Doublet Group distance statistics: 53209

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.007, 0.011, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.004
C2	A	0, 0.000, 0.005, 0.010, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.005 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.001, 0.008, 0.015, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.008 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.001, 0.008, 0.015, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.008 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.001, 0.009, 0.017, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.009 std_dev=0.008
N2	A	0, 0.002, 0.012, 0.023, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.012 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.001, 0.012, 0.023, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.012 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.000, 0.014, 0.029, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.014 std_dev=0.015
O6	A	0, 0.004, 0.021, 0.038, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.021 std_dev=0.017
N7	A	0, -0.001, 0.022, 0.044, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.022 std_dev=0.023
C8	A	0, -0.002, 0.026, 0.054, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.026 std_dev=0.028
O4'	A	0, 0.062, 0.379, 0.695, 0.841 max_d=0.841 avg_d=0.379 std_dev=0.316
C2'	A	0, 0.074, 0.412, 0.750, 0.893 max_d=0.893 avg_d=0.412 std_dev=0.338
C1'	B	0, 0.218, 0.615, 1.012, 1.250 max_d=1.250 avg_d=0.615 std_dev=0.397
N1	B	0, 0.290, 0.724, 1.158, 1.288 max_d=1.288 avg_d=0.724 std_dev=0.434
C6	B	0, 0.329, 0.784, 1.240, 1.260 max_d=1.260 avg_d=0.784 std_dev=0.456
C2'	B	0, 0.291, 0.784, 1.276, 1.432 max_d=1.432 avg_d=0.784 std_dev=0.492
O4'	B	0, 0.321, 0.836, 1.352, 1.460 max_d=1.460 avg_d=0.836 std_dev=0.515
C2	B	0, 0.362, 0.902, 1.443, 1.466 max_d=1.466 avg_d=0.902 std_dev=0.541
C4'	A	0, 0.130, 0.683, 1.235, 1.453 max_d=1.453 avg_d=0.683 std_dev=0.553
C5	B	0, 0.391, 0.946, 1.501, 1.610 max_d=1.610 avg_d=0.946 std_dev=0.555
O2	B	0, 0.422, 0.997, 1.571, 1.583 max_d=1.583 avg_d=0.997 std_dev=0.575
C4'	B	0, 0.379, 0.954, 1.529, 1.521 max_d=1.521 avg_d=0.954 std_dev=0.575
C5'	A	0, 0.068, 0.661, 1.253, 1.687 max_d=1.687 avg_d=0.661 std_dev=0.592
C3'	B	0, 0.364, 0.965, 1.567, 1.563 max_d=1.563 avg_d=0.965 std_dev=0.602
N3	B	0, 0.397, 1.052, 1.708, 1.766 max_d=1.766 avg_d=1.052 std_dev=0.655
C4	B	0, 0.394, 1.049, 1.705, 1.836 max_d=1.836 avg_d=1.049 std_dev=0.656
O2'	A	0, 0.176, 0.846, 1.516, 1.656 max_d=1.656 avg_d=0.846 std_dev=0.670
C3'	A	0, 0.207, 0.918, 1.630, 1.636 max_d=1.636 avg_d=0.918 std_dev=0.711
O2'	B	0, 0.347, 1.083, 1.819, 1.763 max_d=1.763 avg_d=1.083 std_dev=0.736
O3'	B	0, 0.346, 1.126, 1.906, 2.102 max_d=2.102 avg_d=1.126 std_dev=0.780
