Doublet Group distance statistics: 53208

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 1, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.004, 0.008, 0.013, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.008 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.002, 0.007, 0.011, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.004, 0.011, 0.018, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.002, 0.010, 0.018, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.010 std_dev=0.008
N9	A	0, 0.002, 0.011, 0.020, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.011 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.002, 0.012, 0.022, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.012 std_dev=0.010
N7	A	0, 0.007, 0.018, 0.028, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C8	A	0, 0.007, 0.019, 0.031, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.019 std_dev=0.012
O6	A	0, 0.009, 0.025, 0.042, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.025 std_dev=0.016
N2	A	0, 0.011, 0.041, 0.071, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.041 std_dev=0.030
O2	B	0, 0.103, 0.291, 0.479, 0.565 max_d=0.565 avg_d=0.291 std_dev=0.188
C2	B	0, 0.091, 0.279, 0.467, 0.501 max_d=0.501 avg_d=0.279 std_dev=0.188
N3	B	0, 0.091, 0.289, 0.487, 0.562 max_d=0.562 avg_d=0.289 std_dev=0.198
N1	B	0, 0.077, 0.283, 0.488, 0.533 max_d=0.533 avg_d=0.283 std_dev=0.205
C1'	B	0, 0.058, 0.285, 0.511, 0.591 max_d=0.591 avg_d=0.285 std_dev=0.227
C4	B	0, 0.083, 0.311, 0.539, 0.671 max_d=0.671 avg_d=0.311 std_dev=0.228
O4'	A	0, -0.053, 0.175, 0.404, 0.622 max_d=0.622 avg_d=0.175 std_dev=0.229
C6	B	0, 0.078, 0.312, 0.546, 0.677 max_d=0.677 avg_d=0.312 std_dev=0.234
C2'	A	0, -0.064, 0.171, 0.407, 0.637 max_d=0.637 avg_d=0.171 std_dev=0.235
C5	B	0, 0.081, 0.327, 0.572, 0.730 max_d=0.730 avg_d=0.327 std_dev=0.246
N4	B	0, 0.094, 0.340, 0.587, 0.733 max_d=0.733 avg_d=0.340 std_dev=0.246
O2'	B	0, 0.041, 0.293, 0.545, 0.630 max_d=0.630 avg_d=0.293 std_dev=0.252
C2'	B	0, 0.015, 0.291, 0.568, 0.656 max_d=0.656 avg_d=0.291 std_dev=0.276
O2'	A	0, -0.105, 0.177, 0.460, 0.741 max_d=0.741 avg_d=0.177 std_dev=0.282
O4'	B	0, 0.078, 0.403, 0.727, 0.890 max_d=0.890 avg_d=0.403 std_dev=0.324
C4'	A	0, -0.057, 0.273, 0.603, 0.912 max_d=0.912 avg_d=0.273 std_dev=0.330
C3'	A	0, -0.079, 0.288, 0.655, 1.006 max_d=1.006 avg_d=0.288 std_dev=0.367
C3'	B	0, 0.002, 0.399, 0.797, 1.077 max_d=1.077 avg_d=0.399 std_dev=0.398
C4'	B	0, 0.019, 0.449, 0.878, 1.184 max_d=1.184 avg_d=0.449 std_dev=0.429
O3'	B	0, 0.009, 0.440, 0.871, 1.184 max_d=1.184 avg_d=0.440 std_dev=0.431
O3'	A	0, -0.101, 0.415, 0.931, 1.423 max_d=1.423 avg_d=0.415 std_dev=0.516
O5'	A	0, -0.096, 0.490, 1.076, 1.626 max_d=1.626 avg_d=0.490 std_dev=0.586
C5'	A	0, -0.123, 0.479, 1.080, 1.653 max_d=1.653 avg_d=0.479 std_dev=0.601
C5'	B	0, -0.027, 0.645, 1.318, 1.909 max_d=1.909 avg_d=0.645 std_dev=0.673
O5'	B	0, -0.049, 0.661, 1.370, 2.015 max_d=2.015 avg_d=0.661 std_dev=0.710
P	B	0, -0.139, 0.771, 1.680, 2.551 max_d=2.551 avg_d=0.771 std_dev=0.910
OP2	B	0, -0.145, 0.791, 1.727, 2.627 max_d=2.627 avg_d=0.791 std_dev=0.936
OP1	B	0, -0.170, 0.950, 2.070, 3.141 max_d=3.141 avg_d=0.950 std_dev=1.120
OP1	A	0, -0.272, 0.851, 1.973, 3.065 max_d=3.065 avg_d=0.851 std_dev=1.122
P	A	0, -0.404, 0.907, 2.219, 3.509 max_d=3.509 avg_d=0.907 std_dev=1.311
OP2	A	0, -0.924, 1.440, 3.804, 6.152 max_d=6.152 avg_d=1.440 std_dev=2.364

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.14	0.01	0.06	0.42	0.05
C2	0.02	0.00	0.15	0.17	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.23	0.05	0.35	0.01	0.28	0.14	0.28
