Doublet Group distance statistics: 53230

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 11, 4, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.002, 0.007, 0.011, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.004, 0.009, 0.014, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.005, 0.011, 0.017, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.008, 0.017, 0.025, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.017 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.004, 0.013, 0.021, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.005, 0.013, 0.022, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.013 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.003, 0.012, 0.021, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.012 std_dev=0.009
N9	A	0, 0.005, 0.018, 0.030, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.018 std_dev=0.013
N2	A	0, 0.016, 0.030, 0.044, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.030 std_dev=0.014
O6	A	0, 0.017, 0.031, 0.045, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.031 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.005, 0.029, 0.053, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.029 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.005, 0.032, 0.059, 0.122 max_d=0.122 avg_d=0.032 std_dev=0.027
O4'	A	0, 0.033, 0.085, 0.137, 0.220 max_d=0.220 avg_d=0.085 std_dev=0.052
C2'	A	0, 0.033, 0.092, 0.150, 0.215 max_d=0.215 avg_d=0.092 std_dev=0.059
C4'	A	0, 0.054, 0.133, 0.211, 0.327 max_d=0.327 avg_d=0.133 std_dev=0.078
O2'	A	0, 0.080, 0.160, 0.240, 0.314 max_d=0.314 avg_d=0.160 std_dev=0.080
C4	B	0, 0.082, 0.170, 0.257, 0.383 max_d=0.383 avg_d=0.170 std_dev=0.088
C3'	A	0, 0.056, 0.146, 0.236, 0.351 max_d=0.351 avg_d=0.146 std_dev=0.090
N3	B	0, 0.121, 0.214, 0.308, 0.414 max_d=0.414 avg_d=0.214 std_dev=0.093
C5	B	0, 0.072, 0.167, 0.263, 0.396 max_d=0.396 avg_d=0.167 std_dev=0.095
N9	B	0, 0.082, 0.182, 0.282, 0.385 max_d=0.385 avg_d=0.182 std_dev=0.100
C1'	B	0, 0.103, 0.203, 0.304, 0.455 max_d=0.455 avg_d=0.203 std_dev=0.100
C6	B	0, 0.064, 0.167, 0.270, 0.432 max_d=0.432 avg_d=0.167 std_dev=0.103
N7	B	0, 0.117, 0.223, 0.329, 0.447 max_d=0.447 avg_d=0.223 std_dev=0.106
C2	B	0, 0.118, 0.224, 0.330, 0.431 max_d=0.431 avg_d=0.224 std_dev=0.106
C8	B	0, 0.114, 0.222, 0.330, 0.438 max_d=0.438 avg_d=0.222 std_dev=0.108
N1	B	0, 0.080, 0.190, 0.300, 0.425 max_d=0.425 avg_d=0.190 std_dev=0.110
O2'	B	0, 0.116, 0.229, 0.343, 0.571 max_d=0.571 avg_d=0.229 std_dev=0.113
O4'	B	0, 0.113, 0.229, 0.346, 0.530 max_d=0.530 avg_d=0.229 std_dev=0.116
N6	B	0, 0.080, 0.198, 0.317, 0.491 max_d=0.491 avg_d=0.198 std_dev=0.118
C2'	B	0, 0.098, 0.219, 0.341, 0.527 max_d=0.527 avg_d=0.219 std_dev=0.122
O3'	A	0, 0.083, 0.210, 0.337, 0.490 max_d=0.490 avg_d=0.210 std_dev=0.127
