Doublet Group distance statistics: 53212

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, -0.003, 0.007, 0.017, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.007 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.007, 0.019, 0.030, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.019 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.010, 0.025, 0.040, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.025 std_dev=0.015
C5	A	0, 0.002, 0.018, 0.035, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.018 std_dev=0.016
N3	A	0, 0.005, 0.022, 0.039, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.022 std_dev=0.017
N1	A	0, 0.001, 0.019, 0.037, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.019 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.000, 0.024, 0.048, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.024 std_dev=0.024
O6	A	0, 0.001, 0.027, 0.053, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.027 std_dev=0.026
N2	A	0, 0.015, 0.045, 0.075, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.045 std_dev=0.030
N9	A	0, 0.000, 0.030, 0.060, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.030 std_dev=0.030
N7	A	0, 0.006, 0.043, 0.080, 0.113 max_d=0.113 avg_d=0.043 std_dev=0.037
C8	A	0, 0.000, 0.051, 0.101, 0.148 max_d=0.148 avg_d=0.051 std_dev=0.051
C4	B	0, 0.218, 0.521, 0.825, 0.906 max_d=0.906 avg_d=0.521 std_dev=0.303
N3	B	0, 0.184, 0.513, 0.843, 1.018 max_d=1.018 avg_d=0.513 std_dev=0.329
C5	B	0, 0.238, 0.568, 0.899, 0.918 max_d=0.918 avg_d=0.568 std_dev=0.330
N1	B	0, 0.188, 0.530, 0.871, 0.983 max_d=0.983 avg_d=0.530 std_dev=0.342
C2	B	0, 0.159, 0.507, 0.856, 0.970 max_d=0.970 avg_d=0.507 std_dev=0.349
C6	B	0, 0.219, 0.570, 0.920, 1.034 max_d=1.034 avg_d=0.570 std_dev=0.351
O4'	A	0, 0.135, 0.630, 1.124, 1.179 max_d=1.179 avg_d=0.630 std_dev=0.494
C2'	A	0, 0.128, 0.681, 1.234, 1.407 max_d=1.407 avg_d=0.681 std_dev=0.553
N4	B	0, 0.242, 0.877, 1.512, 1.731 max_d=1.731 avg_d=0.877 std_dev=0.635
C4'	A	0, 0.182, 0.832, 1.483, 1.540 max_d=1.540 avg_d=0.832 std_dev=0.651
C3'	A	0, 0.220, 0.924, 1.629, 1.556 max_d=1.556 avg_d=0.924 std_dev=0.705
O2	B	0, 0.092, 0.803, 1.514, 1.743 max_d=1.743 avg_d=0.803 std_dev=0.711
C1'	B	0, 0.138, 0.882, 1.626, 1.841 max_d=1.841 avg_d=0.882 std_dev=0.744
O4'	B	0, 0.168, 1.046, 1.924, 2.102 max_d=2.102 avg_d=1.046 std_dev=0.878
O2'	A	0, 0.107, 0.987, 1.868, 2.400 max_d=2.400 avg_d=0.987 std_dev=0.881
O3'	A	0, 0.299, 1.219, 2.140, 2.186 max_d=2.186 avg_d=1.219 std_dev=0.920
C5'	A	0, 0.322, 1.422, 2.522, 2.387 max_d=2.387 avg_d=1.422 std_dev=1.100
C4'	B	0, 0.081, 1.617, 3.152, 3.495 max_d=3.495 avg_d=1.617 std_dev=1.536
C2'	B	0, 0.071, 1.642, 3.212, 3.677 max_d=3.677 avg_d=1.642 std_dev=1.571
C3'	B	0, 0.112, 1.808, 3.503, 3.901 max_d=3.901 avg_d=1.808 std_dev=1.696
