Doublet Group distance statistics: 53227

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 2, 7, 2, 2, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.016, 0.025, 0.034, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.025 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.027, 0.036, 0.046, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.036 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.017, 0.029, 0.040, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.029 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.012, 0.025, 0.037, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.025 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.018, 0.031, 0.045, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.031 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.033, 0.047, 0.061, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.047 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.033, 0.048, 0.064, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.048 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.023, 0.040, 0.057, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.040 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.033, 0.059, 0.086, 0.117 max_d=0.117 avg_d=0.059 std_dev=0.027
N2	A	0, 0.020, 0.047, 0.073, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.047 std_dev=0.027
C8	A	0, 0.039, 0.067, 0.094, 0.124 max_d=0.124 avg_d=0.067 std_dev=0.027
O6	A	0, 0.063, 0.091, 0.119, 0.156 max_d=0.156 avg_d=0.091 std_dev=0.028
O4'	A	0, 0.193, 0.309, 0.426, 0.548 max_d=0.548 avg_d=0.309 std_dev=0.117
C2'	A	0, 0.210, 0.343, 0.476, 0.638 max_d=0.638 avg_d=0.343 std_dev=0.133
C4'	A	0, 0.297, 0.461, 0.625, 0.737 max_d=0.737 avg_d=0.461 std_dev=0.164
O2'	A	0, 0.291, 0.483, 0.675, 0.915 max_d=0.915 avg_d=0.483 std_dev=0.192
C3'	A	0, 0.336, 0.538, 0.740, 0.984 max_d=0.984 avg_d=0.538 std_dev=0.202
O4'	B	0, 0.237, 0.451, 0.665, 1.147 max_d=1.147 avg_d=0.451 std_dev=0.214
C8	B	0, 0.121, 0.338, 0.555, 0.870 max_d=0.870 avg_d=0.338 std_dev=0.217
N9	B	0, 0.089, 0.317, 0.544, 0.991 max_d=0.991 avg_d=0.317 std_dev=0.228
C1'	B	0, 0.084, 0.321, 0.558, 1.012 max_d=1.012 avg_d=0.321 std_dev=0.237
C4	B	0, 0.163, 0.408, 0.652, 1.143 max_d=1.143 avg_d=0.408 std_dev=0.244
N7	B	0, 0.146, 0.392, 0.639, 0.921 max_d=0.921 avg_d=0.392 std_dev=0.246
C5	B	0, 0.191, 0.439, 0.687, 1.091 max_d=1.091 avg_d=0.439 std_dev=0.248
C6	B	0, 0.296, 0.573, 0.850, 1.252 max_d=1.252 avg_d=0.573 std_dev=0.277
C5'	A	0, 0.571, 0.859, 1.148, 1.386 max_d=1.386 avg_d=0.859 std_dev=0.289
N3	B	0, 0.263, 0.553, 0.843, 1.390 max_d=1.390 avg_d=0.553 std_dev=0.290
N6	B	0, 0.336, 0.644, 0.952, 1.269 max_d=1.269 avg_d=0.644 std_dev=0.308
N1	B	0, 0.390, 0.700, 1.009, 1.456 max_d=1.456 avg_d=0.700 std_dev=0.309
C4'	B	0, 0.265, 0.579, 0.894, 1.532 max_d=1.532 avg_d=0.579 std_dev=0.314
O3'	A	0, 0.423, 0.737, 1.052, 1.590 max_d=1.590 avg_d=0.737 std_dev=0.315
C5'	B	0, 0.527, 0.842, 1.157, 1.538 max_d=1.538 avg_d=0.842 std_dev=0.315
C2	B	0, 0.363, 0.680, 0.997, 1.502 max_d=1.502 avg_d=0.680 std_dev=0.317