C5'	A	0, 0.081, 0.220, 0.359, 0.553 max_d=0.553 avg_d=0.220 std_dev=0.139
C4'	B	0, 0.112, 0.257, 0.401, 0.656 max_d=0.656 avg_d=0.257 std_dev=0.144
C3'	B	0, 0.099, 0.249, 0.400, 0.612 max_d=0.612 avg_d=0.249 std_dev=0.151
OP2	A	0, 0.119, 0.276, 0.432, 0.614 max_d=0.614 avg_d=0.276 std_dev=0.157
O5'	B	0, 0.130, 0.288, 0.446, 0.632 max_d=0.632 avg_d=0.288 std_dev=0.158
O5'	A	0, 0.068, 0.231, 0.394, 0.606 max_d=0.606 avg_d=0.231 std_dev=0.163
P	A	0, 0.073, 0.250, 0.426, 0.605 max_d=0.605 avg_d=0.250 std_dev=0.177
C5'	B	0, 0.109, 0.286, 0.464, 0.750 max_d=0.750 avg_d=0.286 std_dev=0.177
O3'	B	0, 0.124, 0.303, 0.482, 0.747 max_d=0.747 avg_d=0.303 std_dev=0.179
P	B	0, 0.141, 0.333, 0.525, 0.703 max_d=0.703 avg_d=0.333 std_dev=0.192
OP1	A	0, 0.124, 0.332, 0.539, 0.743 max_d=0.743 avg_d=0.332 std_dev=0.207
OP2	B	0, 0.095, 0.309, 0.522, 0.819 max_d=0.819 avg_d=0.309 std_dev=0.214
OP1	B	0, 0.215, 0.440, 0.665, 0.858 max_d=0.858 avg_d=0.440 std_dev=0.225

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.08	0.03
C2	0.01	0.00	0.05	0.06	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.08	0.02	0.08	0.01	0.12	0.10	0.09
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.06	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.05	0.05	0.03
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.06	0.05	0.08	0.06	0.05	0.03	0.03	0.03	0.01	0.03	0.04	0.06	0.02	0.03
C4	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.03	0.01	0.07	0.00	0.09	0.08	0.07
C4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.03	0.05	0.04	0.04	0.02	0.04	0.02	0.01	0.01	0.03	0.05	0.05	0.01
C5	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.03	0.01	0.07	0.01	0.10	0.10	0.09
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.04	0.01	0.05	0.00	0.05	0.06	0.05	0.07	0.05	0.06	0.04	0.03	0.02	0.02	0.01	0.06	0.07	0.04	0.01
C6	0.01	0.00	0.03	0.04	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.05	0.01	0.08	0.00	0.12	0.11	0.10
C8	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.09	0.01	0.09	0.10	0.09
N1	0.01	0.00	0.04	0.05	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.07	0.02	0.08	0.00	0.12	0.10	0.10
N2	0.02	0.01	0.06	0.08	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.09	0.11	0.02	0.09	0.01	0.13	0.10	0.10
N3	0.01	0.00	0.05	0.06	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.07	0.02	0.07	0.00	0.10	0.09	0.08
N7	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.04	0.01	0.09	0.01	0.10	0.11	0.10
N9	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.02	0.01	0.06	0.01	0.07	0.08	0.06
O2'	0.02	0.08	0.01	0.03	0.05	0.04	0.04	0.03	0.06	0.02	0.07	0.09	0.08	0.03	0.03	0.00	0.06	0.03	0.03	0.05	0.08	0.04	0.03
O3'	0.01	0.08	0.01	0.03	0.03	0.02	0.03	0.02	0.05	0.05	0.07	0.11	0.07	0.04	0.02	0.06	0.00	0.01	0.05	0.05	0.06	0.03	0.03
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.02	0.04	0.11	0.04
