Doublet Group distance statistics: 53223

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 0, 4, 11, 0, 3, 2, 1, 0, 2, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.002, 0.010, 0.018, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.005, 0.015, 0.024, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.015 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.006, 0.016, 0.026, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.016 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.016 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.006, 0.017, 0.029, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.017 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.009, 0.021, 0.034, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.021 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.007, 0.020, 0.034, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.020 std_dev=0.014
N2	A	0, 0.007, 0.025, 0.043, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.025 std_dev=0.018
O6	A	0, 0.007, 0.026, 0.045, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.026 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.011, 0.031, 0.051, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.031 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.012, 0.035, 0.058, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.035 std_dev=0.023
C2	B	0, 0.183, 0.480, 0.776, 1.354 max_d=1.354 avg_d=0.480 std_dev=0.297
N1	B	0, 0.287, 0.602, 0.917, 1.412 max_d=1.412 avg_d=0.602 std_dev=0.315
C4	B	0, 0.121, 0.436, 0.752, 1.415 max_d=1.415 avg_d=0.436 std_dev=0.316
N3	B	0, 0.032, 0.350, 0.668, 1.370 max_d=1.370 avg_d=0.350 std_dev=0.318
C5	B	0, 0.275, 0.597, 0.919, 1.384 max_d=1.384 avg_d=0.597 std_dev=0.322
C6	B	0, 0.319, 0.649, 0.978, 1.523 max_d=1.523 avg_d=0.649 std_dev=0.329
O4'	A	0, -0.188, 0.154, 0.496, 1.889 max_d=1.889 avg_d=0.154 std_dev=0.342
N9	B	0, 0.180, 0.537, 0.894, 1.576 max_d=1.576 avg_d=0.537 std_dev=0.357
C2'	A	0, -0.162, 0.203, 0.569, 2.069 max_d=2.069 avg_d=0.203 std_dev=0.366
N7	B	0, 0.361, 0.750, 1.140, 1.700 max_d=1.700 avg_d=0.750 std_dev=0.390
C1'	B	0, 0.173, 0.566, 0.959, 1.688 max_d=1.688 avg_d=0.566 std_dev=0.393
C8	B	0, 0.322, 0.720, 1.117, 1.698 max_d=1.698 avg_d=0.720 std_dev=0.397
N6	B	0, 0.415, 0.818, 1.221, 1.910 max_d=1.910 avg_d=0.818 std_dev=0.403
O5'	B	0, 0.509, 0.915, 1.321, 1.945 max_d=1.945 avg_d=0.915 std_dev=0.406
O4'	B	0, 0.355, 0.770, 1.184, 1.779 max_d=1.779 avg_d=0.770 std_dev=0.414
C2'	B	0, 0.233, 0.656, 1.079, 1.854 max_d=1.854 avg_d=0.656 std_dev=0.423
OP2	B	0, 0.528, 0.963, 1.398, 2.033 max_d=2.033 avg_d=0.963 std_dev=0.435
C3'	B	0, 0.360, 0.805, 1.250, 1.968 max_d=1.968 avg_d=0.805 std_dev=0.445
O2'	B	0, 0.289, 0.739, 1.189, 2.021 max_d=2.021 avg_d=0.739 std_dev=0.450
C4'	B	0, 0.438, 0.893, 1.347, 1.937 max_d=1.937 avg_d=0.893 std_dev=0.454
P	B	0, 0.568, 1.043, 1.518, 2.121 max_d=2.121 avg_d=1.043 std_dev=0.475
