Doublet Group distance statistics: 53222

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 7, 13, 4, 2, 2, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.011, 0.017, 0.022, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.017 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.008, 0.015, 0.022, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.015 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.024, 0.034, 0.045, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.034 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.012, 0.023, 0.033, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.023 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.016 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.009, 0.021, 0.033, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.021 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.010, 0.022, 0.034, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.022 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.027, 0.043, 0.058, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.043 std_dev=0.015
O6	A	0, 0.039, 0.059, 0.078, 0.117 max_d=0.117 avg_d=0.059 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.016, 0.042, 0.068, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.042 std_dev=0.026
N2	A	0, 0.043, 0.070, 0.098, 0.131 max_d=0.131 avg_d=0.070 std_dev=0.027
C8	A	0, 0.025, 0.056, 0.086, 0.163 max_d=0.163 avg_d=0.056 std_dev=0.030
O4'	A	0, 0.063, 0.143, 0.224, 0.402 max_d=0.402 avg_d=0.143 std_dev=0.080
C2'	A	0, 0.051, 0.136, 0.221, 0.338 max_d=0.338 avg_d=0.136 std_dev=0.085
O2'	A	0, 0.090, 0.188, 0.285, 0.463 max_d=0.463 avg_d=0.188 std_dev=0.098
C3'	A	0, 0.115, 0.244, 0.373, 0.618 max_d=0.618 avg_d=0.244 std_dev=0.129
C4'	A	0, 0.082, 0.214, 0.345, 0.616 max_d=0.616 avg_d=0.214 std_dev=0.132
O3'	A	0, 0.181, 0.364, 0.548, 0.839 max_d=0.839 avg_d=0.364 std_dev=0.183
N7	B	0, 0.276, 0.462, 0.647, 1.143 max_d=1.143 avg_d=0.462 std_dev=0.186
C5	B	0, 0.238, 0.426, 0.614, 1.041 max_d=1.041 avg_d=0.426 std_dev=0.188
O5'	A	0, 0.246, 0.436, 0.625, 0.912 max_d=0.912 avg_d=0.436 std_dev=0.189
C6	B	0, 0.318, 0.508, 0.699, 1.066 max_d=1.066 avg_d=0.508 std_dev=0.191
N3	B	0, 0.324, 0.515, 0.706, 0.904 max_d=0.904 avg_d=0.515 std_dev=0.191
N1	B	0, 0.392, 0.585, 0.779, 1.021 max_d=1.021 avg_d=0.585 std_dev=0.193
C5'	A	0, 0.179, 0.373, 0.566, 0.984 max_d=0.984 avg_d=0.373 std_dev=0.194
C2	B	0, 0.388, 0.584, 0.780, 0.934 max_d=0.934 avg_d=0.584 std_dev=0.196
C4	B	0, 0.191, 0.389, 0.587, 0.977 max_d=0.977 avg_d=0.389 std_dev=0.198
N6	B	0, 0.389, 0.602, 0.815, 1.179 max_d=1.179 avg_d=0.602 std_dev=0.213
C8	B	0, 0.183, 0.398, 0.613, 1.178 max_d=1.178 avg_d=0.398 std_dev=0.215
C2'	B	0, 0.356, 0.584, 0.813, 1.275 max_d=1.275 avg_d=0.584 std_dev=0.228
N9	B	0, 0.115, 0.345, 0.576, 1.080 max_d=1.080 avg_d=0.345 std_dev=0.231
C1'	B	0, 0.148, 0.379, 0.610, 1.049 max_d=1.049 avg_d=0.379 std_dev=0.231
P	A	0, 0.304, 0.536, 0.767, 1.130 max_d=1.130 avg_d=0.536 std_dev=0.232