O5'	0.02	0.08	0.03	0.03	0.07	0.01	0.07	0.01	0.08	0.09	0.08	0.09	0.07	0.09	0.06	0.03	0.05	0.03	0.00	0.08	0.02	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.03	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.05	0.02	0.08	0.00	0.13	0.12	0.11
OP1	0.04	0.12	0.05	0.06	0.09	0.05	0.10	0.07	0.12	0.09	0.12	0.13	0.10	0.10	0.07	0.08	0.06	0.04	0.02	0.13	0.00	0.01	0.00
OP2	0.08	0.10	0.05	0.02	0.08	0.05	0.10	0.04	0.11	0.10	0.10	0.10	0.09	0.11	0.08	0.04	0.03	0.11	0.02	0.12	0.01	0.00	0.01
P	0.03	0.09	0.03	0.03	0.07	0.01	0.09	0.01	0.10	0.09	0.10	0.10	0.08	0.10	0.06	0.03	0.03	0.04	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.11	0.07	0.07	0.07	0.06	0.08	0.07	0.08	0.10	0.09	0.09	0.12	0.11	0.07	0.07	0.07	0.06	0.12	0.17	0.14	0.11
C2	0.09	0.13	0.08	0.08	0.08	0.09	0.08	0.10	0.08	0.11	0.10	0.11	0.09	0.11	0.09	0.06	0.08	0.10	0.13	0.14	0.15	0.12
C2'	0.05	0.14	0.07	0.06	0.07	0.05	0.08	0.07	0.09	0.09	0.12	0.12	0.13	0.11	0.06	0.08	0.06	0.06	0.11	0.16	0.14	0.11
C3'	0.06	0.13	0.07	0.06	0.07	0.05	0.08	0.07	0.08	0.11	0.09	0.11	0.12	0.13	0.07	0.08	0.06	0.06	0.11	0.17	0.12	0.10
C4	0.05	0.13	0.06	0.06	0.06	0.05	0.06	0.07	0.06	0.09	0.09	0.11	0.08	0.10	0.06	0.07	0.05	0.06	0.11	0.15	0.14	0.11
C4'	0.06	0.10	0.07	0.07	0.07	0.06	0.09	0.07	0.08	0.11	0.07	0.09	0.12	0.13	0.07	0.07	0.07	0.06	0.11	0.18	0.12	0.10
C5	0.06	0.13	0.06	0.05	0.06	0.05	0.05	0.07	0.05	0.09	0.09	0.12	0.07	0.10	0.05	0.09	0.05	0.05	0.10	0.15	0.14	0.11
C5'	0.06	0.10	0.07	0.06	0.07	0.06	0.09	0.07	0.08	0.12	0.07	0.09	0.14	0.14	0.07	0.07	0.06	0.06	0.10	0.17	0.11	0.09
C6	0.04	0.13	0.05	0.04	0.06	0.05	0.06	0.07	0.06	0.10	0.09	0.12	0.08	0.10	0.05	0.09	0.04	0.06	0.11	0.14	0.15	0.11
C8	0.09	0.14	0.09	0.08	0.09	0.08	0.08	0.08	0.07	0.10	0.11	0.13	0.08	0.11	0.09	0.11	0.08	0.08	0.11	0.18	0.14	0.12
N1	0.07	0.12	0.06	0.06	0.06	0.08	0.07	0.10	0.07	0.11	0.09	0.11	0.08	0.11	0.08	0.06	0.06	0.10	0.13	0.14	0.16	0.12
N2	0.12	0.13	0.11	0.12	0.11	0.12	0.10	0.13	0.10	0.13	0.11	0.12	0.11	0.12	0.12	0.09	0.12	0.13	0.15	0.15	0.16	0.13
N3	0.07	0.13	0.07	0.07	0.07	0.07	0.08	0.08	0.09	0.10	0.10	0.11	0.11	0.11	0.08	0.06	0.07	0.08	0.12	0.15	0.14	0.11
N7	0.10	0.14	0.10	0.08	0.10	0.08	0.07	0.08	0.08	0.10	0.11	0.14	0.08	0.11	0.09	0.12	0.08	0.09	0.11	0.16	0.14	0.11
N9	0.06	0.13	0.07	0.07	0.07	0.06	0.07	0.07	0.06	0.09	0.09	0.11	0.09	0.11	0.06	0.08	0.07	0.06	0.11	0.17	0.14	0.11
O2'	0.08	0.14	0.09	0.09	0.09	0.08	0.11	0.08	0.14	0.10	0.14	0.12	0.18	0.13	0.08	0.11	0.09	0.08	0.12	0.18	0.15	0.12
O3'	0.06	0.14	0.07	0.06	0.07	0.06	0.08	0.08	0.08	0.11	0.10	0.12	0.12	0.13	0.06	0.09	0.06	0.07	0.11	0.17	0.12	0.10
O4'	0.06	0.10	0.07	0.08	0.07	0.07	0.09	0.08	0.08	0.11	0.07	0.09	0.12	0.13	0.07	0.08	0.08	0.07	0.12	0.19	0.14	0.12
O5'	0.06	0.11	0.07	0.06	0.07	0.06	0.11	0.08	0.10	0.13	0.08	0.10	0.15	0.17	0.08	0.07	0.07	0.06	0.11	0.18	0.10	0.09
O6	0.07	0.13	0.08	0.06	0.08	0.07	0.08	0.08	0.08	0.12	0.10	0.13	0.09	0.11	0.07	0.12	0.07	0.06	0.11	0.14	0.17	0.13