O2'	B	0, 0.258, 1.987, 3.717, 4.243 max_d=4.243 avg_d=1.987 std_dev=1.730
O5'	A	0, 0.284, 2.074, 3.865, 4.669 max_d=4.669 avg_d=2.074 std_dev=1.790
O3'	B	0, 0.450, 2.280, 4.110, 4.338 max_d=4.338 avg_d=2.280 std_dev=1.830
C5'	B	0, -0.052, 1.895, 3.843, 4.359 max_d=4.359 avg_d=1.895 std_dev=1.947
P	A	0, 0.486, 2.868, 5.251, 6.285 max_d=6.285 avg_d=2.868 std_dev=2.383
OP1	A	0, -0.102, 2.365, 4.833, 6.985 max_d=6.985 avg_d=2.365 std_dev=2.467
O5'	B	0, -0.207, 2.299, 4.804, 5.425 max_d=5.425 avg_d=2.299 std_dev=2.505
OP2	A	0, 0.833, 3.607, 6.380, 6.504 max_d=6.504 avg_d=3.607 std_dev=2.774
P	B	0, -0.045, 3.198, 6.441, 7.231 max_d=7.231 avg_d=3.198 std_dev=3.243
OP2	B	0, -0.087, 3.437, 6.960, 7.859 max_d=7.859 avg_d=3.437 std_dev=3.524
OP1	B	0, 0.178, 3.768, 7.358, 8.139 max_d=8.139 avg_d=3.768 std_dev=3.590

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.16	0.00	0.22	0.01	0.20	0.27	0.10
C2	0.02	0.00	0.23	0.21	0.00	0.02	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.23	0.24	0.14	0.30	0.00	0.10	0.68	0.18
C2'	0.00	0.23	0.00	0.00	0.10	0.01	0.05	0.14	0.07	0.19	0.16	0.29	0.25	0.14	0.04	0.00	0.01	0.00	0.22	0.06	0.41	0.11	0.12
C3'	0.02	0.21	0.00	0.00	0.16	0.00	0.19	0.01	0.20	0.25	0.20	0.23	0.19	0.24	0.15	0.01	0.00	0.02	0.33	0.22	0.65	0.22	0.32
C4	0.01	0.00	0.10	0.16	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.20	0.08	0.07	0.39	0.00	0.22	0.70	0.21
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.05	0.10	0.03	0.03	0.02	0.10	0.05	0.24	0.01	0.01	0.01	0.07	0.23	0.17	0.03
C5	0.00	0.00	0.05	0.19	0.00	0.06	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.30	0.07	0.02	0.53	0.00	0.39	0.94	0.34
C5'	0.06	0.11	0.14	0.01	0.09	0.00	0.09	0.00	0.09	0.06	0.10	0.11	0.10	0.08	0.07	0.09	0.15	0.01	0.01	0.10	0.32	0.35	0.01
C6	0.01	0.00	0.07	0.20	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.31	0.07	0.05	0.52	0.00	0.35	1.01	0.33
C8	0.00	0.00	0.19	0.25	0.00	0.10	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.31	0.22	0.11	0.63	0.00	0.57	0.86	0.41
N1	0.01	0.00	0.16	0.20	0.00	0.03	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.26	0.16	0.10	0.41	0.00	0.20	0.87	0.24
N2	0.02	0.00	0.29	0.23	0.00	0.03	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.27	0.33	0.18	0.22	0.01	0.13	0.61	0.17
N3	0.02	0.00	0.25	0.19	0.00	0.02	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.22	0.23	0.14	0.26	0.00	0.08	0.57	0.16
N7	0.00	0.00	0.14	0.24	0.00	0.10	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.35	0.20	0.07	0.67	0.00	0.60	1.07	0.47
N9	0.00	0.01	0.04	0.15	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.18	0.03	0.01	0.41	0.00	0.31	0.60	0.22
O2'	0.01	0.23	0.00	0.01	0.20	0.24	0.30	0.09	0.31	0.31	0.26	0.27	0.22	0.35	0.18	0.00	0.01	0.17	0.32	0.35	0.56	0.12	0.22
