Doublet Group distance statistics: 53231

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 1, 4, 1, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.008, 0.013, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.005, 0.013, 0.021, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.013 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.005, 0.013, 0.021, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.003, 0.012, 0.021, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.012 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.002, 0.012, 0.022, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.012 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.004, 0.015, 0.027, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.015 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.007, 0.020, 0.033, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.020 std_dev=0.013
N7	A	0, 0.010, 0.025, 0.039, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.025 std_dev=0.014
O6	A	0, 0.007, 0.023, 0.039, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.023 std_dev=0.016
N2	A	0, 0.004, 0.023, 0.041, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.023 std_dev=0.018
C8	A	0, 0.012, 0.032, 0.052, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.032 std_dev=0.020
C2'	A	0, 0.081, 0.177, 0.274, 0.422 max_d=0.422 avg_d=0.177 std_dev=0.096
O4'	A	0, 0.074, 0.185, 0.296, 0.486 max_d=0.486 avg_d=0.185 std_dev=0.111
O2'	A	0, 0.067, 0.192, 0.317, 0.475 max_d=0.475 avg_d=0.192 std_dev=0.125
C3'	A	0, 0.149, 0.304, 0.460, 0.697 max_d=0.697 avg_d=0.304 std_dev=0.156
C4'	A	0, 0.139, 0.296, 0.452, 0.707 max_d=0.707 avg_d=0.296 std_dev=0.156
N1	B	0, 0.223, 0.382, 0.542, 0.606 max_d=0.606 avg_d=0.382 std_dev=0.160
O5'	A	0, 0.249, 0.410, 0.571, 0.590 max_d=0.590 avg_d=0.410 std_dev=0.161
C2	B	0, 0.264, 0.437, 0.611, 0.670 max_d=0.670 avg_d=0.437 std_dev=0.174
N3	B	0, 0.324, 0.506, 0.689, 0.714 max_d=0.714 avg_d=0.506 std_dev=0.183
P	A	0, 0.144, 0.342, 0.540, 0.697 max_d=0.697 avg_d=0.342 std_dev=0.198
C6	B	0, 0.275, 0.478, 0.682, 0.733 max_d=0.733 avg_d=0.478 std_dev=0.204
OP2	A	0, 0.163, 0.388, 0.614, 0.932 max_d=0.932 avg_d=0.388 std_dev=0.225
O3'	A	0, 0.235, 0.465, 0.694, 1.018 max_d=1.018 avg_d=0.465 std_dev=0.229
OP1	A	0, 0.282, 0.522, 0.761, 0.959 max_d=0.959 avg_d=0.522 std_dev=0.239
C4	B	0, 0.200, 0.446, 0.692, 0.815 max_d=0.815 avg_d=0.446 std_dev=0.246
C5	B	0, 0.247, 0.500, 0.753, 0.872 max_d=0.872 avg_d=0.500 std_dev=0.253
C5'	A	0, 0.210, 0.475, 0.739, 1.221 max_d=1.221 avg_d=0.475 std_dev=0.264
N6	B	0, 0.392, 0.661, 0.931, 0.976 max_d=0.976 avg_d=0.661 std_dev=0.269
N9	B	0, 0.202, 0.539, 0.876, 1.115 max_d=1.115 avg_d=0.539 std_dev=0.337
N7	B	0, 0.354, 0.694, 1.034, 1.187 max_d=1.187 avg_d=0.694 std_dev=0.340
C1'	B	0, 0.314, 0.685, 1.057, 1.336 max_d=1.336 avg_d=0.685 std_dev=0.372
C8	B	0, 0.283, 0.658, 1.032, 1.293 max_d=1.293 avg_d=0.658 std_dev=0.375
C2'	B	0, 0.681, 1.169, 1.656, 1.863 max_d=1.863 avg_d=1.169 std_dev=0.487
