Doublet Group distance statistics: 53229

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 4, 4, 2, 3, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.014, 0.021, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.014 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.012, 0.025, 0.038, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.025 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.020, 0.034, 0.047, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.034 std_dev=0.013
C2	A	0, -0.005, 0.011, 0.027, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.011 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.003, 0.020, 0.037, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.020 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.017, 0.034, 0.052, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.034 std_dev=0.018
N3	A	0, 0.001, 0.019, 0.037, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.019 std_dev=0.018
N2	A	0, -0.004, 0.019, 0.043, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.019 std_dev=0.023
N9	A	0, 0.020, 0.045, 0.070, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.045 std_dev=0.025
O6	A	0, 0.031, 0.060, 0.088, 0.139 max_d=0.139 avg_d=0.060 std_dev=0.029
N7	A	0, 0.043, 0.073, 0.102, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.073 std_dev=0.030
C8	A	0, 0.045, 0.082, 0.119, 0.130 max_d=0.130 avg_d=0.082 std_dev=0.037
O4'	A	0, 0.023, 0.067, 0.112, 0.172 max_d=0.172 avg_d=0.067 std_dev=0.044
C2'	A	0, 0.043, 0.120, 0.197, 0.365 max_d=0.365 avg_d=0.120 std_dev=0.077
C4'	A	0, 0.034, 0.134, 0.234, 0.450 max_d=0.450 avg_d=0.134 std_dev=0.100
O2'	A	0, 0.113, 0.222, 0.330, 0.540 max_d=0.540 avg_d=0.222 std_dev=0.109
C3'	A	0, 0.043, 0.159, 0.276, 0.543 max_d=0.543 avg_d=0.159 std_dev=0.117
O5'	A	0, 0.092, 0.233, 0.373, 0.563 max_d=0.563 avg_d=0.233 std_dev=0.141
C5'	A	0, 0.052, 0.203, 0.354, 0.677 max_d=0.677 avg_d=0.203 std_dev=0.151
O3'	A	0, 0.066, 0.231, 0.397, 0.754 max_d=0.754 avg_d=0.231 std_dev=0.165
C4	B	0, 0.159, 0.336, 0.514, 0.610 max_d=0.610 avg_d=0.336 std_dev=0.178
C2'	B	0, 0.169, 0.347, 0.526, 0.746 max_d=0.746 avg_d=0.347 std_dev=0.179
C2	B	0, 0.171, 0.353, 0.535, 0.741 max_d=0.741 avg_d=0.353 std_dev=0.182
N1	B	0, 0.169, 0.355, 0.540, 0.689 max_d=0.689 avg_d=0.355 std_dev=0.185
N9	B	0, 0.185, 0.371, 0.558, 0.733 max_d=0.733 avg_d=0.371 std_dev=0.186
N3	B	0, 0.150, 0.337, 0.523, 0.712 max_d=0.712 avg_d=0.337 std_dev=0.187
O2'	B	0, 0.176, 0.368, 0.560, 0.722 max_d=0.722 avg_d=0.368 std_dev=0.192
C1'	B	0, 0.196, 0.389, 0.583, 0.805 max_d=0.805 avg_d=0.389 std_dev=0.194
C5	B	0, 0.141, 0.343, 0.545, 0.719 max_d=0.719 avg_d=0.343 std_dev=0.202
C6	B	0, 0.141, 0.344, 0.547, 0.724 max_d=0.724 avg_d=0.344 std_dev=0.203
C3'	B	0, 0.136, 0.351, 0.566, 0.888 max_d=0.888 avg_d=0.351 std_dev=0.215
O3'	B	0, 0.118, 0.344, 0.570, 0.914 max_d=0.914 avg_d=0.344 std_dev=0.226
C8	B	0, 0.183, 0.412, 0.641, 0.958 max_d=0.958 avg_d=0.412 std_dev=0.229
N7	B	0, 0.161, 0.397, 0.632, 0.969 max_d=0.969 avg_d=0.397 std_dev=0.236
