Doublet Group distance statistics: 53213

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.004, 0.016, 0.028, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.016 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.005, 0.017, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.017 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.004, 0.017, 0.030, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.017 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.005, 0.019, 0.032, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.019 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.001, 0.015, 0.028, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.015 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.006, 0.023, 0.040, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.023 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.000, 0.024, 0.047, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.024 std_dev=0.024
C5	A	0, 0.003, 0.030, 0.057, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.030 std_dev=0.027
O6	A	0, 0.012, 0.041, 0.069, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.041 std_dev=0.029
N2	A	0, 0.009, 0.050, 0.091, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.050 std_dev=0.041
C8	A	0, 0.005, 0.050, 0.096, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.050 std_dev=0.045
N7	A	0, 0.003, 0.063, 0.123, 0.144 max_d=0.144 avg_d=0.063 std_dev=0.060
O2	B	0, 0.042, 0.402, 0.762, 0.874 max_d=0.874 avg_d=0.402 std_dev=0.360
N3	B	0, 0.041, 0.419, 0.798, 0.916 max_d=0.916 avg_d=0.419 std_dev=0.378
C2	B	0, 0.024, 0.420, 0.816, 0.951 max_d=0.951 avg_d=0.420 std_dev=0.396
O4'	A	0, -0.085, 0.342, 0.769, 0.944 max_d=0.944 avg_d=0.342 std_dev=0.427
C4	B	0, 0.024, 0.474, 0.924, 1.078 max_d=1.078 avg_d=0.474 std_dev=0.450
C2'	A	0, -0.119, 0.354, 0.827, 1.023 max_d=1.023 avg_d=0.354 std_dev=0.473
N4	B	0, 0.030, 0.515, 1.000, 1.165 max_d=1.165 avg_d=0.515 std_dev=0.485
N1	B	0, -0.026, 0.467, 0.960, 1.149 max_d=1.149 avg_d=0.467 std_dev=0.493
C5	B	0, -0.008, 0.514, 1.035, 1.229 max_d=1.229 avg_d=0.514 std_dev=0.522
C6	B	0, -0.037, 0.506, 1.049, 1.260 max_d=1.260 avg_d=0.506 std_dev=0.543
C1'	B	0, -0.078, 0.479, 1.037, 1.261 max_d=1.261 avg_d=0.479 std_dev=0.557
O4'	B	0, -0.099, 0.480, 1.059, 1.295 max_d=1.295 avg_d=0.480 std_dev=0.579
C4'	B	0, -0.093, 0.521, 1.136, 1.384 max_d=1.384 avg_d=0.521 std_dev=0.614
C5'	B	0, -0.075, 0.548, 1.172, 1.421 max_d=1.421 avg_d=0.548 std_dev=0.624
O2'	B	0, -0.051, 0.574, 1.199, 1.443 max_d=1.443 avg_d=0.574 std_dev=0.625
C2'	B	0, -0.072, 0.565, 1.203, 1.456 max_d=1.456 avg_d=0.565 std_dev=0.637
C3'	B	0, -0.086, 0.584, 1.253, 1.521 max_d=1.521 avg_d=0.584 std_dev=0.670
C4'	A	0, -0.121, 0.576, 1.273, 1.557 max_d=1.557 avg_d=0.576 std_dev=0.697
