, 1, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.004, 0.008, 0.013, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.008 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.007, 0.014, 0.021, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.014 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.008, 0.016, 0.024, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.016 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.012, 0.023, 0.034, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.023 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.010, 0.022, 0.034, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.022 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.011, 0.025, 0.038, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.025 std_dev=0.013
N2	A	0, 0.009, 0.024, 0.038, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.024 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.018, 0.034, 0.050, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.034 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.015, 0.032, 0.049, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.032 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.023, 0.047, 0.070, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.047 std_dev=0.024
O6	A	0, 0.018, 0.042, 0.066, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.042 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.031, 0.060, 0.088, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.060 std_dev=0.029
P	B	0, 0.210, 0.402, 0.593, 0.823 max_d=0.823 avg_d=0.402 std_dev=0.191
N1	B	0, 0.202, 0.397, 0.592, 0.749 max_d=0.749 avg_d=0.397 std_dev=0.195
C6	B	0, 0.195, 0.439, 0.682, 0.936 max_d=0.936 avg_d=0.439 std_dev=0.244
O4'	B	0, 0.177, 0.425, 0.673, 0.804 max_d=0.804 avg_d=0.425 std_dev=0.248
O4'	A	0, -0.034, 0.230, 0.493, 0.974 max_d=0.974 avg_d=0.230 std_dev=0.264
C1'	B	0, 0.192, 0.456, 0.720, 0.904 max_d=0.904 avg_d=0.456 std_dev=0.264
C4'	B	0, 0.174, 0.458, 0.743, 0.941 max_d=0.941 avg_d=0.458 std_dev=0.285
OP2	B	0, 0.199, 0.487, 0.775, 1.070 max_d=1.070 avg_d=0.487 std_dev=0.288
C2'	A	0, -0.044, 0.253, 0.550, 1.056 max_d=1.056 avg_d=0.253 std_dev=0.297
C3'	B	0, 0.192, 0.494, 0.796, 0.993 max_d=0.993 avg_d=0.494 std_dev=0.302
N3	B	0, 0.209, 0.535, 0.862, 1.299 max_d=1.299 avg_d=0.535 std_dev=0.327
C4	B	0, 0.190, 0.518, 0.845, 1.296 max_d=1.296 avg_d=0.518 std_dev=0.328
C2	B	0, 0.200, 0.543, 0.886, 1.267 max_d=1.267 avg_d=0.543 std_dev=0.343
C4'	A	0, -0.060, 0.318, 0.697, 1.383 max_d=1.383 avg_d=0.318 std_dev=0.379
C5	B	0, 0.168, 0.549, 0.931, 1.387 max_d=1.387 avg_d=0.549 std_dev=0.382
C3'	A	0, -0.090, 0.318, 0.725, 1.411 max_d=1.411 avg_d=0.318 std_dev=0.407
N4	B	0, 0.197, 0.635, 1.074, 1.702 max_d=1.702 avg_d=0.635 std_dev=0.439
O5'	B	0, 0.049, 0.498, 0.948, 1.433 max_d=1.433 avg_d=0.498 std_dev=0.450
