Doublet Group distance statistics: 53201

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.011, 0.025, 0.038, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.025 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.021, 0.059, 0.097, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.059 std_dev=0.038
N1	A	0, 0.015, 0.056, 0.097, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.056 std_dev=0.041
N7	A	0, 0.034, 0.083, 0.132, 0.131 max_d=0.131 avg_d=0.083 std_dev=0.049
N9	A	0, 0.024, 0.074, 0.123, 0.131 max_d=0.131 avg_d=0.074 std_dev=0.050
C4	A	0, 0.025, 0.076, 0.126, 0.135 max_d=0.135 avg_d=0.076 std_dev=0.050
O6	A	0, 0.039, 0.091, 0.143, 0.152 max_d=0.152 avg_d=0.091 std_dev=0.052
C8	A	0, 0.039, 0.097, 0.154, 0.153 max_d=0.153 avg_d=0.097 std_dev=0.057
N3	A	0, 0.020, 0.097, 0.174, 0.196 max_d=0.196 avg_d=0.097 std_dev=0.077
C2	A	0, 0.004, 0.082, 0.160, 0.193 max_d=0.193 avg_d=0.082 std_dev=0.078
C1'	A	0, 0.013, 0.094, 0.175, 0.202 max_d=0.202 avg_d=0.094 std_dev=0.081
N2	A	0, 0.032, 0.198, 0.363, 0.420 max_d=0.420 avg_d=0.198 std_dev=0.165
N3	B	0, 0.063, 0.242, 0.422, 0.622 max_d=0.622 avg_d=0.242 std_dev=0.180
C2'	A	0, 0.092, 0.274, 0.457, 0.486 max_d=0.486 avg_d=0.274 std_dev=0.182
C4	B	0, 0.023, 0.223, 0.423, 0.679 max_d=0.679 avg_d=0.223 std_dev=0.200
O2'	A	0, 0.114, 0.338, 0.563, 0.709 max_d=0.709 avg_d=0.338 std_dev=0.224
C2	B	0, 0.033, 0.266, 0.499, 0.725 max_d=0.725 avg_d=0.266 std_dev=0.233
N4	B	0, 0.059, 0.292, 0.526, 0.823 max_d=0.823 avg_d=0.292 std_dev=0.234
C5	B	0, 0.188, 0.442, 0.696, 0.749 max_d=0.749 avg_d=0.442 std_dev=0.254
O4'	A	0, 0.067, 0.330, 0.592, 0.730 max_d=0.730 avg_d=0.330 std_dev=0.262
N1	B	0, 0.191, 0.467, 0.744, 0.842 max_d=0.842 avg_d=0.467 std_dev=0.277
C6	B	0, 0.245, 0.557, 0.869, 0.798 max_d=0.798 avg_d=0.557 std_dev=0.312
O2	B	0, 0.017, 0.347, 0.676, 1.054 max_d=1.054 avg_d=0.347 std_dev=0.330
C3'	A	0, 0.136, 0.507, 0.879, 1.078 max_d=1.078 avg_d=0.507 std_dev=0.372
O5'	B	0, 0.262, 0.640, 1.018, 1.067 max_d=1.067 avg_d=0.640 std_dev=0.378
O3'	A	0, 0.149, 0.540, 0.931, 1.166 max_d=1.166 avg_d=0.540 std_dev=0.391
C1'	B	0, 0.250, 0.641, 1.033, 1.270 max_d=1.270 avg_d=0.641 std_dev=0.392
C4'	A	0, 0.179, 0.601, 1.023, 1.228 max_d=1.228 avg_d=0.601 std_dev=0.422
O2'	B	0, 0.296, 0.782, 1.267, 1.360 max_d=1.360 avg_d=0.782 std_dev=0.485
OP2	A	0, 0.296, 0.814, 1.332, 1.675 max_d=1.675 avg_d=0.814 std_dev=0.518
C2'	B	0, 0.328, 0.856, 1.384, 1.537 max_d=1.537 avg_d=0.856 std_dev=0.528
O5'	A	0, 0.230, 0.788, 1.346, 1.609 max_d=1.609 avg_d=0.788 std_dev=0.558
O3'	B	0, 0.221, 0.793, 1.365, 1.966 max_d=1.966 avg_d=0.793 std_dev=0.572
P	A	0, 0.283, 0.861, 1.438, 1.802 max_d=1.802 avg_d=0.861 std_dev=0.577
O4'	B	0, 0.225, 0.808, 1.392, 1.968 max_d=1.968 avg_d=0.808 std_dev=0.583
C5'	A	0, 0.243, 0.835, 1.427, 1.737 max_d=1.737 avg_d=0.835 std_dev=0.592