C5'	B	0, 0.597, 1.078, 1.560, 1.980 max_d=1.980 avg_d=1.078 std_dev=0.482
O2'	A	0, -0.195, 0.286, 0.768, 2.776 max_d=2.776 avg_d=0.286 std_dev=0.482
O3'	B	0, 0.624, 1.117, 1.610, 2.272 max_d=2.272 avg_d=1.117 std_dev=0.493
C3'	A	0, -0.221, 0.291, 0.803, 2.878 max_d=2.878 avg_d=0.291 std_dev=0.512
C4'	A	0, -0.260, 0.254, 0.768, 2.871 max_d=2.871 avg_d=0.254 std_dev=0.514
OP1	B	0, 0.642, 1.218, 1.794, 2.432 max_d=2.432 avg_d=1.218 std_dev=0.576
O3'	A	0, -0.204, 0.400, 1.003, 3.390 max_d=3.390 avg_d=0.400 std_dev=0.604
O5'	A	0, -0.145, 0.507, 1.159, 3.733 max_d=3.733 avg_d=0.507 std_dev=0.652
C5'	A	0, -0.279, 0.461, 1.201, 4.171 max_d=4.171 avg_d=0.461 std_dev=0.740
OP2	A	0, 0.277, 1.094, 1.911, 4.243 max_d=4.243 avg_d=1.094 std_dev=0.817
P	A	0, 0.191, 1.086, 1.981, 4.823 max_d=4.823 avg_d=1.086 std_dev=0.895
OP1	A	0, 0.361, 1.671, 2.982, 6.293 max_d=6.293 avg_d=1.671 std_dev=1.311

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.10	0.00	0.15	0.02	0.18	0.20	0.24
C2	0.02	0.00	0.23	0.18	0.00	0.11	0.01	0.24	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.23	0.15	0.19	0.27	0.01	0.25	0.26	0.31
C2'	0.00	0.23	0.00	0.00	0.12	0.01	0.06	0.11	0.10	0.11	0.18	0.28	0.23	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.23	0.08	0.25	0.31	0.25
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.13	0.00	0.14	0.02	0.16	0.12	0.17	0.20	0.16	0.14	0.09	0.02	0.01	0.01	0.06	0.17	0.23	0.13	0.08
C4	0.01	0.00	0.12	0.13	0.00	0.05	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.07	0.10	0.23	0.01	0.22	0.24	0.28
C4'	0.00	0.11	0.01	0.00	0.05	0.00	0.04	0.01	0.05	0.08	0.09	0.14	0.10	0.06	0.02	0.13	0.01	0.00	0.01	0.05	0.04	0.04	0.10
C5	0.01	0.01	0.06	0.14	0.00	0.04	0.00	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.08	0.05	0.22	0.01	0.24	0.26	0.28
C5'	0.07	0.24	0.11	0.02	0.17	0.01	0.16	0.00	0.19	0.09	0.23	0.26	0.22	0.11	0.11	0.03	0.09	0.02	0.01	0.19	0.04	0.04	0.02
C6	0.01	0.01	0.10	0.16	0.01	0.05	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.11	0.09	0.24	0.01	0.26	0.26	0.30
C8	0.01	0.01	0.11	0.12	0.00	0.08	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.20	0.10	0.10	0.15	0.02	0.22	0.25	0.26
N1	0.02	0.00	0.18	0.17	0.01	0.09	0.00	0.23	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.13	0.15	0.26	0.01	0.26	0.27	0.31
N2	0.03	0.01	0.28	0.20	0.01	0.14	0.01	0.26	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.32	0.20	0.22	0.29	0.02	0.26	0.26	0.32
N3	0.02	0.00	0.23	0.16	0.00	0.10	0.01	0.22	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.22	0.14	0.18	0.26	0.01	0.23	0.24	0.29
N7	0.01	0.01	0.06	0.14	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.16	0.10	0.05	0.18	0.01	0.23	0.26	0.26
N9	0.01	0.01	0.01	0.09	0.01	0.02	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.03	0.01	0.19	0.01	0.20	0.23	0.26
O2'	0.02	0.23	0.00	0.02	0.07	0.13	0.05	0.03	0.05	0.20	0.14	0.32	0.22	0.16	0.06	0.00	0.04	0.09	0.17	0.05	0.18	0.34	0.22
O3'	0.10	0.15	0.01	0.01	0.07	0.01	0.08	0.09	0.11	0.10	0.13	0.20	0.14	0.10	0.03	0.04	0.00	0.10	0.11	0.12	0.39	0.22	0.17
