Doublet Group distance statistics: 53228

back

Distances from reference structure (by RMSD)

3, 9, 3, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.001, 0.007, 0.013, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.007 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.002, 0.011, 0.019, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.011 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.003, 0.014, 0.025, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.014 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.000, 0.012, 0.023, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.012 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.000, 0.012, 0.024, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.012 std_dev=0.012
N2	A	0, 0.006, 0.022, 0.037, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.022 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.000, 0.016, 0.032, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.016 std_dev=0.016
N9	A	0, -0.002, 0.017, 0.037, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.017 std_dev=0.019
O6	A	0, 0.006, 0.025, 0.044, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.025 std_dev=0.019
N7	A	0, -0.003, 0.023, 0.050, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.023 std_dev=0.027
C8	A	0, -0.008, 0.027, 0.062, 0.166 max_d=0.166 avg_d=0.027 std_dev=0.035
O4'	A	0, 0.025, 0.089, 0.152, 0.288 max_d=0.288 avg_d=0.089 std_dev=0.064
C2'	A	0, 0.031, 0.100, 0.168, 0.294 max_d=0.294 avg_d=0.100 std_dev=0.068
O2'	A	0, 0.050, 0.148, 0.245, 0.381 max_d=0.381 avg_d=0.148 std_dev=0.097
O5'	A	0, 0.065, 0.168, 0.271, 0.447 max_d=0.447 avg_d=0.168 std_dev=0.103
C4'	A	0, 0.038, 0.146, 0.253, 0.468 max_d=0.468 avg_d=0.146 std_dev=0.108
C3'	A	0, 0.037, 0.148, 0.259, 0.447 max_d=0.447 avg_d=0.148 std_dev=0.111
N7	B	0, 0.088, 0.240, 0.391, 0.662 max_d=0.662 avg_d=0.240 std_dev=0.152
C5	B	0, 0.057, 0.210, 0.363, 0.622 max_d=0.622 avg_d=0.210 std_dev=0.153
C5'	A	0, 0.058, 0.211, 0.365, 0.661 max_d=0.661 avg_d=0.211 std_dev=0.154
C6	B	0, 0.059, 0.217, 0.375, 0.589 max_d=0.589 avg_d=0.217 std_dev=0.158
C8	B	0, 0.064, 0.225, 0.385, 0.718 max_d=0.718 avg_d=0.225 std_dev=0.160
C4	B	0, 0.047, 0.212, 0.377, 0.688 max_d=0.688 avg_d=0.212 std_dev=0.165
N9	B	0, 0.044, 0.211, 0.378, 0.722 max_d=0.722 avg_d=0.211 std_dev=0.167
C1'	B	0, 0.039, 0.213, 0.388, 0.766 max_d=0.766 avg_d=0.213 std_dev=0.174
N1	B	0, 0.038, 0.214, 0.390, 0.628 max_d=0.628 avg_d=0.214 std_dev=0.176
N6	B	0, 0.093, 0.275, 0.456, 0.716 max_d=0.716 avg_d=0.275 std_dev=0.181
O3'	A	0, 0.054, 0.237, 0.420, 0.771 max_d=0.771 avg_d=0.237 std_dev=0.183
N3	B	0, 0.077, 0.261, 0.445, 0.767 max_d=0.767 avg_d=0.261 std_dev=0.184
C2	B	0, 0.070, 0.255, 0.440, 0.744 max_d=0.744 avg_d=0.255 std_dev=0.185
O4'	B	0, 0.028, 0.213, 0.398, 0.804 max_d=0.804 avg_d=0.213 std_dev=0.185