OP1	A	0, 0.332, 0.987, 1.641, 2.057 max_d=2.057 avg_d=0.987 std_dev=0.654
P	B	0, 0.488, 1.147, 1.805, 1.953 max_d=1.953 avg_d=1.147 std_dev=0.659
C3'	B	0, 0.328, 0.995, 1.663, 2.124 max_d=2.124 avg_d=0.995 std_dev=0.668
C4'	B	0, 0.375, 1.130, 1.884, 2.343 max_d=2.343 avg_d=1.130 std_dev=0.754
OP2	B	0, 0.603, 1.389, 2.176, 2.318 max_d=2.318 avg_d=1.389 std_dev=0.787
OP1	B	0, 0.515, 1.361, 2.207, 2.315 max_d=2.315 avg_d=1.361 std_dev=0.846
C5'	B	0, 0.734, 1.809, 2.884, 2.779 max_d=2.779 avg_d=1.809 std_dev=1.075

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.15	0.00	0.02	0.05	0.01	0.01	0.02	0.04	0.06	0.10	0.20	0.15	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.02	0.15	0.11	0.08
C2	0.15	0.00	0.10	0.15	0.03	0.24	0.01	0.23	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.11	0.15	0.26	0.18	0.02	0.24	0.16	0.18
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.03	0.01	0.06	0.02	0.05	0.09	0.05	0.16	0.11	0.10	0.04	0.00	0.03	0.01	0.07	0.08	0.20	0.10	0.10
C3'	0.02	0.15	0.00	0.00	0.04	0.00	0.06	0.02	0.05	0.15	0.07	0.24	0.16	0.14	0.04	0.02	0.01	0.01	0.05	0.08	0.18	0.09	0.10
C4	0.05	0.03	0.03	0.04	0.00	0.07	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.01	0.04	0.04	0.09	0.04	0.01	0.16	0.12	0.10
C4'	0.01	0.24	0.01	0.00	0.07	0.00	0.04	0.00	0.06	0.17	0.15	0.35	0.23	0.14	0.04	0.06	0.04	0.00	0.01	0.06	0.10	0.06	0.06
C5	0.01	0.01	0.06	0.06	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.05	0.06	0.04	0.12	0.01	0.12	0.14	0.12
C5'	0.02	0.23	0.02	0.02	0.05	0.00	0.09	0.00	0.07	0.23	0.14	0.35	0.21	0.21	0.07	0.04	0.08	0.02	0.01	0.11	0.02	0.02	0.02
C6	0.04	0.01	0.05	0.05	0.01	0.06	0.01	0.07	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.04	0.05	0.09	0.09	0.00	0.13	0.15	0.12
C8	0.06	0.03	0.09	0.15	0.01	0.17	0.01	0.23	0.02	0.00	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.08	0.13	0.11	0.28	0.03	0.14	0.16	0.17
N1	0.10	0.01	0.05	0.07	0.02	0.15	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.01	0.03	0.06	0.07	0.18	0.10	0.01	0.16	0.13	0.12
N2	0.20	0.00	0.16	0.24	0.04	0.35	0.01	0.35	0.03	0.04	0.03	0.00	0.03	0.01	0.07	0.19	0.24	0.34	0.28	0.04	0.31	0.20	0.25
N3	0.15	0.01	0.11	0.16	0.01	0.23	0.02	0.21	0.02	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.04	0.12	0.15	0.24	0.16	0.03	0.26	0.17	0.19
N7	0.04	0.01	0.10	0.14	0.01	0.14	0.00	0.21	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.13	0.06	0.27	0.03	0.17	0.21	0.21
N9	0.01	0.05	0.04	0.04	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.03	0.07	0.04	0.01	0.00	0.04	0.04	0.02	0.10	0.01	0.15	0.12	0.09
O2'	0.01	0.11	0.00	0.02	0.04	0.06	0.05	0.04	0.04	0.08	0.06	0.19	0.12	0.08	0.04	0.00	0.08	0.03	0.04	0.06	0.20	0.09	0.10
O3'	0.04	0.15	0.03	0.01	0.04	0.04	0.06	0.08	0.05	0.13	0.07	0.24	0.15	0.13	0.04	0.08	0.00	0.04	0.08	0.09	0.24	0.14	0.15
