Doublet Group distance statistics: 53221

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 4, 3, 6, 1, 2, 1, 1, 4, 8, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.010, 0.016, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.001, 0.009, 0.018, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.009 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.006, 0.015, 0.023, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.015 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.007, 0.016, 0.026, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.016 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.010, 0.020, 0.030, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.020 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.003, 0.014, 0.025, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.014 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.009, 0.022, 0.036, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.022 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.012, 0.029, 0.046, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.029 std_dev=0.017
O6	A	0, 0.015, 0.032, 0.050, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.032 std_dev=0.017
N2	A	0, 0.007, 0.024, 0.042, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.024 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.023, 0.046, 0.068, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.046 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.027, 0.053, 0.079, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.053 std_dev=0.026
O2'	A	0, 0.112, 0.254, 0.395, 0.854 max_d=0.854 avg_d=0.254 std_dev=0.141
C2'	A	0, 0.060, 0.214, 0.368, 0.921 max_d=0.921 avg_d=0.214 std_dev=0.154
O4'	A	0, 0.064, 0.225, 0.387, 0.980 max_d=0.980 avg_d=0.225 std_dev=0.161
N6	B	0, 0.270, 0.521, 0.772, 0.890 max_d=0.890 avg_d=0.521 std_dev=0.251
C5	B	0, 0.244, 0.515, 0.786, 0.909 max_d=0.909 avg_d=0.515 std_dev=0.271
C3'	A	0, 0.094, 0.372, 0.650, 1.520 max_d=1.520 avg_d=0.372 std_dev=0.278
C6	B	0, 0.218, 0.497, 0.775, 0.869 max_d=0.869 avg_d=0.497 std_dev=0.278
C4'	A	0, 0.124, 0.412, 0.699, 1.458 max_d=1.458 avg_d=0.412 std_dev=0.287
N7	B	0, 0.319, 0.614, 0.908, 1.023 max_d=1.023 avg_d=0.614 std_dev=0.294
O4'	B	0, 0.253, 0.563, 0.874, 1.366 max_d=1.366 avg_d=0.563 std_dev=0.311
C4	B	0, 0.217, 0.537, 0.856, 0.953 max_d=0.953 avg_d=0.537 std_dev=0.320
N9	B	0, 0.296, 0.633, 0.970, 1.049 max_d=1.049 avg_d=0.633 std_dev=0.337
C8	B	0, 0.342, 0.686, 1.030, 1.096 max_d=1.096 avg_d=0.686 std_dev=0.344
O3'	A	0, 0.113, 0.465, 0.816, 1.988 max_d=1.988 avg_d=0.465 std_dev=0.351
N1	B	0, 0.179, 0.551, 0.923, 1.135 max_d=1.135 avg_d=0.551 std_dev=0.372
N3	B	0, 0.184, 0.559, 0.934, 1.065 max_d=1.065 avg_d=0.559 std_dev=0.375
C2	B	0, 0.180, 0.580, 0.981, 1.091 max_d=1.091 avg_d=0.580 std_dev=0.400
C1'	B	0, 0.335, 0.740, 1.145, 1.225 max_d=1.225 avg_d=0.740 std_dev=0.405
C4'	B	0, 0.339, 0.747, 1.156, 1.527 max_d=1.527 avg_d=0.747 std_dev=0.408
C5'	B	0, 0.362, 0.770, 1.179, 1.696 max_d=1.696 avg_d=0.770 std_dev=0.409