O4'	0.00	0.19	0.01	0.01	0.10	0.00	0.05	0.02	0.09	0.10	0.15	0.22	0.18	0.05	0.01	0.09	0.10	0.00	0.07	0.07	0.27	0.19	0.29
O5'	0.15	0.27	0.23	0.06	0.23	0.01	0.22	0.01	0.24	0.15	0.26	0.29	0.26	0.18	0.19	0.17	0.11	0.07	0.00	0.23	0.02	0.01	0.01
O6	0.02	0.01	0.08	0.17	0.01	0.05	0.01	0.19	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.12	0.07	0.23	0.00	0.26	0.26	0.29
OP1	0.18	0.25	0.25	0.23	0.22	0.04	0.24	0.04	0.26	0.22	0.26	0.26	0.23	0.23	0.20	0.18	0.39	0.27	0.02	0.26	0.00	0.01	0.01
OP2	0.20	0.26	0.31	0.13	0.24	0.04	0.26	0.04	0.26	0.25	0.27	0.26	0.24	0.26	0.23	0.34	0.22	0.19	0.01	0.26	0.01	0.00	0.01
P	0.24	0.31	0.25	0.08	0.28	0.10	0.28	0.02	0.30	0.26	0.31	0.32	0.29	0.26	0.26	0.22	0.17	0.29	0.01	0.29	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.26	0.21	0.21	0.12	0.21	0.15	0.20	0.23	0.14	0.30	0.14	0.26	0.14	0.13	0.24	0.23	0.22	0.21	0.20	0.16	0.13
C2	0.17	0.20	0.16	0.16	0.17	0.20	0.20	0.23	0.19	0.22	0.20	0.18	0.20	0.22	0.19	0.18	0.17	0.22	0.23	0.19	0.19	0.17
C2'	0.15	0.28	0.17	0.16	0.11	0.17	0.14	0.17	0.22	0.14	0.30	0.17	0.25	0.13	0.11	0.20	0.18	0.18	0.16	0.13	0.21	0.15
C3'	0.19	0.29	0.24	0.23	0.17	0.19	0.17	0.19	0.23	0.15	0.29	0.22	0.25	0.15	0.16	0.26	0.25	0.19	0.18	0.19	0.17	0.11
C4	0.15	0.19	0.17	0.16	0.10	0.15	0.13	0.17	0.18	0.14	0.22	0.10	0.20	0.14	0.12	0.18	0.17	0.18	0.20	0.15	0.15	0.11
C4'	0.43	0.43	0.47	0.46	0.38	0.44	0.37	0.43	0.39	0.37	0.43	0.41	0.40	0.35	0.39	0.48	0.48	0.42	0.43	0.47	0.36	0.37
C5	0.14	0.11	0.20	0.18	0.08	0.14	0.10	0.15	0.14	0.11	0.15	0.09	0.18	0.12	0.11	0.20	0.21	0.16	0.21	0.13	0.16	0.12
C5'	0.61	0.63	0.67	0.67	0.60	0.62	0.58	0.61	0.58	0.57	0.61	0.62	0.57	0.56	0.59	0.66	0.69	0.59	0.63	0.68	0.58	0.58
C6	0.11	0.13	0.16	0.15	0.08	0.12	0.10	0.16	0.12	0.11	0.13	0.12	0.15	0.12	0.10	0.16	0.16	0.15	0.21	0.14	0.17	0.14
C8	0.19	0.16	0.26	0.25	0.11	0.19	0.14	0.17	0.21	0.12	0.23	0.12	0.27	0.13	0.13	0.29	0.30	0.18	0.22	0.16	0.15	0.11
N1	0.11	0.14	0.12	0.11	0.12	0.16	0.17	0.20	0.18	0.17	0.16	0.11	0.20	0.19	0.13	0.13	0.11	0.18	0.22	0.17	0.19	0.16
N2	0.27	0.23	0.26	0.28	0.24	0.31	0.25	0.33	0.23	0.31	0.21	0.24	0.24	0.30	0.28	0.30	0.31	0.32	0.29	0.26	0.24	0.23
N3	0.17	0.24	0.16	0.15	0.15	0.18	0.17	0.21	0.19	0.19	0.23	0.18	0.20	0.18	0.17	0.17	0.16	0.22	0.22	0.18	0.17	0.14
N7	0.17	0.14	0.26	0.25	0.11	0.17	0.12	0.16	0.17	0.12	0.17	0.15	0.23	0.13	0.13	0.27	0.30	0.16	0.22	0.14	0.16	0.12
N9	0.18	0.21	0.21	0.20	0.10	0.18	0.14	0.18	0.21	0.13	0.26	0.10	0.25	0.13	0.12	0.24	0.23	0.19	0.21	0.16	0.15	0.11
O2'	0.27	0.30	0.31	0.31	0.16	0.32	0.16	0.32	0.23	0.20	0.31	0.21	0.25	0.16	0.20	0.38	0.37	0.31	0.27	0.28	0.30	0.29
O3'	0.28	0.33	0.32	0.32	0.24	0.28	0.22	0.28	0.26	0.22	0.32	0.29	0.26	0.20	0.24	0.34	0.34	0.27	0.25	0.28	0.23	0.20
O4'	0.43	0.35	0.43	0.43	0.34	0.45	0.32	0.44	0.34	0.35	0.37	0.34	0.36	0.32	0.37	0.46	0.45	0.44	0.43	0.45	0.34	0.37
O5'	0.58	0.61	0.64	0.64	0.57	0.58	0.56	0.57	0.57	0.55	0.60	0.60	0.56	0.54	0.57	0.62	0.66	0.55	0.59	0.61	0.54	0.54