C4'	B	0, 0.028, 0.219, 0.410, 0.784 max_d=0.784 avg_d=0.219 std_dev=0.191
C2'	B	0, 0.040, 0.233, 0.427, 0.847 max_d=0.847 avg_d=0.233 std_dev=0.193
C3'	B	0, 0.023, 0.225, 0.428, 0.837 max_d=0.837 avg_d=0.225 std_dev=0.202
O5'	B	0, 0.061, 0.263, 0.466, 0.781 max_d=0.781 avg_d=0.263 std_dev=0.203
OP2	B	0, 0.050, 0.256, 0.461, 0.863 max_d=0.863 avg_d=0.256 std_dev=0.205
P	B	0, 0.060, 0.269, 0.479, 0.731 max_d=0.731 avg_d=0.269 std_dev=0.209
C5'	B	0, 0.046, 0.257, 0.468, 0.859 max_d=0.859 avg_d=0.257 std_dev=0.211
O2'	B	0, 0.056, 0.271, 0.486, 0.933 max_d=0.933 avg_d=0.271 std_dev=0.215
O3'	B	0, 0.021, 0.241, 0.462, 0.895 max_d=0.895 avg_d=0.241 std_dev=0.221
OP1	B	0, 0.061, 0.305, 0.549, 0.968 max_d=0.968 avg_d=0.305 std_dev=0.244
P	A	0, 0.060, 0.306, 0.551, 0.937 max_d=0.937 avg_d=0.306 std_dev=0.245
OP1	A	0, 0.097, 0.354, 0.610, 1.082 max_d=1.082 avg_d=0.354 std_dev=0.257
OP2	A	0, -0.002, 0.463, 0.928, 1.627 max_d=1.627 avg_d=0.463 std_dev=0.465

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.03	0.11	0.05
C2	0.01	0.00	0.06	0.07	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.10	0.02	0.05	0.01	0.08	0.16	0.08
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.02	0.04	0.02	0.05	0.02	0.06	0.06	0.06	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.06	0.05	0.04	0.03
C3'	0.02	0.07	0.00	0.00	0.06	0.00	0.06	0.02	0.07	0.06	0.08	0.08	0.07	0.06	0.05	0.01	0.01	0.01	0.05	0.08	0.07	0.10	0.04
C4	0.01	0.00	0.04	0.06	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.08	0.01	0.05	0.01	0.08	0.17	0.09
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.04	0.04	0.04	0.03	0.04	0.03	0.06	0.02	0.00	0.01	0.04	0.07	0.03	0.01
C5	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.08	0.02	0.07	0.01	0.12	0.21	0.11
C5'	0.01	0.03	0.02	0.02	0.04	0.01	0.05	0.00	0.06	0.06	0.05	0.03	0.03	0.07	0.04	0.06	0.04	0.01	0.01	0.06	0.08	0.03	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.10	0.02	0.07	0.00	0.13	0.22	0.12
C8	0.01	0.00	0.02	0.06	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.07	0.02	0.07	0.01	0.11	0.21	0.11
N1	0.01	0.00	0.06	0.08	0.01	0.04	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.10	0.02	0.06	0.01	0.11	0.19	0.10
N2	0.02	0.01	0.06	0.08	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.11	0.02	0.05	0.02	0.07	0.15	0.08
N3	0.01	0.00	0.06	0.07	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.09	0.01	0.05	0.01	0.06	0.15	0.07
N7	0.01	0.00	0.03	0.06	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.08	0.02	0.08	0.01	0.14	0.25	0.13
N9	0.00	0.00	0.01	0.05	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.05	0.01	0.07	0.16	0.08
O2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.05	0.06	0.05	0.06	0.06	0.02	0.07	0.08	0.07	0.03	0.02	0.00	0.02	0.05	0.04	0.07	0.10	0.06	0.05
O3'	0.02	0.10	0.02	0.01	0.08	0.02	0.08	0.04	0.10	0.07	0.10	0.11	0.09	0.08	0.06	0.02	0.00	0.02	0.07	0.11	0.11	0.20	0.09
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.04	0.02	0.05	0.12	0.06