O5'	B	0, 0.446, 0.890, 1.333, 1.659 max_d=1.659 avg_d=0.890 std_dev=0.444
C2'	B	0, 0.432, 0.932, 1.432, 1.545 max_d=1.545 avg_d=0.932 std_dev=0.500
O5'	A	0, 0.234, 0.819, 1.404, 2.285 max_d=2.285 avg_d=0.819 std_dev=0.585
C5'	A	0, 0.306, 0.894, 1.483, 2.712 max_d=2.712 avg_d=0.894 std_dev=0.589
C3'	B	0, 0.437, 1.033, 1.629, 1.730 max_d=1.730 avg_d=1.033 std_dev=0.596
P	A	0, 0.258, 0.957, 1.656, 2.592 max_d=2.592 avg_d=0.957 std_dev=0.699
O2'	B	0, 0.541, 1.276, 2.011, 2.643 max_d=2.643 avg_d=1.276 std_dev=0.735
P	B	0, 0.482, 1.224, 1.966, 2.247 max_d=2.247 avg_d=1.224 std_dev=0.742
OP2	A	0, 0.259, 1.025, 1.791, 3.289 max_d=3.289 avg_d=1.025 std_dev=0.766
O3'	B	0, 0.493, 1.289, 2.084, 2.601 max_d=2.601 avg_d=1.289 std_dev=0.796
OP1	A	0, 0.230, 1.134, 2.037, 4.350 max_d=4.350 avg_d=1.134 std_dev=0.904
OP1	B	0, 0.635, 2.045, 3.455, 3.769 max_d=3.769 avg_d=2.045 std_dev=1.410
OP2	B	0, 0.605, 2.477, 4.348, 4.635 max_d=4.635 avg_d=2.477 std_dev=1.871

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.15	0.01	0.28	0.48	0.30
C2	0.02	0.00	0.10	0.19	0.01	0.08	0.01	0.21	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.10	0.20	0.03	0.36	0.01	0.55	0.67	0.52
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.06	0.02	0.04	0.03	0.05	0.04	0.08	0.13	0.10	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.23	0.05	0.23	0.37	0.24
C3'	0.01	0.19	0.00	0.00	0.13	0.00	0.13	0.03	0.15	0.08	0.18	0.21	0.17	0.10	0.07	0.01	0.01	0.03	0.36	0.15	0.30	0.27	0.28
C4	0.01	0.01	0.06	0.13	0.00	0.08	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.12	0.01	0.36	0.01	0.55	0.65	0.53
C4'	0.01	0.08	0.02	0.00	0.08	0.00	0.11	0.01	0.11	0.12	0.10	0.09	0.07	0.13	0.07	0.05	0.01	0.00	0.02	0.12	0.18	0.28	0.09
C5	0.01	0.01	0.04	0.13	0.00	0.11	0.00	0.30	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.13	0.02	0.45	0.01	0.71	0.73	0.64
C5'	0.05	0.21	0.03	0.03	0.22	0.01	0.30	0.00	0.31	0.31	0.27	0.19	0.17	0.35	0.20	0.06	0.04	0.02	0.01	0.35	0.19	0.32	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.15	0.01	0.11	0.01	0.31	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.16	0.02	0.47	0.00	0.76	0.76	0.68
C8	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.12	0.00	0.31	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.08	0.03	0.40	0.01	0.66	0.67	0.60
N1	0.02	0.00	0.08	0.18	0.01	0.10	0.01	0.27	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.19	0.02	0.43	0.01	0.67	0.73	0.62
N2	0.03	0.00	0.13	0.21	0.01	0.09	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.11	0.24	0.03	0.33	0.01	0.49	0.65	0.48
N3	0.02	0.00	0.10	0.17	0.01	0.07	0.00	0.17	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.17	0.02	0.31	0.01	0.47	0.62	0.46
N7	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.13	0.00	0.35	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.10	0.02	0.47	0.01	0.78	0.74	0.69
N9	0.00	0.02	0.02	0.07	0.01	0.07	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.06	0.01	0.31	0.01	0.49	0.60	0.47
O2'	0.02	0.10	0.00	0.01	0.07	0.05	0.07	0.06	0.08	0.04	0.10	0.11	0.09	0.05	0.04	0.00	0.04	0.04	0.05	0.08	0.22	0.33	0.12