OP1	B	0, 0.209, 0.670, 1.132, 1.432 max_d=1.432 avg_d=0.670 std_dev=0.461
C5'	B	0, 0.059, 0.538, 1.016, 1.837 max_d=1.837 avg_d=0.538 std_dev=0.479
C2'	B	0, 0.089, 0.588, 1.088, 1.924 max_d=1.924 avg_d=0.588 std_dev=0.500
C5'	A	0, 0.059, 0.568, 1.077, 1.796 max_d=1.796 avg_d=0.568 std_dev=0.509
O2'	A	0, -0.078, 0.439, 0.955, 1.964 max_d=1.964 avg_d=0.439 std_dev=0.517
P	A	0, 0.078, 0.595, 1.113, 1.662 max_d=1.662 avg_d=0.595 std_dev=0.518
O3'	B	0, 0.039, 0.580, 1.120, 1.660 max_d=1.660 avg_d=0.580 std_dev=0.541
O2	B	0, 0.159, 0.731, 1.304, 1.905 max_d=1.905 avg_d=0.731 std_dev=0.573
O5'	A	0, 0.251, 0.845, 1.440, 1.905 max_d=1.905 avg_d=0.845 std_dev=0.595
O3'	A	0, -0.138, 0.474, 1.087, 2.223 max_d=2.223 avg_d=0.474 std_dev=0.612
OP2	A	0, 0.233, 0.901, 1.570, 1.954 max_d=1.954 avg_d=0.901 std_dev=0.668
OP1	A	0, 0.221, 0.933, 1.646, 2.601 max_d=2.601 avg_d=0.933 std_dev=0.713
O2'	B	0, -0.091, 0.885, 1.862, 3.536 max_d=3.536 avg_d=0.885 std_dev=0.976

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.19	0.00	0.26	0.01	0.32	0.87	0.32
C2	0.01	0.00	0.12	0.03	0.00	0.16	0.00	0.23	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.14	0.30	0.20	0.54	0.01	0.42	0.58	0.24
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.05	0.01	0.02	0.12	0.03	0.11	0.08	0.16	0.13	0.08	0.02	0.00	0.02	0.01	0.17	0.03	0.07	0.78	0.19
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.10	0.19	0.05	0.06	0.03	0.18	0.10	0.03	0.01	0.01	0.16	0.13	0.16	0.64	0.15
C4	0.01	0.00	0.05	0.06	0.00	0.06	0.00	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.17	0.11	0.44	0.01	0.43	0.74	0.30
C4'	0.01	0.16	0.01	0.00	0.06	0.00	0.03	0.00	0.04	0.13	0.11	0.21	0.16	0.10	0.03	0.18	0.03	0.00	0.03	0.03	0.11	0.64	0.15
C5	0.00	0.00	0.02	0.12	0.00	0.03	0.00	0.11	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.14	0.08	0.04	0.44	0.01	0.53	0.75	0.36
C5'	0.05	0.23	0.12	0.01	0.13	0.00	0.11	0.00	0.12	0.18	0.18	0.29	0.22	0.17	0.09	0.06	0.13	0.01	0.02	0.12	0.23	0.38	0.03
C6	0.01	0.01	0.03	0.10	0.01	0.04	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.12	0.07	0.49	0.00	0.57	0.68	0.35
C8	0.00	0.01	0.11	0.19	0.00	0.13	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.28	0.09	0.11	0.32	0.01	0.49	0.85	0.41
N1	0.01	0.00	0.08	0.05	0.00	0.11	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.22	0.14	0.53	0.01	0.51	0.61	0.29
N2	0.02	0.00	0.16	0.06	0.00	0.21	0.01	0.29	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.23	0.37	0.25	0.57	0.01	0.38	0.49	0.22
N3	0.01	0.00	0.13	0.03	0.00	0.16	0.00	0.22	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.16	0.29	0.21	0.50	0.01	0.37	0.64	0.23
N7	0.00	0.01	0.08	0.18	0.00	0.10	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.26	0.08	0.07	0.37	0.01	0.56	0.81	0.42
N9	0.00	0.01	0.02	0.10	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.11	0.09	0.01	0.35	0.01	0.41	0.84	0.34