O5'	0.04	0.05	0.04	0.05	0.05	0.01	0.07	0.01	0.07	0.07	0.06	0.05	0.05	0.08	0.05	0.04	0.07	0.04	0.00	0.08	0.02	0.01	0.01
O6	0.01	0.01	0.06	0.08	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.11	0.02	0.08	0.00	0.16	0.24	0.13
OP1	0.03	0.08	0.05	0.07	0.08	0.07	0.12	0.08	0.13	0.11	0.11	0.07	0.06	0.14	0.07	0.10	0.11	0.05	0.02	0.16	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.16	0.04	0.10	0.17	0.03	0.21	0.03	0.22	0.21	0.19	0.15	0.15	0.25	0.16	0.06	0.20	0.12	0.01	0.24	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.08	0.03	0.04	0.09	0.01	0.11	0.01	0.12	0.11	0.10	0.08	0.07	0.13	0.08	0.05	0.09	0.06	0.01	0.13	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.13	0.07	0.08	0.04	0.10	0.09	0.14	0.08	0.15	0.08	0.12	0.12	0.15	0.08	0.05	0.07	0.11	0.12	0.10	0.16	0.10
C2	0.07	0.20	0.07	0.07	0.11	0.07	0.09	0.09	0.11	0.09	0.17	0.17	0.15	0.12	0.07	0.10	0.08	0.06	0.10	0.13	0.08	0.06
C2'	0.06	0.14	0.07	0.09	0.05	0.12	0.07	0.16	0.07	0.12	0.09	0.13	0.10	0.12	0.06	0.06	0.09	0.09	0.13	0.12	0.17	0.12
C3'	0.13	0.10	0.15	0.17	0.06	0.19	0.09	0.23	0.07	0.15	0.07	0.08	0.10	0.14	0.11	0.13	0.17	0.16	0.18	0.14	0.18	0.16
C4	0.05	0.15	0.05	0.06	0.03	0.08	0.09	0.11	0.08	0.12	0.08	0.12	0.14	0.15	0.06	0.06	0.07	0.08	0.11	0.10	0.12	0.07
C4'	0.17	0.08	0.18	0.19	0.11	0.20	0.13	0.21	0.11	0.18	0.08	0.08	0.13	0.17	0.15	0.17	0.18	0.19	0.18	0.15	0.18	0.15
C5	0.06	0.11	0.06	0.06	0.05	0.09	0.10	0.12	0.10	0.13	0.06	0.09	0.16	0.15	0.08	0.07	0.07	0.09	0.11	0.10	0.12	0.06
C5'	0.19	0.10	0.21	0.20	0.15	0.20	0.16	0.20	0.14	0.20	0.11	0.11	0.15	0.19	0.18	0.21	0.21	0.20	0.17	0.14	0.17	0.15
C6	0.06	0.13	0.06	0.06	0.07	0.08	0.10	0.10	0.10	0.11	0.09	0.11	0.16	0.13	0.07	0.08	0.08	0.07	0.10	0.11	0.10	0.06
C8	0.10	0.08	0.10	0.10	0.09	0.12	0.13	0.14	0.12	0.15	0.08	0.07	0.16	0.17	0.11	0.08	0.09	0.13	0.12	0.09	0.15	0.09
N1	0.06	0.17	0.07	0.06	0.08	0.07	0.09	0.09	0.10	0.10	0.14	0.14	0.15	0.12	0.07	0.09	0.08	0.06	0.10	0.13	0.09	0.06
N2	0.11	0.22	0.11	0.09	0.15	0.08	0.13	0.08	0.16	0.10	0.20	0.20	0.17	0.12	0.11	0.13	0.10	0.08	0.11	0.16	0.07	0.08
N3	0.06	0.20	0.06	0.06	0.09	0.07	0.08	0.09	0.09	0.10	0.14	0.18	0.14	0.13	0.06	0.08	0.08	0.06	0.10	0.11	0.10	0.05
N7	0.09	0.07	0.09	0.09	0.08	0.11	0.13	0.13	0.13	0.14	0.08	0.06	0.17	0.16	0.10	0.08	0.09	0.11	0.12	0.09	0.14	0.08
N9	0.07	0.12	0.07	0.07	0.04	0.10	0.11	0.13	0.09	0.14	0.06	0.10	0.14	0.16	0.09	0.05	0.07	0.10	0.12	0.09	0.15	0.09
O2'	0.07	0.15	0.08	0.09	0.09	0.10	0.09	0.15	0.09	0.12	0.11	0.16	0.12	0.13	0.07	0.07	0.10	0.08	0.13	0.13	0.18	0.14
O3'	0.13	0.11	0.17	0.21	0.06	0.22	0.08	0.27	0.07	0.15	0.08	0.09	0.10	0.13	0.10	0.16	0.21	0.16	0.22	0.18	0.20	0.20
O4'	0.14	0.08	0.13	0.12	0.11	0.14	0.14	0.15	0.12	0.18	0.08	0.07	0.14	0.18	0.15	0.11	0.10	0.16	0.13	0.12	0.17	0.12
O5'	0.19	0.11	0.19	0.18	0.16	0.19	0.18	0.20	0.16	0.21	0.13	0.12	0.18	0.21	0.19	0.20	0.18	0.20	0.17	0.14	0.18	0.15