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.08	0.01	0.03	0.01	0.05	0.08	0.11	0.17	0.16	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.27	0.03	0.31	0.45	0.01
C3'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.09	0.00	0.05	0.01	0.08	0.10	0.14	0.20	0.17	0.07	0.02	0.00	0.00	0.00	0.38	0.06	0.53	0.29	0.14
C4	0.00	0.01	0.08	0.09	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.11	0.02	0.37	0.01	0.31	0.24	0.34
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.04	0.04	0.05	0.05	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.12	0.71	0.22
C5	0.00	0.01	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.06	0.01	0.48	0.01	0.48	0.69	0.59
C5'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.06	0.00	0.06	0.00	0.07	0.03	0.08	0.07	0.07	0.05	0.03	0.02	0.02	0.00	0.01	0.07	0.34	0.30	0.02
C6	0.01	0.01	0.05	0.08	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.10	0.02	0.51	0.00	0.53	0.78	0.64
C8	0.00	0.01	0.08	0.10	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.06	0.12	0.03	0.49	0.02	0.47	0.69	0.60
N1	0.01	0.01	0.11	0.14	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.18	0.04	0.44	0.01	0.42	0.48	0.47
N2	0.03	0.01	0.17	0.20	0.02	0.05	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.15	0.28	0.07	0.31	0.02	0.22	0.09	0.18
N3	0.01	0.01	0.16	0.17	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.12	0.21	0.04	0.29	0.01	0.21	0.08	0.17
N7	0.00	0.01	0.05	0.07	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.08	0.02	0.56	0.02	0.58	0.98	0.76
N9	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.34	0.01	0.28	0.16	0.29
O2'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.05	0.02	0.02	0.02	0.04	0.06	0.08	0.15	0.12	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.09	0.02	0.08	0.95	0.30
O3'	0.01	0.23	0.01	0.00	0.11	0.01	0.06	0.02	0.10	0.12	0.18	0.28	0.21	0.08	0.03	0.02	0.00	0.01	0.34	0.08	0.65	0.50	0.05
O4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.03	0.04	0.07	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.09	0.54	0.17
O5'	0.14	0.35	0.27	0.38	0.37	0.01	0.48	0.01	0.51	0.49	0.44	0.31	0.29	0.56	0.34	0.09	0.34	0.03	0.00	0.57	0.02	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.08	0.02	0.57	0.00	0.63	1.05	0.79
OP1	0.06	0.28	0.31	0.53	0.31	0.12	0.48	0.34	0.53	0.47	0.42	0.22	0.21	0.58	0.28	0.08	0.65	0.09	0.02	0.63	0.00	0.01	0.01
OP2	0.42	0.14	0.45	0.29	0.24	0.71	0.69	0.30	0.78	0.69	0.48	0.09	0.08	0.98	0.16	0.95	0.50	0.54	0.01	1.05	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.28	0.01	0.14	0.34	0.22	0.59	0.02	0.64	0.60	0.47	0.18	0.17	0.76	0.29	0.30	0.05	0.17	0.00	0.79	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.23	0.34	0.30	0.16	0.21	0.16	0.21	0.18	0.21	0.20	0.13	0.27	0.33	0.33	0.21	0.22	0.20	0.28	0.19
C2	0.21	0.13	0.26	0.22	0.12	0.18	0.12	0.20	0.15	0.17	0.12	0.13	0.14	0.29	0.22	0.19	0.19	0.17	0.19	0.15
C2'	0.36	0.32	0.49	0.43	0.21	0.31	0.23	0.28	0.28	0.32	0.25	0.15	0.37	0.53	0.48	0.29	0.31	0.27	0.35	0.27
C3'	0.34	0.28	0.44	0.39	0.20	0.30	0.22	0.28	0.27	0.30	0.22	0.14	0.31	0.46	0.42	0.28	0.31	0.27	0.38	0.28
C4	0.23	0.21	0.31	0.27	0.14	0.20	0.15	0.20	0.18	0.21	0.17	0.10	0.24	0.31	0.29	0.19	0.23	0.20	0.30	0.21
C4'	0.20	0.18	0.28	0.25	0.14	0.20	0.15	0.21	0.17	0.18	0.16	0.11	0.20	0.27	0.27	0.20	0.21	0.20	0.29	0.19
C5	0.23	0.22	0.30	0.28	0.16	0.20	0.18	0.20	0.21	0.23	0.19	0.11	0.23	0.28	0.28	0.18	0.27	0.25	0.39	0.27
C5'	0.17	0.15	0.22	0.21	0.13	0.17	0.15	0.18	0.16	0.16	0.13	0.11	0.16	0.19	0.21	0.18	0.20	0.19	0.32	0.20
C6	0.23	0.18	0.26	0.25	0.13	0.20	0.16	0.21	0.21	0.22	0.13	0.09	0.17	0.25	0.25	0.19	0.27	0.26	0.40	0.29