C3'	B	0, 0.402, 0.641, 0.881, 1.116 max_d=1.116 avg_d=0.641 std_dev=0.240
O4'	B	0, 0.305, 0.548, 0.792, 1.297 max_d=1.297 avg_d=0.548 std_dev=0.244
OP2	A	0, 0.357, 0.604, 0.851, 1.094 max_d=1.094 avg_d=0.604 std_dev=0.247
OP1	A	0, 0.348, 0.639, 0.930, 1.503 max_d=1.503 avg_d=0.639 std_dev=0.291
C4'	B	0, 0.474, 0.818, 1.162, 1.401 max_d=1.401 avg_d=0.818 std_dev=0.344
O3'	B	0, 0.237, 0.653, 1.070, 1.644 max_d=1.644 avg_d=0.653 std_dev=0.417
O2'	B	0, 0.308, 0.757, 1.207, 2.845 max_d=2.845 avg_d=0.757 std_dev=0.449
C5'	B	0, 0.833, 1.370, 1.908, 2.224 max_d=2.224 avg_d=1.370 std_dev=0.538
O5'	B	0, 1.171, 2.248, 3.326, 4.118 max_d=4.118 avg_d=2.248 std_dev=1.077
OP2	B	0, 2.867, 4.233, 5.598, 6.286 max_d=6.286 avg_d=4.233 std_dev=1.366
P	B	0, 2.131, 3.688, 5.245, 6.030 max_d=6.030 avg_d=3.688 std_dev=1.557
OP1	B	0, 2.604, 4.731, 6.859, 7.758 max_d=7.758 avg_d=4.731 std_dev=2.127

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.02	0.07	0.07	0.04
C2	0.03	0.00	0.08	0.12	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.15	0.02	0.08	0.01	0.13	0.13	0.10
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.05	0.02	0.05	0.01	0.06	0.03	0.07	0.10	0.08	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.06	0.06	0.13	0.09	0.07
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.09	0.00	0.10	0.02	0.12	0.09	0.12	0.13	0.10	0.10	0.06	0.01	0.01	0.01	0.07	0.13	0.14	0.07	0.08
C4	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.07	0.01	0.11	0.11	0.08
C4'	0.00	0.06	0.02	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.06	0.05	0.06	0.07	0.05	0.06	0.03	0.05	0.02	0.00	0.02	0.07	0.06	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.12	0.02	0.11	0.02	0.14	0.15	0.11
C5'	0.02	0.07	0.01	0.02	0.05	0.01	0.07	0.00	0.09	0.07	0.08	0.07	0.06	0.09	0.04	0.04	0.04	0.01	0.01	0.10	0.05	0.01	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.12	0.01	0.06	0.01	0.09	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.15	0.02	0.12	0.01	0.16	0.17	0.13
C8	0.02	0.01	0.03	0.09	0.00	0.05	0.01	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.10	0.03	0.13	0.02	0.14	0.15	0.11
N1	0.02	0.00	0.07	0.12	0.01	0.06	0.01	0.08	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.16	0.02	0.10	0.01	0.15	0.15	0.12
N2	0.03	0.00	0.10	0.13	0.01	0.07	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.18	0.03	0.09	0.01	0.14	0.13	0.10
N3	0.03	0.00	0.08	0.10	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.13	0.02	0.07	0.01	0.11	0.10	0.08
N7	0.02	0.01	0.04	0.10	0.01	0.06	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.12	0.03	0.14	0.03	0.16	0.18	0.14
N9	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.06	0.01	0.07	0.02	0.09	0.10	0.06
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.05	0.05	0.04	0.04	0.06	0.02	0.08	0.11	0.08	0.03	0.02	0.00	0.04	0.04	0.03	0.05	0.11	0.07	0.04
O3'	0.02	0.15	0.02	0.01	0.10	0.02	0.12	0.04	0.15	0.10	0.16	0.18	0.13	0.12	0.06	0.04	0.00	0.02	0.09	0.17	0.18	0.11	0.11
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.07	0.03	0.07	0.09	0.07