O6	0.12	0.23	0.18	0.17	0.13	0.13	0.10	0.16	0.15	0.11	0.21	0.19	0.16	0.11	0.11	0.17	0.19	0.16	0.23	0.15	0.19	0.17
OP1	0.66	0.90	0.69	0.70	0.77	0.66	0.82	0.67	0.90	0.72	0.95	0.80	0.93	0.78	0.71	0.66	0.71	0.64	0.75	0.80	0.78	0.74
OP2	0.52	0.68	0.52	0.53	0.60	0.52	0.64	0.54	0.71	0.58	0.74	0.61	0.74	0.62	0.56	0.50	0.53	0.53	0.62	0.61	0.58	0.57
P	0.62	0.82	0.62	0.62	0.72	0.60	0.76	0.62	0.82	0.68	0.86	0.73	0.84	0.73	0.67	0.58	0.62	0.61	0.70	0.72	0.70	0.68

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.09	0.06	0.23	0.08
C2	0.02	0.00	0.12	0.18	0.01	0.07	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.23	0.02	0.22	0.16	0.16	0.12
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.07	0.01	0.06	0.01	0.08	0.04	0.10	0.12	0.07	0.04	0.03	0.00	0.01	0.00	0.12	0.14	0.16	0.05
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.12	0.00	0.12	0.01	0.14	0.07	0.17	0.16	0.14	0.09	0.06	0.02	0.01	0.01	0.14	0.19	0.13	0.09
C4	0.01	0.01	0.07	0.12	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.14	0.02	0.21	0.11	0.16	0.09
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.06	0.04	0.07	0.06	0.06	0.04	0.03	0.02	0.03	0.00	0.01	0.07	0.20	0.05
C5	0.01	0.00	0.06	0.12	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.15	0.02	0.26	0.13	0.14	0.13
C5'	0.02	0.08	0.01	0.01	0.06	0.01	0.07	0.00	0.08	0.07	0.08	0.06	0.08	0.07	0.04	0.02	0.02	0.02	0.01	0.07	0.16	0.01
C6	0.02	0.00	0.08	0.14	0.01	0.06	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.19	0.03	0.28	0.16	0.15	0.15
C8	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.08	0.03	0.24	0.10	0.17	0.11
N1	0.02	0.00	0.10	0.17	0.01	0.07	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.23	0.03	0.26	0.17	0.16	0.15
N3	0.01	0.00	0.12	0.16	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.19	0.02	0.19	0.13	0.16	0.09
N6	0.02	0.01	0.07	0.14	0.01	0.06	0.01	0.08	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.04	0.19	0.04	0.30	0.17	0.16	0.18
N7	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.11	0.03	0.27	0.12	0.14	0.14
N9	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.07	0.01	0.18	0.08	0.18	0.07
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.04	0.02	0.06	0.07	0.04	0.02	0.01	0.00	0.05	0.02	0.04	0.13	0.18	0.05
O3'	0.02	0.23	0.01	0.01	0.14	0.03	0.15	0.02	0.19	0.08	0.23	0.19	0.19	0.11	0.07	0.05	0.00	0.02	0.12	0.26	0.17	0.14
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.02	0.04	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.06	0.06	0.29	0.13
O5'	0.09	0.22	0.12	0.14	0.21	0.01	0.26	0.01	0.28	0.24	0.26	0.19	0.30	0.27	0.18	0.04	0.12	0.06	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.06	0.16	0.14	0.19	0.11	0.07	0.13	0.07	0.16	0.10	0.17	0.13	0.17	0.12	0.08	0.13	0.26	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.23	0.16	0.16	0.13	0.16	0.20	0.14	0.16	0.15	0.17	0.16	0.16	0.16	0.14	0.18	0.18	0.17	0.29	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.12	0.05	0.09	0.09	0.05	0.13	0.01	0.15	0.11	0.15	0.09	0.18	0.14	0.07	0.05	0.14	0.13	0.00	0.00	0.01	0.00