O4'	B	0, 0.206, 0.711, 1.216, 1.595 max_d=1.595 avg_d=0.711 std_dev=0.505
O2'	B	0, 0.867, 1.456, 2.044, 2.136 max_d=2.136 avg_d=1.456 std_dev=0.589
C4'	B	0, 0.711, 1.311, 1.911, 2.232 max_d=2.232 avg_d=1.311 std_dev=0.600
C3'	B	0, 0.871, 1.502, 2.132, 2.377 max_d=2.377 avg_d=1.502 std_dev=0.631
O5'	B	0, 0.843, 1.557, 2.271, 2.720 max_d=2.720 avg_d=1.557 std_dev=0.714
C5'	B	0, 1.088, 1.864, 2.641, 2.776 max_d=2.776 avg_d=1.864 std_dev=0.776
OP2	B	0, 1.064, 1.847, 2.631, 2.981 max_d=2.981 avg_d=1.847 std_dev=0.783
P	B	0, 1.060, 1.852, 2.643, 3.089 max_d=3.089 avg_d=1.852 std_dev=0.792
O3'	B	0, 1.196, 2.012, 2.829, 2.985 max_d=2.985 avg_d=2.012 std_dev=0.817
OP1	B	0, 1.400, 2.291, 3.182, 3.380 max_d=3.380 avg_d=2.291 std_dev=0.891

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.05	0.01	0.07	0.05	0.05
C2	0.02	0.00	0.07	0.08	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.11	0.03	0.12	0.02	0.13	0.18	0.13
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.06	0.04	0.07	0.08	0.07	0.04	0.02	0.00	0.03	0.01	0.05	0.06	0.07	0.08	0.06
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.06	0.00	0.08	0.02	0.09	0.08	0.09	0.09	0.07	0.09	0.05	0.01	0.01	0.01	0.10	0.10	0.09	0.09	0.09
C4	0.01	0.00	0.05	0.06	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.07	0.02	0.12	0.01	0.13	0.16	0.13
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.07	0.04	0.03	0.03	0.07	0.03	0.03	0.02	0.00	0.01	0.06	0.07	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.09	0.02	0.15	0.01	0.18	0.21	0.18
C5'	0.02	0.05	0.01	0.02	0.06	0.01	0.09	0.00	0.09	0.10	0.07	0.04	0.04	0.11	0.06	0.03	0.04	0.01	0.01	0.11	0.08	0.06	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.09	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.06	0.11	0.03	0.16	0.01	0.19	0.24	0.19
C8	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.07	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.09	0.03	0.15	0.01	0.16	0.16	0.15
N1	0.02	0.00	0.07	0.09	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.11	0.03	0.14	0.01	0.17	0.22	0.17
N2	0.02	0.01	0.08	0.09	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.12	0.04	0.11	0.03	0.12	0.17	0.12
N3	0.02	0.00	0.07	0.07	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.09	0.03	0.10	0.01	0.11	0.15	0.11
N7	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.10	0.03	0.17	0.01	0.20	0.22	0.20
N9	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.10	0.01	0.11	0.12	0.10
O2'	0.02	0.09	0.00	0.01	0.05	0.03	0.04	0.03	0.06	0.03	0.08	0.11	0.08	0.03	0.02	0.00	0.04	0.04	0.04	0.06	0.08	0.06	0.04
O3'	0.02	0.11	0.03	0.01	0.07	0.02	0.09	0.04	0.11	0.09	0.11	0.12	0.09	0.10	0.05	0.04	0.00	0.02	0.13	0.13	0.14	0.15	0.13
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.04	0.03	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.09	0.03	0.10	0.09	0.08
O5'	0.05	0.12	0.05	0.10	0.12	0.01	0.15	0.01	0.16	0.15	0.14	0.11	0.10	0.17	0.10	0.04	0.13	0.09	0.00	0.17	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.02	0.06	0.10	0.01	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.06	0.13	0.03	0.17	0.00	0.22	0.27	0.22
