Doublet Group distance statistics: 53203

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 2, 2, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.000, 0.012, 0.024, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C6	A	0, -0.002, 0.011, 0.023, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.011 std_dev=0.013
N1	A	0, -0.002, 0.015, 0.033, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.015 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.000, 0.018, 0.036, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.018 std_dev=0.018
N3	A	0, 0.001, 0.020, 0.040, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.020 std_dev=0.020
C5	A	0, -0.006, 0.016, 0.038, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.016 std_dev=0.022
N2	A	0, 0.005, 0.028, 0.051, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.028 std_dev=0.023
C4	A	0, -0.005, 0.023, 0.050, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.023 std_dev=0.027
N9	A	0, -0.003, 0.026, 0.055, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.026 std_dev=0.029
N7	A	0, -0.013, 0.030, 0.072, 0.136 max_d=0.136 avg_d=0.030 std_dev=0.042
O6	A	0, -0.012, 0.035, 0.082, 0.135 max_d=0.135 avg_d=0.035 std_dev=0.047
C8	A	0, -0.013, 0.036, 0.086, 0.163 max_d=0.163 avg_d=0.036 std_dev=0.050
C2'	A	0, 0.048, 0.166, 0.284, 0.361 max_d=0.361 avg_d=0.166 std_dev=0.118
O4'	A	0, 0.038, 0.161, 0.284, 0.382 max_d=0.382 avg_d=0.161 std_dev=0.123
O3'	A	0, 0.017, 0.151, 0.284, 0.381 max_d=0.381 avg_d=0.151 std_dev=0.134
C3'	A	0, 0.026, 0.189, 0.352, 0.529 max_d=0.529 avg_d=0.189 std_dev=0.163
O2'	A	0, 0.088, 0.259, 0.431, 0.487 max_d=0.487 avg_d=0.259 std_dev=0.172
C4'	A	0, 0.022, 0.222, 0.423, 0.625 max_d=0.625 avg_d=0.222 std_dev=0.200
C4	B	0, 0.205, 0.452, 0.699, 0.790 max_d=0.790 avg_d=0.452 std_dev=0.247
N1	B	0, 0.186, 0.446, 0.706, 0.940 max_d=0.940 avg_d=0.446 std_dev=0.260
C5	B	0, 0.216, 0.481, 0.747, 0.850 max_d=0.850 avg_d=0.481 std_dev=0.265
O4'	B	0, 0.216, 0.482, 0.748, 0.966 max_d=0.966 avg_d=0.482 std_dev=0.266
C6	B	0, 0.220, 0.486, 0.752, 0.926 max_d=0.926 avg_d=0.486 std_dev=0.266
N3	B	0, 0.219, 0.490, 0.761, 0.813 max_d=0.813 avg_d=0.490 std_dev=0.271
N4	B	0, 0.196, 0.480, 0.763, 1.049 max_d=1.049 avg_d=0.480 std_dev=0.284
C2	B	0, 0.182, 0.475, 0.767, 0.893 max_d=0.893 avg_d=0.475 std_dev=0.292
C5'	A	0, 0.089, 0.385, 0.682, 0.900 max_d=0.900 avg_d=0.385 std_dev=0.296
O5'	A	0, 0.084, 0.383, 0.683, 0.871 max_d=0.871 avg_d=0.383 std_dev=0.300
C1'	B	0, 0.169, 0.471, 0.774, 1.015 max_d=1.015 avg_d=0.471 std_dev=0.303
C4'	B	0, 0.214, 0.532, 0.850, 1.164 max_d=1.164 avg_d=0.532 std_dev=0.318
O5'	B	0, 0.219, 0.540, 0.861, 1.085 max_d=1.085 avg_d=0.540 std_dev=0.321
O2	B	0, 0.230, 0.568, 0.906, 0.965 max_d=0.965 avg_d=0.568 std_dev=0.338
