Doublet Group distance statistics: 53211

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.005, 0.008, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.005 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.003, 0.013, 0.024, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.016 std_dev=0.011
O6	A	0, 0.004, 0.017, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.017 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.003, 0.016, 0.028, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.007, 0.020, 0.033, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.020 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.006, 0.020, 0.034, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.020 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.006, 0.021, 0.035, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.021 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.008, 0.024, 0.041, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.024 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.005, 0.022, 0.039, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.022 std_dev=0.017
C8	A	0, 0.007, 0.027, 0.048, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.027 std_dev=0.021
N2	A	0, 0.009, 0.035, 0.060, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.035 std_dev=0.025
O2'	A	0, 0.040, 0.208, 0.376, 0.422 max_d=0.422 avg_d=0.208 std_dev=0.168
C2'	A	0, 0.006, 0.229, 0.451, 0.612 max_d=0.612 avg_d=0.229 std_dev=0.223
O4'	A	0, 0.026, 0.306, 0.586, 0.766 max_d=0.766 avg_d=0.306 std_dev=0.280
C1'	B	0, -0.068, 0.300, 0.667, 1.003 max_d=1.003 avg_d=0.300 std_dev=0.368
N1	B	0, -0.074, 0.297, 0.668, 1.011 max_d=1.011 avg_d=0.297 std_dev=0.371
C2'	B	0, 0.036, 0.415, 0.794, 1.010 max_d=1.010 avg_d=0.415 std_dev=0.379
O2'	B	0, 0.070, 0.450, 0.830, 0.849 max_d=0.849 avg_d=0.450 std_dev=0.380
C2	B	0, -0.043, 0.353, 0.749, 1.086 max_d=1.086 avg_d=0.353 std_dev=0.396
O2	B	0, 0.025, 0.443, 0.861, 1.128 max_d=1.128 avg_d=0.443 std_dev=0.418
C6	B	0, 0.078, 0.497, 0.916, 1.044 max_d=1.044 avg_d=0.497 std_dev=0.419
C3'	A	0, -0.010, 0.432, 0.874, 1.208 max_d=1.208 avg_d=0.432 std_dev=0.442
N3	B	0, 0.043, 0.503, 0.962, 1.221 max_d=1.221 avg_d=0.503 std_dev=0.459
C4'	A	0, 0.020, 0.504, 0.987, 1.311 max_d=1.311 avg_d=0.504 std_dev=0.484
C4	B	0, 0.116, 0.640, 1.164, 1.178 max_d=1.178 avg_d=0.640 std_dev=0.524
C5	B	0, 0.124, 0.656, 1.187, 1.096 max_d=1.096 avg_d=0.656 std_dev=0.532
O3'	A	0, -0.057, 0.514, 1.086, 1.570 max_d=1.570 avg_d=0.514 std_dev=0.572
O4'	B	0, -0.091, 0.515, 1.121, 1.663 max_d=1.663 avg_d=0.515 std_dev=0.606
N4	B	0, 0.152, 0.818, 1.485, 1.391 max_d=1.391 avg_d=0.818 std_dev=0.666
C5'	A	0, 0.064, 0.896, 1.729, 2.223 max_d=2.223 avg_d=0.896 std_dev=0.832
O5'	A	0, 0.027, 0.910, 1.792, 2.399 max_d=2.399 avg_d=0.910 std_dev=0.883
