Doublet Group distance statistics: 53217

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.000, 0.002, 0.004, 0.004 max_d=0.004 avg_d=0.002 std_dev=0.002
C1'	A	0, 0.000, 0.005, 0.009, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.005 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.000, 0.005, 0.010, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.005 std_dev=0.005
O6	A	0, 0.000, 0.005, 0.010, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.005 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.000, 0.005, 0.011, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.005 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.000, 0.008, 0.016, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.000, 0.010, 0.019, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.010 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.000, 0.011, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C8	A	0, 0.000, 0.017, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.017
N2	A	0, 0.000, 0.022, 0.043, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.022 std_dev=0.022
N9	A	0, 0.000, 0.022, 0.045, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.022 std_dev=0.022
N7	A	0, 0.000, 0.030, 0.061, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.030 std_dev=0.030
C1'	B	0, 0.000, 0.114, 0.228, 0.228 max_d=0.228 avg_d=0.114 std_dev=0.114
O4'	B	0, 0.000, 0.154, 0.308, 0.308 max_d=0.308 avg_d=0.154 std_dev=0.154
C2'	B	0, 0.000, 0.177, 0.354, 0.354 max_d=0.354 avg_d=0.177 std_dev=0.177
N1	B	0, 0.000, 0.320, 0.640, 0.640 max_d=0.640 avg_d=0.320 std_dev=0.320
O4'	A	0, 0.000, 0.330, 0.661, 0.661 max_d=0.661 avg_d=0.330 std_dev=0.330
C2'	A	0, 0.000, 0.350, 0.700, 0.700 max_d=0.700 avg_d=0.350 std_dev=0.350
C4'	A	0, 0.000, 0.374, 0.749, 0.749 max_d=0.749 avg_d=0.374 std_dev=0.374
C3'	B	0, 0.000, 0.377, 0.754, 0.754 max_d=0.754 avg_d=0.377 std_dev=0.377
C3'	A	0, 0.000, 0.436, 0.871, 0.871 max_d=0.871 avg_d=0.436 std_dev=0.436
C4'	B	0, 0.000, 0.446, 0.892, 0.892 max_d=0.892 avg_d=0.446 std_dev=0.446
C6	B	0, 0.000, 0.471, 0.942, 0.942 max_d=0.942 avg_d=0.471 std_dev=0.471
O3'	A	0, 0.000, 0.507, 1.013, 1.013 max_d=1.013 avg_d=0.507 std_dev=0.507
O2'	B	0, 0.000, 0.524, 1.049, 1.049 max_d=1.049 avg_d=0.524 std_dev=0.524
O2'	A	0, 0.000, 0.534, 1.068, 1.068 max_d=1.068 avg_d=0.534 std_dev=0.534
C2	B	0, 0.000, 0.614, 1.228, 1.228 max_d=1.228 avg_d=0.614 std_dev=0.614
O3'	B	0, 0.000, 0.624, 1.247, 1.247 max_d=1.247 avg_d=0.624 std_dev=0.624
C5'	B	0, 0.000, 0.672, 1.343, 1.343 max_d=1.343 avg_d=0.672 std_dev=0.672
O2	B	0, 0.000, 0.718, 1.437, 1.437 max_d=1.437 avg_d=0.718 std_dev=0.718
O5'	A	0, 0.000, 0.728, 1.455, 1.455 max_d=1.455 avg_d=0.728 std_dev=0.728
C5	B	0, 0.000, 0.771, 1.541, 1.541 max_d=1.541 avg_d=0.771 std_dev=0.771
C5'	A	0, 0.000, 0.832, 1.663, 1.663 max_d=1.663 avg_d=0.832 std_dev=0.832
N3	B	0, 0.000, 0.884, 1.769, 1.769 max_d=1.769 avg_d=0.884 std_dev=0.884
C4	B	0, 0.000, 0.938, 1.875, 1.875 max_d=1.875 avg_d=0.938 std_dev=0.938
P	A	0, 0.000, 1.145, 2.290, 2.290 max_d=2.290 avg_d=1.145 std_dev=1.145
OP2	A	0, 0.000, 1.261, 2.522, 2.522 max_d=2.522 avg_d=1.261 std_dev=1.261
N4	B	0, 0.000, 1.284, 2.568, 2.568 max_d=2.568 avg_d=1.284 std_dev=1.284
OP1	A	0, 0.000, 1.637, 3.273, 3.273 max_d=3.273 avg_d=1.637 std_dev=1.637
O5'	B	0, 0.000, 1.694, 3.388, 3.388 max_d=3.388 avg_d=1.694 std_dev=1.694
OP2	B	0, 0.000, 1.908, 3.816, 3.816 max_d=3.816 avg_d=1.908 std_dev=1.908
P	B	0, 0.000, 2.011, 4.023, 4.023 max_d=4.023 avg_d=2.011 std_dev=2.011
OP1	B	0, 0.000, 2.155, 4.310, 4.310 max_d=4.310 avg_d=2.155 std_dev=2.155