O4'	0.00	0.26	0.01	0.01	0.09	0.00	0.04	0.02	0.09	0.11	0.18	0.34	0.24	0.06	0.02	0.03	0.04	0.00	0.04	0.07	0.11	0.11	0.08
O5'	0.05	0.18	0.07	0.05	0.04	0.01	0.12	0.01	0.09	0.28	0.10	0.28	0.16	0.27	0.10	0.04	0.08	0.04	0.00	0.14	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.08	0.08	0.01	0.06	0.01	0.11	0.00	0.03	0.01	0.04	0.03	0.03	0.01	0.06	0.09	0.07	0.14	0.00	0.17	0.21	0.18
OP1	0.15	0.24	0.20	0.18	0.16	0.10	0.12	0.02	0.13	0.14	0.16	0.31	0.26	0.17	0.15	0.20	0.24	0.11	0.02	0.17	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.16	0.10	0.09	0.12	0.06	0.14	0.02	0.15	0.16	0.13	0.20	0.17	0.21	0.12	0.09	0.14	0.11	0.02	0.21	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.18	0.10	0.10	0.10	0.06	0.12	0.02	0.12	0.17	0.12	0.25	0.19	0.21	0.09	0.10	0.15	0.08	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.11	0.14	0.21	0.08	0.30	0.17	0.65	0.15	0.10	0.11	0.08	0.16	0.12	0.18	0.19	0.14	0.19	0.45	0.18
C2	0.19	0.17	0.20	0.28	0.07	0.38	0.14	0.63	0.15	0.15	0.14	0.13	0.27	0.15	0.26	0.33	0.24	0.20	0.41	0.22
C2'	0.13	0.13	0.16	0.21	0.09	0.27	0.15	0.62	0.15	0.12	0.13	0.09	0.17	0.17	0.19	0.18	0.21	0.20	0.40	0.18
C3'	0.09	0.13	0.11	0.16	0.10	0.23	0.10	0.61	0.09	0.08	0.15	0.13	0.16	0.11	0.14	0.11	0.23	0.19	0.35	0.15
C4	0.12	0.13	0.16	0.23	0.02	0.31	0.15	0.65	0.14	0.10	0.14	0.05	0.21	0.14	0.20	0.20	0.16	0.14	0.45	0.17
C4'	0.15	0.17	0.14	0.19	0.14	0.28	0.15	0.62	0.14	0.15	0.19	0.15	0.20	0.12	0.18	0.19	0.18	0.20	0.42	0.17
C5	0.13	0.14	0.19	0.24	0.08	0.30	0.18	0.66	0.18	0.12	0.15	0.07	0.20	0.19	0.20	0.17	0.15	0.15	0.45	0.17
C5'	0.15	0.19	0.12	0.14	0.15	0.22	0.13	0.56	0.13	0.15	0.20	0.16	0.21	0.12	0.15	0.17	0.23	0.23	0.41	0.19
C6	0.18	0.13	0.24	0.29	0.07	0.35	0.19	0.66	0.21	0.15	0.13	0.05	0.20	0.23	0.24	0.24	0.19	0.15	0.43	0.19
C8	0.11	0.13	0.14	0.19	0.11	0.25	0.17	0.64	0.17	0.11	0.16	0.13	0.17	0.18	0.15	0.12	0.13	0.23	0.46	0.20
N1	0.21	0.15	0.24	0.31	0.05	0.40	0.15	0.64	0.18	0.16	0.12	0.08	0.25	0.20	0.28	0.34	0.24	0.21	0.41	0.23
N2	0.24	0.20	0.23	0.33	0.11	0.43	0.13	0.62	0.15	0.18	0.15	0.18	0.30	0.17	0.32	0.40	0.30	0.29	0.40	0.28
N3	0.14	0.15	0.15	0.23	0.05	0.32	0.13	0.62	0.12	0.11	0.13	0.12	0.24	0.12	0.21	0.26	0.20	0.14	0.42	0.18
N7	0.13	0.15	0.18	0.21	0.14	0.26	0.20	0.65	0.20	0.13	0.17	0.15	0.18	0.21	0.17	0.12	0.12	0.22	0.46	0.19
N9	0.11	0.12	0.14	0.20	0.06	0.28	0.16	0.64	0.15	0.09	0.13	0.05	0.18	0.14	0.17	0.16	0.14	0.18	0.46	0.18
O2'	0.14	0.11	0.16	0.22	0.09	0.29	0.17	0.63	0.16	0.12	0.11	0.09	0.16	0.15	0.20	0.21	0.21	0.22	0.42	0.21
O3'	0.09	0.13	0.11	0.16	0.10	0.23	0.08	0.61	0.08	0.09	0.15	0.12	0.16	0.09	0.14	0.12	0.24	0.18	0.33	0.13
O4'	0.16	0.16	0.15	0.22	0.14	0.32	0.18	0.65	0.17	0.15	0.16	0.13	0.18	0.10	0.19	0.23	0.11	0.21	0.47	0.20
O5'	0.14	0.18	0.12	0.14	0.16	0.20	0.12	0.54	0.12	0.14	0.21	0.20	0.20	0.14	0.14	0.14	0.24	0.24	0.40	0.19
O6	0.21	0.12	0.30	0.32	0.11	0.36	0.23	0.67	0.27	0.19	0.11	0.07	0.17	0.29	0.26	0.22	0.19	0.16	0.42	0.19