O4'	B	0, 0.179, 0.420, 0.660, 0.967 max_d=0.967 avg_d=0.420 std_dev=0.240
P	A	0, 0.090, 0.332, 0.574, 0.994 max_d=0.994 avg_d=0.332 std_dev=0.242
N6	B	0, 0.118, 0.380, 0.642, 1.021 max_d=1.021 avg_d=0.380 std_dev=0.262
C4'	B	0, 0.144, 0.409, 0.675, 1.060 max_d=1.060 avg_d=0.409 std_dev=0.265
OP2	A	0, 0.161, 0.455, 0.748, 1.271 max_d=1.271 avg_d=0.455 std_dev=0.293
OP1	A	0, 0.067, 0.373, 0.679, 1.262 max_d=1.262 avg_d=0.373 std_dev=0.306
O5'	B	0, 0.136, 0.491, 0.845, 1.306 max_d=1.306 avg_d=0.491 std_dev=0.355
C5'	B	0, 0.108, 0.488, 0.868, 1.503 max_d=1.503 avg_d=0.488 std_dev=0.380
P	B	0, -0.092, 0.730, 1.552, 3.031 max_d=3.031 avg_d=0.730 std_dev=0.822
OP1	B	0, -0.165, 0.839, 1.843, 3.617 max_d=3.617 avg_d=0.839 std_dev=1.004
OP2	B	0, -0.469, 0.991, 2.450, 5.155 max_d=5.155 avg_d=0.991 std_dev=1.460

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.07	0.05
C2	0.04	0.00	0.08	0.07	0.01	0.05	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.10	0.10	0.03	0.07	0.01	0.08	0.13	0.09
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.04	0.06	0.10	0.08	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.03	0.04	0.03	0.02
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.09	0.06	0.10	0.07	0.09	0.04	0.01	0.01	0.01	0.05	0.08	0.06	0.04	0.03
C4	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.05	0.01	0.07	0.00	0.08	0.14	0.10
C4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.03	0.06	0.03	0.07	0.05	0.06	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.05	0.02	0.01
C5	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.07	0.01	0.10	0.01	0.14	0.20	0.14
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.07	0.09	0.05	0.06	0.04	0.10	0.04	0.02	0.02	0.01	0.01	0.09	0.05	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.08	0.01	0.11	0.00	0.16	0.21	0.16
C8	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.06	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.09	0.02	0.11	0.01	0.14	0.19	0.14
N1	0.03	0.00	0.06	0.06	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.08	0.02	0.09	0.01	0.12	0.17	0.12
N2	0.04	0.00	0.10	0.10	0.01	0.07	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.13	0.13	0.04	0.06	0.02	0.08	0.12	0.08
N3	0.04	0.00	0.08	0.07	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.09	0.09	0.04	0.05	0.01	0.06	0.11	0.07
N7	0.01	0.01	0.03	0.09	0.01	0.06	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.10	0.02	0.13	0.02	0.18	0.24	0.18
N9	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.07	0.12	0.08
O2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.04	0.02	0.03	0.02	0.05	0.02	0.08	0.13	0.09	0.02	0.01	0.00	0.03	0.02	0.03	0.05	0.05	0.03	0.02
O3'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.05	0.01	0.07	0.02	0.08	0.09	0.08	0.13	0.09	0.10	0.04	0.03	0.00	0.01	0.05	0.09	0.09	0.06	0.05
O4'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.02	0.04	0.06	0.05