O2'	0.02	0.14	0.00	0.03	0.04	0.18	0.14	0.06	0.11	0.28	0.06	0.23	0.16	0.26	0.11	0.00	0.06	0.12	0.08	0.16	0.23	0.93	0.38
O3'	0.19	0.30	0.02	0.01	0.17	0.03	0.08	0.13	0.12	0.09	0.22	0.37	0.29	0.08	0.09	0.06	0.00	0.15	0.20	0.08	0.23	0.60	0.15
O4'	0.00	0.20	0.01	0.01	0.11	0.00	0.04	0.01	0.07	0.11	0.14	0.25	0.21	0.07	0.01	0.12	0.15	0.00	0.33	0.04	0.39	0.84	0.36
O5'	0.26	0.54	0.17	0.16	0.44	0.03	0.44	0.02	0.49	0.32	0.53	0.57	0.50	0.37	0.35	0.08	0.20	0.33	0.00	0.48	0.02	0.02	0.01
O6	0.01	0.01	0.03	0.13	0.01	0.03	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.08	0.04	0.48	0.00	0.63	0.68	0.39
OP1	0.32	0.42	0.07	0.16	0.43	0.11	0.53	0.23	0.57	0.49	0.51	0.38	0.37	0.56	0.41	0.23	0.23	0.39	0.02	0.63	0.00	0.01	0.01
OP2	0.87	0.58	0.78	0.64	0.74	0.64	0.75	0.38	0.68	0.85	0.61	0.49	0.64	0.81	0.84	0.93	0.60	0.84	0.02	0.68	0.01	0.00	0.00
P	0.32	0.24	0.19	0.15	0.30	0.15	0.36	0.03	0.35	0.41	0.29	0.22	0.23	0.42	0.34	0.38	0.15	0.36	0.01	0.39	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.09	0.10	0.11	0.20	0.11	0.21	0.19	0.15	0.11	0.13	0.29	0.11	0.13	0.09	0.11	0.40	0.14	0.35	0.13
C2	0.21	0.21	0.16	0.15	0.10	0.18	0.17	0.30	0.10	0.13	0.13	0.15	0.35	0.31	0.15	0.16	0.30	0.20	0.35	0.09
C2'	0.12	0.11	0.10	0.11	0.18	0.11	0.20	0.20	0.16	0.12	0.13	0.23	0.11	0.13	0.09	0.09	0.39	0.12	0.39	0.13
C3'	0.18	0.18	0.15	0.18	0.14	0.13	0.14	0.20	0.13	0.16	0.16	0.17	0.22	0.16	0.09	0.14	0.40	0.07	0.30	0.06
C4	0.13	0.08	0.06	0.11	0.22	0.14	0.25	0.22	0.15	0.08	0.10	0.32	0.15	0.11	0.09	0.14	0.38	0.14	0.35	0.12
C4'	0.30	0.29	0.29	0.33	0.25	0.23	0.25	0.17	0.26	0.28	0.27	0.23	0.30	0.26	0.21	0.24	0.42	0.17	0.37	0.18
C5	0.09	0.09	0.10	0.10	0.36	0.14	0.39	0.21	0.23	0.09	0.21	0.47	0.09	0.09	0.09	0.16	0.40	0.13	0.34	0.14
C5'	0.39	0.36	0.36	0.46	0.36	0.35	0.37	0.28	0.38	0.38	0.34	0.33	0.35	0.26	0.34	0.36	0.48	0.26	0.40	0.27
C6	0.08	0.11	0.12	0.12	0.36	0.16	0.44	0.25	0.29	0.10	0.21	0.43	0.12	0.06	0.13	0.17	0.38	0.12	0.33	0.11
C8	0.10	0.12	0.13	0.10	0.36	0.13	0.34	0.18	0.21	0.12	0.23	0.53	0.08	0.18	0.08	0.15	0.42	0.15	0.35	0.16
N1	0.16	0.13	0.09	0.15	0.22	0.19	0.29	0.32	0.19	0.07	0.12	0.28	0.24	0.19	0.17	0.17	0.32	0.17	0.33	0.09
N2	0.28	0.33	0.28	0.18	0.08	0.22	0.10	0.35	0.08	0.21	0.23	0.07	0.50	0.50	0.20	0.18	0.25	0.26	0.34	0.10
N3	0.19	0.19	0.15	0.14	0.10	0.15	0.16	0.25	0.11	0.13	0.12	0.16	0.29	0.25	0.11	0.14	0.34	0.17	0.35	0.10
N7	0.09	0.15	0.17	0.10	0.43	0.13	0.43	0.19	0.26	0.14	0.28	0.59	0.09	0.20	0.09	0.17	0.42	0.15	0.34	0.17
N9	0.11	0.08	0.08	0.11	0.26	0.12	0.26	0.19	0.17	0.09	0.15	0.39	0.10	0.11	0.08	0.13	0.40	0.13	0.35	0.14
O2'	0.08	0.13	0.09	0.05	0.23	0.11	0.23	0.20	0.18	0.12	0.19	0.29	0.13	0.14	0.17	0.08	0.39	0.22	0.49	0.24
O3'	0.41	0.41	0.38	0.37	0.28	0.26	0.25	0.15	0.29	0.37	0.37	0.23	0.48	0.43	0.27	0.29	0.43	0.19	0.39	0.21
O4'	0.26	0.22	0.23	0.27	0.17	0.21	0.19	0.17	0.21	0.23	0.18	0.19	0.24	0.21	0.15	0.22	0.41	0.17	0.38	0.18