N4	B	0, 0.431, 1.235, 2.039, 2.289 max_d=2.289 avg_d=1.235 std_dev=0.804
C5'	B	0, 0.517, 1.557, 2.597, 2.559 max_d=2.559 avg_d=1.557 std_dev=1.040
O3'	A	0, 0.375, 1.662, 2.949, 2.851 max_d=2.851 avg_d=1.662 std_dev=1.287
O5'	A	0, 0.459, 2.036, 3.614, 3.910 max_d=3.910 avg_d=2.036 std_dev=1.578
O5'	B	0, 0.886, 3.028, 5.169, 5.143 max_d=5.143 avg_d=3.028 std_dev=2.142
P	A	0, 0.703, 3.043, 5.384, 5.608 max_d=5.608 avg_d=3.043 std_dev=2.341
OP2	A	0, 0.897, 3.659, 6.421, 6.540 max_d=6.540 avg_d=3.659 std_dev=2.762
OP1	A	0, 0.958, 4.158, 7.359, 7.600 max_d=7.600 avg_d=4.158 std_dev=3.200
P	B	0, 1.256, 4.568, 7.881, 7.429 max_d=7.429 avg_d=4.568 std_dev=3.313
OP1	B	0, 1.218, 4.557, 7.895, 7.908 max_d=7.908 avg_d=4.557 std_dev=3.338
OP2	B	0, 1.435, 5.218, 9.002, 8.634 max_d=8.634 avg_d=5.218 std_dev=3.783

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.25	0.00	0.36	0.01	0.14	0.46	0.11
C2	0.01	0.00	0.14	0.07	0.00	0.12	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.35	0.18	0.45	0.01	0.23	0.72	0.18
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.07	0.01	0.04	0.19	0.07	0.09	0.12	0.17	0.14	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.06	0.16	0.29	0.04
C3'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.15	0.00	0.25	0.02	0.24	0.34	0.15	0.06	0.05	0.35	0.19	0.01	0.00	0.02	0.18	0.29	0.17	0.27	0.07
C4	0.01	0.00	0.07	0.15	0.00	0.03	0.00	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.15	0.10	0.60	0.01	0.16	0.92	0.40
C4'	0.00	0.12	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.02	0.16	0.07	0.17	0.12	0.13	0.05	0.26	0.01	0.00	0.01	0.04	0.35	0.11	0.26
C5	0.00	0.00	0.04	0.25	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.21	0.04	0.05	0.80	0.01	0.53	1.30	0.71
C5'	0.07	0.16	0.19	0.02	0.10	0.00	0.08	0.00	0.09	0.13	0.12	0.20	0.15	0.12	0.06	0.07	0.19	0.01	0.01	0.09	0.17	0.10	0.01
C6	0.01	0.00	0.07	0.24	0.01	0.02	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.18	0.04	0.08	0.78	0.00	0.49	1.32	0.69
C8	0.01	0.00	0.09	0.34	0.00	0.16	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.32	0.23	0.09	0.95	0.01	0.80	1.40	0.92
N1	0.01	0.00	0.12	0.15	0.00	0.07	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.09	0.20	0.14	0.62	0.00	0.18	1.02	0.41
N2	0.01	0.00	0.17	0.06	0.00	0.17	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.48	0.21	0.32	0.01	0.48	0.52	0.13
N3	0.01	0.00	0.14	0.05	0.00	0.12	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.37	0.18	0.40	0.01	0.27	0.62	0.13
N7	0.00	0.00	0.06	0.35	0.00	0.13	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.32	0.23	0.05	0.99	0.01	0.91	1.61	1.03
N9	0.00	0.00	0.01	0.19	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.05	0.01	0.65	0.01	0.26	0.92	0.47
O2'	0.02	0.06	0.00	0.01	0.11	0.26	0.21	0.07	0.18	0.32	0.09	0.12	0.07	0.32	0.16	0.00	0.02	0.18	0.22	0.22	0.15	0.31	0.07