OP1	0.13	0.14	0.11	0.13	0.16	0.17	0.11	0.52	0.12	0.12	0.18	0.23	0.15	0.15	0.11	0.15	0.25	0.32	0.37	0.22
OP2	0.13	0.13	0.11	0.13	0.17	0.17	0.11	0.51	0.12	0.12	0.17	0.25	0.14	0.17	0.11	0.17	0.27	0.30	0.38	0.21
P	0.12	0.13	0.10	0.12	0.15	0.16	0.10	0.51	0.11	0.12	0.16	0.21	0.14	0.14	0.10	0.14	0.26	0.29	0.38	0.21

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.13	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.06	0.00	0.26	0.12	0.35	0.18
C2	0.02	0.00	0.06	0.01	0.01	0.09	0.02	0.35	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.17	0.06	0.14	0.25	0.12	0.34	0.14
C2'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.04	0.01	0.10	0.17	0.13	0.03	0.05	0.04	0.12	0.00	0.02	0.03	0.31	0.28	0.36	0.29
C3'	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.01	0.13	0.04	0.13	0.05	0.03	0.09	0.06	0.02	0.01	0.01	0.24	0.26	0.36	0.28
C4	0.02	0.01	0.04	0.08	0.00	0.16	0.00	0.53	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.05	0.06	0.25	0.06	0.35	0.09
C4'	0.02	0.09	0.01	0.01	0.16	0.00	0.17	0.01	0.15	0.08	0.13	0.17	0.08	0.03	0.02	0.01	0.02	0.17	0.27	0.06
C5	0.02	0.02	0.10	0.13	0.00	0.17	0.00	0.54	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.15	0.10	0.05	0.26	0.09	0.37	0.11
C5'	0.13	0.35	0.17	0.04	0.53	0.01	0.54	0.00	0.48	0.34	0.45	0.57	0.26	0.12	0.09	0.04	0.01	0.29	0.32	0.02
C6	0.02	0.01	0.13	0.13	0.01	0.15	0.00	0.48	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.12	0.09	0.27	0.10	0.39	0.14
N1	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.08	0.01	0.34	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.05	0.03	0.27	0.10	0.36	0.15
N3	0.02	0.01	0.05	0.03	0.01	0.13	0.01	0.45	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.14	0.05	0.12	0.25	0.09	0.35	0.11
N4	0.02	0.01	0.04	0.09	0.00	0.17	0.01	0.57	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.08	0.05	0.07	0.25	0.06	0.35	0.08
O2	0.02	0.00	0.12	0.06	0.02	0.08	0.02	0.26	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.28	0.12	0.21	0.25	0.19	0.32	0.17
O2'	0.02	0.17	0.00	0.02	0.07	0.03	0.15	0.12	0.18	0.05	0.14	0.08	0.28	0.00	0.05	0.01	0.31	0.39	0.43	0.35
O3'	0.06	0.06	0.02	0.01	0.05	0.02	0.10	0.09	0.12	0.05	0.05	0.05	0.12	0.05	0.00	0.12	0.18	0.29	0.34	0.25
O4'	0.00	0.14	0.03	0.01	0.06	0.01	0.05	0.04	0.09	0.03	0.12	0.07	0.21	0.01	0.12	0.00	0.35	0.33	0.45	0.34
O5'	0.26	0.25	0.31	0.24	0.25	0.02	0.26	0.01	0.27	0.27	0.25	0.25	0.25	0.31	0.18	0.35	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.12	0.12	0.28	0.26	0.06	0.17	0.09	0.29	0.10	0.10	0.09	0.06	0.19	0.39	0.29	0.33	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.35	0.34	0.36	0.36	0.35	0.27	0.37	0.32	0.39	0.36	0.35	0.35	0.32	0.43	0.34	0.45	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.18	0.14	0.29	0.28	0.09	0.06	0.11	0.02	0.14	0.15	0.11	0.08	0.17	0.35	0.25	0.34	0.01	0.00	0.01	0.00