P	B	0, 0.339, 0.686, 1.033, 1.189 max_d=1.189 avg_d=0.686 std_dev=0.347
P	A	0, 0.073, 0.426, 0.779, 0.987 max_d=0.987 avg_d=0.426 std_dev=0.353
C2'	B	0, 0.257, 0.612, 0.966, 1.197 max_d=1.197 avg_d=0.612 std_dev=0.355
C3'	B	0, 0.259, 0.615, 0.972, 1.252 max_d=1.252 avg_d=0.615 std_dev=0.356
OP1	A	0, 0.085, 0.450, 0.816, 1.220 max_d=1.220 avg_d=0.450 std_dev=0.366
O2'	B	0, 0.312, 0.726, 1.139, 1.319 max_d=1.319 avg_d=0.726 std_dev=0.413
C5'	B	0, 0.274, 0.693, 1.112, 1.288 max_d=1.288 avg_d=0.693 std_dev=0.419
O3'	B	0, 0.306, 0.744, 1.183, 1.479 max_d=1.479 avg_d=0.744 std_dev=0.438
OP2	A	0, 0.025, 0.497, 0.968, 1.432 max_d=1.432 avg_d=0.497 std_dev=0.471
OP2	B	0, 0.372, 0.973, 1.574, 1.914 max_d=1.914 avg_d=0.973 std_dev=0.601
OP1	B	0, 0.519, 1.340, 2.160, 2.765 max_d=2.765 avg_d=1.340 std_dev=0.821

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.04	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.06	0.02	0.23	0.06	0.08
C2	0.03	0.00	0.07	0.06	0.00	0.05	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.05	0.06	0.12	0.03	0.18	0.06	0.07
C2'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.08	0.03	0.08	0.08	0.07	0.04	0.02	0.00	0.03	0.01	0.05	0.09	0.20	0.07	0.09
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.05	0.03	0.05	0.07	0.06	0.04	0.01	0.02	0.00	0.01	0.06	0.06	0.17	0.07	0.07
C4	0.02	0.00	0.05	0.03	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.02	0.03	0.13	0.01	0.19	0.06	0.06
C4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.05	0.03	0.06	0.05	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.03	0.18	0.06	0.06
C5	0.01	0.01	0.05	0.03	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.09	0.02	0.02	0.17	0.01	0.15	0.08	0.08
C5'	0.02	0.02	0.02	0.02	0.04	0.01	0.07	0.00	0.07	0.09	0.05	0.03	0.02	0.10	0.04	0.02	0.04	0.01	0.02	0.09	0.12	0.07	0.03
C6	0.02	0.02	0.08	0.05	0.01	0.02	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.13	0.02	0.04	0.18	0.00	0.14	0.10	0.10
C8	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.03	0.03	0.17	0.02	0.18	0.07	0.06
N1	0.03	0.01	0.08	0.05	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.14	0.04	0.05	0.16	0.02	0.16	0.08	0.09
N2	0.03	0.01	0.08	0.07	0.01	0.06	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.14	0.07	0.07	0.10	0.04	0.19	0.05	0.07
N3	0.04	0.01	0.07	0.06	0.00	0.05	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.11	0.05	0.06	0.10	0.02	0.20	0.05	0.06
N7	0.01	0.01	0.04	0.04	0.01	0.04	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.07	0.02	0.01	0.19	0.02	0.14	0.09	0.09
N9	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.02	0.00	0.12	0.01	0.21	0.06	0.06
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.08	0.01	0.09	0.02	0.13	0.05	0.14	0.14	0.11	0.07	0.04	0.00	0.07	0.01	0.06	0.14	0.21	0.09	0.10