O5'	0.04	0.08	0.06	0.07	0.07	0.02	0.11	0.01	0.12	0.13	0.10	0.09	0.07	0.14	0.07	0.03	0.09	0.07	0.00	0.14	0.02	0.01	0.01
O6	0.02	0.01	0.06	0.13	0.01	0.07	0.02	0.10	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.05	0.17	0.03	0.14	0.00	0.19	0.20	0.16
OP1	0.07	0.13	0.13	0.14	0.11	0.06	0.14	0.05	0.16	0.14	0.15	0.14	0.11	0.16	0.09	0.11	0.18	0.07	0.02	0.19	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.13	0.09	0.07	0.11	0.03	0.15	0.01	0.17	0.15	0.15	0.13	0.10	0.18	0.10	0.07	0.11	0.09	0.01	0.20	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.10	0.07	0.08	0.08	0.02	0.11	0.01	0.13	0.11	0.12	0.10	0.08	0.14	0.06	0.04	0.11	0.07	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.18	0.13	0.15	0.09	0.13	0.09	0.22	0.15	0.15	0.19	0.14	0.18	0.13	0.10	0.27	0.21	0.11	0.27	0.41	0.31	0.29
C2	0.16	0.15	0.22	0.22	0.14	0.23	0.18	0.39	0.20	0.21	0.16	0.15	0.30	0.23	0.16	0.45	0.20	0.18	0.45	0.44	0.43	0.25
C2'	0.10	0.19	0.13	0.17	0.09	0.13	0.08	0.24	0.14	0.13	0.19	0.15	0.18	0.13	0.09	0.29	0.19	0.10	0.31	0.47	0.29	0.25
C3'	0.10	0.20	0.16	0.17	0.10	0.12	0.09	0.22	0.15	0.11	0.20	0.16	0.18	0.10	0.07	0.26	0.19	0.09	0.28	0.54	0.23	0.23
C4	0.14	0.16	0.18	0.19	0.10	0.19	0.11	0.33	0.13	0.18	0.15	0.14	0.20	0.18	0.13	0.41	0.19	0.15	0.40	0.47	0.35	0.23
C4'	0.08	0.18	0.16	0.15	0.10	0.10	0.11	0.16	0.17	0.10	0.19	0.14	0.20	0.11	0.07	0.19	0.23	0.08	0.23	0.48	0.22	0.25
C5	0.16	0.17	0.22	0.22	0.12	0.22	0.13	0.36	0.15	0.18	0.16	0.16	0.20	0.18	0.15	0.47	0.20	0.17	0.50	0.61	0.39	0.27
C5'	0.10	0.19	0.21	0.16	0.13	0.11	0.14	0.14	0.18	0.12	0.20	0.16	0.20	0.14	0.10	0.18	0.24	0.10	0.24	0.55	0.16	0.23
C6	0.18	0.18	0.26	0.25	0.15	0.26	0.17	0.41	0.20	0.19	0.19	0.17	0.25	0.20	0.17	0.51	0.24	0.20	0.58	0.67	0.48	0.34
C8	0.14	0.20	0.14	0.18	0.12	0.16	0.10	0.26	0.15	0.14	0.19	0.17	0.16	0.11	0.12	0.35	0.19	0.13	0.38	0.57	0.29	0.24
N1	0.17	0.16	0.25	0.24	0.15	0.26	0.19	0.42	0.22	0.20	0.19	0.16	0.30	0.22	0.17	0.49	0.23	0.20	0.54	0.55	0.47	0.28
N2	0.16	0.16	0.22	0.22	0.15	0.23	0.20	0.40	0.22	0.22	0.17	0.15	0.32	0.25	0.17	0.45	0.20	0.19	0.44	0.41	0.46	0.27
N3	0.15	0.16	0.18	0.20	0.11	0.20	0.14	0.35	0.15	0.20	0.15	0.14	0.25	0.21	0.14	0.41	0.19	0.16	0.38	0.41	0.38	0.24
N7	0.17	0.20	0.20	0.21	0.13	0.21	0.12	0.33	0.14	0.17	0.18	0.18	0.16	0.14	0.15	0.45	0.20	0.17	0.50	0.70	0.35	0.31
N9	0.13	0.18	0.14	0.17	0.08	0.15	0.06	0.27	0.13	0.15	0.18	0.14	0.16	0.13	0.11	0.34	0.19	0.12	0.33	0.46	0.30	0.23
O2'	0.12	0.19	0.13	0.15	0.11	0.12	0.11	0.23	0.16	0.15	0.19	0.15	0.20	0.15	0.11	0.27	0.21	0.11	0.27	0.41	0.33	0.31
O3'	0.10	0.20	0.17	0.19	0.09	0.12	0.08	0.22	0.15	0.11	0.20	0.16	0.18	0.10	0.07	0.25	0.20	0.09	0.27	0.57	0.22	0.23
O4'	0.10	0.18	0.14	0.15	0.10	0.11	0.12	0.16	0.17	0.11	0.20	0.14	0.20	0.11	0.08	0.21	0.25	0.09	0.23	0.42	0.28	0.30
O5'	0.17	0.24	0.22	0.18	0.20	0.14	0.20	0.20	0.22	0.18	0.24	0.22	0.23	0.19	0.18	0.26	0.22	0.17	0.24	0.64	0.17	0.24
O6	0.20	0.20	0.30	0.28	0.17	0.30	0.18	0.45	0.22	0.19	0.22	0.19	0.26	0.19	0.18	0.54	0.29	0.23	0.69	0.84	0.58	0.49
OP1	0.19	0.24	0.22	0.18	0.20	0.15	0.20	0.17	0.22	0.18	0.24	0.23	0.23	0.19	0.18	0.27	0.26	0.19	0.24	0.82	0.21	0.28