O5'	0.03	0.07	0.03	0.05	0.07	0.01	0.10	0.01	0.11	0.11	0.09	0.06	0.05	0.13	0.06	0.03	0.05	0.04	0.00	0.14	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.03	0.08	0.00	0.05	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.05	0.09	0.02	0.14	0.00	0.21	0.26	0.19
OP1	0.03	0.08	0.04	0.06	0.08	0.05	0.14	0.05	0.16	0.14	0.12	0.08	0.06	0.18	0.07	0.05	0.09	0.04	0.01	0.21	0.00	0.01	0.00
OP2	0.07	0.13	0.03	0.04	0.14	0.02	0.20	0.02	0.21	0.19	0.17	0.12	0.11	0.24	0.12	0.03	0.06	0.06	0.01	0.26	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.09	0.02	0.03	0.10	0.01	0.14	0.01	0.16	0.14	0.12	0.08	0.07	0.18	0.08	0.02	0.05	0.05	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.14	0.14	0.11	0.12	0.10	0.18	0.15	0.20	0.22	0.18	0.10	0.25	0.24	0.15	0.18	0.11	0.11	0.29	0.25	0.19	0.22
C2	0.13	0.13	0.13	0.12	0.09	0.12	0.10	0.23	0.11	0.18	0.15	0.09	0.13	0.17	0.13	0.15	0.11	0.10	0.37	0.51	0.66	0.49
C2'	0.13	0.14	0.12	0.08	0.12	0.08	0.18	0.12	0.20	0.23	0.18	0.09	0.25	0.25	0.14	0.16	0.08	0.10	0.32	0.31	0.15	0.22
C3'	0.10	0.12	0.10	0.05	0.09	0.05	0.15	0.09	0.15	0.23	0.14	0.08	0.20	0.24	0.12	0.13	0.06	0.07	0.36	0.34	0.13	0.19
C4	0.12	0.14	0.13	0.12	0.10	0.11	0.12	0.21	0.14	0.18	0.17	0.09	0.16	0.17	0.13	0.15	0.11	0.09	0.36	0.45	0.53	0.43
C4'	0.10	0.12	0.10	0.06	0.11	0.06	0.18	0.08	0.18	0.24	0.15	0.09	0.23	0.25	0.13	0.14	0.08	0.08	0.30	0.20	0.24	0.10
C5	0.12	0.15	0.12	0.13	0.11	0.13	0.13	0.24	0.13	0.17	0.17	0.11	0.13	0.16	0.13	0.13	0.13	0.10	0.39	0.57	0.72	0.53
C5'	0.09	0.13	0.08	0.04	0.10	0.04	0.15	0.06	0.14	0.23	0.13	0.10	0.18	0.22	0.12	0.11	0.07	0.07	0.32	0.22	0.35	0.07
C6	0.12	0.16	0.12	0.14	0.12	0.15	0.13	0.27	0.13	0.16	0.16	0.12	0.13	0.16	0.13	0.13	0.14	0.10	0.42	0.65	0.88	0.62
C8	0.13	0.16	0.12	0.12	0.15	0.10	0.18	0.18	0.17	0.21	0.18	0.13	0.17	0.20	0.16	0.13	0.13	0.12	0.35	0.43	0.44	0.38
N1	0.12	0.14	0.13	0.13	0.10	0.14	0.12	0.26	0.11	0.17	0.15	0.10	0.12	0.17	0.13	0.14	0.12	0.10	0.40	0.61	0.82	0.58
N2	0.13	0.12	0.13	0.12	0.09	0.13	0.11	0.24	0.10	0.19	0.14	0.08	0.13	0.17	0.13	0.16	0.10	0.10	0.37	0.50	0.65	0.49
N3	0.13	0.13	0.13	0.11	0.09	0.11	0.11	0.20	0.13	0.18	0.16	0.08	0.16	0.17	0.13	0.16	0.10	0.10	0.35	0.43	0.51	0.41
N7	0.13	0.17	0.11	0.13	0.15	0.12	0.15	0.22	0.15	0.18	0.17	0.14	0.13	0.17	0.15	0.12	0.14	0.12	0.40	0.56	0.69	0.52
N9	0.13	0.14	0.13	0.11	0.12	0.10	0.16	0.18	0.17	0.20	0.17	0.10	0.20	0.20	0.14	0.15	0.11	0.10	0.33	0.37	0.36	0.34
O2'	0.15	0.15	0.14	0.10	0.14	0.10	0.21	0.13	0.24	0.24	0.21	0.11	0.32	0.27	0.16	0.19	0.10	0.12	0.30	0.23	0.14	0.17
O3'	0.10	0.12	0.09	0.05	0.10	0.04	0.17	0.07	0.17	0.24	0.14	0.08	0.23	0.26	0.13	0.13	0.06	0.08	0.36	0.34	0.19	0.15
O4'	0.12	0.13	0.13	0.10	0.12	0.09	0.18	0.12	0.19	0.23	0.17	0.10	0.24	0.24	0.13	0.17	0.11	0.10	0.27	0.18	0.16	0.15
O5'	0.15	0.14	0.15	0.07	0.10	0.06	0.13	0.05	0.12	0.24	0.13	0.11	0.13	0.20	0.15	0.14	0.01	0.12	0.33	0.31	0.23	0.12
O6	0.12	0.18	0.12	0.15	0.14	0.17	0.15	0.29	0.16	0.16	0.18	0.15	0.17	0.17	0.14	0.12	0.16	0.12	0.45	0.75	1.05	0.72
OP1	0.08	0.21	0.10	0.03	0.06	0.01	0.06	0.04	0.09	0.18	0.17	0.16	0.08	0.14	0.08	0.12	0.01	0.03	0.46	0.45	0.46	0.12
OP2	0.05	0.32	0.05	0.05	0.16	0.10	0.13	0.14	0.21	0.07	0.29	0.26	0.18	0.07	0.07	0.05	0.02	0.06	0.59	0.72	0.19	0.41