O3'	0.16	0.24	0.01	0.00	0.08	0.01	0.07	0.15	0.07	0.22	0.16	0.33	0.23	0.20	0.03	0.01	0.00	0.11	0.31	0.10	0.87	0.50	0.45
O4'	0.00	0.14	0.00	0.02	0.07	0.01	0.02	0.01	0.05	0.11	0.10	0.18	0.14	0.07	0.01	0.17	0.11	0.00	0.09	0.03	0.12	0.16	0.11
O5'	0.22	0.30	0.22	0.33	0.39	0.01	0.53	0.01	0.52	0.63	0.41	0.22	0.26	0.67	0.41	0.32	0.31	0.09	0.00	0.59	0.01	0.03	0.01
O6	0.01	0.00	0.06	0.22	0.00	0.07	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.35	0.10	0.03	0.59	0.00	0.45	1.15	0.41
OP1	0.20	0.10	0.41	0.65	0.22	0.23	0.39	0.32	0.35	0.57	0.20	0.13	0.08	0.60	0.31	0.56	0.87	0.12	0.01	0.45	0.00	0.01	0.01
OP2	0.27	0.68	0.11	0.22	0.70	0.17	0.94	0.35	1.01	0.86	0.87	0.61	0.57	1.07	0.60	0.12	0.50	0.16	0.03	1.15	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.18	0.12	0.32	0.21	0.03	0.34	0.01	0.33	0.41	0.24	0.17	0.16	0.47	0.22	0.22	0.45	0.11	0.01	0.41	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.30	0.19	0.45	0.14	0.53	0.18	0.56	0.19	0.20	0.24	0.11	0.44	0.28	0.86	0.41	1.06	1.79	0.97	1.34
C2	0.08	0.13	0.15	0.26	0.12	0.54	0.15	0.83	0.18	0.08	0.18	0.16	0.17	0.10	0.46	0.45	0.98	0.98	0.36	0.83
C2'	0.14	0.22	0.17	0.57	0.19	0.62	0.32	0.64	0.28	0.13	0.16	0.21	0.41	0.20	1.11	0.40	1.26	2.26	1.39	1.74
C3'	0.29	0.50	0.29	0.75	0.25	0.68	0.15	0.58	0.10	0.26	0.44	0.24	0.74	0.14	1.33	0.43	1.04	2.22	1.28	1.60
C4	0.07	0.06	0.11	0.14	0.10	0.35	0.09	0.52	0.07	0.02	0.10	0.11	0.08	0.35	0.54	0.32	0.77	1.13	0.39	0.84
C4'	0.40	0.57	0.43	0.89	0.28	0.74	0.10	0.61	0.12	0.35	0.50	0.26	0.82	0.17	1.43	0.47	0.90	2.06	1.12	1.41
C5	0.28	0.09	0.43	0.27	0.20	0.14	0.14	0.28	0.03	0.12	0.14	0.29	0.18	0.65	0.48	0.16	0.43	0.81	0.29	0.56
C5'	0.56	0.78	0.59	1.09	0.53	0.86	0.35	0.77	0.35	0.54	0.74	0.53	1.04	0.20	1.66	0.58	0.84	1.84	1.02	1.24
C6	0.28	0.24	0.42	0.27	0.19	0.11	0.20	0.32	0.06	0.15	0.12	0.32	0.41	0.62	0.39	0.16	0.39	0.61	0.38	0.46
C8	0.31	0.19	0.52	0.40	0.23	0.21	0.09	0.14	0.11	0.10	0.31	0.31	0.27	0.81	0.70	0.11	0.36	1.05	0.31	0.66
N1	0.12	0.24	0.15	0.05	0.09	0.30	0.20	0.58	0.13	0.08	0.22	0.12	0.35	0.34	0.31	0.30	0.65	0.70	0.25	0.57
N2	0.19	0.15	0.34	0.45	0.23	0.70	0.17	1.05	0.25	0.13	0.28	0.36	0.18	0.17	0.54	0.54	1.20	1.02	0.51	0.93
N3	0.12	0.05	0.19	0.36	0.08	0.60	0.12	0.84	0.14	0.11	0.06	0.11	0.06	0.07	0.60	0.50	1.12	1.24	0.59	1.04
N7	0.41	0.12	0.67	0.50	0.28	0.23	0.13	0.12	0.09	0.17	0.28	0.40	0.16	0.94	0.65	0.13	0.24	0.78	0.34	0.49
N9	0.08	0.20	0.16	0.20	0.14	0.30	0.10	0.38	0.11	0.07	0.22	0.16	0.29	0.43	0.66	0.25	0.72	1.32	0.51	0.94
O2'	0.29	0.13	0.39	0.73	0.31	0.86	0.51	1.02	0.47	0.25	0.09	0.36	0.31	0.23	1.09	0.57	1.73	2.77	2.01	2.28
O3'	0.30	0.42	0.37	0.86	0.06	0.75	0.18	0.65	0.14	0.20	0.32	0.02	0.72	0.14	1.44	0.44	1.10	2.43	1.47	1.75
O4'	0.35	0.52	0.33	0.67	0.29	0.61	0.14	0.51	0.14	0.33	0.45	0.27	0.72	0.25	1.11	0.46	0.82	1.71	0.87	1.18
