Doublet Group distance statistics: 53226

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 3, 8, 3, 2, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.003, 0.008, 0.014, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.008 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.001, 0.009, 0.017, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.009 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.003, 0.013, 0.023, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.013 std_dev=0.010
N2	A	0, 0.010, 0.022, 0.034, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.022 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.002, 0.015, 0.028, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.015 std_dev=0.013
N1	A	0, -0.002, 0.013, 0.028, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.013 std_dev=0.015
C5	A	0, 0.000, 0.016, 0.033, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.016 std_dev=0.017
C4	A	0, -0.003, 0.019, 0.040, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.019 std_dev=0.022
N9	A	0, -0.005, 0.021, 0.047, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.021 std_dev=0.026
O6	A	0, 0.002, 0.032, 0.061, 0.117 max_d=0.117 avg_d=0.032 std_dev=0.030
N7	A	0, -0.004, 0.033, 0.071, 0.161 max_d=0.161 avg_d=0.033 std_dev=0.037
C8	A	0, -0.010, 0.038, 0.086, 0.215 max_d=0.215 avg_d=0.038 std_dev=0.048
N1	B	0, 0.075, 0.240, 0.405, 0.707 max_d=0.707 avg_d=0.240 std_dev=0.165
C2	B	0, 0.070, 0.246, 0.423, 0.784 max_d=0.784 avg_d=0.246 std_dev=0.176
C6	B	0, 0.060, 0.259, 0.459, 0.809 max_d=0.809 avg_d=0.259 std_dev=0.200
N3	B	0, 0.051, 0.255, 0.458, 0.945 max_d=0.945 avg_d=0.255 std_dev=0.204
C4	B	0, 0.034, 0.261, 0.488, 0.906 max_d=0.906 avg_d=0.261 std_dev=0.227
C5	B	0, 0.057, 0.287, 0.516, 0.993 max_d=0.993 avg_d=0.287 std_dev=0.230
N6	B	0, 0.057, 0.328, 0.599, 1.105 max_d=1.105 avg_d=0.328 std_dev=0.271
N9	B	0, 0.066, 0.361, 0.657, 1.306 max_d=1.306 avg_d=0.361 std_dev=0.296
N7	B	0, 0.081, 0.397, 0.713, 1.398 max_d=1.398 avg_d=0.397 std_dev=0.316
C8	B	0, 0.086, 0.426, 0.766, 1.524 max_d=1.524 avg_d=0.426 std_dev=0.340
C1'	B	0, 0.055, 0.433, 0.811, 1.575 max_d=1.575 avg_d=0.433 std_dev=0.378
O4'	A	0, -0.283, 0.365, 1.012, 2.019 max_d=2.019 avg_d=0.365 std_dev=0.648
C2'	A	0, -0.274, 0.397, 1.067, 2.082 max_d=2.082 avg_d=0.397 std_dev=0.670
C2'	B	0, -0.061, 0.610, 1.280, 2.233 max_d=2.233 avg_d=0.610 std_dev=0.671
C3'	B	0, -0.066, 0.735, 1.535, 2.821 max_d=2.821 avg_d=0.735 std_dev=0.801
C3'	A	0, -0.340, 0.479, 1.298, 2.724 max_d=2.724 avg_d=0.479 std_dev=0.819
O3'	A	0, -0.322, 0.531, 1.384, 2.833 max_d=2.833 avg_d=0.531 std_dev=0.853
O3'	B	0, -0.073, 0.835, 1.744, 3.209 max_d=3.209 avg_d=0.835 std_dev=0.908
C4'	A	0, -0.386, 0.529, 1.445, 2.980 max_d=2.980 avg_d=0.529 std_dev=0.915
O4'	B	0, -0.151, 0.776, 1.703, 3.021 max_d=3.021 avg_d=0.776 std_dev=0.927
O2'	A	0, -0.404, 0.612, 1.628, 3.098 max_d=3.098 avg_d=0.612 std_dev=1.016
C4'	B	0, -0.170, 0.862, 1.895, 3.372 max_d=3.372 avg_d=0.862 std_dev=1.032