C4'	B	0, -0.015, 0.902, 1.819, 2.506 max_d=2.506 avg_d=0.902 std_dev=0.917
O5'	B	0, 0.085, 1.032, 1.980, 2.533 max_d=2.533 avg_d=1.032 std_dev=0.947
C3'	B	0, -0.037, 0.952, 1.941, 2.709 max_d=2.709 avg_d=0.952 std_dev=0.989
C5'	B	0, 0.046, 1.076, 2.105, 2.784 max_d=2.784 avg_d=1.076 std_dev=1.030
OP1	B	0, 0.240, 1.319, 2.399, 2.480 max_d=2.480 avg_d=1.319 std_dev=1.080
P	B	0, 0.201, 1.321, 2.441, 2.803 max_d=2.803 avg_d=1.321 std_dev=1.120
P	A	0, -0.134, 1.080, 2.293, 3.327 max_d=3.327 avg_d=1.080 std_dev=1.213
OP2	A	0, -0.135, 1.221, 2.577, 3.720 max_d=3.720 avg_d=1.221 std_dev=1.356
O3'	B	0, -0.052, 1.349, 2.750, 3.837 max_d=3.837 avg_d=1.349 std_dev=1.401
OP1	A	0, -0.282, 1.184, 2.650, 3.990 max_d=3.990 avg_d=1.184 std_dev=1.466
OP2	B	0, 0.233, 1.745, 3.257, 3.867 max_d=3.867 avg_d=1.745 std_dev=1.512

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.01	0.31	0.10	0.22
C2	0.03	0.00	0.08	0.09	0.01	0.30	0.01	0.54	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.09	0.20	0.40	0.00	0.25	0.24	0.24
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.05	0.09	0.09	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01	0.05	0.02	0.18	0.22	0.12
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.09	0.00	0.12	0.00	0.13	0.10	0.12	0.07	0.07	0.13	0.07	0.02	0.00	0.01	0.04	0.14	0.09	0.24	0.09
C4	0.02	0.01	0.03	0.09	0.00	0.17	0.00	0.30	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.09	0.11	0.12	0.00	0.38	0.18	0.29
C4'	0.00	0.30	0.02	0.00	0.17	0.00	0.15	0.00	0.20	0.02	0.26	0.35	0.28	0.07	0.06	0.05	0.01	0.00	0.01	0.19	0.06	0.23	0.03
C5	0.01	0.01	0.01	0.12	0.00	0.15	0.00	0.28	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.13	0.07	0.06	0.00	0.52	0.31	0.40
C5'	0.03	0.54	0.01	0.00	0.30	0.00	0.28	0.00	0.37	0.07	0.48	0.63	0.47	0.16	0.13	0.05	0.02	0.01	0.01	0.35	0.01	0.11	0.02
C6	0.02	0.00	0.01	0.13	0.00	0.20	0.00	0.37	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.15	0.10	0.16	0.00	0.48	0.36	0.38
C8	0.01	0.01	0.07	0.10	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.10	0.05	0.15	0.01	0.62	0.27	0.46
N1	0.03	0.00	0.05	0.12	0.01	0.26	0.01	0.48	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.13	0.16	0.31	0.00	0.33	0.33	0.30
N2	0.04	0.00	0.09	0.07	0.01	0.35	0.01	0.63	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.08	0.24	0.56	0.01	0.36	0.29	0.34
N3	0.03	0.00	0.09	0.07	0.00	0.28	0.00	0.47	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.06	0.20	0.33	0.01	0.22	0.13	0.19
N7	0.01	0.01	0.06	0.13	0.00	0.07	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.14	0.02	0.08	0.01	0.66	0.34	0.49
N9	0.01	0.01	0.02	0.07	0.00	0.06	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.02	0.05	0.00	0.45	0.17	0.34
O2'	0.00	0.06	0.00	0.02	0.04	0.05	0.03	0.05	0.04	0.03	0.06	0.07	0.06	0.02	0.02	0.00	0.02	0.04	0.06	0.04	0.04	0.42	0.09