OP2	A	0, 0.631, 0.955, 1.279, 1.812 max_d=1.812 avg_d=0.955 std_dev=0.324
O5'	A	0, 0.675, 1.015, 1.355, 1.633 max_d=1.633 avg_d=1.015 std_dev=0.340
P	A	0, 0.246, 0.596, 0.945, 1.211 max_d=1.211 avg_d=0.596 std_dev=0.349
C2'	B	0, 0.176, 0.551, 0.926, 1.702 max_d=1.702 avg_d=0.551 std_dev=0.375
C3'	B	0, 0.229, 0.651, 1.072, 2.034 max_d=2.034 avg_d=0.651 std_dev=0.422
O2'	B	0, 0.270, 0.726, 1.182, 2.001 max_d=2.001 avg_d=0.726 std_dev=0.456
O5'	B	0, 0.560, 1.043, 1.526, 2.581 max_d=2.581 avg_d=1.043 std_dev=0.483
O3'	B	0, 0.169, 0.655, 1.142, 2.414 max_d=2.414 avg_d=0.655 std_dev=0.486
OP1	B	0, 0.879, 1.406, 1.932, 2.344 max_d=2.344 avg_d=1.406 std_dev=0.526
P	B	0, 0.783, 1.369, 1.956, 3.309 max_d=3.309 avg_d=1.369 std_dev=0.587
OP1	A	0, 0.439, 1.172, 1.906, 3.827 max_d=3.827 avg_d=1.172 std_dev=0.734
OP2	B	0, 1.037, 1.927, 2.817, 5.047 max_d=5.047 avg_d=1.927 std_dev=0.890

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.14	0.02	0.39	0.32	0.15
C2	0.03	0.00	0.09	0.06	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.11	0.06	0.25	0.02	0.38	0.35	0.13
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.06	0.02	0.05	0.04	0.06	0.06	0.07	0.11	0.09	0.06	0.03	0.00	0.04	0.01	0.23	0.06	0.46	0.29	0.21
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.03	0.06	0.08	0.06	0.08	0.06	0.08	0.04	0.02	0.01	0.03	0.29	0.06	0.44	0.30	0.24
C4	0.02	0.01	0.06	0.05	0.00	0.02	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.07	0.03	0.28	0.01	0.45	0.32	0.15
C4'	0.02	0.05	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.04	0.10	0.03	0.09	0.06	0.09	0.03	0.08	0.03	0.00	0.02	0.06	0.25	0.26	0.09
C5	0.01	0.01	0.05	0.06	0.00	0.05	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.06	0.02	0.36	0.01	0.52	0.31	0.19
C5'	0.03	0.07	0.04	0.03	0.11	0.00	0.18	0.00	0.18	0.23	0.12	0.06	0.06	0.24	0.13	0.06	0.07	0.02	0.01	0.22	0.19	0.23	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.06	0.01	0.04	0.01	0.18	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.10	0.07	0.04	0.36	0.01	0.51	0.34	0.21
C8	0.01	0.01	0.06	0.08	0.01	0.10	0.01	0.23	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.07	0.04	0.37	0.02	0.58	0.26	0.20
N1	0.03	0.01	0.07	0.06	0.01	0.03	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.09	0.05	0.31	0.01	0.44	0.35	0.17
N2	0.04	0.00	0.11	0.08	0.01	0.09	0.01	0.06	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.16	0.14	0.07	0.21	0.02	0.34	0.37	0.12
N3	0.03	0.01	0.09	0.06	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.11	0.06	0.22	0.02	0.38	0.34	0.13
N7	0.01	0.01	0.06	0.08	0.01	0.09	0.00	0.24	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.07	0.03	0.40	0.03	0.61	0.28	0.24
N9	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.03	0.01	0.13	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.05	0.01	0.27	0.02	0.47	0.30	0.15
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.08	0.08	0.08	0.06	0.10	0.07	0.11	0.16	0.13	0.07	0.04	0.00	0.07	0.04	0.16	0.10	0.37	0.31	0.18
O3'	0.04	0.11	0.04	0.01	0.07	0.03	0.06	0.07	0.07	0.07	0.09	0.14	0.11	0.07	0.05	0.07	0.00	0.03	0.31	0.07	0.39	0.31	0.26