O3'	0.01	0.20	0.02	0.01	0.12	0.01	0.13	0.04	0.16	0.08	0.19	0.24	0.17	0.10	0.06	0.04	0.00	0.01	0.29	0.16	0.44	0.18	0.23
O4'	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.10	0.02	0.25	0.43	0.26
O5'	0.15	0.36	0.23	0.36	0.36	0.02	0.45	0.01	0.47	0.40	0.43	0.33	0.31	0.47	0.31	0.05	0.29	0.10	0.00	0.52	0.02	0.01	0.01
O6	0.01	0.01	0.05	0.15	0.01	0.12	0.01	0.35	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.16	0.02	0.52	0.00	0.85	0.80	0.74
OP1	0.28	0.55	0.23	0.30	0.55	0.18	0.71	0.19	0.76	0.66	0.67	0.49	0.47	0.78	0.49	0.22	0.44	0.25	0.02	0.85	0.00	0.01	0.01
OP2	0.48	0.67	0.37	0.27	0.65	0.28	0.73	0.32	0.76	0.67	0.73	0.65	0.62	0.74	0.60	0.33	0.18	0.43	0.01	0.80	0.01	0.00	0.01
P	0.30	0.52	0.24	0.28	0.53	0.09	0.64	0.01	0.68	0.60	0.62	0.48	0.46	0.69	0.47	0.12	0.23	0.26	0.01	0.74	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.35	0.20	0.16	0.18	0.15	0.16	0.18	0.25	0.23	0.33	0.29	0.24	0.16	0.16	0.41	0.22	0.18	0.24	0.53	1.25	0.38
C2	0.35	0.16	0.32	0.30	0.18	0.21	0.15	0.13	0.15	0.38	0.23	0.11	0.22	0.29	0.32	0.43	0.46	0.24	0.23	0.84	1.03	0.53
C2'	0.27	0.32	0.22	0.18	0.19	0.18	0.17	0.25	0.23	0.30	0.31	0.26	0.23	0.23	0.22	0.42	0.20	0.21	0.35	0.68	1.55	0.58
C3'	0.20	0.33	0.15	0.11	0.18	0.14	0.17	0.28	0.23	0.25	0.32	0.27	0.23	0.20	0.17	0.43	0.22	0.12	0.32	0.55	1.55	0.47
C4	0.35	0.30	0.33	0.31	0.10	0.25	0.10	0.17	0.22	0.35	0.32	0.17	0.24	0.21	0.27	0.45	0.49	0.26	0.16	0.57	0.94	0.35
C4'	0.17	0.37	0.18	0.20	0.21	0.22	0.19	0.39	0.27	0.15	0.35	0.31	0.26	0.16	0.13	0.47	0.22	0.14	0.40	0.50	1.50	0.44
C5	0.45	0.31	0.47	0.47	0.13	0.39	0.11	0.27	0.22	0.36	0.34	0.14	0.25	0.22	0.33	0.59	0.71	0.34	0.17	0.48	0.70	0.22
C5'	0.17	0.33	0.20	0.30	0.18	0.33	0.16	0.54	0.22	0.16	0.30	0.29	0.22	0.15	0.13	0.53	0.33	0.18	0.50	0.63	1.43	0.52
C6	0.49	0.21	0.52	0.52	0.23	0.40	0.16	0.26	0.18	0.39	0.29	0.15	0.24	0.26	0.39	0.66	0.77	0.35	0.17	0.54	0.64	0.26
C8	0.33	0.39	0.37	0.41	0.14	0.39	0.14	0.33	0.26	0.28	0.38	0.28	0.26	0.16	0.20	0.57	0.62	0.29	0.22	0.49	0.72	0.15
N1	0.43	0.16	0.44	0.42	0.26	0.31	0.19	0.17	0.14	0.40	0.23	0.18	0.22	0.30	0.39	0.57	0.63	0.30	0.16	0.72	0.81	0.39
N2	0.31	0.14	0.27	0.26	0.19	0.18	0.18	0.15	0.14	0.35	0.19	0.14	0.20	0.30	0.29	0.37	0.38	0.22	0.32	1.03	1.16	0.66
N3	0.31	0.23	0.26	0.24	0.10	0.18	0.10	0.13	0.19	0.36	0.27	0.13	0.23	0.24	0.26	0.35	0.37	0.22	0.26	0.78	1.13	0.53
N7	0.43	0.37	0.49	0.55	0.11	0.47	0.12	0.37	0.25	0.31	0.38	0.21	0.26	0.18	0.28	0.65	0.81	0.36	0.26	0.46	0.58	0.16
N9	0.29	0.36	0.27	0.26	0.14	0.23	0.13	0.19	0.25	0.29	0.35	0.26	0.25	0.17	0.19	0.45	0.41	0.22	0.16	0.49	0.97	0.26
O2'	0.29	0.34	0.26	0.31	0.21	0.30	0.19	0.39	0.26	0.25	0.34	0.29	0.28	0.20	0.21	0.40	0.25	0.29	0.51	0.84	1.80	0.77
O3'	0.21	0.33	0.17	0.16	0.19	0.18	0.19	0.33	0.25	0.25	0.32	0.27	0.26	0.22	0.18	0.44	0.18	0.15	0.41	0.60	1.76	0.61
O4'	0.17	0.39	0.15	0.13	0.22	0.16	0.20	0.28	0.27	0.19	0.36	0.34	0.27	0.17	0.13	0.45	0.19	0.13	0.27	0.54	1.15	0.25
O5'	0.20	0.56	0.26	0.35	0.29	0.38	0.27	0.66	0.39	0.25	0.53	0.46	0.38	0.22	0.18	0.61	0.33	0.17	0.60	1.46	0.83	0.66
O6	0.52	0.19	0.60	0.61	0.27	0.46	0.18	0.32	0.18	0.37	0.28	0.22	0.25	0.26	0.41	0.76	0.90	0.38	0.22	0.49	0.50	0.21