O5'	0.65	0.99	0.74	1.42	0.76	1.32	0.54	1.39	0.54	0.67	0.99	0.79	1.29	0.27	1.86	0.82	1.25	1.82	1.23	1.44
O6	0.37	0.33	0.60	0.46	0.25	0.11	0.25	0.18	0.06	0.22	0.16	0.46	0.58	0.79	0.47	0.10	0.20	0.40	0.58	0.36
OP1	0.74	0.46	1.22	1.86	0.49	1.68	0.71	2.05	0.83	0.60	0.51	0.49	0.64	0.95	1.82	1.02	1.87	1.81	1.73	1.72
OP2	1.12	1.63	1.33	1.97	1.51	1.56	1.16	1.60	1.05	1.22	1.76	1.62	1.92	0.99	2.46	1.10	1.56	1.81	1.54	1.60
P	0.95	1.05	1.25	1.99	0.92	1.70	0.82	1.82	0.87	0.89	1.09	0.95	1.29	0.82	2.36	1.12	1.71	1.90	1.65	1.71

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.27	0.00	0.26	0.27	0.62	0.35
C2	0.01	0.00	0.17	0.25	0.00	0.06	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.23	0.05	0.10	0.39	0.15	1.18	0.61
C2'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.03	0.01	0.17	0.17	0.21	0.02	0.12	0.04	0.34	0.00	0.02	0.01	0.46	0.14	0.68	0.44
C3'	0.00	0.25	0.00	0.00	0.29	0.00	0.23	0.00	0.16	0.17	0.30	0.32	0.25	0.01	0.01	0.01	0.37	0.42	0.24	0.15
C4	0.01	0.00	0.03	0.29	0.00	0.09	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.32	0.09	0.02	0.53	0.69	1.68	1.03
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.09	0.00	0.09	0.00	0.07	0.05	0.08	0.11	0.04	0.24	0.03	0.00	0.01	0.57	0.16	0.22
C5	0.01	0.00	0.17	0.23	0.00	0.09	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.36	0.08	0.06	0.56	0.82	1.68	1.13
C5'	0.06	0.04	0.17	0.00	0.08	0.00	0.07	0.00	0.03	0.02	0.07	0.10	0.03	0.07	0.16	0.01	0.01	0.08	0.22	0.01
C6	0.01	0.01	0.21	0.16	0.00	0.07	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.32	0.06	0.09	0.50	0.59	1.37	0.96
N1	0.01	0.01	0.02	0.17	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.19	0.09	0.01	0.40	0.20	1.09	0.65
N3	0.01	0.00	0.12	0.30	0.00	0.08	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.26	0.04	0.08	0.46	0.41	1.46	0.81
N4	0.01	0.01	0.04	0.32	0.00	0.11	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.34	0.13	0.02	0.56	0.85	1.83	1.12
O2	0.02	0.00	0.34	0.25	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.32	0.12	0.16	0.30	0.16	0.97	0.40
O2'	0.01	0.23	0.00	0.01	0.32	0.24	0.36	0.07	0.32	0.19	0.26	0.34	0.32	0.00	0.02	0.17	0.48	0.16	0.74	0.41
O3'	0.27	0.05	0.02	0.01	0.09	0.03	0.08	0.16	0.06	0.09	0.04	0.13	0.12	0.02	0.00	0.20	0.30	0.80	0.20	0.28
O4'	0.00	0.10	0.01	0.01	0.02	0.00	0.06	0.01	0.09	0.01	0.08	0.02	0.16	0.17	0.20	0.00	0.02	0.44	0.26	0.22
O5'	0.26	0.39	0.46	0.37	0.53	0.01	0.56	0.01	0.50	0.40	0.46	0.56	0.30	0.48	0.30	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.27	0.15	0.14	0.42	0.69	0.57	0.82	0.08	0.59	0.20	0.41	0.85	0.16	0.16	0.80	0.44	0.00	0.00	0.01	0.01
OP2	0.62	1.18	0.68	0.24	1.68	0.16	1.68	0.22	1.37	1.09	1.46	1.83	0.97	0.74	0.20	0.26	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.35	0.61	0.44	0.15	1.03	0.22	1.13	0.01	0.96	0.65	0.81	1.12	0.40	0.41	0.28	0.22	0.00	0.01	0.00	0.00