O3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.09	0.01	0.13	0.02	0.15	0.10	0.13	0.08	0.06	0.14	0.07	0.02	0.00	0.01	0.03	0.17	0.07	0.42	0.16
O4'	0.00	0.20	0.01	0.01	0.11	0.00	0.07	0.01	0.10	0.05	0.16	0.24	0.20	0.02	0.02	0.04	0.01	0.00	0.08	0.09	0.27	0.09	0.20
O5'	0.07	0.40	0.05	0.04	0.12	0.01	0.06	0.01	0.16	0.15	0.31	0.56	0.33	0.08	0.05	0.06	0.03	0.08	0.00	0.13	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.00	0.02	0.14	0.00	0.19	0.00	0.35	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.17	0.09	0.13	0.00	0.55	0.43	0.44
OP1	0.31	0.25	0.18	0.09	0.38	0.06	0.52	0.01	0.48	0.62	0.33	0.36	0.22	0.66	0.45	0.04	0.07	0.27	0.01	0.55	0.00	0.00	0.01
OP2	0.10	0.24	0.22	0.24	0.18	0.23	0.31	0.11	0.36	0.27	0.33	0.29	0.13	0.34	0.17	0.42	0.42	0.09	0.02	0.43	0.00	0.00	0.00
P	0.22	0.24	0.12	0.09	0.29	0.03	0.40	0.02	0.38	0.46	0.30	0.34	0.19	0.49	0.34	0.09	0.16	0.20	0.00	0.44	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.35	0.09	0.08	0.22	0.14	0.20	0.33	0.16	0.20	0.33	0.21	0.46	0.17	0.13	0.12	0.41	0.35	0.32	0.23
C2	0.17	0.37	0.09	0.09	0.33	0.12	0.51	0.27	0.34	0.13	0.34	0.41	0.58	0.21	0.11	0.12	0.31	0.62	0.38	0.39
C2'	0.18	0.37	0.17	0.05	0.32	0.08	0.22	0.25	0.15	0.23	0.40	0.34	0.43	0.07	0.05	0.16	0.35	0.42	0.38	0.27
C3'	0.16	0.28	0.34	0.16	0.13	0.21	0.11	0.34	0.13	0.14	0.29	0.14	0.38	0.27	0.18	0.17	0.43	0.45	0.43	0.32
C4	0.16	0.32	0.07	0.08	0.22	0.23	0.38	0.40	0.30	0.12	0.27	0.25	0.49	0.24	0.23	0.14	0.44	0.46	0.34	0.31
C4'	0.15	0.28	0.27	0.15	0.09	0.19	0.23	0.33	0.19	0.13	0.26	0.08	0.42	0.18	0.18	0.15	0.41	0.44	0.45	0.31
C5	0.10	0.20	0.10	0.20	0.26	0.37	0.45	0.50	0.40	0.06	0.16	0.29	0.42	0.31	0.39	0.28	0.53	0.36	0.42	0.35
C5'	0.29	0.38	0.41	0.28	0.32	0.34	0.46	0.43	0.40	0.29	0.36	0.33	0.51	0.36	0.35	0.31	0.50	0.44	0.44	0.32
C6	0.08	0.14	0.10	0.14	0.39	0.33	0.57	0.44	0.48	0.14	0.17	0.43	0.43	0.32	0.38	0.32	0.45	0.42	0.42	0.35
C8	0.11	0.20	0.16	0.33	0.14	0.44	0.25	0.65	0.22	0.06	0.17	0.16	0.34	0.28	0.44	0.20	0.67	0.17	0.46	0.40
N1	0.11	0.25	0.10	0.02	0.40	0.20	0.59	0.33	0.43	0.08	0.24	0.48	0.53	0.25	0.22	0.21	0.35	0.54	0.36	0.35
N2	0.18	0.39	0.12	0.17	0.34	0.06	0.47	0.23	0.29	0.16	0.39	0.47	0.59	0.17	0.07	0.08	0.27	0.70	0.44	0.45
N3	0.19	0.39	0.05	0.05	0.28	0.12	0.41	0.29	0.28	0.18	0.37	0.31	0.56	0.19	0.10	0.09	0.32	0.60	0.38	0.37
N7	0.09	0.12	0.16	0.38	0.20	0.53	0.36	0.67	0.34	0.07	0.11	0.23	0.31	0.35	0.54	0.35	0.66	0.21	0.54	0.44
N9	0.16	0.30	0.11	0.16	0.17	0.26	0.26	0.46	0.21	0.14	0.27	0.19	0.44	0.22	0.26	0.12	0.52	0.33	0.32	0.29
O2'	0.29	0.44	0.06	0.12	0.41	0.14	0.34	0.10	0.30	0.35	0.46	0.41	0.48	0.10	0.18	0.31	0.11	0.41	0.54	0.32
O3'	0.13	0.24	0.38	0.12	0.15	0.14	0.06	0.25	0.10	0.12	0.26	0.17	0.32	0.37	0.10	0.12	0.34	0.46	0.53	0.35
O4'	0.16	0.29	0.15	0.13	0.06	0.19	0.22	0.35	0.16	0.11	0.25	0.06	0.45	0.18	0.19	0.12	0.43	0.38	0.36	0.25
O5'	0.13	0.25	0.19	0.13	0.20	0.20	0.42	0.34	0.31	0.10	0.20	0.27	0.44	0.17	0.22	0.13	0.42	0.45	0.44	0.31