OP1	0.07	0.13	0.07	0.09	0.13	0.07	0.18	0.08	0.19	0.16	0.17	0.12	0.11	0.20	0.11	0.08	0.14	0.10	0.01	0.22	0.00	0.01	0.01
OP2	0.05	0.18	0.08	0.09	0.16	0.03	0.21	0.06	0.24	0.16	0.22	0.17	0.15	0.22	0.12	0.06	0.15	0.09	0.02	0.27	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.13	0.06	0.09	0.13	0.02	0.18	0.01	0.19	0.15	0.17	0.12	0.11	0.20	0.10	0.04	0.13	0.08	0.00	0.22	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.20	0.33	0.29	0.14	0.25	0.16	0.41	0.20	0.19	0.22	0.17	0.26	0.19	0.18	0.45	0.38	0.27	0.24	0.19	0.42	0.17
C2	0.16	0.17	0.21	0.13	0.10	0.15	0.17	0.45	0.19	0.19	0.10	0.19	0.28	0.25	0.12	0.34	0.15	0.14	0.24	0.14	0.47	0.13
C2'	0.19	0.22	0.32	0.26	0.13	0.22	0.17	0.40	0.20	0.21	0.22	0.18	0.26	0.22	0.16	0.47	0.36	0.26	0.22	0.19	0.45	0.17
C3'	0.20	0.19	0.33	0.28	0.13	0.23	0.15	0.41	0.18	0.20	0.18	0.17	0.25	0.20	0.16	0.48	0.39	0.26	0.22	0.19	0.45	0.17
C4	0.15	0.17	0.23	0.17	0.11	0.17	0.15	0.42	0.18	0.16	0.15	0.16	0.26	0.19	0.12	0.36	0.22	0.16	0.25	0.14	0.44	0.13
C4'	0.24	0.21	0.38	0.35	0.16	0.27	0.16	0.40	0.19	0.19	0.22	0.19	0.24	0.18	0.19	0.50	0.46	0.28	0.26	0.22	0.41	0.18
C5	0.14	0.17	0.20	0.14	0.12	0.16	0.14	0.44	0.16	0.14	0.11	0.17	0.26	0.18	0.12	0.31	0.17	0.14	0.30	0.17	0.44	0.16
C5'	0.26	0.19	0.39	0.37	0.17	0.29	0.15	0.42	0.16	0.19	0.18	0.20	0.21	0.16	0.21	0.50	0.48	0.29	0.28	0.22	0.42	0.19
C6	0.17	0.19	0.18	0.14	0.14	0.18	0.15	0.47	0.17	0.16	0.12	0.19	0.28	0.19	0.14	0.28	0.14	0.17	0.34	0.21	0.47	0.20
C8	0.16	0.15	0.25	0.20	0.11	0.18	0.13	0.42	0.17	0.13	0.15	0.16	0.26	0.16	0.12	0.36	0.26	0.17	0.27	0.15	0.42	0.14
N1	0.18	0.17	0.19	0.14	0.13	0.18	0.16	0.47	0.18	0.17	0.09	0.20	0.30	0.22	0.14	0.30	0.14	0.18	0.31	0.19	0.48	0.18
N2	0.18	0.17	0.22	0.13	0.09	0.16	0.20	0.45	0.19	0.24	0.10	0.21	0.28	0.31	0.12	0.36	0.15	0.15	0.20	0.14	0.49	0.14
N3	0.15	0.19	0.24	0.17	0.11	0.17	0.17	0.42	0.19	0.20	0.17	0.17	0.26	0.23	0.13	0.38	0.22	0.17	0.22	0.14	0.45	0.13
N7	0.14	0.16	0.21	0.16	0.12	0.16	0.13	0.43	0.16	0.13	0.12	0.17	0.26	0.16	0.12	0.32	0.20	0.15	0.31	0.17	0.43	0.16
N9	0.18	0.16	0.27	0.22	0.11	0.20	0.14	0.41	0.18	0.15	0.18	0.16	0.26	0.17	0.14	0.39	0.29	0.20	0.24	0.15	0.42	0.13
O2'	0.21	0.29	0.36	0.31	0.17	0.24	0.20	0.36	0.23	0.23	0.27	0.23	0.28	0.23	0.19	0.52	0.42	0.27	0.24	0.25	0.41	0.18
O3'	0.19	0.20	0.33	0.28	0.12	0.23	0.16	0.40	0.18	0.21	0.18	0.17	0.25	0.22	0.16	0.50	0.40	0.26	0.21	0.20	0.46	0.18
O4'	0.27	0.20	0.38	0.35	0.17	0.29	0.16	0.41	0.21	0.19	0.23	0.20	0.26	0.18	0.21	0.49	0.45	0.30	0.28	0.23	0.41	0.20
O5'	0.26	0.17	0.34	0.32	0.17	0.28	0.14	0.45	0.13	0.18	0.14	0.20	0.18	0.15	0.20	0.45	0.41	0.29	0.26	0.19	0.46	0.20
O6	0.19	0.21	0.18	0.17	0.17	0.21	0.17	0.49	0.18	0.19	0.18	0.20	0.28	0.21	0.17	0.26	0.16	0.21	0.40	0.27	0.50	0.27
OP1	0.26	0.15	0.35	0.33	0.16	0.29	0.12	0.46	0.10	0.17	0.11	0.20	0.14	0.14	0.20	0.45	0.43	0.29	0.26	0.19	0.46	0.20
OP2	0.25	0.18	0.27	0.26	0.18	0.27	0.13	0.50	0.10	0.17	0.10	0.21	0.13	0.14	0.20	0.37	0.30	0.28	0.25	0.17	0.50	0.20