O4'	0.01	0.06	0.01	0.03	0.03	0.00	0.02	0.02	0.04	0.04	0.05	0.07	0.06	0.03	0.01	0.04	0.03	0.00	0.08	0.04	0.36	0.35	0.18
O5'	0.14	0.25	0.23	0.29	0.28	0.02	0.36	0.01	0.36	0.37	0.31	0.21	0.22	0.40	0.27	0.16	0.31	0.08	0.00	0.41	0.03	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.06	0.06	0.01	0.06	0.01	0.22	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.10	0.07	0.04	0.41	0.00	0.56	0.35	0.25
OP1	0.39	0.38	0.46	0.44	0.45	0.25	0.52	0.19	0.51	0.58	0.44	0.34	0.38	0.61	0.47	0.37	0.39	0.36	0.03	0.56	0.00	0.02	0.01
OP2	0.32	0.35	0.29	0.30	0.32	0.26	0.31	0.23	0.34	0.26	0.35	0.37	0.34	0.28	0.30	0.31	0.31	0.35	0.02	0.35	0.02	0.00	0.01
P	0.15	0.13	0.21	0.24	0.15	0.09	0.19	0.01	0.21	0.20	0.17	0.12	0.13	0.24	0.15	0.18	0.26	0.18	0.01	0.25	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.30	0.11	0.16	0.21	0.17	0.20	0.20	0.23	0.15	0.28	0.27	0.22	0.17	0.13	0.30	0.32	0.17	0.35	0.30	0.26	0.28
C2	0.18	0.22	0.16	0.19	0.10	0.21	0.10	0.27	0.15	0.20	0.21	0.17	0.16	0.18	0.13	0.16	0.13	0.19	0.53	0.42	0.38	0.50
C2'	0.07	0.28	0.08	0.18	0.19	0.17	0.18	0.18	0.21	0.16	0.26	0.26	0.20	0.18	0.13	0.28	0.38	0.15	0.49	0.45	0.52	0.46
C3'	0.13	0.33	0.10	0.29	0.24	0.23	0.22	0.21	0.24	0.15	0.30	0.32	0.22	0.17	0.17	0.27	0.51	0.20	0.45	0.40	0.56	0.46
C4	0.17	0.25	0.20	0.17	0.12	0.20	0.16	0.25	0.20	0.18	0.25	0.20	0.21	0.18	0.11	0.26	0.21	0.20	0.40	0.31	0.26	0.35
C4'	0.21	0.34	0.16	0.35	0.29	0.29	0.27	0.25	0.29	0.21	0.32	0.34	0.27	0.23	0.24	0.26	0.54	0.27	0.43	0.39	0.47	0.44
C5	0.21	0.22	0.25	0.19	0.10	0.21	0.17	0.25	0.20	0.21	0.23	0.14	0.23	0.21	0.16	0.30	0.19	0.21	0.38	0.29	0.34	0.37
C5'	0.29	0.37	0.26	0.48	0.32	0.39	0.30	0.37	0.31	0.25	0.35	0.37	0.29	0.26	0.29	0.28	0.69	0.33	0.48	0.45	0.50	0.51
C6	0.23	0.18	0.26	0.21	0.12	0.22	0.16	0.26	0.17	0.23	0.17	0.13	0.22	0.24	0.19	0.26	0.15	0.21	0.44	0.33	0.44	0.46
C8	0.17	0.28	0.24	0.16	0.15	0.18	0.19	0.21	0.23	0.17	0.28	0.20	0.24	0.19	0.13	0.37	0.29	0.20	0.28	0.22	0.22	0.24
N1	0.21	0.19	0.21	0.21	0.10	0.21	0.12	0.27	0.12	0.23	0.17	0.15	0.17	0.23	0.17	0.19	0.12	0.20	0.51	0.39	0.46	0.52
N2	0.17	0.22	0.14	0.19	0.13	0.20	0.11	0.27	0.16	0.19	0.21	0.18	0.15	0.16	0.13	0.12	0.12	0.18	0.60	0.50	0.40	0.58
N3	0.16	0.25	0.16	0.17	0.13	0.21	0.14	0.27	0.19	0.16	0.24	0.21	0.18	0.16	0.10	0.19	0.18	0.19	0.48	0.39	0.27	0.42
N7	0.20	0.24	0.27	0.18	0.13	0.19	0.19	0.23	0.23	0.20	0.26	0.15	0.25	0.21	0.16	0.36	0.24	0.20	0.32	0.24	0.30	0.31
N9	0.14	0.28	0.18	0.15	0.16	0.19	0.18	0.23	0.22	0.16	0.27	0.23	0.22	0.17	0.11	0.32	0.28	0.19	0.33	0.27	0.21	0.27
O2'	0.14	0.28	0.13	0.19	0.22	0.20	0.21	0.22	0.22	0.22	0.26	0.26	0.21	0.22	0.18	0.28	0.33	0.17	0.67	0.62	0.71	0.62
O3'	0.14	0.32	0.12	0.33	0.23	0.27	0.21	0.24	0.23	0.16	0.28	0.31	0.21	0.18	0.17	0.25	0.54	0.21	0.51	0.46	0.75	0.57
O4'	0.15	0.35	0.11	0.24	0.28	0.21	0.26	0.20	0.29	0.18	0.33	0.33	0.27	0.21	0.20	0.29	0.42	0.22	0.23	0.22	0.23	0.20
O5'	0.21	0.40	0.31	0.17	0.28	0.15	0.29	0.18	0.34	0.22	0.39	0.34	0.34	0.24	0.22	0.59	0.26	0.15	0.17	0.16	0.24	0.20
O6	0.25	0.17	0.29	0.24	0.17	0.23	0.20	0.27	0.19	0.25	0.16	0.16	0.26	0.26	0.22	0.30	0.16	0.22	0.44	0.33	0.50	0.49