O2'	B	0, -0.346, 0.879, 2.104, 4.417 max_d=4.417 avg_d=0.879 std_dev=1.225
O5'	A	0, -0.533, 0.830, 2.193, 4.470 max_d=4.470 avg_d=0.830 std_dev=1.363
C5'	A	0, -0.579, 0.868, 2.314, 4.636 max_d=4.636 avg_d=0.868 std_dev=1.446
OP2	A	0, -0.661, 0.900, 2.461, 5.556 max_d=5.556 avg_d=0.900 std_dev=1.561
P	A	0, -0.678, 0.910, 2.497, 5.530 max_d=5.530 avg_d=0.910 std_dev=1.587
OP1	A	0, -0.746, 1.097, 2.940, 6.383 max_d=6.383 avg_d=1.097 std_dev=1.843
C5'	B	0, -0.692, 1.287, 3.266, 6.262 max_d=6.262 avg_d=1.287 std_dev=1.979
O5'	B	0, -0.978, 1.648, 4.275, 8.003 max_d=8.003 avg_d=1.648 std_dev=2.627
OP2	B	0, -1.320, 1.924, 5.167, 9.984 max_d=9.984 avg_d=1.924 std_dev=3.244
P	B	0, -1.396, 2.012, 5.419, 10.322 max_d=10.322 avg_d=2.012 std_dev=3.408
OP1	B	0, -1.686, 2.314, 6.314, 12.234 max_d=12.234 avg_d=2.314 std_dev=4.000

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.27	0.00	0.26	0.01	0.30	0.09	0.12
C2	0.01	0.00	0.38	0.22	0.00	0.22	0.00	0.32	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.36	0.28	0.36	0.42	0.01	0.30	0.20	0.20
C2'	0.00	0.38	0.00	0.00	0.20	0.02	0.11	0.15	0.18	0.19	0.30	0.46	0.37	0.11	0.03	0.00	0.05	0.03	0.44	0.14	0.65	0.51	0.46
C3'	0.01	0.22	0.00	0.00	0.21	0.00	0.26	0.01	0.28	0.22	0.26	0.20	0.18	0.26	0.17	0.02	0.01	0.02	0.14	0.30	0.49	0.17	0.20
C4	0.01	0.00	0.20	0.21	0.00	0.07	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.21	0.19	0.40	0.01	0.28	0.23	0.21
C4'	0.01	0.22	0.02	0.00	0.07	0.00	0.06	0.00	0.06	0.23	0.14	0.30	0.21	0.18	0.07	0.23	0.04	0.00	0.01	0.06	0.23	0.22	0.10
C5	0.01	0.00	0.11	0.26	0.00	0.06	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.14	0.18	0.08	0.45	0.01	0.34	0.40	0.33
C5'	0.06	0.32	0.15	0.01	0.16	0.00	0.16	0.00	0.17	0.31	0.24	0.41	0.29	0.27	0.13	0.08	0.17	0.01	0.01	0.17	0.24	0.28	0.01
C6	0.01	0.00	0.18	0.28	0.00	0.06	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.21	0.16	0.47	0.00	0.35	0.43	0.34
C8	0.01	0.01	0.19	0.22	0.00	0.23	0.00	0.31	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.46	0.09	0.20	0.45	0.01	0.39	0.39	0.40
N1	0.01	0.00	0.30	0.26	0.00	0.14	0.00	0.24	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.19	0.25	0.28	0.45	0.01	0.30	0.32	0.25
N2	0.02	0.00	0.46	0.20	0.01	0.30	0.01	0.41	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.53	0.32	0.43	0.44	0.01	0.35	0.14	0.21
N3	0.01	0.00	0.37	0.18	0.00	0.21	0.00	0.29	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.36	0.28	0.36	0.40	0.01	0.31	0.14	0.18
N7	0.01	0.01	0.11	0.26	0.01	0.18	0.00	0.27	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.39	0.14	0.10	0.49	0.01	0.45	0.52	0.47
N9	0.00	0.01	0.03	0.17	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.16	0.16	0.01	0.36	0.01	0.28	0.19	0.20
O2'	0.01	0.36	0.00	0.02	0.06	0.23	0.14	0.08	0.06	0.46	0.19	0.53	0.36	0.39	0.16	0.00	0.06	0.15	0.27	0.14	0.53	0.53	0.37
O3'	0.27	0.28	0.05	0.01	0.21	0.04	0.18	0.17	0.21	0.09	0.25	0.32	0.28	0.14	0.16	0.06	0.00	0.18	0.23	0.21	0.20	0.18	0.16
O4'	0.00	0.36	0.03	0.02	0.19	0.00	0.08	0.01	0.16	0.20	0.28	0.43	0.36	0.10	0.01	0.15	0.18	0.00	0.18	0.11	0.21	0.25	0.18