O3'	0.02	0.05	0.03	0.00	0.02	0.03	0.02	0.04	0.02	0.03	0.04	0.07	0.05	0.02	0.02	0.07	0.00	0.03	0.06	0.03	0.18	0.06	0.06
O4'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.04	0.03	0.05	0.07	0.06	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.05	0.03	0.26	0.08	0.11
O5'	0.06	0.12	0.05	0.06	0.13	0.02	0.17	0.02	0.18	0.17	0.16	0.10	0.10	0.19	0.12	0.06	0.06	0.05	0.00	0.21	0.01	0.02	0.01
O6	0.02	0.03	0.09	0.06	0.01	0.03	0.01	0.09	0.00	0.02	0.02	0.04	0.02	0.02	0.01	0.14	0.03	0.03	0.21	0.00	0.12	0.12	0.13
OP1	0.23	0.18	0.20	0.17	0.19	0.18	0.15	0.12	0.14	0.18	0.16	0.19	0.20	0.14	0.21	0.21	0.18	0.26	0.01	0.12	0.00	0.02	0.01
OP2	0.06	0.06	0.07	0.07	0.06	0.06	0.08	0.07	0.10	0.07	0.08	0.05	0.05	0.09	0.06	0.09	0.06	0.08	0.02	0.12	0.02	0.00	0.01
P	0.08	0.07	0.09	0.07	0.06	0.06	0.08	0.03	0.10	0.06	0.09	0.07	0.06	0.09	0.06	0.10	0.06	0.11	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.23	0.13	0.11	0.10	0.18	0.22	0.34	0.25	0.09	0.25	0.14	0.34	0.20	0.10	0.16	0.27	0.55	0.36	0.27
C2	0.07	0.14	0.11	0.08	0.08	0.09	0.26	0.15	0.23	0.08	0.19	0.10	0.24	0.13	0.08	0.09	0.30	0.58	0.57	0.37
C2'	0.13	0.22	0.15	0.15	0.09	0.23	0.21	0.42	0.23	0.09	0.24	0.14	0.35	0.23	0.15	0.20	0.20	0.67	0.25	0.26
C3'	0.24	0.29	0.24	0.26	0.18	0.31	0.18	0.49	0.22	0.20	0.29	0.20	0.38	0.30	0.27	0.27	0.16	0.74	0.19	0.29
C4	0.11	0.16	0.15	0.13	0.13	0.17	0.32	0.26	0.30	0.13	0.21	0.13	0.28	0.17	0.12	0.18	0.34	0.50	0.53	0.33
C4'	0.27	0.34	0.27	0.26	0.21	0.30	0.14	0.46	0.19	0.24	0.32	0.21	0.42	0.32	0.26	0.29	0.16	0.55	0.19	0.22
C5	0.19	0.20	0.21	0.20	0.23	0.23	0.35	0.29	0.33	0.21	0.21	0.22	0.29	0.21	0.19	0.25	0.37	0.43	0.56	0.33
C5'	0.26	0.32	0.28	0.27	0.18	0.33	0.09	0.47	0.13	0.21	0.30	0.18	0.43	0.35	0.28	0.32	0.14	0.43	0.19	0.18
C6	0.19	0.20	0.20	0.19	0.24	0.20	0.33	0.24	0.30	0.20	0.20	0.26	0.27	0.20	0.19	0.23	0.36	0.43	0.59	0.35
C8	0.24	0.21	0.24	0.24	0.20	0.30	0.35	0.40	0.37	0.25	0.20	0.17	0.33	0.25	0.22	0.34	0.39	0.42	0.50	0.32
N1	0.12	0.15	0.15	0.13	0.16	0.14	0.29	0.18	0.25	0.13	0.16	0.19	0.23	0.15	0.13	0.15	0.33	0.50	0.60	0.36
N2	0.07	0.15	0.10	0.06	0.08	0.05	0.22	0.11	0.19	0.07	0.20	0.12	0.23	0.12	0.07	0.04	0.28	0.66	0.58	0.40
N3	0.07	0.16	0.11	0.07	0.07	0.09	0.27	0.19	0.25	0.07	0.23	0.13	0.26	0.14	0.06	0.08	0.30	0.59	0.53	0.36
N7	0.27	0.26	0.28	0.27	0.26	0.31	0.37	0.37	0.37	0.29	0.23	0.23	0.34	0.27	0.26	0.34	0.40	0.40	0.55	0.34
N9	0.12	0.18	0.15	0.14	0.11	0.21	0.30	0.33	0.31	0.13	0.21	0.13	0.31	0.19	0.13	0.22	0.34	0.47	0.47	0.30
O2'	0.13	0.19	0.14	0.15	0.09	0.23	0.24	0.42	0.25	0.09	0.21	0.14	0.31	0.22	0.15	0.18	0.20	0.77	0.23	0.29
O3'	0.30	0.33	0.29	0.31	0.27	0.32	0.26	0.46	0.30	0.28	0.34	0.29	0.39	0.33	0.31	0.29	0.20	0.92	0.23	0.40
O4'	0.17	0.31	0.17	0.14	0.17	0.20	0.12	0.37	0.17	0.16	0.31	0.19	0.39	0.24	0.12	0.19	0.27	0.45	0.32	0.23