OP1	0.20	0.51	0.40	0.32	0.32	0.35	0.35	0.39	0.45	0.23	0.53	0.39	0.47	0.29	0.23	0.61	0.26	0.26	0.36	0.37	0.47	0.39
OP2	0.52	0.71	0.39	0.58	0.63	0.49	0.62	0.45	0.66	0.54	0.69	0.68	0.65	0.58	0.56	0.24	0.77	0.51	0.46	0.45	0.38	0.47
P	0.12	0.37	0.22	0.11	0.24	0.17	0.25	0.19	0.32	0.16	0.37	0.30	0.32	0.20	0.16	0.46	0.22	0.15	0.17	0.16	0.25	0.19

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.02	0.03	0.01	0.02	0.05	0.03	0.02	0.04	0.05	0.02	0.01	0.00	0.02	0.16	0.01	0.17	0.11	0.42	0.21
C2	0.05	0.00	0.17	0.13	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.20	0.18	0.08	0.25	0.16	0.65	0.38
C2'	0.00	0.17	0.00	0.01	0.08	0.01	0.04	0.11	0.07	0.10	0.12	0.17	0.06	0.08	0.02	0.01	0.02	0.02	0.19	0.23	0.50	0.19
C3'	0.02	0.13	0.01	0.00	0.10	0.00	0.10	0.01	0.11	0.09	0.13	0.12	0.12	0.10	0.07	0.02	0.01	0.01	0.35	0.24	0.58	0.28
C4	0.03	0.01	0.08	0.10	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.15	0.12	0.04	0.29	0.16	0.63	0.39
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.08	0.05	0.06	0.06	0.08	0.04	0.12	0.02	0.01	0.02	0.08	0.30	0.04
C5	0.02	0.01	0.04	0.10	0.01	0.05	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.19	0.09	0.04	0.36	0.19	0.71	0.48
C5'	0.05	0.10	0.11	0.01	0.10	0.01	0.13	0.00	0.13	0.15	0.11	0.09	0.14	0.15	0.10	0.03	0.10	0.03	0.01	0.11	0.38	0.03
C6	0.03	0.01	0.07	0.11	0.01	0.05	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.21	0.11	0.05	0.35	0.20	0.74	0.50
C8	0.02	0.01	0.10	0.09	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.18	0.07	0.06	0.39	0.21	0.64	0.46
N1	0.04	0.00	0.12	0.13	0.02	0.05	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.21	0.15	0.07	0.30	0.18	0.71	0.45
N3	0.05	0.01	0.17	0.12	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.19	0.17	0.08	0.22	0.15	0.59	0.34
N6	0.02	0.01	0.06	0.12	0.01	0.06	0.01	0.14	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.24	0.10	0.05	0.39	0.23	0.79	0.55
N7	0.01	0.01	0.08	0.10	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.21	0.07	0.05	0.42	0.23	0.72	0.53
N9	0.00	0.02	0.02	0.07	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.11	0.10	0.02	0.29	0.15	0.57	0.36
O2'	0.02	0.20	0.01	0.02	0.15	0.12	0.19	0.03	0.21	0.18	0.21	0.19	0.24	0.21	0.11	0.00	0.05	0.07	0.27	0.27	0.53	0.26
O3'	0.16	0.18	0.02	0.01	0.12	0.02	0.09	0.10	0.11	0.07	0.15	0.17	0.10	0.07	0.10	0.05	0.00	0.11	0.34	0.28	0.54	0.29
O4'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.04	0.01	0.04	0.03	0.05	0.06	0.07	0.08	0.05	0.05	0.02	0.07	0.11	0.00	0.33	0.24	0.27	0.26
O5'	0.17	0.25	0.19	0.35	0.29	0.02	0.36	0.01	0.35	0.39	0.30	0.22	0.39	0.42	0.29	0.27	0.34	0.33	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.11	0.16	0.23	0.24	0.16	0.08	0.19	0.11	0.20	0.21	0.18	0.15	0.23	0.23	0.15	0.27	0.28	0.24	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.42	0.65	0.50	0.58	0.63	0.30	0.71	0.38	0.74	0.64	0.71	0.59	0.79	0.72	0.57	0.53	0.54	0.27	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.21	0.38	0.19	0.28	0.39	0.04	0.48	0.03	0.50	0.46	0.45	0.34	0.55	0.53	0.36	0.26	0.29	0.26	0.01	0.01	0.01	0.00