O5'	0.26	0.42	0.44	0.14	0.40	0.01	0.45	0.01	0.47	0.45	0.45	0.44	0.40	0.49	0.36	0.27	0.23	0.18	0.00	0.49	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.14	0.30	0.01	0.06	0.01	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.21	0.11	0.49	0.00	0.41	0.53	0.41
OP1	0.30	0.30	0.65	0.49	0.28	0.23	0.34	0.24	0.35	0.39	0.30	0.35	0.31	0.45	0.28	0.53	0.20	0.21	0.01	0.41	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.20	0.51	0.17	0.23	0.22	0.40	0.28	0.43	0.39	0.32	0.14	0.14	0.52	0.19	0.53	0.18	0.25	0.01	0.53	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.20	0.46	0.20	0.21	0.10	0.33	0.01	0.34	0.40	0.25	0.21	0.18	0.47	0.20	0.37	0.16	0.18	0.00	0.41	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.19	0.44	0.65	0.12	0.60	0.11	1.28	0.14	0.13	0.19	0.15	0.16	0.11	0.14	0.24	0.58	0.19	1.24	1.91	1.31	1.28
C2	0.17	0.15	0.58	0.43	0.11	0.13	0.13	0.35	0.12	0.21	0.14	0.12	0.14	0.19	0.17	0.76	0.54	0.22	0.25	0.42	0.59	0.41
C2'	0.50	0.18	0.47	0.65	0.29	0.45	0.21	1.10	0.13	0.39	0.19	0.25	0.17	0.29	0.41	0.40	0.69	0.26	1.09	1.79	1.19	1.15
C3'	0.10	0.36	0.59	0.94	0.15	0.92	0.11	1.73	0.18	0.07	0.31	0.27	0.18	0.07	0.09	0.27	0.83	0.37	1.65	2.56	1.75	1.81
C4	0.13	0.14	0.49	0.50	0.08	0.36	0.09	0.80	0.09	0.14	0.14	0.08	0.13	0.13	0.12	0.48	0.52	0.08	0.72	1.03	0.63	0.56
C4'	0.55	0.69	0.92	1.29	0.57	1.44	0.50	2.27	0.50	0.47	0.59	0.66	0.43	0.45	0.53	0.60	1.11	0.94	2.26	3.22	2.40	2.48
C5	0.14	0.10	0.46	0.42	0.10	0.29	0.14	0.65	0.13	0.17	0.12	0.07	0.18	0.18	0.13	0.53	0.47	0.09	0.60	0.83	0.48	0.42
C5'	0.86	0.97	1.13	1.52	0.86	1.80	0.79	2.66	0.77	0.77	0.86	0.96	0.67	0.73	0.83	0.79	1.33	1.34	2.76	3.78	3.03	3.08
C6	0.17	0.09	0.48	0.35	0.13	0.17	0.17	0.37	0.14	0.22	0.10	0.08	0.19	0.23	0.17	0.66	0.45	0.14	0.29	0.47	0.37	0.27
C8	0.13	0.12	0.42	0.50	0.09	0.48	0.12	1.02	0.15	0.13	0.16	0.09	0.21	0.14	0.11	0.34	0.48	0.16	1.04	1.51	1.05	1.00
N1	0.18	0.11	0.53	0.34	0.13	0.10	0.16	0.24	0.12	0.24	0.11	0.10	0.16	0.23	0.18	0.77	0.48	0.22	0.18	0.46	0.63	0.51
N2	0.21	0.17	0.66	0.43	0.15	0.10	0.18	0.19	0.16	0.26	0.16	0.16	0.18	0.24	0.21	0.94	0.58	0.38	0.37	0.57	1.01	0.81
N3	0.16	0.17	0.55	0.53	0.10	0.30	0.10	0.69	0.10	0.16	0.15	0.12	0.11	0.15	0.14	0.58	0.57	0.12	0.56	0.80	0.51	0.37
N7	0.13	0.11	0.42	0.43	0.11	0.38	0.15	0.81	0.17	0.16	0.14	0.08	0.23	0.18	0.13	0.43	0.45	0.13	0.82	1.14	0.75	0.70
N9	0.14	0.14	0.45	0.55	0.08	0.49	0.09	1.06	0.12	0.12	0.16	0.10	0.16	0.11	0.11	0.34	0.52	0.14	1.02	1.51	1.02	0.98
O2'	0.95	0.45	0.77	0.88	0.63	0.66	0.46	0.85	0.28	0.68	0.28	0.66	0.21	0.51	0.77	0.80	1.03	0.79	1.01	1.46	1.09	0.98
O3'	0.30	0.55	0.91	1.27	0.38	1.17	0.33	1.96	0.38	0.26	0.48	0.49	0.34	0.27	0.31	0.58	1.15	0.56	1.78	2.68	1.80	1.89
O4'	0.54	0.63	0.87	1.13	0.56	1.28	0.51	2.02	0.49	0.50	0.54	0.61	0.42	0.47	0.53	0.63	0.97	0.87	2.00	2.79	2.11	2.13
O5'	0.66	0.86	0.94	1.26	0.73	1.53	0.72	2.35	0.76	0.65	0.84	0.79	0.73	0.67	0.68	0.64	1.10	1.10	2.50	3.41	2.79	2.79
O6	0.20	0.08	0.45	0.30	0.16	0.15	0.21	0.27	0.17	0.27	0.10	0.10	0.23	0.28	0.21	0.69	0.43	0.18	0.20	0.46	0.43	0.37