O6	0.07	0.12	0.07	0.06	0.08	0.08	0.11	0.11	0.12	0.12	0.10	0.10	0.17	0.14	0.08	0.09	0.08	0.08	0.11	0.12	0.10	0.05
OP1	0.14	0.12	0.15	0.13	0.13	0.11	0.15	0.11	0.15	0.15	0.14	0.12	0.17	0.16	0.14	0.16	0.15	0.13	0.11	0.06	0.14	0.07
OP2	0.31	0.39	0.31	0.25	0.36	0.22	0.38	0.21	0.40	0.34	0.40	0.37	0.40	0.36	0.34	0.36	0.26	0.26	0.20	0.19	0.20	0.17
P	0.24	0.21	0.25	0.22	0.24	0.20	0.25	0.20	0.24	0.25	0.22	0.22	0.25	0.26	0.24	0.27	0.23	0.22	0.19	0.15	0.18	0.15

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.00	0.08	0.12	0.12	0.09
C2	0.03	0.00	0.02	0.03	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.06	0.05	0.13	0.18	0.12	0.13
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.04	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02	0.00	0.01	0.00	0.07	0.10	0.09	0.08
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.07	0.09	0.05
C4	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.02	0.12	0.17	0.11	0.12
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.05	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.11	0.04
C5	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.04	0.02	0.13	0.18	0.09	0.11
C5'	0.03	0.06	0.04	0.02	0.05	0.01	0.05	0.00	0.05	0.05	0.05	0.07	0.06	0.05	0.04	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.02
C6	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.05	0.03	0.13	0.18	0.08	0.11
C8	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.07	0.04	0.03	0.12	0.16	0.09	0.10
N1	0.02	0.00	0.02	0.03	0.01	0.04	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.05	0.04	0.13	0.18	0.10	0.12
N3	0.02	0.00	0.02	0.03	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.05	0.05	0.12	0.17	0.13	0.13
N6	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.07	0.05	0.03	0.14	0.18	0.09	0.11
N7	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.07	0.04	0.03	0.12	0.18	0.09	0.11
N9	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.01	0.11	0.15	0.10	0.10
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.03	0.01	0.05	0.04	0.05	0.07	0.04	0.05	0.07	0.07	0.03	0.00	0.03	0.01	0.07	0.12	0.09	0.09
O3'	0.04	0.06	0.01	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.05	0.04	0.05	0.05	0.05	0.04	0.04	0.03	0.00	0.03	0.04	0.07	0.10	0.05
O4'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.04	0.05	0.03	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.06	0.11	0.14	0.08
O5'	0.08	0.13	0.07	0.04	0.12	0.02	0.13	0.01	0.13	0.12	0.13	0.12	0.14	0.12	0.11	0.07	0.04	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.12	0.18	0.10	0.07	0.17	0.05	0.18	0.02	0.18	0.16	0.18	0.17	0.18	0.18	0.15	0.12	0.07	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.12	0.09	0.09	0.11	0.11	0.09	0.08	0.08	0.09	0.10	0.13	0.09	0.09	0.10	0.09	0.10	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.13	0.08	0.05	0.12	0.04	0.11	0.02	0.11	0.10	0.12	0.13	0.11	0.11	0.10	0.09	0.05	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00