O5'	0.18	0.29	0.20	0.19	0.17	0.27	0.15	0.43	0.16	0.15	0.28	0.19	0.42	0.29	0.19	0.28	0.14	0.45	0.19	0.19
O6	0.23	0.23	0.24	0.23	0.27	0.24	0.33	0.25	0.30	0.23	0.22	0.30	0.29	0.23	0.23	0.26	0.37	0.40	0.60	0.34
OP1	0.16	0.12	0.24	0.18	0.13	0.25	0.26	0.36	0.29	0.17	0.12	0.12	0.26	0.29	0.18	0.26	0.35	0.39	0.46	0.37
OP2	0.23	0.23	0.33	0.24	0.11	0.24	0.12	0.36	0.16	0.17	0.20	0.10	0.35	0.45	0.26	0.23	0.18	0.34	0.22	0.16
P	0.10	0.16	0.20	0.08	0.04	0.17	0.16	0.34	0.19	0.07	0.15	0.07	0.31	0.31	0.09	0.19	0.19	0.36	0.27	0.21

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.11	0.13	0.36	0.20
C2	0.02	0.00	0.17	0.16	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.15	0.18	0.05	0.21	0.20	0.49	0.23
C2'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.05	0.01	0.07	0.02	0.12	0.02	0.15	0.06	0.29	0.00	0.02	0.00	0.22	0.40	0.23	0.08
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.03	0.01	0.14	0.03	0.19	0.02	0.13	0.04	0.28	0.02	0.01	0.01	0.30	0.60	0.15	0.20
C4	0.02	0.00	0.05	0.03	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.04	0.04	0.34	0.34	0.50	0.22
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.09	0.01	0.10	0.02	0.03	0.05	0.08	0.03	0.02	0.00	0.01	0.30	0.29	0.07
C5	0.01	0.01	0.07	0.14	0.01	0.09	0.00	0.15	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.14	0.03	0.38	0.35	0.47	0.21
C5'	0.02	0.05	0.02	0.03	0.10	0.01	0.15	0.00	0.15	0.05	0.06	0.12	0.09	0.03	0.04	0.01	0.01	0.34	0.36	0.01
C6	0.01	0.01	0.12	0.19	0.01	0.10	0.00	0.15	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.06	0.19	0.04	0.34	0.27	0.40	0.20
N1	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.22	0.19	0.42	0.21
N3	0.02	0.00	0.15	0.13	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.17	0.05	0.27	0.27	0.52	0.24
N4	0.02	0.01	0.06	0.04	0.00	0.05	0.02	0.12	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.09	0.05	0.05	0.36	0.40	0.52	0.23
O2	0.03	0.00	0.29	0.28	0.01	0.08	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.24	0.33	0.07	0.15	0.15	0.51	0.24
O2'	0.01	0.15	0.00	0.02	0.08	0.03	0.04	0.03	0.06	0.03	0.14	0.09	0.24	0.00	0.05	0.04	0.13	0.43	0.17	0.05
O3'	0.02	0.18	0.02	0.01	0.04	0.02	0.14	0.04	0.19	0.01	0.17	0.05	0.33	0.05	0.00	0.02	0.26	0.81	0.15	0.29
O4'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.05	0.05	0.07	0.04	0.02	0.00	0.13	0.15	0.46	0.31
O5'	0.11	0.21	0.22	0.30	0.34	0.01	0.38	0.01	0.34	0.22	0.27	0.36	0.15	0.13	0.26	0.13	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.13	0.20	0.40	0.60	0.34	0.30	0.35	0.34	0.27	0.19	0.27	0.40	0.15	0.43	0.81	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.36	0.49	0.23	0.15	0.50	0.29	0.47	0.36	0.40	0.42	0.52	0.52	0.51	0.17	0.15	0.46	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.20	0.23	0.08	0.20	0.22	0.07	0.21	0.01	0.20	0.21	0.24	0.23	0.24	0.05	0.29	0.31	0.01	0.01	0.01	0.00