O2'	A	0, -0.140, 0.570, 1.280, 1.571 max_d=1.571 avg_d=0.570 std_dev=0.710
C3'	A	0, -0.135, 0.598, 1.331, 1.631 max_d=1.631 avg_d=0.598 std_dev=0.733
O5'	B	0, -0.099, 0.640, 1.379, 1.676 max_d=1.676 avg_d=0.640 std_dev=0.739
O3'	B	0, -0.092, 0.648, 1.388, 1.683 max_d=1.683 avg_d=0.648 std_dev=0.740
OP2	A	0, -0.001, 0.777, 1.555, 1.840 max_d=1.840 avg_d=0.777 std_dev=0.778
O5'	A	0, -0.144, 0.677, 1.497, 1.831 max_d=1.831 avg_d=0.677 std_dev=0.820
P	A	0, -0.128, 0.739, 1.607, 1.956 max_d=1.956 avg_d=0.739 std_dev=0.867
C5'	A	0, -0.151, 0.765, 1.682, 2.054 max_d=2.054 avg_d=0.765 std_dev=0.916
OP1	A	0, -0.138, 0.837, 1.813, 2.205 max_d=2.205 avg_d=0.837 std_dev=0.975
P	B	0, -0.177, 0.799, 1.775, 2.173 max_d=2.173 avg_d=0.799 std_dev=0.976
O3'	A	0, -0.210, 0.830, 1.869, 2.295 max_d=2.295 avg_d=0.830 std_dev=1.039
OP2	B	0, -0.208, 0.867, 1.943, 2.383 max_d=2.383 avg_d=0.867 std_dev=1.075
OP1	B	0, -0.259, 1.121, 2.501, 3.065 max_d=3.065 avg_d=1.121 std_dev=1.380

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.06	0.04	0.05	0.01	0.03	0.02	0.07	0.01	0.01	0.18	0.00	0.19	0.03	0.24	0.22	0.16
C2	0.01	0.00	0.20	0.33	0.01	0.26	0.02	0.22	0.04	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.48	0.38	0.19	0.16	0.05	0.09	0.06	0.13
C2'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.05	0.04	0.06	0.12	0.02	0.20	0.10	0.28	0.22	0.19	0.03	0.00	0.01	0.01	0.32	0.06	0.47	0.49	0.40
C3'	0.01	0.33	0.00	0.00	0.30	0.01	0.34	0.01	0.38	0.21	0.37	0.30	0.29	0.31	0.18	0.02	0.01	0.04	0.01	0.39	0.25	0.06	0.09
C4	0.01	0.01	0.05	0.30	0.00	0.17	0.02	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.31	0.20	0.11	0.05	0.02	0.07	0.09	0.03
C4'	0.01	0.26	0.04	0.01	0.17	0.00	0.15	0.01	0.19	0.03	0.23	0.29	0.25	0.09	0.06	0.27	0.02	0.01	0.02	0.17	0.13	0.02	0.03
C5	0.04	0.02	0.06	0.34	0.02	0.15	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.25	0.23	0.06	0.04	0.00	0.05	0.06	0.01
C5'	0.06	0.22	0.12	0.01	0.08	0.01	0.06	0.00	0.11	0.06	0.17	0.29	0.19	0.02	0.03	0.15	0.19	0.02	0.01	0.09	0.08	0.01	0.01
C6	0.04	0.04	0.02	0.38	0.02	0.19	0.01	0.11	0.00	0.01	0.02	0.05	0.04	0.01	0.03	0.32	0.33	0.09	0.06	0.01	0.04	0.05	0.05
C8	0.05	0.01	0.20	0.21	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.06	0.14	0.02	0.16	0.15	0.12
N1	0.01	0.02	0.10	0.37	0.01	0.23	0.01	0.17	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.02	0.01	0.43	0.39	0.14	0.12	0.04	0.08	0.07	0.11
N2	0.03	0.01	0.28	0.30	0.01	0.29	0.02	0.29	0.05	0.00	0.03	0.00	0.01	0.03	0.01	0.54	0.43	0.22	0.25	0.07	0.17	0.16	0.23
N3	0.02	0.00	0.22	0.29	0.00	0.25	0.03	0.19	0.04	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01	0.43	0.29	0.20	0.10	0.05	0.03	0.05	0.06
N7	0.07	0.02	0.19	0.31	0.03	0.09	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.00	0.05	0.08	0.13	0.01	0.09	0.03	0.10	0.09	0.06