OP2	0.23	0.27	0.25	0.21	0.23	0.19	0.22	0.24	0.24	0.20	0.26	0.26	0.23	0.21	0.22	0.36	0.21	0.22	0.30	0.97	0.25	0.36
P	0.19	0.24	0.22	0.18	0.20	0.15	0.20	0.18	0.22	0.18	0.23	0.23	0.22	0.19	0.19	0.28	0.25	0.19	0.24	0.79	0.19	0.27

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.02	0.03	0.01	0.02	0.06	0.03	0.01	0.04	0.05	0.03	0.01	0.01	0.03	0.22	0.01	0.20	0.39	0.17	0.20
C2	0.05	0.00	0.20	0.11	0.01	0.18	0.01	0.36	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.35	0.10	0.15	0.36	0.36	0.54	0.39
C2'	0.00	0.20	0.00	0.01	0.11	0.02	0.07	0.14	0.11	0.07	0.16	0.20	0.09	0.04	0.03	0.00	0.06	0.02	0.49	0.85	0.29	0.43
C3'	0.02	0.11	0.01	0.00	0.07	0.01	0.07	0.03	0.08	0.04	0.10	0.10	0.08	0.05	0.04	0.02	0.01	0.01	0.42	1.00	0.28	0.49
C4	0.03	0.01	0.11	0.07	0.00	0.09	0.00	0.23	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.21	0.12	0.08	0.25	0.35	0.41	0.40
C4'	0.01	0.18	0.02	0.01	0.09	0.00	0.07	0.01	0.10	0.03	0.15	0.17	0.08	0.02	0.02	0.11	0.04	0.00	0.02	0.39	0.30	0.07
C5	0.02	0.01	0.07	0.07	0.00	0.07	0.00	0.21	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.19	0.15	0.04	0.22	0.46	0.50	0.52
C5'	0.06	0.36	0.14	0.03	0.23	0.01	0.21	0.00	0.26	0.11	0.33	0.33	0.24	0.14	0.13	0.11	0.09	0.02	0.01	0.32	0.40	0.02
C6	0.03	0.01	0.11	0.08	0.01	0.10	0.01	0.26	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.25	0.12	0.06	0.23	0.51	0.57	0.55
C8	0.01	0.01	0.07	0.04	0.01	0.03	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.07	0.23	0.06	0.21	0.42	0.38	0.47
N1	0.04	0.00	0.16	0.10	0.01	0.15	0.01	0.33	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.32	0.10	0.11	0.29	0.44	0.59	0.49
N3	0.05	0.01	0.20	0.10	0.00	0.17	0.01	0.33	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.31	0.10	0.15	0.37	0.34	0.44	0.33
N6	0.03	0.01	0.09	0.08	0.01	0.08	0.01	0.24	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.23	0.13	0.05	0.22	0.61	0.62	0.62
N7	0.01	0.01	0.04	0.05	0.01	0.02	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.10	0.20	0.04	0.21	0.51	0.47	0.56
N9	0.01	0.02	0.03	0.04	0.01	0.02	0.01	0.13	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.08	0.19	0.01	0.20	0.33	0.31	0.35
O2'	0.03	0.35	0.00	0.02	0.21	0.11	0.19	0.11	0.25	0.07	0.32	0.31	0.23	0.10	0.08	0.00	0.10	0.08	0.52	1.05	0.36	0.51
O3'	0.22	0.10	0.06	0.01	0.12	0.04	0.15	0.09	0.12	0.23	0.10	0.10	0.13	0.20	0.19	0.10	0.00	0.17	0.26	0.97	0.38	0.42
O4'	0.01	0.15	0.02	0.01	0.08	0.00	0.04	0.02	0.06	0.06	0.11	0.15	0.05	0.04	0.01	0.08	0.17	0.00	0.21	0.28	0.33	0.31
O5'	0.20	0.36	0.49	0.42	0.25	0.02	0.22	0.01	0.23	0.21	0.29	0.37	0.22	0.21	0.20	0.52	0.26	0.21	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.39	0.36	0.85	1.00	0.35	0.39	0.46	0.32	0.51	0.42	0.44	0.34	0.61	0.51	0.33	1.05	0.97	0.28	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.17	0.54	0.29	0.28	0.41	0.30	0.50	0.40	0.57	0.38	0.59	0.44	0.62	0.47	0.31	0.36	0.38	0.33	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.20	0.39	0.43	0.49	0.40	0.07	0.52	0.02	0.55	0.47	0.49	0.33	0.62	0.56	0.35	0.51	0.42	0.31	0.01	0.01	0.01	0.00