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.00	0.10	0.00	0.31	0.12	0.12
C2	0.01	0.00	0.11	0.09	0.00	0.07	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.25	0.22	0.13	0.05	0.00	0.61	0.41	0.08
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.04	0.01	0.00	0.07	0.02	0.10	0.07	0.16	0.11	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01	0.06	0.01	0.09	0.15	0.09
C3'	0.02	0.09	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.10	0.04	0.14	0.09	0.07	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.02	0.27	0.00	0.04
C4	0.00	0.00	0.04	0.02	0.00	0.05	0.01	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.13	0.13	0.07	0.06	0.00	0.61	0.40	0.09
C4'	0.00	0.07	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.06	0.03	0.07	0.05	0.06	0.04	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.06	0.13	0.19	0.02
C5	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.09	0.03	0.04	0.00	0.75	0.54	0.07
C5'	0.03	0.09	0.07	0.01	0.06	0.01	0.07	0.00	0.10	0.02	0.11	0.08	0.07	0.05	0.02	0.06	0.02	0.02	0.01	0.10	0.21	0.34	0.01
C6	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.13	0.12	0.06	0.03	0.00	0.78	0.59	0.05
C8	0.01	0.01	0.10	0.10	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.01	0.07	0.05	0.00	0.69	0.48	0.08
N1	0.01	0.00	0.07	0.04	0.01	0.07	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.20	0.18	0.11	0.03	0.00	0.71	0.52	0.06
N2	0.01	0.01	0.16	0.14	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.32	0.28	0.14	0.07	0.00	0.58	0.36	0.09
N3	0.01	0.00	0.11	0.09	0.00	0.06	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.23	0.20	0.13	0.06	0.01	0.54	0.34	0.09
N7	0.01	0.01	0.06	0.07	0.02	0.04	0.01	0.05	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.02	0.00	0.81	0.61	0.06
N9	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.07	0.01	0.08	0.00	0.54	0.32	0.11
O2'	0.01	0.25	0.00	0.01	0.13	0.02	0.08	0.06	0.13	0.06	0.20	0.32	0.23	0.01	0.03	0.00	0.04	0.02	0.06	0.11	0.10	0.19	0.11
O3'	0.07	0.22	0.01	0.00	0.13	0.01	0.09	0.02	0.12	0.01	0.18	0.28	0.20	0.03	0.07	0.04	0.00	0.04	0.05	0.11	0.31	0.03	0.05
O4'	0.00	0.13	0.01	0.01	0.07	0.00	0.03	0.02	0.06	0.07	0.11	0.14	0.13	0.03	0.01	0.02	0.04	0.00	0.13	0.04	0.26	0.10	0.12
O5'	0.10	0.05	0.06	0.06	0.06	0.02	0.04	0.01	0.03	0.05	0.03	0.07	0.06	0.02	0.08	0.06	0.05	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00
O6	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.11	0.11	0.04	0.01	0.00	0.85	0.66	0.04
OP1	0.31	0.61	0.09	0.27	0.61	0.13	0.75	0.21	0.78	0.69	0.71	0.58	0.54	0.81	0.54	0.10	0.31	0.26	0.00	0.85	0.00	0.01	0.00
OP2	0.12	0.41	0.15	0.00	0.40	0.19	0.54	0.34	0.59	0.48	0.52	0.36	0.34	0.61	0.32	0.19	0.03	0.10	0.01	0.66	0.01	0.00	0.00
P	0.12	0.08	0.09	0.04	0.09	0.02	0.07	0.01	0.05	0.08	0.06	0.09	0.09	0.06	0.11	0.11	0.05	0.12	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.03	0.11	0.01	0.12	0.05	0.17	0.15	0.27	0.14	0.01	0.06	0.09	0.22	0.07	0.16	0.07	0.94	0.89	0.75	0.90
C2	0.05	0.14	0.02	0.05	0.26	0.08	0.25	0.15	0.16	0.10	0.20	0.32	0.09	0.03	0.06	0.03	0.04	0.09	0.23	0.04
C2'	0.10	0.20	0.10	0.07	0.02	0.15	0.16	0.31	0.13	0.07	0.14	0.06	0.36	0.21	0.11	0.05	1.06	1.07	1.07	1.12
C3'	0.16	0.25	0.18	0.04	0.01	0.14	0.14	0.36	0.11	0.11	0.18	0.04	0.43	0.33	0.07	0.01	1.15	1.22	1.20	1.27
C4	0.02	0.04	0.03	0.05	0.05	0.06	0.11	0.05	0.09	0.01	0.01	0.08	0.10	0.05	0.07	0.03	0.41	0.39	0.19	0.34
C4'	0.25	0.33	0.26	0.06	0.15	0.02	0.04	0.20	0.05	0.22	0.29	0.12	0.46	0.38	0.00	0.11	0.88	0.90	0.79	0.93
C5	0.03	0.10	0.06	0.05	0.09	0.07	0.04	0.02	0.02	0.05	0.12	0.08	0.11	0.14	0.09	0.03	0.22	0.15	0.00	0.14
C5'	0.45	0.58	0.51	0.28	0.41	0.15	0.27	0.04	0.27	0.44	0.54	0.39	0.71	0.63	0.23	0.26	0.63	0.65	0.62	0.69