P	0.05	0.22	0.07	0.01	0.07	0.02	0.05	0.05	0.10	0.13	0.18	0.17	0.08	0.08	0.04	0.08	0.01	0.03	0.45	0.45	0.28	0.17

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.07	0.28	0.27	0.14
C2	0.03	0.00	0.08	0.18	0.02	0.21	0.02	0.38	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.08	0.19	0.05	0.32	0.45	0.94	0.62
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.03	0.07	0.06	0.08	0.03	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.07	0.17	0.41	0.14
C3'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.10	0.00	0.08	0.01	0.12	0.03	0.16	0.16	0.10	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.18	0.05	0.32	0.05
C4	0.02	0.02	0.04	0.10	0.00	0.12	0.00	0.24	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.09	0.04	0.15	0.11	0.40	0.27
C4'	0.01	0.21	0.01	0.00	0.12	0.00	0.11	0.01	0.15	0.02	0.19	0.19	0.13	0.07	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.15	0.32	0.12
C5	0.01	0.02	0.02	0.08	0.00	0.11	0.00	0.25	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.07	0.04	0.17	0.14	0.47	0.31
C5'	0.04	0.38	0.02	0.01	0.24	0.01	0.25	0.00	0.32	0.11	0.37	0.33	0.31	0.19	0.13	0.04	0.04	0.03	0.01	0.01	0.06	0.02
C6	0.02	0.00	0.03	0.12	0.01	0.15	0.01	0.32	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.11	0.05	0.26	0.31	0.74	0.48
C8	0.01	0.03	0.07	0.03	0.01	0.02	0.02	0.11	0.03	0.00	0.03	0.02	0.04	0.00	0.00	0.09	0.05	0.02	0.04	0.17	0.12	0.04
N1	0.02	0.00	0.06	0.16	0.01	0.19	0.01	0.37	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.17	0.06	0.32	0.45	0.96	0.62
N3	0.03	0.00	0.08	0.16	0.01	0.19	0.00	0.33	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.08	0.17	0.05	0.23	0.27	0.64	0.43
N6	0.02	0.01	0.03	0.10	0.01	0.13	0.02	0.31	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.04	0.02	0.05	0.09	0.05	0.26	0.32	0.76	0.49
N7	0.01	0.02	0.04	0.04	0.01	0.07	0.00	0.19	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.07	0.03	0.04	0.11	0.06	0.26	0.17
N9	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.13	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.04	0.13	0.11	0.05
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.03	0.03	0.03	0.04	0.02	0.09	0.05	0.08	0.05	0.07	0.02	0.00	0.04	0.03	0.05	0.34	0.68	0.30
O3'	0.01	0.19	0.02	0.01	0.09	0.01	0.07	0.04	0.11	0.05	0.17	0.17	0.09	0.03	0.03	0.04	0.00	0.01	0.28	0.16	0.53	0.08
O4'	0.00	0.05	0.00	0.02	0.04	0.00	0.04	0.03	0.05	0.02	0.06	0.05	0.05	0.04	0.02	0.03	0.01	0.00	0.13	0.27	0.18	0.12
O5'	0.07	0.32	0.07	0.18	0.15	0.01	0.17	0.01	0.26	0.04	0.32	0.23	0.26	0.11	0.04	0.05	0.28	0.13	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.28	0.45	0.17	0.05	0.11	0.15	0.14	0.01	0.31	0.17	0.45	0.27	0.32	0.06	0.13	0.34	0.16	0.27	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.27	0.94	0.41	0.32	0.40	0.32	0.47	0.06	0.74	0.12	0.96	0.64	0.76	0.26	0.11	0.68	0.53	0.18	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.14	0.62	0.14	0.05	0.27	0.12	0.31	0.02	0.48	0.04	0.62	0.43	0.49	0.17	0.05	0.30	0.08	0.12	0.01	0.00	0.00	0.00