N9	0.01	0.00	0.03	0.18	0.01	0.06	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.15	0.02	0.01	0.14	0.02	0.17	0.16	0.11
O2'	0.01	0.48	0.00	0.02	0.31	0.27	0.25	0.15	0.32	0.00	0.43	0.54	0.43	0.08	0.15	0.00	0.04	0.14	0.16	0.30	0.32	0.48	0.27
O3'	0.18	0.38	0.01	0.01	0.20	0.02	0.23	0.19	0.33	0.03	0.39	0.43	0.29	0.13	0.02	0.04	0.00	0.08	0.28	0.33	0.14	0.25	0.23
O4'	0.00	0.19	0.01	0.04	0.11	0.01	0.06	0.02	0.09	0.06	0.14	0.22	0.20	0.01	0.01	0.14	0.08	0.00	0.09	0.06	0.10	0.05	0.02
O5'	0.19	0.16	0.32	0.01	0.05	0.02	0.04	0.01	0.06	0.14	0.12	0.25	0.10	0.09	0.14	0.16	0.28	0.09	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00
O6	0.03	0.05	0.06	0.39	0.02	0.17	0.00	0.09	0.01	0.02	0.04	0.07	0.05	0.03	0.02	0.30	0.33	0.06	0.06	0.00	0.05	0.07	0.06
OP1	0.24	0.09	0.47	0.25	0.07	0.13	0.05	0.08	0.04	0.16	0.08	0.17	0.03	0.10	0.17	0.32	0.14	0.10	0.01	0.05	0.00	0.01	0.01
OP2	0.22	0.06	0.49	0.06	0.09	0.02	0.06	0.01	0.05	0.15	0.07	0.16	0.05	0.09	0.16	0.48	0.25	0.05	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.13	0.40	0.09	0.03	0.03	0.01	0.01	0.05	0.12	0.11	0.23	0.06	0.06	0.11	0.27	0.23	0.02	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.27	0.16	0.29	0.30	0.10	0.35	0.16	0.33	0.03	0.15	0.05	0.16	0.27	0.34	0.31	0.33	0.40	0.44	0.08	0.59
C2	0.34	0.29	0.32	0.28	0.10	0.32	0.06	0.27	0.18	0.29	0.21	0.04	0.35	0.35	0.25	0.36	0.36	0.11	0.68	0.51
C2'	0.69	0.44	0.71	0.68	0.07	0.77	0.05	0.65	0.25	0.48	0.24	0.11	0.57	0.79	0.69	0.78	0.61	0.43	0.09	0.59
C3'	0.93	0.85	0.99	1.02	0.67	0.99	0.67	0.98	0.81	0.88	0.76	0.58	0.91	0.95	1.00	0.95	1.16	1.17	0.59	1.29
C4	0.25	0.17	0.24	0.21	0.12	0.27	0.19	0.23	0.03	0.15	0.05	0.21	0.27	0.29	0.20	0.29	0.31	0.04	0.39	0.49
C4'	0.69	0.61	0.77	0.87	0.47	0.86	0.48	0.94	0.58	0.64	0.53	0.42	0.66	0.73	0.89	0.76	1.13	1.40	0.77	1.41
C5	0.15	0.07	0.13	0.10	0.24	0.17	0.32	0.13	0.16	0.05	0.06	0.35	0.20	0.20	0.09	0.19	0.19	0.13	0.35	0.36
C5'	0.73	0.65	0.83	0.96	0.55	0.93	0.58	1.04	0.66	0.69	0.58	0.51	0.68	0.78	0.99	0.79	1.26	1.61	1.11	1.61
C6	0.17	0.11	0.13	0.09	0.20	0.16	0.25	0.12	0.10	0.08	0.02	0.34	0.21	0.20	0.07	0.20	0.17	0.27	0.48	0.33
C8	0.05	0.04	0.06	0.05	0.31	0.12	0.41	0.10	0.30	0.09	0.15	0.37	0.12	0.14	0.07	0.11	0.16	0.07	0.08	0.35
N1	0.26	0.22	0.23	0.18	0.02	0.24	0.08	0.19	0.08	0.20	0.13	0.16	0.29	0.28	0.15	0.28	0.25	0.26	0.61	0.39
N2	0.39	0.36	0.38	0.34	0.25	0.36	0.22	0.32	0.29	0.36	0.31	0.19	0.39	0.40	0.31	0.40	0.41	0.12	0.81	0.54
N3	0.35	0.28	0.33	0.31	0.07	0.35	0.02	0.32	0.16	0.28	0.18	0.07	0.34	0.37	0.29	0.38	0.41	0.08	0.58	0.59
N7	0.04	0.07	0.04	0.03	0.36	0.08	0.43	0.06	0.31	0.12	0.19	0.43	0.10	0.11	0.03	0.09	0.11	0.10	0.19	0.30
N9	0.18	0.09	0.18	0.17	0.18	0.23	0.27	0.20	0.14	0.06	0.03	0.25	0.21	0.24	0.18	0.23	0.28	0.17	0.17	0.47
O2'	0.10	0.23	0.15	0.13	0.60	0.27	0.69	0.16	0.49	0.21	0.42	0.69	0.07	0.33	0.21	0.21	0.06	0.02	0.84	0.05
O3'	0.86	0.84	0.99	1.11	0.75	1.01	0.76	1.12	0.84	0.86	0.79	0.72	0.87	0.90	1.11	0.86	1.40	1.74	0.66	1.63