O5'	0.61	0.58	0.59	0.63	0.61	0.65	0.63	0.66	0.63	0.61	0.59	0.61	0.55	0.55	0.54	0.67	0.36	0.47	0.73	0.49
O6	0.06	0.17	0.24	0.16	0.44	0.15	0.53	0.25	0.39	0.18	0.28	0.50	0.11	0.15	0.15	0.17	0.39	0.12	0.30	0.13
OP1	0.56	0.59	0.57	0.49	0.45	0.50	0.40	0.47	0.45	0.53	0.56	0.38	0.65	0.76	0.63	0.51	0.89	0.66	0.43	0.60
OP2	0.25	0.27	0.17	0.19	0.22	0.29	0.21	0.34	0.22	0.24	0.26	0.21	0.31	0.25	0.27	0.32	0.76	0.50	0.23	0.46
P	0.19	0.22	0.15	0.11	0.14	0.19	0.11	0.22	0.13	0.18	0.20	0.11	0.27	0.30	0.21	0.23	0.56	0.32	0.24	0.26

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.00	0.27	0.37	0.30	0.14
C2	0.01	0.00	0.09	0.08	0.00	0.03	0.01	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.06	0.12	0.08	0.41	0.36	0.26	0.19
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.02	0.01	0.09	0.10	0.12	0.01	0.07	0.02	0.17	0.00	0.03	0.02	0.43	0.62	0.47	0.45
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.11	0.00	0.10	0.01	0.09	0.07	0.10	0.12	0.07	0.01	0.01	0.02	0.28	0.52	0.39	0.33
C4	0.01	0.00	0.02	0.11	0.00	0.01	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.15	0.06	0.04	0.58	0.34	0.21	0.29
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.06	0.12	0.02	0.00	0.01	0.33	0.36	0.04
C5	0.01	0.01	0.09	0.10	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.22	0.04	0.04	0.64	0.35	0.21	0.33
C5'	0.03	0.08	0.10	0.01	0.08	0.00	0.09	0.00	0.09	0.06	0.09	0.09	0.10	0.05	0.11	0.02	0.01	0.29	0.37	0.02
C6	0.01	0.00	0.12	0.09	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.21	0.03	0.05	0.60	0.36	0.22	0.30
N1	0.00	0.00	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.09	0.09	0.02	0.45	0.37	0.25	0.21
N3	0.01	0.00	0.07	0.10	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.09	0.07	0.49	0.35	0.24	0.23
N4	0.01	0.01	0.02	0.12	0.00	0.01	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.16	0.07	0.04	0.61	0.34	0.21	0.31
O2	0.01	0.00	0.17	0.07	0.01	0.06	0.01	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.17	0.17	0.11	0.30	0.36	0.29	0.13
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.15	0.12	0.22	0.05	0.21	0.09	0.08	0.16	0.17	0.00	0.04	0.06	0.26	0.56	0.43	0.35
O3'	0.15	0.12	0.03	0.01	0.06	0.02	0.04	0.11	0.03	0.09	0.09	0.07	0.17	0.04	0.00	0.11	0.29	0.35	0.37	0.23
O4'	0.00	0.08	0.02	0.02	0.04	0.00	0.04	0.02	0.05	0.02	0.07	0.04	0.11	0.06	0.11	0.00	0.21	0.27	0.45	0.10
O5'	0.27	0.41	0.43	0.28	0.58	0.01	0.64	0.01	0.60	0.45	0.49	0.61	0.30	0.26	0.29	0.21	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.37	0.36	0.62	0.52	0.34	0.33	0.35	0.29	0.36	0.37	0.35	0.34	0.36	0.56	0.35	0.27	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.30	0.26	0.47	0.39	0.21	0.36	0.21	0.37	0.22	0.25	0.24	0.21	0.29	0.43	0.37	0.45	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.14	0.19	0.45	0.33	0.29	0.04	0.33	0.02	0.30	0.21	0.23	0.31	0.13	0.35	0.23	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00