OP1	0.72	0.81	1.06	1.50	0.70	1.77	0.63	2.64	0.62	0.60	0.72	0.80	0.55	0.57	0.67	0.66	1.35	1.25	2.87	3.91	3.16	3.23
OP2	0.42	0.58	0.66	0.98	0.44	1.25	0.39	2.01	0.42	0.33	0.53	0.54	0.38	0.33	0.39	0.49	0.89	0.85	2.28	3.09	2.59	2.56
P	0.59	0.71	0.87	1.26	0.60	1.56	0.55	2.39	0.56	0.51	0.65	0.68	0.52	0.50	0.56	0.54	1.13	1.10	2.66	3.60	3.00	3.00

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.29	0.00	0.11	0.11	0.48	0.25
C2	0.03	0.00	0.20	0.35	0.01	0.61	0.01	1.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.29	0.43	1.37	1.71	1.34	1.35
C2'	0.00	0.20	0.00	0.00	0.10	0.02	0.06	0.17	0.09	0.12	0.15	0.21	0.07	0.09	0.03	0.00	0.06	0.02	0.18	0.37	0.30	0.10
C3'	0.01	0.35	0.00	0.00	0.12	0.00	0.14	0.02	0.12	0.37	0.22	0.35	0.15	0.32	0.14	0.02	0.01	0.01	0.21	0.36	0.41	0.22
C4	0.02	0.01	0.10	0.12	0.00	0.25	0.00	0.48	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.12	0.19	0.23	0.64	0.68	0.40	0.40
C4'	0.01	0.61	0.02	0.00	0.25	0.00	0.08	0.00	0.22	0.37	0.46	0.59	0.13	0.25	0.05	0.19	0.04	0.01	0.01	0.15	0.36	0.14
C5	0.01	0.01	0.06	0.14	0.00	0.08	0.00	0.22	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.18	0.14	0.11	0.41	0.46	0.33	0.22
C5'	0.06	1.14	0.17	0.02	0.48	0.00	0.22	0.00	0.46	0.57	0.88	1.06	0.31	0.40	0.10	0.06	0.18	0.01	0.01	0.29	0.24	0.01
C6	0.01	0.00	0.09	0.12	0.00	0.22	0.00	0.46	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	0.15	0.21	0.71	0.81	0.58	0.55
C8	0.01	0.01	0.12	0.37	0.01	0.37	0.00	0.57	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.25	0.20	0.22	0.43	0.75	1.04	0.85
N1	0.02	0.00	0.15	0.22	0.00	0.46	0.01	0.88	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.22	0.34	1.14	1.40	1.12	1.09
N3	0.03	0.00	0.21	0.35	0.00	0.59	0.00	1.06	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.30	0.43	1.21	1.42	1.00	1.07
N6	0.01	0.01	0.07	0.15	0.01	0.13	0.01	0.31	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.20	0.14	0.15	0.56	0.65	0.45	0.40
N7	0.01	0.01	0.09	0.32	0.01	0.25	0.00	0.40	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.25	0.18	0.11	0.24	0.63	0.80	0.63
N9	0.00	0.01	0.03	0.14	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.14	0.18	0.01	0.15	0.24	0.50	0.28
O2'	0.02	0.17	0.00	0.02	0.12	0.19	0.18	0.06	0.17	0.25	0.16	0.17	0.20	0.25	0.14	0.00	0.08	0.13	0.19	0.20	0.38	0.23
O3'	0.29	0.29	0.06	0.01	0.19	0.04	0.14	0.18	0.15	0.20	0.22	0.30	0.14	0.18	0.18	0.08	0.00	0.21	0.25	0.44	0.46	0.34
O4'	0.00	0.43	0.02	0.01	0.23	0.01	0.11	0.01	0.21	0.22	0.34	0.43	0.15	0.11	0.01	0.13	0.21	0.00	0.06	0.10	0.51	0.30
O5'	0.11	1.37	0.18	0.21	0.64	0.01	0.41	0.01	0.71	0.43	1.14	1.21	0.56	0.24	0.15	0.19	0.25	0.06	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.11	1.71	0.37	0.36	0.68	0.15	0.46	0.29	0.81	0.75	1.40	1.42	0.65	0.63	0.24	0.20	0.44	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.48	1.34	0.30	0.41	0.40	0.36	0.33	0.24	0.58	1.04	1.12	1.00	0.45	0.80	0.50	0.38	0.46	0.51	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.25	1.35	0.10	0.22	0.40	0.14	0.22	0.01	0.55	0.85	1.09	1.07	0.40	0.63	0.28	0.23	0.34	0.30	0.00	0.01	0.01	0.00