O3'	0.25	0.35	0.01	0.00	0.15	0.01	0.04	0.19	0.04	0.23	0.20	0.48	0.37	0.23	0.05	0.02	0.00	0.19	0.17	0.08	0.30	0.23	0.15
O4'	0.00	0.18	0.01	0.02	0.10	0.00	0.05	0.01	0.08	0.09	0.14	0.21	0.18	0.05	0.01	0.18	0.19	0.00	0.31	0.06	0.22	0.25	0.07
O5'	0.36	0.45	0.16	0.18	0.60	0.01	0.80	0.01	0.78	0.95	0.62	0.32	0.40	0.99	0.65	0.22	0.17	0.31	0.00	0.87	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.06	0.29	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.22	0.08	0.06	0.87	0.00	0.70	1.53	0.86
OP1	0.14	0.23	0.16	0.17	0.16	0.35	0.53	0.17	0.49	0.80	0.18	0.48	0.27	0.91	0.26	0.15	0.30	0.22	0.01	0.70	0.00	0.01	0.00
OP2	0.46	0.72	0.29	0.27	0.92	0.11	1.30	0.10	1.32	1.40	1.02	0.52	0.62	1.61	0.92	0.31	0.23	0.25	0.01	1.53	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.18	0.04	0.07	0.40	0.26	0.71	0.01	0.69	0.92	0.41	0.13	0.13	1.03	0.47	0.07	0.15	0.07	0.00	0.86	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.25	0.30	0.20	0.22	0.31	0.46	0.32	0.69	0.32	0.30	0.30	0.30	0.29	0.12	0.30	0.49	1.23	1.49	1.25	1.50
C2	0.18	0.10	0.23	0.30	0.19	0.47	0.34	0.74	0.33	0.16	0.14	0.25	0.21	0.22	0.33	0.42	0.94	1.09	1.22	1.15
C2'	0.22	0.27	0.14	0.17	0.34	0.41	0.38	0.71	0.36	0.29	0.30	0.35	0.24	0.16	0.36	0.46	1.44	1.79	1.49	1.82
C3'	0.14	0.20	0.17	0.30	0.20	0.11	0.24	0.29	0.25	0.15	0.23	0.23	0.30	0.28	0.53	0.15	0.88	1.17	0.82	1.12
C4	0.19	0.22	0.15	0.21	0.34	0.45	0.39	0.67	0.36	0.27	0.27	0.35	0.17	0.17	0.36	0.48	0.99	1.19	1.12	1.23
C4'	0.20	0.10	0.24	0.34	0.17	0.20	0.24	0.37	0.27	0.18	0.12	0.17	0.14	0.32	0.53	0.14	0.74	0.93	0.52	0.77
C5	0.20	0.26	0.13	0.17	0.44	0.40	0.46	0.61	0.40	0.29	0.35	0.46	0.18	0.26	0.43	0.46	0.87	1.06	0.95	1.06
C5'	0.20	0.09	0.36	0.50	0.11	0.34	0.16	0.45	0.20	0.14	0.11	0.11	0.16	0.47	0.71	0.16	0.61	0.61	0.43	0.38
C6	0.20	0.18	0.18	0.20	0.43	0.40	0.49	0.62	0.41	0.27	0.27	0.48	0.14	0.31	0.43	0.44	0.79	0.96	0.94	0.97
C8	0.23	0.39	0.07	0.10	0.44	0.37	0.41	0.56	0.37	0.34	0.44	0.46	0.38	0.22	0.44	0.46	0.95	1.17	0.89	1.14
N1	0.20	0.10	0.22	0.25	0.28	0.43	0.43	0.68	0.38	0.22	0.10	0.32	0.20	0.29	0.38	0.42	0.82	0.98	1.05	1.01
N2	0.18	0.20	0.27	0.35	0.20	0.48	0.23	0.78	0.25	0.13	0.28	0.31	0.28	0.23	0.30	0.36	0.94	1.07	1.31	1.14
N3	0.17	0.10	0.22	0.29	0.24	0.49	0.33	0.76	0.32	0.18	0.17	0.27	0.15	0.15	0.31	0.46	1.05	1.23	1.30	1.30
N7	0.20	0.37	0.07	0.13	0.49	0.36	0.47	0.55	0.40	0.33	0.46	0.53	0.30	0.27	0.47	0.45	0.85	1.05	0.84	1.02
N9	0.22	0.32	0.13	0.17	0.36	0.43	0.37	0.64	0.35	0.31	0.34	0.36	0.29	0.14	0.36	0.49	1.06	1.28	1.08	1.29
O2'	0.52	0.38	0.55	0.66	0.42	0.94	0.51	1.30	0.55	0.49	0.36	0.39	0.33	0.35	0.43	0.83	2.14	2.66	2.36	2.69
O3'	0.46	0.22	0.42	0.50	0.44	0.44	0.64	0.43	0.67	0.46	0.25	0.43	0.04	0.37	0.55	0.50	0.64	1.08	0.69	0.95
O4'	0.09	0.13	0.03	0.11	0.15	0.23	0.18	0.40	0.18	0.13	0.14	0.16	0.18	0.18	0.36	0.19	0.78	1.01	0.68	0.88