C8	0.23	0.25	0.32	0.31	0.20	0.21	0.20	0.21	0.22	0.23	0.23	0.17	0.27	0.30	0.33	0.19	0.27	0.26	0.41	0.28
N1	0.21	0.12	0.24	0.21	0.11	0.18	0.11	0.18	0.16	0.18	0.10	0.14	0.11	0.25	0.21	0.17	0.22	0.19	0.28	0.20
N2	0.18	0.11	0.21	0.19	0.15	0.19	0.14	0.24	0.14	0.13	0.14	0.17	0.09	0.27	0.19	0.21	0.20	0.21	0.12	0.16
N3	0.22	0.17	0.30	0.25	0.11	0.20	0.12	0.21	0.16	0.19	0.13	0.10	0.20	0.32	0.26	0.20	0.20	0.18	0.21	0.16
N7	0.24	0.25	0.31	0.30	0.21	0.21	0.21	0.22	0.23	0.24	0.23	0.17	0.25	0.28	0.31	0.19	0.30	0.30	0.45	0.32
N9	0.23	0.23	0.33	0.30	0.17	0.20	0.17	0.20	0.19	0.22	0.20	0.13	0.27	0.32	0.32	0.20	0.24	0.21	0.33	0.22
O2'	0.36	0.32	0.52	0.45	0.21	0.31	0.21	0.28	0.26	0.31	0.25	0.16	0.38	0.58	0.51	0.28	0.29	0.26	0.30	0.24
O3'	0.40	0.32	0.51	0.46	0.22	0.36	0.26	0.32	0.32	0.35	0.25	0.15	0.36	0.55	0.50	0.34	0.35	0.31	0.41	0.32
O4'	0.16	0.15	0.21	0.20	0.12	0.18	0.12	0.19	0.13	0.15	0.14	0.10	0.17	0.19	0.22	0.20	0.17	0.17	0.24	0.15
O5'	0.20	0.20	0.15	0.15	0.30	0.23	0.31	0.28	0.27	0.23	0.25	0.35	0.14	0.18	0.19	0.30	0.20	0.22	0.07	0.18
O6	0.23	0.17	0.24	0.25	0.13	0.22	0.19	0.24	0.23	0.22	0.12	0.09	0.15	0.23	0.24	0.20	0.32	0.34	0.48	0.36
OP1	0.17	0.12	0.37	0.35	0.20	0.18	0.21	0.18	0.17	0.13	0.12	0.27	0.20	0.43	0.48	0.19	0.16	0.16	0.15	0.12
OP2	0.28	0.18	0.52	0.47	0.59	0.34	0.51	0.25	0.30	0.17	0.41	0.84	0.20	0.74	0.66	0.22	0.19	0.17	0.11	0.13
P	0.16	0.22	0.24	0.22	0.46	0.16	0.42	0.20	0.31	0.22	0.36	0.58	0.12	0.34	0.33	0.21	0.17	0.18	0.09	0.15

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.08	0.05
C2	0.04	0.00	0.04	0.07	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.07	0.04	0.14	0.14	0.24	0.16
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.03	0.02	0.07	0.00	0.02	0.00	0.03	0.10	0.05	0.04
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.06	0.00	0.05	0.01	0.06	0.03	0.08	0.07	0.09	0.02	0.01	0.01	0.07	0.13	0.13	0.10
C4	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.05	0.01	0.21	0.27	0.38	0.28
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.06	0.00	0.05	0.01	0.04	0.03	0.05	0.07	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.08	0.04	0.03
C5	0.01	0.00	0.04	0.05	0.01	0.05	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.06	0.03	0.19	0.25	0.35	0.26
C5'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.12	0.01	0.12	0.00	0.08	0.06	0.10	0.14	0.05	0.03	0.02	0.01	0.01	0.05	0.03	0.02
C6	0.01	0.01	0.05	0.06	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.07	0.04	0.14	0.15	0.23	0.18
N1	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.11	0.10	0.19	0.13
N3	0.03	0.00	0.03	0.08	0.01	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.08	0.03	0.18	0.23	0.33	0.24
N4	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.04	0.07	0.02	0.23	0.34	0.44	0.32
O2	0.06	0.01	0.07	0.09	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.02	0.01	0.03	0.00	0.05	0.09	0.08	0.10	0.10	0.19	0.12
O2'	0.01	0.03	0.00	0.02	0.04	0.02	0.04	0.03	0.04	0.02	0.04	0.04	0.05	0.00	0.03	0.01	0.05	0.15	0.08	0.07
O3'	0.02	0.07	0.02	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.07	0.03	0.08	0.07	0.09	0.03	0.00	0.01	0.11	0.21	0.23	0.17
O4'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.08	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.08	0.06
O5'	0.03	0.14	0.03	0.07	0.21	0.02	0.19	0.01	0.14	0.11	0.18	0.23	0.10	0.05	0.11	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.02	0.14	0.10	0.13	0.27	0.08	0.25	0.05	0.15	0.10	0.23	0.34	0.10	0.15	0.21	0.02	0.02	0.00	0.03	0.01
OP2	0.08	0.24	0.05	0.13	0.38	0.04	0.35	0.03	0.23	0.19	0.33	0.44	0.19	0.08	0.23	0.08	0.01	0.03	0.00	0.02
P	0.05	0.16	0.04	0.10	0.28	0.03	0.26	0.02	0.18	0.13	0.24	0.32	0.12	0.07	0.17	0.06	0.01	0.01	0.02	0.00