OP1	0.10	0.12	0.09	0.10	0.08	0.14	0.11	0.17	0.09	0.15	0.07	0.11	0.15	0.18	0.09	0.11	0.10	0.13	0.15	0.19	0.19	0.15
OP2	0.10	0.14	0.11	0.11	0.12	0.12	0.16	0.13	0.16	0.18	0.14	0.13	0.21	0.22	0.12	0.10	0.11	0.11	0.13	0.18	0.13	0.12
P	0.08	0.11	0.08	0.08	0.08	0.09	0.12	0.11	0.11	0.15	0.08	0.10	0.16	0.18	0.09	0.08	0.08	0.09	0.11	0.18	0.12	0.10

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.04	0.05	0.11	0.04
C2	0.02	0.00	0.05	0.06	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.08	0.02	0.08	0.07	0.13	0.05
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.04	0.05	0.05	0.04	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.07	0.07	0.03
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.06	0.06	0.05	0.07	0.07	0.04	0.02	0.00	0.01	0.05	0.08	0.05	0.05
C4	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.05	0.01	0.08	0.07	0.11	0.05
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.04	0.02	0.02	0.04	0.04	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.06	0.02
C5	0.01	0.00	0.03	0.06	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.07	0.01	0.10	0.08	0.12	0.07
C5'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.00	0.06	0.06	0.05	0.03	0.07	0.07	0.04	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.06	0.01	0.03	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.08	0.02	0.10	0.09	0.13	0.08
C8	0.01	0.00	0.04	0.06	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.07	0.02	0.09	0.07	0.11	0.07
N1	0.02	0.00	0.05	0.06	0.01	0.02	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.08	0.02	0.09	0.08	0.13	0.07
N3	0.01	0.00	0.05	0.05	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.07	0.02	0.07	0.07	0.13	0.05
N6	0.01	0.00	0.04	0.07	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.09	0.02	0.11	0.11	0.14	0.10
N7	0.01	0.00	0.04	0.07	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.09	0.02	0.11	0.09	0.13	0.09
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.07	0.06	0.10	0.05
O2'	0.02	0.06	0.00	0.02	0.04	0.03	0.04	0.03	0.04	0.03	0.06	0.06	0.04	0.03	0.02	0.00	0.05	0.03	0.03	0.06	0.09	0.03
O3'	0.01	0.08	0.02	0.00	0.05	0.01	0.07	0.02	0.08	0.07	0.08	0.07	0.09	0.09	0.04	0.05	0.00	0.01	0.05	0.10	0.05	0.06
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.07	0.12	0.07
O5'	0.04	0.08	0.04	0.05	0.08	0.01	0.10	0.01	0.10	0.09	0.09	0.07	0.11	0.11	0.07	0.03	0.05	0.05	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.05	0.07	0.07	0.08	0.07	0.03	0.08	0.02	0.09	0.07	0.08	0.07	0.11	0.09	0.06	0.06	0.10	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.13	0.07	0.05	0.11	0.06	0.12	0.04	0.13	0.11	0.13	0.13	0.14	0.13	0.10	0.09	0.05	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.05	0.03	0.05	0.05	0.02	0.07	0.01	0.08	0.07	0.07	0.05	0.10	0.09	0.05	0.03	0.06	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00