O5'	0.17	0.52	0.50	0.93	0.46	0.67	0.23	0.73	0.14	0.20	0.62	0.55	0.71	0.50	1.20	0.26	0.56	0.57	0.82	0.35
O6	0.20	0.20	0.18	0.20	0.48	0.37	0.53	0.58	0.43	0.28	0.31	0.57	0.14	0.36	0.47	0.42	0.72	0.88	0.87	0.87
OP1	1.01	0.24	1.38	2.00	0.44	1.97	0.87	2.24	1.05	0.76	0.17	0.34	0.21	0.97	1.77	1.38	1.89	2.03	2.21	1.89
OP2	0.46	0.54	1.09	1.75	0.56	1.31	0.22	1.49	0.25	0.16	0.77	0.73	0.79	0.94	1.90	0.65	1.33	1.82	2.14	1.59
P	0.69	0.17	1.14	1.76	0.14	1.48	0.38	1.61	0.57	0.39	0.29	0.21	0.43	0.88	1.86	0.93	1.39	1.59	1.91	1.45

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.21	0.00	0.26	0.48	0.75	0.27
C2	0.01	0.00	0.12	0.08	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.21	0.29	0.07	0.30	0.38	1.02	0.38
C2'	0.00	0.12	0.00	0.01	0.06	0.01	0.10	0.17	0.12	0.03	0.10	0.06	0.21	0.00	0.04	0.01	0.60	0.79	1.20	0.80
C3'	0.02	0.08	0.01	0.00	0.02	0.01	0.10	0.02	0.11	0.01	0.05	0.02	0.16	0.01	0.00	0.02	0.34	0.68	0.76	0.51
C4	0.01	0.00	0.06	0.02	0.00	0.04	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.18	0.01	0.46	0.36	0.96	0.43
C4'	0.02	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.08	0.01	0.09	0.01	0.03	0.04	0.09	0.14	0.07	0.01	0.02	0.55	0.19	0.17
C5	0.00	0.00	0.10	0.10	0.00	0.08	0.00	0.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.09	0.06	0.57	0.39	0.81	0.44
C5'	0.07	0.10	0.17	0.02	0.25	0.01	0.33	0.00	0.32	0.17	0.15	0.27	0.02	0.02	0.27	0.02	0.01	0.14	0.24	0.02
C6	0.00	0.00	0.12	0.11	0.00	0.09	0.00	0.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.08	0.08	0.55	0.43	0.75	0.41
N1	0.00	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.19	0.00	0.37	0.42	0.87	0.36
N3	0.01	0.00	0.10	0.05	0.00	0.03	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.20	0.26	0.06	0.35	0.35	1.06	0.42
N4	0.01	0.00	0.06	0.02	0.00	0.04	0.00	0.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	0.18	0.01	0.48	0.34	0.98	0.45
O2	0.01	0.00	0.21	0.16	0.00	0.09	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.36	0.38	0.12	0.26	0.38	1.08	0.35
O2'	0.03	0.21	0.00	0.01	0.15	0.14	0.15	0.02	0.14	0.07	0.20	0.17	0.36	0.00	0.03	0.07	0.55	0.76	1.43	0.84
O3'	0.21	0.29	0.04	0.00	0.18	0.07	0.09	0.27	0.08	0.19	0.26	0.18	0.38	0.03	0.00	0.11	0.22	0.56	0.54	0.20
O4'	0.00	0.07	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.02	0.08	0.00	0.06	0.01	0.12	0.07	0.11	0.00	0.05	0.45	0.49	0.14
O5'	0.26	0.30	0.60	0.34	0.46	0.02	0.57	0.01	0.55	0.37	0.35	0.48	0.26	0.55	0.22	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.48	0.38	0.79	0.68	0.36	0.55	0.39	0.14	0.43	0.42	0.35	0.34	0.38	0.76	0.56	0.45	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.75	1.02	1.20	0.76	0.96	0.19	0.81	0.24	0.75	0.87	1.06	0.98	1.08	1.43	0.54	0.49	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.27	0.38	0.80	0.51	0.43	0.17	0.44	0.02	0.41	0.36	0.42	0.45	0.35	0.84	0.20	0.14	0.01	0.00	0.00	0.00