C6	0.06	0.00	0.07	0.01	0.06	0.00	0.07	0.08	0.05	0.01	0.03	0.06	0.03	0.16	0.03	0.00	0.03	0.12	0.26	0.13
C8	0.01	0.23	0.05	0.14	0.15	0.19	0.04	0.20	0.01	0.10	0.24	0.15	0.30	0.11	0.21	0.08	0.55	0.47	0.35	0.48
N1	0.06	0.13	0.05	0.05	0.16	0.07	0.10	0.16	0.05	0.07	0.16	0.19	0.12	0.10	0.04	0.03	0.12	0.17	0.38	0.22
N2	0.05	0.20	0.01	0.08	0.38	0.13	0.35	0.22	0.21	0.14	0.31	0.48	0.15	0.00	0.11	0.04	0.07	0.02	0.40	0.17
N3	0.02	0.06	0.01	0.01	0.20	0.02	0.24	0.04	0.18	0.07	0.12	0.25	0.01	0.01	0.01	0.01	0.35	0.41	0.13	0.30
N7	0.01	0.24	0.06	0.10	0.22	0.14	0.12	0.11	0.07	0.13	0.27	0.23	0.27	0.17	0.16	0.06	0.33	0.23	0.13	0.25
N9	0.02	0.14	0.01	0.09	0.02	0.14	0.07	0.17	0.07	0.05	0.11	0.00	0.22	0.01	0.14	0.06	0.65	0.59	0.44	0.58
O2'	0.02	0.04	0.00	0.15	0.22	0.21	0.36	0.36	0.30	0.08	0.04	0.29	0.21	0.13	0.15	0.14	1.16	1.25	1.29	1.28
O3'	0.04	0.00	0.02	0.23	0.28	0.30	0.42	0.55	0.37	0.13	0.09	0.35	0.18	0.19	0.23	0.20	1.42	1.58	1.53	1.61
O4'	0.16	0.22	0.13	0.01	0.10	0.05	0.02	0.15	0.03	0.15	0.19	0.07	0.30	0.18	0.07	0.08	0.75	0.71	0.51	0.70
O5'	0.33	0.52	0.37	0.14	0.34	0.00	0.19	0.15	0.17	0.35	0.49	0.33	0.67	0.44	0.08	0.12	0.69	0.67	0.67	0.73
O6	0.07	0.02	0.09	0.01	0.20	0.00	0.21	0.10	0.14	0.05	0.10	0.23	0.07	0.22	0.03	0.00	0.15	0.30	0.36	0.26
OP1	0.23	0.12	0.09	0.18	0.25	0.30	0.35	0.36	0.36	0.24	0.14	0.25	0.01	0.01	0.12	0.34	0.81	0.81	0.80	0.83
OP2	0.66	1.11	0.55	0.23	1.00	0.08	0.76	0.08	0.65	0.82	1.17	1.05	1.28	0.48	0.01	0.36	0.46	0.38	0.44	0.51
P	0.41	0.67	0.49	0.26	0.51	0.08	0.33	0.07	0.29	0.46	0.66	0.52	0.84	0.54	0.21	0.17	0.54	0.51	0.59	0.60

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.11	0.05	0.23	0.09
C2	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.31	0.20	0.37	0.28
C2'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.03	0.00	0.02	0.04	0.03	0.00	0.01	0.00	0.21	0.02	0.29	0.16
C3'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.07	0.03	0.04	0.06	0.02	0.01	0.00	0.00	0.30	0.01	0.34	0.21
C4	0.00	0.00	0.04	0.06	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.08	0.03	0.42	0.37	0.44	0.40
C4'	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.23	0.20	0.01
C5	0.02	0.00	0.04	0.08	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.10	0.05	0.43	0.36	0.46	0.42
C5'	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.35	0.28	0.02
C6	0.02	0.00	0.03	0.07	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.07	0.05	0.38	0.22	0.42	0.34
N1	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.29	0.13	0.36	0.25
N3	0.01	0.00	0.02	0.04	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.37	0.30	0.41	0.35
N4	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.01	0.03	0.05	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.09	0.05	0.43	0.41	0.43	0.42
O2	0.02	0.00	0.03	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.03	0.02	0.24	0.14	0.33	0.22
O2'	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.00	0.01	0.06	0.07	0.18	0.05
O3'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.08	0.01	0.10	0.01	0.07	0.03	0.05	0.09	0.03	0.00	0.00	0.01	0.24	0.01	0.30	0.17
O4'	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.20	0.18	0.03
O5'	0.11	0.31	0.21	0.30	0.42	0.01	0.43	0.01	0.38	0.29	0.37	0.43	0.24	0.06	0.24	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01
OP1	0.05	0.20	0.02	0.01	0.37	0.23	0.36	0.35	0.22	0.13	0.30	0.41	0.14	0.07	0.01	0.20	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.23	0.37	0.29	0.34	0.44	0.20	0.46	0.28	0.42	0.36	0.41	0.43	0.33	0.18	0.30	0.18	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.09	0.28	0.16	0.21	0.40	0.01	0.42	0.02	0.34	0.25	0.35	0.42	0.22	0.05	0.17	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00