OP1	0.65	0.93	0.68	0.34	0.69	0.29	0.61	0.43	0.69	0.49	0.85	0.87	0.64	0.49	0.59	1.20	0.36	0.43	0.45	1.55	0.78	0.58
OP2	0.53	0.91	0.56	0.60	0.67	0.56	0.65	0.73	0.76	0.51	0.89	0.82	0.74	0.54	0.55	0.84	0.66	0.40	0.69	1.56	0.64	0.76
P	0.41	0.81	0.40	0.24	0.55	0.24	0.49	0.54	0.61	0.31	0.76	0.73	0.57	0.34	0.40	0.88	0.26	0.20	0.51	1.56	0.70	0.66

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.20	0.00	0.10	0.38	0.20	0.15
C2	0.03	0.00	0.25	0.19	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.44	0.32	0.15	0.15	0.78	0.33	0.29
C2'	0.01	0.25	0.00	0.00	0.13	0.01	0.06	0.13	0.11	0.14	0.19	0.24	0.08	0.08	0.02	0.00	0.03	0.02	0.26	0.47	0.41	0.27
C3'	0.01	0.19	0.00	0.00	0.13	0.00	0.16	0.02	0.17	0.19	0.17	0.17	0.18	0.20	0.11	0.01	0.01	0.01	0.06	0.14	0.24	0.09
C4	0.02	0.01	0.13	0.13	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.27	0.19	0.09	0.19	0.81	0.37	0.33
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.07	0.11	0.06	0.05	0.09	0.11	0.06	0.15	0.02	0.00	0.02	0.27	0.23	0.04
C5	0.01	0.01	0.06	0.16	0.00	0.08	0.00	0.16	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.25	0.12	0.06	0.28	1.06	0.54	0.46
C5'	0.04	0.11	0.13	0.02	0.11	0.01	0.16	0.00	0.17	0.17	0.15	0.09	0.20	0.19	0.10	0.04	0.12	0.02	0.01	0.46	0.37	0.01
C6	0.02	0.01	0.11	0.17	0.00	0.07	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.32	0.17	0.09	0.28	1.10	0.55	0.47
C8	0.01	0.01	0.14	0.19	0.01	0.11	0.00	0.17	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.22	0.06	0.08	0.33	1.03	0.57	0.48
N1	0.02	0.00	0.19	0.17	0.00	0.06	0.01	0.15	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.39	0.26	0.13	0.22	0.97	0.44	0.39
N3	0.03	0.00	0.24	0.17	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.41	0.32	0.14	0.12	0.66	0.27	0.24
N6	0.01	0.01	0.08	0.18	0.01	0.09	0.01	0.20	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.31	0.13	0.08	0.32	1.25	0.65	0.55
N7	0.01	0.01	0.08	0.20	0.01	0.11	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.23	0.06	0.04	0.36	1.20	0.67	0.56
N9	0.00	0.01	0.02	0.11	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.14	0.10	0.01	0.19	0.73	0.36	0.30
O2'	0.02	0.44	0.00	0.01	0.27	0.15	0.25	0.04	0.32	0.22	0.39	0.41	0.31	0.23	0.14	0.00	0.05	0.12	0.22	0.54	0.55	0.26
O3'	0.20	0.32	0.03	0.01	0.19	0.02	0.12	0.12	0.17	0.06	0.26	0.32	0.13	0.06	0.10	0.05	0.00	0.14	0.12	0.20	0.25	0.13
O4'	0.00	0.15	0.02	0.01	0.09	0.00	0.06	0.02	0.09	0.08	0.13	0.14	0.08	0.04	0.01	0.12	0.14	0.00	0.07	0.26	0.38	0.18
O5'	0.10	0.15	0.26	0.06	0.19	0.02	0.28	0.01	0.28	0.33	0.22	0.12	0.32	0.36	0.19	0.22	0.12	0.07	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.38	0.78	0.47	0.14	0.81	0.27	1.06	0.46	1.10	1.03	0.97	0.66	1.25	1.20	0.73	0.54	0.20	0.26	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.20	0.33	0.41	0.24	0.37	0.23	0.54	0.37	0.55	0.57	0.44	0.27	0.65	0.67	0.36	0.55	0.25	0.38	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.15	0.29	0.27	0.09	0.33	0.04	0.46	0.01	0.47	0.48	0.39	0.24	0.55	0.56	0.30	0.26	0.13	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00