P	0.24	0.14	0.30	0.28	0.15	0.27	0.11	0.46	0.08	0.16	0.09	0.19	0.14	0.12	0.18	0.40	0.36	0.28	0.25	0.16	0.46	0.18

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.31	0.30	0.19	0.17
C2	0.02	0.00	0.10	0.08	0.00	0.06	0.00	0.30	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.19	0.12	0.04	0.30	0.14	0.37	0.12
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.02	0.02	0.04	0.04	0.06	0.08	0.11	0.03	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.15	0.20	0.27	0.07
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.06	0.00	0.10	0.02	0.09	0.16	0.08	0.08	0.12	0.15	0.08	0.02	0.01	0.02	0.06	0.18	0.32	0.09
C4	0.01	0.00	0.05	0.06	0.00	0.10	0.00	0.34	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.10	0.05	0.02	0.31	0.16	0.34	0.12
C4'	0.01	0.06	0.02	0.00	0.10	0.00	0.16	0.01	0.15	0.22	0.10	0.04	0.18	0.22	0.12	0.05	0.02	0.00	0.01	0.25	0.28	0.02
C5	0.01	0.00	0.02	0.10	0.00	0.16	0.00	0.45	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.08	0.02	0.29	0.14	0.39	0.13
C5'	0.11	0.30	0.04	0.02	0.34	0.01	0.45	0.00	0.46	0.49	0.39	0.25	0.51	0.53	0.32	0.05	0.09	0.03	0.01	0.39	0.34	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.09	0.01	0.15	0.01	0.46	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.06	0.03	0.28	0.15	0.42	0.14
C8	0.01	0.01	0.06	0.16	0.00	0.22	0.00	0.49	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.17	0.02	0.31	0.16	0.33	0.13
N1	0.02	0.00	0.08	0.08	0.01	0.10	0.01	0.39	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.07	0.04	0.29	0.13	0.40	0.13
N3	0.01	0.00	0.11	0.08	0.00	0.04	0.00	0.25	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.18	0.12	0.04	0.31	0.18	0.32	0.12
N6	0.01	0.01	0.03	0.12	0.01	0.18	0.01	0.51	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.09	0.02	0.26	0.20	0.45	0.17
N7	0.01	0.00	0.04	0.15	0.00	0.22	0.00	0.53	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.16	0.01	0.28	0.15	0.40	0.14
N9	0.00	0.01	0.01	0.08	0.00	0.12	0.00	0.32	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.06	0.01	0.32	0.20	0.28	0.13
O2'	0.01	0.19	0.00	0.02	0.10	0.05	0.07	0.05	0.11	0.04	0.16	0.18	0.09	0.03	0.03	0.00	0.03	0.08	0.07	0.19	0.28	0.07
O3'	0.02	0.12	0.01	0.01	0.05	0.02	0.08	0.09	0.06	0.17	0.07	0.12	0.09	0.16	0.06	0.03	0.00	0.03	0.23	0.21	0.40	0.22
O4'	0.01	0.04	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.03	0.02	0.04	0.04	0.02	0.01	0.01	0.08	0.03	0.00	0.35	0.44	0.11	0.28
O5'	0.31	0.30	0.15	0.06	0.31	0.01	0.29	0.01	0.28	0.31	0.29	0.31	0.26	0.28	0.32	0.07	0.23	0.35	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.30	0.14	0.20	0.18	0.16	0.25	0.14	0.39	0.15	0.16	0.13	0.18	0.20	0.15	0.20	0.19	0.21	0.44	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.19	0.37	0.27	0.32	0.34	0.28	0.39	0.34	0.42	0.33	0.40	0.32	0.45	0.40	0.28	0.28	0.40	0.11	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.17	0.12	0.07	0.09	0.12	0.02	0.13	0.01	0.14	0.13	0.13	0.12	0.17	0.14	0.13	0.07	0.22	0.28	0.01	0.01	0.01	0.00