O6	0.12	0.09	0.11	0.21	0.47	0.40	0.60	0.47	0.52	0.27	0.25	0.50	0.29	0.37	0.50	0.41	0.47	0.37	0.50	0.39
OP1	0.55	0.57	0.40	0.36	0.07	0.30	0.24	0.13	0.10	0.38	0.40	0.16	0.86	0.68	0.28	0.41	0.17	0.47	0.34	0.22
OP2	0.27	0.46	0.12	0.04	0.05	0.11	0.34	0.35	0.22	0.18	0.38	0.11	0.74	0.27	0.10	0.13	0.48	0.59	0.58	0.50
P	0.41	0.50	0.23	0.21	0.03	0.15	0.28	0.13	0.13	0.27	0.37	0.14	0.77	0.45	0.14	0.27	0.25	0.50	0.41	0.30

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.04	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.23	0.00	0.11	0.27	0.37	0.18
C2	0.02	0.00	0.08	0.18	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.23	0.15	0.03	0.07	0.49	0.19	0.18
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.14	0.07	0.01	0.06	0.01	0.15	0.00	0.01	0.01	0.31	0.33	0.76	0.55
C3'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.30	0.00	0.32	0.01	0.28	0.18	0.24	0.32	0.12	0.01	0.00	0.02	0.03	0.09	0.52	0.23
C4	0.02	0.00	0.01	0.30	0.00	0.13	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.29	0.11	0.01	0.18	0.68	0.23	0.36
C4'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.13	0.00	0.15	0.00	0.14	0.08	0.09	0.14	0.03	0.24	0.01	0.00	0.01	0.14	0.26	0.08
C5	0.01	0.00	0.05	0.32	0.00	0.15	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.27	0.19	0.02	0.19	0.70	0.29	0.39
C5'	0.04	0.07	0.14	0.01	0.15	0.00	0.17	0.00	0.14	0.07	0.11	0.17	0.04	0.08	0.15	0.00	0.01	0.08	0.06	0.01
C6	0.00	0.01	0.07	0.28	0.00	0.14	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.21	0.14	0.03	0.12	0.58	0.13	0.25
N1	0.01	0.00	0.01	0.18	0.01	0.08	0.01	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.18	0.06	0.01	0.04	0.45	0.16	0.14
N3	0.02	0.00	0.06	0.24	0.00	0.09	0.01	0.11	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.28	0.09	0.02	0.13	0.59	0.15	0.26
N4	0.02	0.01	0.01	0.32	0.00	0.14	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.32	0.15	0.01	0.21	0.73	0.32	0.43
O2	0.02	0.00	0.15	0.12	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.16	0.30	0.04	0.07	0.42	0.31	0.17
O2'	0.01	0.23	0.00	0.01	0.29	0.24	0.27	0.08	0.21	0.18	0.28	0.32	0.16	0.00	0.02	0.17	0.21	0.28	0.75	0.54
O3'	0.23	0.15	0.01	0.00	0.11	0.01	0.19	0.15	0.14	0.06	0.09	0.15	0.30	0.02	0.00	0.15	0.21	0.13	0.33	0.09
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.04	0.17	0.15	0.00	0.07	0.33	0.16	0.03
O5'	0.11	0.07	0.31	0.03	0.18	0.01	0.19	0.01	0.12	0.04	0.13	0.21	0.07	0.21	0.21	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.27	0.49	0.33	0.09	0.68	0.14	0.70	0.08	0.58	0.45	0.59	0.73	0.42	0.28	0.13	0.33	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.37	0.19	0.76	0.52	0.23	0.26	0.29	0.06	0.13	0.16	0.15	0.32	0.31	0.75	0.33	0.16	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.18	0.18	0.55	0.23	0.36	0.08	0.39	0.01	0.25	0.14	0.26	0.43	0.17	0.54	0.09	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00