O4'	0.40	0.33	0.44	0.51	0.18	0.54	0.16	0.60	0.25	0.34	0.25	0.14	0.39	0.43	0.53	0.47	0.76	0.94	0.55	1.05
O5'	0.71	0.66	0.81	0.90	0.59	0.86	0.62	0.93	0.68	0.69	0.60	0.56	0.67	0.75	0.93	0.74	1.18	1.33	1.25	1.50
O6	0.09	0.05	0.06	0.04	0.27	0.08	0.30	0.05	0.17	0.06	0.10	0.41	0.14	0.13	0.05	0.12	0.10	0.37	0.45	0.25
OP1	0.69	0.66	0.81	0.91	0.64	0.82	0.66	0.89	0.68	0.68	0.63	0.65	0.67	0.75	0.96	0.69	1.13	1.41	1.17	1.41
OP2	0.61	0.61	0.69	0.73	0.59	0.67	0.59	0.68	0.60	0.62	0.59	0.61	0.62	0.65	0.74	0.60	0.89	0.76	1.15	1.10
P	0.68	0.65	0.77	0.86	0.61	0.80	0.63	0.86	0.66	0.67	0.61	0.60	0.65	0.72	0.88	0.69	1.08	1.20	1.23	1.37

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.03	0.00	0.04	0.11	0.15	0.10
C2	0.01	0.00	0.03	0.10	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.12	0.01	0.07	0.51	0.35	0.02
C2'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.08	0.02	0.02	0.02	0.09	0.01	0.03	0.00	0.03	0.17	0.12	0.02
C3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.01	0.09	0.02	0.08	0.01	0.15	0.01	0.02	0.01	0.06	0.11	0.02	0.08
C4	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.03	0.01	0.02	0.58	0.57	0.09
C4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.01	0.00	0.01	0.14	0.13	0.03
C5	0.02	0.01	0.08	0.08	0.00	0.04	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.07	0.01	0.12	0.37	0.59	0.22
C5'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.00	0.04	0.03	0.09	0.04	0.09	0.02	0.02	0.01	0.01	0.29	0.30	0.01
C6	0.02	0.01	0.08	0.09	0.01	0.05	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.06	0.08	0.01	0.15	0.20	0.44	0.23
N1	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.04	0.00	0.02	0.30	0.31	0.10
N3	0.01	0.01	0.02	0.08	0.01	0.05	0.01	0.09	0.02	0.01	0.00	0.05	0.02	0.03	0.11	0.01	0.07	0.63	0.46	0.02
N4	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.05	0.00	0.06	0.03	0.03	0.01	0.03	0.62	0.68	0.12
O2	0.03	0.00	0.09	0.15	0.02	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.03	0.19	0.02	0.11	0.52	0.28	0.05
O2'	0.02	0.03	0.01	0.01	0.05	0.02	0.07	0.02	0.06	0.04	0.03	0.03	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.08	0.02	0.03
O3'	0.03	0.12	0.03	0.02	0.03	0.01	0.07	0.02	0.08	0.04	0.11	0.03	0.19	0.03	0.00	0.02	0.12	0.09	0.09	0.19
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.09	0.10	0.02	0.16
O5'	0.04	0.07	0.03	0.06	0.02	0.01	0.12	0.01	0.15	0.02	0.07	0.03	0.11	0.04	0.12	0.09	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.11	0.51	0.17	0.11	0.58	0.14	0.37	0.29	0.20	0.30	0.63	0.62	0.52	0.08	0.09	0.10	0.02	0.00	0.02	0.02
OP2	0.15	0.35	0.12	0.02	0.57	0.13	0.59	0.30	0.44	0.31	0.46	0.68	0.28	0.02	0.09	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.10	0.02	0.02	0.08	0.09	0.03	0.22	0.01	0.23	0.10	0.02	0.12	0.05	0.03	0.19	0.16	0.01	0.02	0.01	0.00